123 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_2919 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013158  Huta_2919  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 203 aa  411  1e-114  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0416345  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3888  transcriptional regulator, TetR family  46.6 
 
 		 214 aa  167  1e-40  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4340  transcriptional regulator, TetR family  37.88 
 
 		 203 aa  145  6e-34  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0786  transcriptional regulator, TetR family  45.18 
 
 		 202 aa  140  9e-33  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.536081  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1806  transcriptional regulator, TetR family  39.27 
 
 		 207 aa  135  4e-31  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.382485 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0012  transcriptional regulator, TetR family  42.55 
 
 		 207 aa  132  3e-30  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1807  transcriptional regulator, TetR family  42.25 
 
 		 199 aa  130  1.0000000000000001e-29  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.366594 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2490  transcriptional regulator, TetR family  40.64 
 
 		 200 aa  127  1.0000000000000001e-28  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.375188  normal  0.286749 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1374  transcriptional regulator, TetR family  37.11 
 
 		 225 aa  127  1.0000000000000001e-28  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.181966  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2007  transcriptional regulator, TetR family  41.71 
 
 		 221 aa  122  5e-27  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.175096  normal  0.641587 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1935  transcriptional regulator, TetR family  39.56 
 
 		 233 aa  117  9.999999999999999e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0893  transcriptional regulator, TetR family  39.06 
 
 		 201 aa  115  3.9999999999999997e-25  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.17617  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1316  transcriptional regulator, TetR family  34.22 
 
 		 298 aa  112  4.0000000000000004e-24  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1985  transcriptional regulator, TetR family  39.26 
 
 		 269 aa  112  5e-24  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.351825 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1896  transcriptional regulator, TetR family  35.18 
 
 		 204 aa  105  6e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0499  transcriptional regulator, TetR family  39.25 
 
 		 201 aa  103  2e-21  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.38098  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0748  transcriptional regulator, TetR family  37.95 
 
 		 194 aa  102  5e-21  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.866187  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1666  transcriptional regulator, TetR family  32.99 
 
 		 209 aa  94.7  7e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.40268  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1196  transcriptional regulator, TetR family  38.6 
 
 		 228 aa  93.2  2e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  unclonable  0.000000002147  hitchhiker  0.00000600855 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2800  transcriptional regulator, TetR family  25.64 
 
 		 206 aa  66.6  0.0000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16270  transcriptional regulator  26.7 
 
 		 287 aa  58.5  0.00000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3859  TetR family transcriptional regulator  26.06 
 
 		 211 aa  53.5  0.000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.677666 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2564  TetR family transcriptional regulator  25.57 
 
 		 214 aa  52.4  0.000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.454515 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5235  transcriptional regulator  29.88 
 
 		 207 aa  52.4  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.16745 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4897  TetR family transcriptional regulator  27.22 
 
 		 231 aa  50.8  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.043246  normal  0.757086 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3867  TetR family transcriptional regulator  25.98 
 
 		 225 aa  49.7  0.00003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.53155  normal  0.151589 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1866  TetR family transcriptional regulator  34.52 
 
 		 212 aa  49.7  0.00003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.26917  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0915  TetR family transcriptional regulator  25.51 
 
 		 213 aa  49.3  0.00004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5749  TetR family transcriptional regulator  30.46 
 
 		 225 aa  48.5  0.00006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.147109  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4029  transcriptional regulator, TetR family  25.28 
 
 		 217 aa  48.5  0.00007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.697639  normal  0.116148 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5516  TetR family transcriptional regulator  30.46 
 
 		 270 aa  48.1  0.00008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.165925  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1062  TetR family transcriptional regulator  22.84 
 
 		 215 aa  47.8  0.0001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.453034  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1493  TetR family transcriptional regulator  23.21 
 
 		 200 aa  47.4  0.0001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0772  transcriptional regulator, TetR family  36.07 
 
 		 223 aa  47.4  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8100  transcriptional regulator, TetR family  25.64 
 
 		 218 aa  47.8  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.978856  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2304  TetR family transcriptional regulator  20.1 
 
 		 211 aa  47  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.373552  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2479  TetR family transcriptional regulator  20.1 
 
 		 211 aa  47  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.660065  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1823  TetR family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 222 aa  46.6  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.331222  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9078  putative transcriptional regulator, TetR family  31.82 
 
 		 211 aa  46.6  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3506  TetR family transcriptional regulator  28.76 
 
 		 195 aa  47  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.154198  normal  0.0873465 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4073  TetR family transcriptional regulator  26.92 
 
 		 223 aa  47  0.0002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2272  TetR family transcriptional regulator  20.62 
 
 		 211 aa  46.2  0.0003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000566042  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2248  TetR family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 222 aa  46.2  0.0003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0660336  normal  0.0152181 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3836  TetR family transcriptional regulator  26.79 
 
 		 246 aa  46.2  0.0003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.487675  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3603  TetR family transcriptional regulator  28.92 
 
 		 205 aa  46.6  0.0003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.162578  normal  0.242533 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2500  transcriptional regulator, TetR family  20.62 
 
 		 211 aa  46.2  0.0003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0652  transcriptional regulator, TetR family  25.7 
 
 		 190 aa  46.6  0.0003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00127288  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4778  transcriptional regulator, TetR family  27.03 
 
 		 227 aa  46.2  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0545614  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3642  TetR family transcriptional regulator  37.1 
 
