More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Elen_0411 on replicon NC_013204
Organism: Eggerthella lenta DSM 2243



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013204  Elen_0411  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 196 aa  403  1.0000000000000001e-112  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.3269  hitchhiker  0.00212654 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1137  transcriptional regulator, TetR family  29.19 
 
 		 193 aa  76.3  0.0000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0971  TetR family transcriptional regulator  28.65 
 
 		 193 aa  74.7  0.0000000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0982  TetR family transcriptional regulator  28.11 
 
 		 193 aa  72.4  0.000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0971  TetR family transcriptional regulator  28.11 
 
 		 193 aa  72.4  0.000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1052  TetR family transcriptional regulator  28.11 
 
 		 193 aa  72.4  0.000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4217  transcriptional regulator, TetR family  28.49 
 
 		 193 aa  72.4  0.000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.152492 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1217  transcriptional regulator, TetR family  28.11 
 
 		 193 aa  70.9  0.00000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1088  transcriptional regulator, TetR family  26.49 
 
 		 193 aa  69.3  0.00000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0974  TetR family transcriptional regulator  27.89 
 
 		 194 aa  68.6  0.00000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1156  TetR family transcriptional regulator  27.03 
 
 		 193 aa  68.6  0.00000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.813518  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1697  hypothetical protein  24.87 
 
 		 199 aa  62  0.000000005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.280342 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4006  transcriptional regulator, TetR family  39.68 
 
 		 202 aa  61.6  0.000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05020  transcriptional regulator, TetR family  40.98 
 
 		 194 aa  60.1  0.00000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4171  TetR family transcriptional regulator  55.1 
 
 		 203 aa  60.1  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0201849  hitchhiker  0.000462956 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5186  transcriptional regulator, TetR family  27.74 
 
 		 185 aa  58.9  0.00000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.225373  normal  0.188797 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7448  transcriptional regulator, TetR family  27.81 
 
 		 212 aa  57.4  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.58477 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1381  transcriptional regulator, TetR family  37.33 
 
 		 184 aa  57.4  0.0000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.419771  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0477  TetR family transcriptional regulator  25.45 
 
 		 211 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.178939  normal  0.0289146 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3295  transcriptional regulator, TetR family  45.31 
 
 		 208 aa  57.4  0.0000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0817  TetR family transcriptional regulator  41.38 
 
 		 212 aa  57.4  0.0000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5638  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 238 aa  57  0.0000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.491763  normal  0.336395 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0788  TetR family transcriptional regulator  47.27 
 
 		 221 aa  56.6  0.0000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.796627 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4304  TetR family transcriptional regulator  49.02 
 
 		 202 aa  56.6  0.0000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.148025  normal  0.676238 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0266  TetR family transcriptional regulator  27.12 
 
 		 207 aa  56.2  0.0000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.437766  hitchhiker  0.000931508 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0314  TetR family transcriptional regulator  25.53 
 
 		 211 aa  55.8  0.0000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0057  multidrug efflux pump repressor protein BpeR  25.53 
 
 		 211 aa  55.8  0.0000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1017  repressor protein  25.53 
 
 		 211 aa  55.8  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2037  transcriptional regulator, TetR family  28.83 
 
 		 234 aa  55.8  0.0000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2113  transcriptional regulator, TetR family  36.27 
 
 		 207 aa  55.8  0.0000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.918403  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0857  multidrug efflux pump repressor protein BpeR  25.53 
 
 		 211 aa  55.8  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0609  multidrug efflux pump repressor protein BpeR  25.53 
 
 		 211 aa  55.8  0.0000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.780096  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2443  multidrug efflux pump repressor protein BpeR  25.53 
 
 		 211 aa  55.8  0.0000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0852  multidrug efflux pump repressor protein BpeR  25.53 
 
 		 211 aa  55.8  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1826  transcriptional regulator UidR  25 
 
 		 196 aa  55.5  0.0000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1805  transcriptional regulator UidR  25 
 
 		 196 aa  55.5  0.0000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.947665  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0679  TetR family transcriptional regulator  25.53 
 
 		 211 aa  55.5  0.0000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3493  TetR family transcriptional regulator  27.71 
 
 		 211 aa  55.1  0.0000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.729173  normal  0.75311 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01587  DNA-binding transcriptional repressor  25 
 
 		 196 aa  55.1  0.0000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1693  transcriptional regulator UidR  25 
 
 		 196 aa  55.1  0.0000007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2330  transcriptional regulator UidR  25 
 
 		 195 aa  55.1  0.0000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01577  hypothetical protein  25 
 
 		 196 aa  55.1  0.0000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.98021  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2012  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 196 aa  55.1  0.0000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.952906  normal  0.615913 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2024  transcriptional regulator, TetR family  25 
 
 		 192 aa  54.7  0.0000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.180766  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1581  transcriptional regulator UidR  25 
 
 		 192 aa  54.7  0.0000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0684  TetR family transcriptional regulator  39.19 
 
 		 213 aa  54.7  0.0000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.974708 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0376  TetR family transcriptional regulator  26.11 
 
 		 194 aa  54.7  0.0000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5412  TetR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 212 aa  54.7  0.0000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00435132  normal  0.234222 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3576  TetR-like virulence regulator  46.3 
 
