More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_0023 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_0023  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 205 aa  414  9.999999999999999e-116  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1492  putative transcriptional regulator, TetR family  47.87 
 
 		 216 aa  178  4.999999999999999e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8769  putative transcriptional regulator, TetR family  40.43 
 
 		 202 aa  154  7e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2766  regulatory protein, TetR  39.13 
 
 		 198 aa  143  2e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.597397  hitchhiker  0.0084658 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3882  transcriptional regulator, TetR family  44.09 
 
 		 190 aa  143  2e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2679  transcriptional regulator, TetR family  38.17 
 
 		 210 aa  132  3e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.569392  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5621  transcriptional regulator, TetR family  35.26 
 
 		 195 aa  131  6.999999999999999e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00254336 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3751  putative transcriptional regulator, TetR family  37.77 
 
 		 178 aa  107  1e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0636766  normal  0.384261 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10333  TetR/AcrR family transcriptional regulator  31.5 
 
 		 200 aa  93.6  2e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22250  transcriptional regulator  32.76 
 
 		 196 aa  82.8  0.000000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0446991  normal  0.543201 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5669  regulatory protein TetR  46.67 
 
 		 190 aa  60.1  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1523  TetR family transcriptional regulator  29.01 
 
 		 200 aa  59.7  0.00000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000120489 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1574  regulatory protein, TetR  29.01 
 
 		 200 aa  58.2  0.00000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.979673 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4464  TetR family transcriptional regulator  38.75 
 
 		 204 aa  57.8  0.0000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0680244 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4533  TetR family transcriptional regulator  33.61 
 
 		 218 aa  56.6  0.0000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.505005  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2304  TetR family transcriptional regulator  23.94 
 
 		 211 aa  55.5  0.0000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.373552  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2479  TetR family transcriptional regulator  23.94 
 
 		 211 aa  55.5  0.0000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.660065  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1173  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 189 aa  55.1  0.0000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2510  TetR family transcriptional regulator  24.65 
 
 		 209 aa  54.3  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00262483  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0355  transcriptional regulator, TetR family  28.12 
 
 		 195 aa  54.3  0.000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0306  TetR family transcriptional regulator  27.42 
 
 		 219 aa  54.3  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0641939  normal  0.172302 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2272  TetR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 211 aa  53.1  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000566042  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2226  TetR family transcriptional regulator  23.94 
 
 		 211 aa  53.5  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0397604  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2002  TetR family transcriptional regulator  30.69 
 
 		 191 aa  53.9  0.000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0595533  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2500  transcriptional regulator, TetR family  31.03 
 
 		 211 aa  53.1  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3711  transcriptional regulator, TetR family  47.06 
 
 		 220 aa  53.5  0.000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1742  transcriptional regulator, TetR family  27.03 
 
 		 235 aa  53.1  0.000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.666045  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3211  regulatory protein, TetR  47.06 
 
 		 221 aa  52.4  0.000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.878438  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0949  transcriptional regulator, TetR family  32.69 
 
 		 286 aa  52.4  0.000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2575  transcriptional regulator, TetR family  22.54 
 
 		 211 aa  52.4  0.000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000582548  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10080  Transcriptional regulator, TetR family  24.31 
 
 		 217 aa  52  0.000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.530554  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2175  TetR family transcriptional regulator  27.84 
 
 		 214 aa  52  0.000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.595394  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1543  TetR family transcriptional regulator  39.34 
 
 		 238 aa  51.6  0.000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.176522 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23110  transcriptional regulator  37.5 
 
 		 203 aa  51.6  0.000008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2067  TetR family transcriptional regulator  34.31 
 
 		 216 aa  51.6  0.000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3731  TetR family transcriptional regulator  27.84 
 
 		 214 aa  51.2  0.00001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1586  TetR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 215 aa  51.2  0.00001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.377059  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1588  TetR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 235 aa  51.2  0.00001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.472704 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0092  transcriptional regulator, TetR family  25.26 
 
 		 207 aa  50.8  0.00001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00302716  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6365  putative transcriptional regulator, TetR family  30.39 
 
 		 210 aa  51.2  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.277737  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5106  TetR family transcriptional regulator  46 
 
 		 223 aa  51.2  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.146428  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2032  TetR family transcriptional regulator  27.84 
 
 		 214 aa  51.2  0.00001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.874631  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2153  transcriptional regulator PsrA  38.1 
 
 		 233 aa  50.8  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.64739  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0744  regulatory protein TetR  38.81 
 
 		 191 aa  51.2  0.00001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25180  transcriptional regulator PsrA  38.1 
 
 		 233 aa  50.8  0.00001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0008  transcriptional regulator, TetR family  39.74 
 
 		 195 aa  50.8  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.643837 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2666  TetR family transcriptional regulator  38.57 
 
 		 213 aa  50.1  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3598  TetR family transcriptional regulator  37.1 
 
 		 235 aa  50.1  0.00002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.153473  normal  0.929745 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2259  TetR family transcriptional regulator  45.1 
 
 		 221 aa  50.1  0.00002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.289727  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5412  TetR family transcriptional regulator  25.14 
 
 		 212 aa  50.1  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00435132  normal  0.234222 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1684  TetR family transcriptional regulator  37.1 
 