 		 227 aa  45.8  0.0004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.494269 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2169  transcriptional regulator, TetR family  25.41 
 
 		 207 aa  45.8  0.0004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.821962  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30540  transcriptional regulator, TetR family  35.44 
 
 		 195 aa  45.8  0.0004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2226  TetR family transcriptional regulator  20.1 
 
 		 211 aa  45.8  0.0005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0397604  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1015  transcriptional regulator, TetR family  25.53 
 
 		 201 aa  45.4  0.0005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2575  transcriptional regulator, TetR family  20.56 
 
 		 211 aa  45.4  0.0006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000582548  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4280  transcriptional regulator, TetR family  27.33 
 
 		 203 aa  45.1  0.0007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.409841  normal  0.686522 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4955  TetR family transcriptional regulator  25.51 
 
 		 424 aa  45.1  0.0007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.868884 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0773  TetR family transcriptional regulator  26.17 
 
 		 224 aa  44.7  0.0009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0502  TetR family transcriptional regulator  26.17 
 
 		 224 aa  44.7  0.0009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0170  TetR family transcriptional regulator  35.85 
 
 		 192 aa  44.7  0.0009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.652591  normal  0.659974 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05660  putative transcriptional regulator  37.8 
 
 		 206 aa  44.3  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2734  putative transcriptional regulator, TetR family  26.29 
 
 		 206 aa  44.7  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.596696  normal  0.79417 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0573  TetR family transcriptional regulator  26.17 
 
 		 232 aa  44.7  0.001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0810713  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0685  TetR family transcriptional regulator  26.17 
 
 		 232 aa  44.7  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2087  TetR family transcriptional regulator  26.17 
 
 		 232 aa  44.7  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.390005  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1991  TetR family transcriptional regulator  26.17 
 
 		 232 aa  44.7  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1638  TetR family transcriptional regulator  26.17 
 
 		 232 aa  44.7  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0537  putative transcriptional regulator  37.8 
 
 		 206 aa  44.3  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.664064  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5570  transcriptional regulator, TetR family  27.4 
 
 		 198 aa  44.3  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0626  TetR family transcriptional regulator  26.71 
 
 		 199 aa  44.3  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3407  TetR family transcriptional regulator  24.58 
 
 		 422 aa  44.3  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.282297 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0421  transcriptional regulator, TetR family  27.46 
 
 		 198 aa  44.3  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3368  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 229 aa  44.3  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.823068  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1867  transcriptional regulator, TetR family  25 
 
 		 201 aa  43.5  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.129849  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5720  TetR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 291 aa  43.9  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.649137  normal  0.760569 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00759  transcriptional regulator, TetR family protein  30.93 
 
 		 224 aa  43.9  0.002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0513  transcriptional regulator, TetR family  26.51 
 
 		 193 aa  43.9  0.002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.826847 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4414  transcriptional regulator, TetR family  24.71 
 
 		 419 aa  43.5  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.617294  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4466  transcriptional regulator, TetR family  38.33 
 
 		 204 aa  43.5  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.575375  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2213  putative transcription regulator transcription regulator protein  29.08 
 
 		 236 aa  42.7  0.003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1872  TetR family transcriptional regulator  27.47 
 
 		 194 aa  43.1  0.003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0891  TetR family transcriptional regulator  26.17 
 
 		 211 aa  43.1  0.003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4024  TetR family transcriptional regulator  22.89 
 
 		 207 aa  43.1  0.003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.563014  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0719  TetR family transcriptional regulator  31 
 
 		 408 aa  43.1  0.003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0260522 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3293  TetR family transcriptional regulator  24.2 
 
 		 190 aa  42.7  0.003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00124137 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4290  transcriptional regulator, TetR family  35.48 
 
 		 226 aa  43.1  0.003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.000567463  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2510  TetR family transcriptional regulator  20.11 
 
 		 209 aa  42.4  0.004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00262483  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5488  TetR family transcriptional regulator  25.34 
 
 		 238 aa  42.7  0.004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2497  TetR family transcriptional regulator  26.98 
 
 		 201 aa  42.7  0.004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.55388 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47520  putative transcriptional regulator  32.73 
 
 		 197 aa  42.7  0.004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3710  regulatory protein, TetR  30.77 
 
 		 230 aa  42.7  0.004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4115  transcriptional regulator, TetR family  28.95 
 
 		 194 aa  42.4  0.004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.1417 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0894  TetR family transcriptional regulator  44.19 
 
 		 260 aa  42.4  0.004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2188  transcriptional regulator, TetR family  35.48 
 
 		 194 aa  42.7  0.004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.106219  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4006  transcriptional regulator, TetR family  39.62 
 
 		 202 aa  42.4  0.004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3897  TetR family transcriptional regulator  26.03 
 
 		 213 aa  42.4  0.005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3979  transcriptional regulator, TetR family  34.62 
 
 		 222 aa  42.4  0.005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.318215  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0411  transcriptional regulator, TetR family  24.39 
 
 		 196 aa  42.4  0.005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.3269  hitchhiker  0.00212654 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2692  TetR family transcriptional regulator  25.88 
 
 		 195 aa  42.4  0.005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.728372  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2285  TetR family transcriptional regulator  18.82 
 
 		 211 aa  42  0.005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0118465  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2411  transcriptional regulator, TetR family  25.37 
 
 		 205 aa  42.4  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.147912 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>