 		 207 aa  53.9  0.000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2291  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 205 aa  54.3  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.857741  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3259  transcriptional regulator, TetR family  24.85 
 
 		 219 aa  53.9  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.147915  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1470  transcriptional regulator, TetR family  31.48 
 
 		 213 aa  53.9  0.000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.772741  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1502  transcriptional regulator, TetR family  45.83 
 
 		 195 aa  53.1  0.000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.385487  normal  0.318035 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26800  transcriptional regulator  35.44 
 
 		 184 aa  53.9  0.000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.463482  normal  0.288316 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2636  transcriptional regulator, TetR family  39.66 
 
 		 198 aa  53.9  0.000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3347  regulatory protein, TetR  46.3 
 
 		 205 aa  53.5  0.000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.235212  normal  0.0210246 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5488  TetR family transcriptional regulator  40.74 
 
 		 238 aa  53.9  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4062  transcriptional regulator, TetR family  30.56 
 
 		 216 aa  53.1  0.000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0166  TetR family transcriptional regulator  40.28 
 
 		 193 aa  53.1  0.000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.141555  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2067  TetR family transcriptional regulator  27.32 
 
 		 216 aa  53.5  0.000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0707  TetR family transcriptional regulator  25.61 
 
 		 219 aa  53.5  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1969  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 205 aa  53.9  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0320964 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3149  TetR family transcriptional regulator  51.06 
 
 		 233 aa  53.5  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2155  TetR family transcriptional regulator  45.61 
 
 		 195 aa  53.5  0.000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0726  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 203 aa  53.1  0.000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3714  transcriptional regulator, TetR family  42.11 
 
 		 226 aa  53.1  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.576002 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3416  transcriptional regulator, TetR family  42.11 
 
 		 226 aa  52.8  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.180038  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0119  TetR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 201 aa  52.8  0.000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  decreased coverage  0.00000000566826  decreased coverage  0.00000000000241144 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0441  TetR family transcriptional regulator  43.4 
 
 		 198 aa  52.8  0.000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.805705 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1944  TetR family transcriptional regulator  43.86 
 
 		 234 aa  53.1  0.000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.358022  decreased coverage  0.0015067 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3699  TetR family transcriptional regulator  39.53 
 
 		 204 aa  52.8  0.000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.158617  normal  0.554277 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3637  TetR family transcriptional regulator  27.98 
 
 		 228 aa  52.4  0.000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0322  transcriptional regulator, TetR family  36.36 
 
 		 223 aa  52.4  0.000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.541277 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5941  TetR family transcriptional regulator  26.51 
 
 		 213 aa  52.8  0.000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.272965 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0265  TetR family transcriptional regulator  40.38 
 
 		 200 aa  52.4  0.000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00630944 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6560  transcriptional regulator, TetR family  42.37 
 
 		 203 aa  52.4  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1087  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 215 aa  52.8  0.000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.9461  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3152  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  25 
 
 		 215 aa  52.8  0.000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7136  transcriptional regulator, TetR family  29.29 
 
 		 237 aa  52  0.000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00720754  normal  0.217815 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2796  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 231 aa  52  0.000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.252593 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2995  TetR family transcriptional regulator  48.94 
 
 		 211 aa  52  0.000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.428403  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2592  transcriptional regulator, TetR family  29.41 
 
 		 205 aa  52  0.000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000712719  hitchhiker  0.00165626 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2704  TetR family transcriptional regulator  43.14 
 
 		 203 aa  52  0.000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.187148 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0282  TetR family transcriptional regulator  28.38 
 
 		 201 aa  52  0.000006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.356366  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3324  regulatory protein, TetR  28.57 
 
 		 204 aa  51.6  0.000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0882884 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2169  transcriptional regulator, TetR family  25.93 
 
 		 207 aa  51.6  0.000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.821962  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0312  transcriptional regulator, TetR family  42.31 
 
 		 206 aa  51.6  0.000007  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000380117  normal  0.28635 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0503  TetR family transcriptional regulator  25.82 
 
 		 193 aa  51.6  0.000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0457  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 189 aa  51.6  0.000008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3950  TetR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 212 aa  51.6  0.000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.390353  normal  0.629082 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2755  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 200 aa  51.2  0.000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0191  transcriptional regulator, TetR family  41.82 
 
 		 243 aa  51.2  0.000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.00113557  decreased coverage  0.000257741 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2094  transcriptional regulator, TetR family  32.88 
 
 		 186 aa  50.8  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000324065 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0571  TetR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 200 aa  50.8  0.00001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.530829  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0290  TetR family transcriptional regulator  24.55 
 
 		 209 aa  50.4  0.00001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.547414  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0507  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  25 
 
 		 215 aa  50.8  0.00001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.480121  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0455  transcriptional regulator, TetR family  25.41 
 
 		 193 aa  50.4  0.00001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0937341  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1668  TetR family transcriptional regulator  37.74 
 
 		 204 aa  51.2  0.00001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0540  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  25 
 
 		 215 aa  50.8  0.00001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0027  TetR family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 209 aa  51.2  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.790094 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>