More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_2679 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_2679  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 210 aa  425  1e-118  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.569392  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2766  regulatory protein, TetR  63.3 
 
 		 198 aa  237  9e-62  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.597397  hitchhiker  0.0084658 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1492  putative transcriptional regulator, TetR family  40.93 
 
 		 216 aa  158  5e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8769  putative transcriptional regulator, TetR family  43.75 
 
 		 202 aa  147  2.0000000000000003e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0023  transcriptional regulator, TetR family  38.17 
 
 		 205 aa  132  3e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22250  transcriptional regulator  42.19 
 
 		 196 aa  129  4.0000000000000003e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0446991  normal  0.543201 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10333  TetR/AcrR family transcriptional regulator  39.69 
 
 		 200 aa  121  8e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3882  transcriptional regulator, TetR family  39.36 
 
 		 190 aa  116  3e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3751  putative transcriptional regulator, TetR family  36.41 
 
 		 178 aa  110  2.0000000000000002e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0636766  normal  0.384261 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5621  transcriptional regulator, TetR family  32.45 
 
 		 195 aa  107  2e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00254336 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5669  regulatory protein TetR  35.93 
 
 		 190 aa  82.4  0.000000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1938  TetR family transcriptional regulator  32.28 
 
 		 225 aa  59.7  0.00000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1511  TetR family transcriptional regulator  34.74 
 
 		 273 aa  59.3  0.00000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.752097  hitchhiker  0.00148325 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1055  TetR family transcriptional regulator  34.74 
 
 		 273 aa  59.3  0.00000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1535  TetR family transcriptional regulator  34.74 
 
 		 273 aa  59.3  0.00000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4675  TetR family transcriptional regulator  34.74 
 
 		 273 aa  58.5  0.00000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.104564 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1982  transcriptional regulator, TetR family  41.77 
 
 		 209 aa  58.2  0.00000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.142001  hitchhiker  0.0000322137 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3483  TetR family transcriptional regulator  30.87 
 
 		 218 aa  57.4  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.961452  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1275  TetR family transcriptional regulator  33.68 
 
 		 318 aa  57  0.0000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.033456  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0133  TetR family transcriptional regulator  33.68 
 
 		 318 aa  57  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.221572  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1719  transcriptional regulator, TetR family  28.91 
 
 		 196 aa  56.6  0.0000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1958  TetR family transcriptional regulator  33.68 
 
 		 316 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00062632  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5106  TetR family transcriptional regulator  47.17 
 
 		 223 aa  57.4  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.146428  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1805  TetR family transcriptional regulator  33.68 
 
 		 316 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.754817  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1784  TetR family transcriptional regulator  33.68 
 
 		 316 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.261379  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2528  TetR family transcriptional regulator  33.68 
 
 		 317 aa  57  0.0000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0660251  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1789  TetR family transcriptional regulator  38.81 
 
 		 210 aa  57  0.0000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.461504  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3211  regulatory protein, TetR  47.17 
 
 		 221 aa  56.6  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.878438  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1033  TetR family transcriptional regulator  33.68 
 
 		 318 aa  57  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.781792  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2050  TetR family transcriptional regulator  34.09 
 
 		 212 aa  57  0.0000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00274298  normal  0.196014 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1925  TetR family transcriptional regulator  34.09 
 
 		 212 aa  57  0.0000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00396712  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2155  TetR family transcriptional regulator  34.09 
 
 		 212 aa  57  0.0000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.116273  normal  0.663988 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1457  TetR family transcriptional regulator  33.68 
 
 		 276 aa  57  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.166824  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1719  TetR family transcriptional regulator  33.68 
 
 		 272 aa  57  0.0000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.7573  hitchhiker  0.00027252 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1762  TetR family transcriptional regulator  33.68 
 
 		 318 aa  57  0.0000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0114483  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1807  TetR family transcriptional regulator  38.64 
 
 		 218 aa  56.2  0.0000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.237257  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1417  TetR family transcriptional regulator  33.68 
 
 		 272 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.702279  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4362  TetR family transcriptional regulator  27.95 
 
 		 228 aa  55.8  0.0000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0699129  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2126  TetR family transcriptional regulator  38.03 
 
 		 212 aa  56.2  0.0000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00345057  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2171  TetR family transcriptional regulator  38.03 
 
 		 212 aa  56.2  0.0000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.068169  normal  0.22854 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2258  transcriptional regulator, TetR family  38.03 
 
 		 212 aa  56.2  0.0000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.968255  hitchhiker  0.0010637 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2052  TetR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 212 aa  56.2  0.0000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00634978  normal  0.379689 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2245  TetR family transcriptional regulator  38.03 
 
 		 212 aa  56.2  0.0000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2493  TetR family transcriptional regulator  32.22 
 