 		 235 aa  50.4  0.00002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.46279  normal  0.0995016 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4041  TetR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 182 aa  50.8  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.449289  normal  0.0505107 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0876  TetR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 226 aa  50.1  0.00002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.140831 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0382  TetR family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 242 aa  50.1  0.00002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.894324  normal  0.190078 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1938  TetR family transcriptional regulator  36.92 
 
 		 225 aa  50.4  0.00002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2144  TetR family transcriptional regulator  37.1 
 
 		 235 aa  49.7  0.00003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0903799 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3517  trancscriptional regulator MtrR, putative  27.5 
 
 		 197 aa  49.7  0.00003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.178393  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1660  TetR family transcriptional regulator  37.1 
 
 		 235 aa  49.7  0.00003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.903697  normal  0.835101 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3871  TetR family transcriptional regulator  36.51 
 
 		 235 aa  49.7  0.00003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0560  transcriptional regulator, TetR family  36.51 
 
 		 208 aa  50.1  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2880  TetR family transcriptional regulator  38.36 
 
 		 195 aa  49.7  0.00003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4259  regulatory protein TetR  29.66 
 
 		 208 aa  49.3  0.00004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.344931  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2158  transcriptional regulator, TetR family  42.86 
 
 		 244 aa  49.3  0.00004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3508  TetR family transcriptional regulator  34.74 
 
 		 227 aa  49.3  0.00004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.343043  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0707  TetR family transcriptional regulator  43.1 
 
 		 219 aa  49.3  0.00004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1958  TetR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 251 aa  48.9  0.00005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.455038  normal  0.501183 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1982  transcriptional regulator, TetR family  44.9 
 
 		 209 aa  48.9  0.00005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.142001  hitchhiker  0.0000322137 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2285  TetR family transcriptional regulator  22.86 
 
 		 211 aa  48.5  0.00006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0118465  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3323  TetR family transcriptional regulator  43.48 
 
 		 227 aa  48.5  0.00006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.481358  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3353  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 195 aa  48.5  0.00006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1044  TetR family transcriptional regulator  32.56 
 
 		 180 aa  48.5  0.00006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0206033 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3259  transcriptional regulator, TetR family  44.64 
 
 		 219 aa  48.5  0.00006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.147915  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40790  putative transcriptional regulator  35.21 
 
 		 193 aa  48.5  0.00006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3054  TetR family transcriptional regulator  35.82 
 
 		 126 aa  48.5  0.00006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0108952 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6235  transcriptional regulator, TetR family  38.89 
 
 		 230 aa  48.5  0.00006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.319409  normal  0.706195 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4873  transcriptional regulator, TetR family  38.89 
 
 		 193 aa  48.5  0.00006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3878  transcriptional regulator, TetR family  33.04 
 
 		 196 aa  48.5  0.00007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0129032  normal  0.838393 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4147  TetR family transcriptional regulator  33.75 
 
 		 234 aa  48.5  0.00007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2269  putative transcriptional regulator  42.11 
 
 		 207 aa  48.5  0.00007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.629172  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3159  putative transcriptional regulator, TetR family  28.42 
 
 		 221 aa  48.5  0.00007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.251281  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3459  putative transcriptional regulator  35.21 
 
 		 193 aa  48.5  0.00007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.429515  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26760  putative transcriptional regulator  42.11 
 
 		 198 aa  48.5  0.00007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2434  transcriptional regulator, TetR family  21.99 
 
 		 211 aa  48.5  0.00007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00620  Transcriptional regulatory protein, TetR family  41.67 
 
 		 227 aa  48.5  0.00007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3899  TetR family transcriptional regulator  41.07 
 
 		 247 aa  48.5  0.00007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0449568  normal  0.0930409 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3508  transcriptional regulator PsrA  37.1 
 
 		 238 aa  48.5  0.00008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1017  repressor protein  43.1 
 
 		 211 aa  48.1  0.00008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0857  multidrug efflux pump repressor protein BpeR  43.1 
 
 		 211 aa  48.1  0.00008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11503  transcriptional regulator  44.9 
 
 		 187 aa  48.1  0.00008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.243571 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0106  transcriptional regulator, TetR family  39.06 
 
 		 242 aa  48.1  0.00008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.180704  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0353  transcriptional regulator, TetR family  36.23 
 
 		 191 aa  48.1  0.00008  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000439096  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2744  TetR family transcriptional regulator  43.14 
 
 		 187 aa  48.1  0.00008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.184508  normal  0.510089 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0852  multidrug efflux pump repressor protein BpeR  43.1 
 
 		 211 aa  48.1  0.00008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0314  TetR family transcriptional regulator  43.1 
 
 		 211 aa  48.1  0.00009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0057  multidrug efflux pump repressor protein BpeR  43.1 
 
 		 211 aa  48.1  0.00009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0679  TetR family transcriptional regulator  43.1 
 
 		 211 aa  48.1  0.00009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2443  multidrug efflux pump repressor protein BpeR  43.1 
 
 		 211 aa  48.1  0.00009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3664  regulatory protein, TetR  29.91 
 
 		 182 aa  48.1  0.00009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0609  multidrug efflux pump repressor protein BpeR  43.1 
 
 		 211 aa  48.1  0.00009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.780096  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01897  transcriptional regulator, TetR family protein  36.51 
 
 		 207 aa  47.8  0.0001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0111118  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>