156 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmag_3888 on replicon NC_013923
Organism: Natrialba magadii ATCC 43099



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013923  Nmag_3888  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 214 aa  433  1e-120  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2919  transcriptional regulator, TetR family  46.6 
 
 		 203 aa  167  1e-40  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0416345  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0786  transcriptional regulator, TetR family  39.06 
 
 		 202 aa  125  6e-28  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.536081  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1935  transcriptional regulator, TetR family  39.33 
 
 		 233 aa  122  4e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4340  transcriptional regulator, TetR family  37.88 
 
 		 203 aa  121  8e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2007  transcriptional regulator, TetR family  35.2 
 
 		 221 aa  119  3.9999999999999996e-26  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.175096  normal  0.641587 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0012  transcriptional regulator, TetR family  36 
 
 		 207 aa  119  4.9999999999999996e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1985  transcriptional regulator, TetR family  38.29 
 
 		 269 aa  116  3e-25  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.351825 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2490  transcriptional regulator, TetR family  33.69 
 
 		 200 aa  113  3e-24  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.375188  normal  0.286749 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1316  transcriptional regulator, TetR family  32.98 
 
 		 298 aa  112  5e-24  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0893  transcriptional regulator, TetR family  35.45 
 
 		 201 aa  108  5e-23  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.17617  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1374  transcriptional regulator, TetR family  33 
 
 		 225 aa  103  1e-21  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.181966  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1806  transcriptional regulator, TetR family  33.51 
 
 		 207 aa  102  4e-21  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.382485 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1896  transcriptional regulator, TetR family  31.75 
 
 		 204 aa  96.3  3e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0499  transcriptional regulator, TetR family  33.73 
 
 		 201 aa  94.4  1e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.38098  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1666  transcriptional regulator, TetR family  33.14 
 
 		 209 aa  91.7  7e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.40268  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1807  transcriptional regulator, TetR family  32.29 
 
 		 199 aa  90.9  1e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.366594 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0748  transcriptional regulator, TetR family  29.26 
 
 		 194 aa  81.6  0.000000000000008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.866187  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1196  transcriptional regulator, TetR family  31.02 
 
 		 228 aa  73.9  0.000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  unclonable  0.000000002147  hitchhiker  0.00000600855 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2434  transcriptional regulator, TetR family  25.84 
 
 		 211 aa  56.6  0.0000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2304  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 211 aa  54.3  0.000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.373552  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2479  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 211 aa  54.3  0.000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.660065  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2575  transcriptional regulator, TetR family  24.76 
 
 		 211 aa  53.5  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000582548  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2272  TetR family transcriptional regulator  23.79 
 
 		 211 aa  52.8  0.000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000566042  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2800  transcriptional regulator, TetR family  24.04 
 
 		 206 aa  52.8  0.000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2500  transcriptional regulator, TetR family  23.79 
 
 		 211 aa  52.8  0.000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2226  TetR family transcriptional regulator  24.52 
 
 		 211 aa  52.4  0.000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0397604  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2734  putative transcriptional regulator, TetR family  28.24 
 
 		 206 aa  51.6  0.000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.596696  normal  0.79417 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0810  transcriptional regulator  23.43 
 
 		 206 aa  50.4  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.490663  normal  0.19914 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2692  TetR family transcriptional regulator  23.78 
 
 		 195 aa  50.1  0.00003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.728372  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2510  TetR family transcriptional regulator  23.44 
 
 		 209 aa  49.3  0.00004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00262483  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3240  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  21.94 
 
 		 213 aa  49.3  0.00004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.501766  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2285  TetR family transcriptional regulator  23.44 
 
 		 211 aa  49.3  0.00004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0118465  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1592  transcriptional regulator, TetR family  26.34 
 
 		 198 aa  48.9  0.00006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1071  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  21.43 
 
 		 213 aa  48.5  0.00008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0117133  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3046  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  24.12 
 
 		 216 aa  47.8  0.0001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.303422  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3066  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  21.24 
 
 		 218 aa  47.8  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.283852  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0805  TetR family transcriptional regulator  37.84 
 
 		 204 aa  47.8  0.0001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2881  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  21.24 
 
 		 218 aa  47.8  0.0001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.531949 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6827  putative transcriptional regulator, TetR family  26.17 
 
 		 200 aa  48.1  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0995041 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3206  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  21.24 
 
 		 218 aa  47.8  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21800  transcriptional regulator  28.67 
 
 		 265 aa  48.1  0.0001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.391718  normal  0.223847 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2564  TetR family transcriptional regulator  24.74 
 
 		 214 aa  47.4  0.0002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.454515 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1467  transcriptional regulator, TetR family  36.11 
 
 		 217 aa  47.4  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1365  transcriptional regulator  25.14 
 
 		 211 aa  47  0.0002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.575727 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6913  putative transcriptional regulator, TetR family  31.96 
 
 		 183 aa  47.4  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.128918  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0612  transcriptional regulator, TetR family  25.13 
 
 		 204 aa  47.4  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5073  transcriptional regulator TetR family  26.25 
 
 		 227 aa  47.4  0.0002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.479761  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0982  TetR family transcriptional regulator  24.73 
 
