More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_5412 on replicon NC_007974
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007974  Rmet_5412  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 212 aa  437  9.999999999999999e-123  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00435132  normal  0.234222 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4635  regulatory protein, TetR  71.73 
 
 		 226 aa  297  9e-80  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3380  regulatory protein, TetR  57.44 
 
 		 222 aa  241  3.9999999999999997e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.386273  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2028  transcriptional regulator, TetR family  37.36 
 
 		 194 aa  59.7  0.00000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.937171  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1535  transcriptional regulator, TetR family  22.92 
 
 		 204 aa  57  0.0000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1567  TetR family transcriptional regulator  30.15 
 
 		 202 aa  56.2  0.0000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.246189  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0425  transcriptional regulator, TetR family  27.59 
 
 		 195 aa  55.8  0.0000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.752712  normal  0.122961 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0005  TetR family transcriptional regulator  28.78 
 
 		 195 aa  55.5  0.0000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0931339  normal  0.381518 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5720  TetR family transcriptional regulator  31.21 
 
 		 291 aa  55.5  0.0000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.649137  normal  0.760569 
 
 
-
 
NC_013167  Cyan8802_4614  transcriptional regulator, TetR family  24.08 
 
 		 191 aa  55.1  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2692  TetR family transcriptional regulator  35.38 
 
 		 195 aa  54.7  0.0000009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.728372  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2856  TetR family transcriptional regulator  25.32 
 
 		 194 aa  55.1  0.0000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.661308  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4171  TetR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 203 aa  54.7  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0201849  hitchhiker  0.000462956 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0411  transcriptional regulator, TetR family  31.58 
 
 		 196 aa  54.7  0.000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.3269  hitchhiker  0.00212654 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3739  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 210 aa  53.5  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.461772  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5637  TetR family transcriptional regulator  36.78 
 
 		 220 aa  53.5  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.766944 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0219  regulatory protein, TetR  39.06 
 
 		 211 aa  53.5  0.000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3812  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 210 aa  53.5  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.246252 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2430  transcriptional regulator, TetR family  28.96 
 
 		 207 aa  53.1  0.000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.466149 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3751  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 210 aa  53.1  0.000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3720  transcriptional regulator, TetR family  28.74 
 
 		 200 aa  52.8  0.000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.91394  normal  0.0177543 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1499  TetR family transcriptional regulator  26.78 
 
 		 203 aa  52.4  0.000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0951967  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2838  transcriptional regulator, TetR family  31.36 
 
 		 183 aa  52.4  0.000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3684  TetR family transcriptional regulator  24.24 
 
 		 202 aa  52  0.000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0301  transcriptional regulator, TetR family  24.18 
 
 		 199 aa  52  0.000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0864199  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2636  transcriptional regulator, TetR family  28.7 
 
 		 198 aa  51.6  0.000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5621  transcriptional regulator, TetR family  26.67 
 
 		 195 aa  51.6  0.000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00254336 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2089  transcriptional regulator, TetR family  26.16 
 
 		 220 aa  51.2  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0021127  n/a   
 
 
-
 
NC_011721  PCC8801_4458  transcriptional regulator, TetR family  23.2 
 
 		 195 aa  50.8  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1014  TetR family transcriptional regulator  32.67 
 
 		 212 aa  50.8  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4417  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 207 aa  51.2  0.00001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7118  putative transcriptional regulator, TetR family  27.68 
 
 		 186 aa  51.2  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0105564  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2800  TetR family transcriptional regulator  30.91 
 
 		 201 aa  51.2  0.00001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4204  TetR family transcriptional regulator  31.5 
 
 		 213 aa  51.2  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2630  TetR family transcriptional regulator  33.65 
 
 		 205 aa  50.8  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0697093  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1056  TetR family transcriptional regulator  23.7 
 
 		 205 aa  50.1  0.00002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0248365  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0817  TetR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 332 aa  50.8  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2650  transcriptional regulator, TetR family  23.74 
 
 		 211 aa  50.1  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02619  transcriptional regulator  33.7 
 
 		 217 aa  50.8  0.00002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0023  transcriptional regulator, TetR family  25.14 
 
 		 205 aa  50.1  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3341  transcriptional regulator, TetR family  41.38 
 
 		 226 aa  50.4  0.00002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4813  TetR family transcriptional regulator  38.57 
 
 		 223 aa  50.4  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4649  transcriptional regulator, TetR family  25.71 
 
 		 186 aa  50.8  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.490512  normal  0.521268 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1709  TetR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 224 aa  49.7  0.00003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.400859  normal  0.0301663 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3775  transcriptional regulator, TetR family  27.89 
 
 		 224 aa  49.3  0.00004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5264  transcriptional regulator, TetR family  31.87 
 
 		 470 aa  48.9  0.00005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.641699  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1935  transcriptional regulator, TetR family  26.74 
 
 		 233 aa  48.5  0.00006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4231  transcriptional regulator, TetR family  30.08 
 
 		 191 aa  48.9  0.00006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2000  TetR family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 234 aa  48.9  0.00006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.920156  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2610  TetR family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 234 aa  48.9  0.00006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.341012  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5045  transcriptional regulator, TetR family  40.62 
 
