More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_1502 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011832  Mpal_1502  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 195 aa  403  1.0000000000000001e-112  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.385487  normal  0.318035 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1694  TetR family transcriptional regulator  30.27 
 
 		 219 aa  94  1e-18  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.0960426 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1535  transcriptional regulator, TetR family  27.57 
 
 		 204 aa  77  0.0000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1567  TetR family transcriptional regulator  27.72 
 
 		 202 aa  77  0.0000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.246189  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2740  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 230 aa  73.6  0.000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0291953  hitchhiker  0.000390237 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0191  transcriptional regulator, TetR family  39.18 
 
 		 243 aa  73.2  0.000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.00113557  decreased coverage  0.000257741 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1656  TetR family transcriptional regulator  30.37 
 
 		 196 aa  71.2  0.000000000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0515046  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0899  TetR family transcriptional regulator  27.75 
 
 		 193 aa  67  0.0000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.494549  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0726  transcriptional regulator, TetR family  41.54 
 
 		 203 aa  63.2  0.000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8390  putative transcriptional regulator, TetR family  29.55 
 
 		 222 aa  59.7  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1697  hypothetical protein  25.74 
 
 		 199 aa  59.7  0.00000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.280342 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0788  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 221 aa  58.9  0.00000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.796627 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4061  TetR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 240 aa  58.5  0.00000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01892  transcription regulator protein  35.48 
 
 		 207 aa  58.2  0.00000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00576188  normal  0.449964 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0033  TetR family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 256 aa  56.6  0.0000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0282  TetR family transcriptional regulator  25.93 
 
 		 201 aa  56.6  0.0000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.356366  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4672  TetR family transcriptional regulator  30.69 
 
 		 224 aa  55.8  0.0000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.959951  normal  0.170381 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11350  transcriptional regulator  47.92 
 
 		 220 aa  55.8  0.0000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3548  TetR family transcriptional regulator  36.05 
 
 		 216 aa  55.8  0.0000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0265  TetR family transcriptional regulator  35.53 
 
 		 194 aa  55.5  0.0000004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.250901  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1451  TetR family transcriptional regulator  31.68 
 
 		 224 aa  55.8  0.0000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1397  TetR family transcriptional regulator  31.68 
 
 		 224 aa  55.5  0.0000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.515474  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1415  TetR family transcriptional regulator  31.68 
 
 		 224 aa  55.5  0.0000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3721  transcriptional regulator, TetR family  39.22 
 
 		 260 aa  54.7  0.0000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.249433  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0013  TetR family transcriptional regulator  39.44 
 
 		 424 aa  54.7  0.0000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0542947  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1705  TetR family transcriptional regulator  23.58 
 
 		 203 aa  54.3  0.000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.164694  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0411  transcriptional regulator, TetR family  45.83 
 
 		 196 aa  53.1  0.000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.3269  hitchhiker  0.00212654 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2993  TetR family transcriptional regulator  26.55 
 
 		 206 aa  53.5  0.000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0068  transcriptional regulator, TetR family  30.56 
 
 		 185 aa  53.1  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.139926 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4897  TetR family transcriptional regulator  39.47 
 
 		 231 aa  53.9  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.043246  normal  0.757086 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4079  TetR family transcriptional regulator  37.25 
 
 		 244 aa  53.5  0.000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.780842  normal  0.246764 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3815  regulatory protein, TetR  37.25 
 
 		 252 aa  53.1  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00651597  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28930  transcriptional regulator  27.78 
 
 		 205 aa  53.5  0.000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.218384 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1473  TetR family transcriptional regulator  22.96 
 
 		 195 aa  53.1  0.000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1795  TetR family transcriptional regulator  31.46 
 
 		 224 aa  53.5  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.141886 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6397  TetR family transcriptional regulator  40.32 
 
 		 218 aa  52.8  0.000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.467706 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3449  TetR family transcriptional regulator  31 
 
 		 209 aa  53.1  0.000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.772262  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0309  transcriptional regulator, TetR family  26.19 
 
 		 213 aa  52.8  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.302465  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3421  transcriptional regulator, TetR family  23.61 
 
 		 223 aa  52.8  0.000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.288907  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0737  transcriptional regulator, TetR family  48.15 
 
 		 209 aa  52.8  0.000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11992  MarR family transcriptional regulator  26 
 
 		 406 aa  52.8  0.000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1496  transcriptional regulator, TetR family  39.29 
 
 		 206 aa  52.8  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4666  TetR family transcriptional regulator  47.17 
 
 		 214 aa  52.8  0.000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.441468  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1427  TetR family transcriptional regulator  23.53 
 
 		 204 aa  52.8  0.000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.286714  hitchhiker  0.000126282 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1426  transcriptional regulator, TetR family  28.87 
 
 		 204 aa  53.1  0.000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0803354  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1594  TetR family transcriptional regulator  25.57 
 
 		 210 aa  52.4  0.000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.000000000148614  unclonable  0.000000209189 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2134  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 219 aa  52.4  0.000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00399747  normal  0.0273951 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3744  transcriptional regulator, TetR family  23.61 
 
 		 223 aa  52.4  0.000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4304  TetR family transcriptional regulator  42.31 
 
