More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_0457 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009616  Tmel_0457  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 189 aa  370  1e-102  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1720  TetR family transcriptional regulator  32.32 
 
 		 200 aa  97.1  1e-19  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1778  TetR family transcriptional regulator  31.52 
 
 		 199 aa  96.3  2e-19  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0789135  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0191  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 210 aa  85.9  3e-16  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1444  transcriptional regulator, TetR family  28.43 
 
 		 225 aa  72.8  0.000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0101817  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3621  TetR family transcriptional regulator  29.15 
 
 		 203 aa  65.5  0.0000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.941769  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1939  transcriptional regulator, TetR family  31.34 
 
 		 206 aa  59.3  0.00000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.640559  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3101  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 230 aa  59.3  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.359837  normal  0.83525 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0081  transcriptional regulator, TetR family  28.66 
 
 		 211 aa  58.5  0.00000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0322  transcriptional regulator, TetR family  35.29 
 
 		 223 aa  58.5  0.00000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.541277 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4578  TetR family transcriptional regulator  39.19 
 
 		 238 aa  58.2  0.00000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.127543  normal  0.45553 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0683  TetR family transcriptional regulator  37.33 
 
 		 216 aa  57  0.0000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000557469  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4681  TetR family transcriptional regulator  45.61 
 
 		 283 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.433841  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1692  transcriptional regulator, TetR family  30.77 
 
 		 224 aa  57.4  0.0000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0186  TetR family transcriptional regulator  28.46 
 
 		 203 aa  56.6  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.625871  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1819  TetR family transcriptional regulator  28.46 
 
 		 203 aa  56.6  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.191224 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3796  TetR family transcriptional regulator  43.86 
 
 		 275 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.323175 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1027  transcriptional regulator, TetR family  32.17 
 
 		 201 aa  56.2  0.0000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0199  TetR family regulatory protein  26.5 
 
 		 214 aa  56.2  0.0000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3333  TetR family transcriptional regulator  32.17 
 
 		 201 aa  56.2  0.0000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0974  regulatory protein, TetR  40 
 
 		 205 aa  56.2  0.0000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1039  TetR family transcriptional regulator  32.17 
 
 		 201 aa  56.2  0.0000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.747573 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2085  transcriptional regulator, TetR family  43.64 
 
 		 210 aa  56.2  0.0000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3293  transcriptional regulator, TetR family  28.03 
 
 		 200 aa  55.5  0.0000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000151669  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3090  TetR family transcriptional regulator  37.33 
 
 		 218 aa  55.5  0.0000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.595832  hitchhiker  0.000923351 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3698  transcriptional regulator, TetR family  29.66 
 
 		 202 aa  55.1  0.0000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5720  TetR family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 291 aa  54.7  0.0000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.649137  normal  0.760569 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2292  intercellular adhesion regulator  26.63 
 
 		 185 aa  54.7  0.0000008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0364892  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0987  TetR family transcriptional regulator  36.92 
 
 		 195 aa  54.7  0.0000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.995143  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7226  putative transcriptional regulator, TetR family  44.44 
 
 		 209 aa  54.7  0.0000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.373834 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0175  TetR family transcriptional regulator  33.72 
 
 		 203 aa  53.9  0.000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1777  regulatory protein, TetR  28.81 
 
 		 202 aa  53.9  0.000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.26768  normal  0.308935 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8489  putative transcriptional regulator, TetR family  50 
 
 		 203 aa  54.3  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.280909  normal  0.379927 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4626  TetR family transcriptional regulator  26.26 
 
 		 212 aa  54.3  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.734291 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0286  TetR family transcriptional regulator  38.82 
 
 		 186 aa  53.9  0.000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2558  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 190 aa  54.3  0.000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4247  TetR family transcriptional regulator  26.26 
 
 		 212 aa  54.3  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0639864  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3277  TetR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 275 aa  54.3  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1006  TetR family transcriptional regulator  32.17 
 
 		 189 aa  54.3  0.000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4333  TetR family transcriptional regulator  26.26 
 
 		 212 aa  54.3  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.771402  normal  0.443044 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3054  TetR family transcriptional regulator  48.94 
 
 		 126 aa  53.5  0.000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0108952 
 
 
-
 
NC_003296  RS02063  putative transcription regulator transcription regulator protein  28.78 
 
 		 224 aa  53.5  0.000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0495626  normal  0.936254 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2456  transcriptional regulator, TetR family  30.43 
 
 		 211 aa  53.5  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0797268  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2767  TetR family transcriptional regulator  30.69 
 
 		 214 aa  53.1  0.000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0855812  normal  0.684751 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1805  TetR family transcriptional regulator  23.72 
 
 		 203 aa  53.1  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.386636  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3413  transcriptional regulator, TetR family  48.08 
 
 		 246 aa  53.1  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2226  TetR family transcriptional regulator  45.1 
 
 		 223 aa  53.5  0.000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.145555  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00759  transcriptional regulator, TetR family protein  30.97 
 
 		 224 aa  53.1  0.000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1824  TetR family transcriptional regulator  23.72 
 