 		 193 aa  46.6  0.0003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0971  TetR family transcriptional regulator  24.73 
 
 		 193 aa  46.6  0.0003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0971  TetR family transcriptional regulator  24.73 
 
 		 193 aa  46.2  0.0003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1052  TetR family transcriptional regulator  24.73 
 
 		 193 aa  46.6  0.0003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5318  transcriptional regulator, TetR family  28.1 
 
 		 197 aa  46.2  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0104  TetR family transcriptional regulator  24.7 
 
 		 190 aa  46.6  0.0003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1156  TetR family transcriptional regulator  24.34 
 
 		 193 aa  45.8  0.0005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.813518  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4635  regulatory protein, TetR  31.76 
 
 		 226 aa  45.8  0.0005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3195  transcriptional regulator, TetR family  26.42 
 
 		 200 aa  45.8  0.0005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0974  TetR family transcriptional regulator  24.34 
 
 		 194 aa  45.4  0.0006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1217  transcriptional regulator, TetR family  24.86 
 
 		 193 aa  45.4  0.0006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0626  TetR family transcriptional regulator  25.77 
 
 		 199 aa  45.4  0.0007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3897  TetR family transcriptional regulator  27.08 
 
 		 213 aa  45.1  0.0008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1164  TetR family transcriptional regulator  33.78 
 
 		 184 aa  45.1  0.0008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00000872016  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0166  TetR family transcriptional regulator  26.86 
 
 		 193 aa  45.1  0.0008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.141555  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1067  TetR family transcriptional regulator  37.7 
 
 		 202 aa  45.1  0.0008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0103  TetR family transcriptional regulator  24.7 
 
 		 190 aa  45.1  0.0008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6365  putative transcriptional regulator, TetR family  22.94 
 
 		 210 aa  45.1  0.0009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.277737  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0856  TetR family transcriptional regulator  24.85 
 
 		 194 aa  45.1  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.257581  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4306  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 202 aa  44.3  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.651969  normal  0.688785 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1056  TetR family transcriptional regulator  30.12 
 
 		 205 aa  44.7  0.001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0248365  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2028  transcriptional regulator, TetR family  23.95 
 
 		 194 aa  44.3  0.001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.937171  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3905  TetR family transcriptional regulator  25.37 
 
 		 211 aa  44.7  0.001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4074  TetR family transcriptional regulator  24.12 
 
 		 194 aa  44.3  0.001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.137574 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1142  TetR family transcriptional regulator  25.43 
 
 		 210 aa  44.7  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.282615  normal  0.594609 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4218  TetR family transcriptional regulator  29.7 
 
 		 202 aa  44.7  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.135159  normal  1 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0056  transcriptional regulator, TetR family  27.22 
 
 		 198 aa  44.7  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0897  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 194 aa  43.9  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0955  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 194 aa  43.9  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0535  TetR family transcriptional regulator  39.62 
 
 		 217 aa  43.9  0.002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0588697 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3867  TetR family transcriptional regulator  25.28 
 
 		 225 aa  43.5  0.002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.53155  normal  0.151589 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2055  TetR family transcriptional regulator  24.43 
 
 		 206 aa  43.5  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4046  TetR family transcriptional regulator  23.74 
 
 		 212 aa  43.9  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0961065 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1858  TetR family transcriptional regulator  27.98 
 
 		 234 aa  43.9  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.543066  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4330  TetR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 235 aa  43.9  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1012  transcriptional regulator, TetR family  24.29 
 
 		 212 aa  43.9  0.002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.156612  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3236  transcriptional regulator, TetR family  25 
 
 		 194 aa  43.5  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0469246  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4844  transcriptional regulator, TetR family  27.23 
 
 		 252 aa  43.9  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1137  transcriptional regulator, TetR family  24.32 
 
 		 193 aa  43.9  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5813  transcriptional regulator, TetR family  24.85 
 
 		 243 aa  43.9  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.393234  hitchhiker  0.00386056 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0551  transcriptional regulator, TetR family  39.62 
 
 		 220 aa  43.9  0.002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0170  TetR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 192 aa  43.5  0.003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.652591  normal  0.659974 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3860  TetR family transcriptional regulator  23.91 
 
 		 236 aa  43.1  0.003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.195527  normal  0.716599 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0835  TetR family transcriptional regulator  27.03 
 
 		 201 aa  43.1  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.861936  normal  0.897725 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1128  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  22.09 
 
 		 227 aa  43.1  0.003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000181094 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6683  TetR family transcriptional regulator  22.93 
 
 		 207 aa  43.1  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6560  transcriptional regulator, TetR family  29.41 
 
 		 203 aa  43.1  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0915  TetR family transcriptional regulator  22.96 
 
 		 213 aa  43.1  0.003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0425  transcriptional regulator, TetR family  21.34 
 
 		 195 aa  43.1  0.003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.752712  normal  0.122961 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1088  transcriptional regulator, TetR family  24.32 
 
 		 193 aa  43.1  0.003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0452  transcriptional regulator, TetR family  22.75 
 
 		 207 aa  43.5  0.003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4217  transcriptional regulator, TetR family  24.32 
 
 		 193 aa  43.1  0.003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.152492 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>