 		 202 aa  52  0.000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.148025  normal  0.676238 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3714  transcriptional regulator, TetR family  28.38 
 
 		 226 aa  52  0.000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.576002 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0167  transcriptional regulator, TetR family  37.5 
 
 		 200 aa  52  0.000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6292  TetR family transcriptional regulator  38.18 
 
 		 210 aa  52  0.000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3459  TetR family transcriptional regulator  48.08 
 
 		 324 aa  51.6  0.000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000855252 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1993  TetR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 210 aa  51.6  0.000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.209055  normal  0.134866 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2366  TetR family transcriptional regulator  27.03 
 
 		 217 aa  51.6  0.000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.711286  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3923  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 214 aa  51.6  0.000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4446  TetR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 210 aa  51.6  0.000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2543  TetR family transcriptional regulator  27.03 
 
 		 217 aa  51.6  0.000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1843  transcriptional regulatory protein  23.7 
 
 		 201 aa  51.6  0.000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.677238  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1121  TetR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 210 aa  51.6  0.000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0496337  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4417  transcriptional regulator, TetR family  44.44 
 
 		 207 aa  51.2  0.000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2799  TetR family transcriptional regulator  46.94 
 
 		 217 aa  51.2  0.000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.364827  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3950  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 212 aa  51.2  0.000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.390353  normal  0.629082 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2636  transcriptional regulator, TetR family  45.28 
 
 		 198 aa  50.8  0.00001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1969  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 205 aa  50.4  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0320964 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0700  TetR family transcriptional regulator  36.07 
 
 		 178 aa  50.4  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.665559 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0194  transcriptional regulator, TetR family  44.83 
 
 		 225 aa  50.8  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3185  TetR family transcriptional regulator  45.28 
 
 		 208 aa  50.8  0.00001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.579993  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1120  transcriptional regulator, TetR family  30.53 
 
 		 223 aa  50.8  0.00001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.917457  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3241  TetR family transcriptional regulator  40.68 
 
 		 221 aa  50.8  0.00001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1944  TetR family transcriptional regulator  43.1 
 
 		 234 aa  50.8  0.00001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.358022  decreased coverage  0.0015067 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1703  TetR family transcriptional regulator  26.42 
 
 		 199 aa  51.2  0.00001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.188958  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1071  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  32.47 
 
 		 213 aa  50.1  0.00002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0117133  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3576  TetR-like virulence regulator  40.82 
 
 		 207 aa  50.1  0.00002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2324  TetR family transcriptional regulator  26.35 
 
 		 217 aa  50.1  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000190708  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1958  TetR family transcriptional regulator  34.41 
 
 		 251 aa  50.4  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.455038  normal  0.501183 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3562  TetR family transcriptional regulator  35.63 
 
 		 216 aa  50.1  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.137861 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6809  transcriptional regulator, TetR family  42 
 
 		 178 aa  50.1  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.318139  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6345  transcriptional regulator, TetR family  44.9 
 
 		 241 aa  50.1  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2436  TetR family transcriptional regulator  40.68 
 
 		 243 aa  50.4  0.00002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.747053 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2177  transcriptional regulator, TetR family  39.47 
 
 		 210 aa  50.1  0.00002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.480454  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6173  transcriptional regulator, TetR family  33.93 
 
 		 202 aa  50.4  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0557  regulatory protein TetR  37.93 
 
 		 251 aa  50.4  0.00002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3994  TetR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 391 aa  50.1  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.777734 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1098  TetR family transcriptional regulator  40.74 
 
 		 209 aa  50.1  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0976848 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1313  TetR family transcriptional regulator  25.49 
 
 		 203 aa  49.7  0.00003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1493  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 200 aa  49.7  0.00003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4588  transcriptional regulator, TetR family  37.74 
 
 		 206 aa  49.3  0.00003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.112472 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3347  regulatory protein, TetR  40.82 
 
 		 205 aa  49.7  0.00003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.235212  normal  0.0210246 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0024  TetR family transcriptional regulator  34.57 
 
 		 193 aa  49.7  0.00003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1759  transcriptional regulator, TetR family  28.89 
 
 		 217 aa  49.7  0.00003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1551  TetR family transcriptional regulator  37.88 
 
 		 227 aa  49.7  0.00003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.386957  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1071  TetR family transcriptional regulator  44 
 
 		 240 aa  49.3  0.00003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.457023 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1869  TetR family transcriptional regulator  43.33 
 
 		 215 aa  49.7  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4171  TetR family transcriptional regulator  35.59 
 
 		 203 aa  49.3  0.00003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0201849  hitchhiker  0.000462956 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0043  regulatory protein, TetR  39.29 
 
 		 211 aa  49.7  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27950  transcriptional regulator  35.23 
 
 		 207 aa  49.3  0.00003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00827834  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2718  transcriptional regulator, TetR family domain protein  27.97 
 
 		 198 aa  49.7  0.00003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.087281  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4366  transcriptional regulator, TetR family  28 
 
 		 211 aa  49.3  0.00003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.00655225  normal  0.460481 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1709  TetR family transcriptional regulator  41.51 
 
 		 224 aa  49.3  0.00003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.400859  normal  0.0301663 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>