 		 203 aa  53.1  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0882089  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11037  TetR family transcriptional regulator  25.14 
 
 		 197 aa  53.5  0.000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.102388  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47520  putative transcriptional regulator  39.29 
 
 		 197 aa  53.5  0.000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1871  TetR family transcriptional regulator  23.72 
 
 		 203 aa  53.1  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.516108  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1790  TetR family transcriptional regulator  37.8 
 
 		 220 aa  53.1  0.000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.536923  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0871  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 202 aa  52.8  0.000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3295  transcriptional regulator, TetR family  53.19 
 
 		 208 aa  52.8  0.000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1121  TetR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 221 aa  52.8  0.000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3527  TetR family transcriptional regulator  45.1 
 
 		 227 aa  52.4  0.000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0655225  normal  0.540257 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4065  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 193 aa  52.4  0.000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2190  TetR family transcriptional regulator  41.07 
 
 		 277 aa  52.4  0.000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.168858  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4464  TetR family transcriptional regulator  41.07 
 
 		 278 aa  52.4  0.000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3902  TetR family transcriptional regulator  41.07 
 
 		 278 aa  52.4  0.000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2247  TetR family transcriptional regulator  45.1 
 
 		 227 aa  52.4  0.000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3625  TetR family transcriptional regulator  41.07 
 
 		 278 aa  52.4  0.000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.662049  normal  0.863638 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3252  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 200 aa  52.4  0.000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2401  TetR family transcriptional regulator  45.1 
 
 		 223 aa  52  0.000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.853887 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5186  transcriptional regulator, TetR family  44.44 
 
 		 185 aa  52  0.000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.225373  normal  0.188797 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3860  TetR family transcriptional regulator  29.7 
 
 		 203 aa  52  0.000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.526451  normal  0.667209 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1774  TetR family transcriptional regulator  34.72 
 
 		 200 aa  52  0.000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3827  transcriptional regulator, TetR family  44.64 
 
 		 190 aa  52  0.000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0170  TetR family transcriptional regulator  30.88 
 
 		 192 aa  52  0.000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.652591  normal  0.659974 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0472  putative transcription regulator protein  25.66 
 
 		 213 aa  51.6  0.000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.19326  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0675  regulatory protein, TetR  37.68 
 
 		 220 aa  51.6  0.000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0111  transcriptional regulator, TetR family  38.18 
 
 		 207 aa  51.6  0.000006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.482364  normal  0.0755622 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1697  hypothetical protein  40.74 
 
 		 199 aa  52  0.000006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.280342 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1759  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 217 aa  52  0.000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5593  TetR family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 233 aa  51.6  0.000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.531399  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3151  TetR family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 202 aa  52  0.000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0868  transcriptional regulator, TetR family  41.79 
 
 		 222 aa  51.6  0.000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000000486929  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0411  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 196 aa  51.6  0.000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.3269  hitchhiker  0.00212654 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5697  TetR family transcriptional regulator  43.55 
 
 		 220 aa  51.6  0.000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.197583  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2983  TetR family transcriptional regulator  41.27 
 
 		 190 aa  51.6  0.000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3684  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 202 aa  51.2  0.000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0639  TetR family transcriptional regulator  37.68 
 
 		 220 aa  51.2  0.000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.307578  hitchhiker  0.000146714 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2249  transcriptional regulator, TetR family  32.14 
 
 		 228 aa  51.2  0.000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.115177  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4680  transcriptional regulator, TetR family  36.49 
 
 		 236 aa  51.2  0.000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2041  TetR family transcriptional regulator  27.56 
 
 		 211 aa  51.2  0.000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0362  transcriptional regulator, TetR family  28.16 
 
 		 213 aa  50.8  0.00001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0594  TetR family transcriptional regulator  36.23 
 
 		 247 aa  50.4  0.00001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0201579  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0771  transcriptional regulator, TetR family  36.23 
 
 		 218 aa  50.8  0.00001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.353788  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3104  TetR family transcriptional regulator  28.33 
 
 		 194 aa  50.8  0.00001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.428011 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1574  TetR family transcriptional regulator  28.71 
 
 		 203 aa  50.8  0.00001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.00597987  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3620  TetR family transcriptional regulator  28.71 
 
 		 203 aa  50.4  0.00001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3117  TetR family transcriptional regulator  43.4 
 
 		 248 aa  50.4  0.00001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0347  transcriptional regulator, TetR family  28.16 
 
 		 213 aa  50.8  0.00001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.421077  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1564  transcriptional regulator, TetR family  23.08 
 
 		 228 aa  50.8  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.127259  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1633  TetR family transcriptional regulator  35.05 
 
 		 210 aa  50.8  0.00001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.124131  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1128  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  36.11 
 
 		 227 aa  50.8  0.00001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000181094 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4973  TetR family transcriptional regulator  34.72 
 
 		 201 aa  50.4  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0231413  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4557  TetR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 199 aa  50.8  0.00001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03740  transcriptional regulator, TetR family  40.26 
 
 		 221 aa  50.8  0.00001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>