 		 208 aa  48.5  0.00007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.301448 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4604  transcriptional regulator, TetR family  34.38 
 
 		 255 aa  48.5  0.00007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2388  TetR family transcriptional regulator  31.73 
 
 		 206 aa  48.5  0.00007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0915  TetR family transcriptional regulator  29.29 
 
 		 213 aa  48.5  0.00007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0412  TetR family transcriptional regulator  22.78 
 
 		 212 aa  48.5  0.00008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.417244  normal  0.216002 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4114  TetR family transcriptional regulator  29.27 
 
 		 191 aa  48.1  0.00009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3955  TetR family transcriptional regulator  29.27 
 
 		 191 aa  48.1  0.00009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.915843  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2977  transcriptional regulator, TetR family  35.71 
 
 		 196 aa  48.1  0.00009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4434  TetR family transcriptional regulator  29.27 
 
 		 191 aa  48.1  0.00009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1058  TetR family transcriptional regulator  31.75 
 
 		 187 aa  48.1  0.00009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1074  TetR family transcriptional regulator  31.75 
 
 		 187 aa  48.1  0.00009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.220175  normal  0.111345 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2032  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 213 aa  48.1  0.00009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.44645  normal  0.684987 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04039  hypothetical protein  22.82 
 
 		 215 aa  48.1  0.0001  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000282396  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3801  TetR family transcriptional regulator  22.82 
 
 		 215 aa  47.8  0.0001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000000675626  normal  0.64863 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1756  transcriptional regulator, TetR family  34.85 
 
 		 205 aa  48.1  0.0001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000229906 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2580  TetR family transcriptional regulator  24.14 
 
 		 211 aa  47.8  0.0001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.257801 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0974  regulatory protein, TetR  27.86 
 
 		 205 aa  48.1  0.0001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1059  transcriptional regulator, TetR family  24.43 
 
 		 188 aa  47.8  0.0001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0356  transcriptional regulator, TetR family  30 
 
 		 235 aa  47.8  0.0001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00145185  hitchhiker  0.0000223354 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4304  TetR family transcriptional regulator  32.79 
 
 		 202 aa  47.8  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.148025  normal  0.676238 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6560  transcriptional regulator, TetR family  38.78 
 
 		 203 aa  47.8  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4455  TetR family transcriptional regulator  22.82 
 
 		 215 aa  47.8  0.0001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  1.10893e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1085  TetR family transcriptional regulator  31.75 
 
 		 187 aa  47.8  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.973817  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1515  putative transcriptional regulator, TetR family  42.86 
 
 		 219 aa  47.8  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.254086  hitchhiker  0.00363064 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2447  TetR family transcriptional regulator  28.8 
 
 		 208 aa  47.8  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3060  TetR family transcriptional regulator  31.11 
 
 		 230 aa  48.1  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0482313 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3694  TetR family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 222 aa  47.8  0.0001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0184  TetR family transcriptional regulator  34.25 
 
 		 335 aa  47.4  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000505732  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1543  TetR family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 238 aa  47  0.0002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.176522 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2226  TetR family transcriptional regulator  34.25 
 
 		 210 aa  47  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0810  transcriptional regulator, TetR family  38.89 
 
 		 268 aa  47.4  0.0002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3856  transcriptional regulator, TetR family  29.21 
 
 		 199 aa  47  0.0002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1955  transcriptional regulator, TetR family  32.43 
 
 		 202 aa  47  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.22623  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0153  TetR family transcriptional regulator  40.38 
 
 		 193 aa  47  0.0002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2497  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 201 aa  47  0.0002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.55388 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1293  TetR family transcriptional regulator  35.94 
 
 		 213 aa  47.4  0.0002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.313328  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4067  TetR family transcriptional regulator  28.46 
 
 		 191 aa  47.4  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.200915  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1976  putative transcriptional regulator, TetR family  34.48 
 
 		 181 aa  47  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2639  TetR family transcriptional regulator  29.09 
 
 		 213 aa  47  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3482  TetR family transcriptional regulator  35.62 
 
 		 248 aa  47.4  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0660414  normal  0.032442 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3407  transcriptional regulator, TetR family  40.82 
 
 		 178 aa  47  0.0002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5460  TetR family transcriptional regulator  31.73 
 
 		 206 aa  47  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10308  TetR/AcrR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 210 aa  47.4  0.0002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000336223  normal  0.125099 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1548  TetR family transcriptional regulator  23.21 
 
 		 206 aa  47  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3699  TetR family transcriptional regulator  38.16 
 
 		 204 aa  47.4  0.0002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.158617  normal  0.554277 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1694  TetR family transcriptional regulator  26.19 
 
 		 219 aa  47  0.0002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.0960426 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1023  transcriptional regulator, TetR family  37.5 
 
 		 269 aa  47.4  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.048156  normal  0.0140553 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1382  transcriptional regulator, TetR family  32.63 
 
 		 204 aa  46.6  0.0003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.117773  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0662  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 205 aa  46.6  0.0003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4165  TetR family transcriptional regulator  31.93 
 
 		 232 aa  46.2  0.0003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.367589  normal  0.612517 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>