 		 239 aa  55.5  0.0000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4531  hypothetical protein  38.03 
 
 		 227 aa  55.8  0.0000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3324  TetR family transcriptional regulator  23.43 
 
 		 212 aa  55.5  0.0000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.272078  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14520  Transcriptional regulator PsrA  38.57 
 
 		 239 aa  55.8  0.0000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3711  transcriptional regulator, TetR family  45.28 
 
 		 220 aa  55.5  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1862  TetR family transcriptional regulator  47.06 
 
 		 213 aa  55.1  0.0000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1684  TetR family transcriptional regulator  26.83 
 
 		 227 aa  55.1  0.0000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2543  TetR family transcriptional regulator  47.06 
 
 		 211 aa  55.1  0.0000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.214617 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1816  TetR family transcriptional regulator  47.06 
 
 		 228 aa  55.1  0.0000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0241637  normal  0.594701 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2259  TetR family transcriptional regulator  45.28 
 
 		 221 aa  54.7  0.0000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.289727  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2116  regulatory protein, TetR  47.06 
 
 		 214 aa  54.7  0.0000009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000000093152  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2069  TetR family transcriptional regulator  35.16 
 
 		 219 aa  54.7  0.0000009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.118237  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2066  TetR family transcriptional regulator  47.06 
 
 		 211 aa  54.7  0.0000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.612632  hitchhiker  0.000107098 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1067  TetR family transcriptional regulator  25.91 
 
 		 202 aa  54.3  0.000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1888  transcriptional regulator, TetR family protein  47.06 
 
 		 213 aa  54.7  0.000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2339  TetR family transcriptional regulator  47.06 
 
 		 215 aa  54.7  0.000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.519522  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0446  TetR family transcriptional regulator  29.12 
 
 		 220 aa  53.9  0.000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.73057 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1598  TetR family transcriptional regulator  43.86 
 
 		 239 aa  53.9  0.000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.235097  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1586  TetR family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 215 aa  53.5  0.000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.377059  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1684  TetR family transcriptional regulator  36.51 
 
 		 235 aa  53.5  0.000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.46279  normal  0.0995016 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3282  regulatory protein, TetR  36.51 
 
 		 238 aa  53.9  0.000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2129  TetR family transcriptional regulator  37.68 
 
 		 229 aa  53.9  0.000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.101154  normal  0.382383 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2546  transcriptional regulator, TetR family  29.84 
 
 		 207 aa  53.5  0.000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1588  TetR family transcriptional regulator  35.06 
 
 		 235 aa  53.5  0.000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.472704 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2144  TetR family transcriptional regulator  36.51 
 
 		 235 aa  53.1  0.000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0903799 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3711  transcriptional regulator, TetR family  38.71 
 
 		 207 aa  53.1  0.000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.644349  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1660  TetR family transcriptional regulator  36.51 
 
 		 235 aa  53.1  0.000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.903697  normal  0.835101 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0170  TetR family transcriptional regulator  47.06 
 
 		 233 aa  53.1  0.000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000323068 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01897  transcriptional regulator, TetR family protein  31.88 
 
 		 207 aa  53.1  0.000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0111118  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3598  TetR family transcriptional regulator  36.51 
 
 		 235 aa  53.1  0.000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.153473  normal  0.929745 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2779  transcriptional regulator, TetR family  28.24 
 
 		 185 aa  53.1  0.000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.441306  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1543  TetR family transcriptional regulator  34.85 
 
 		 238 aa  52.4  0.000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.176522 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3508  transcriptional regulator PsrA  34.92 
 
 		 238 aa  52.4  0.000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0316  putative transcriptional regulator, TetR family  30.15 
 
 		 211 aa  52.4  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3871  TetR family transcriptional regulator  34.92 
 
 		 235 aa  52  0.000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1742  transcriptional regulator, TetR family  35.09 
 
 		 235 aa  51.6  0.000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.666045  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3036  regulatory protein, TetR  27.57 
 
 		 216 aa  52  0.000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0300267  normal  0.0658454 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2153  transcriptional regulator PsrA  40 
 
 		 233 aa  51.2  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.64739  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5804  TetR family transcriptional regulator  28.86 
 
 		 254 aa  51.2  0.00001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000000100556  hitchhiker  0.000892453 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3750  TetR family transcriptional regulator  30.95 
 
 		 230 aa  50.8  0.00001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25180  transcriptional regulator PsrA  40 
 
 		 233 aa  51.2  0.00001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1814  transcriptional regulator, TetR family  30.21 
 
 		 216 aa  50.1  0.00002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4464  TetR family transcriptional regulator  30.06 
 
 		 204 aa  50.8  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0680244 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2917  TetR family transcriptional regulator  44.23 
 
 		 218 aa  50.4  0.00002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02639  transcriptional regulator  41.18 
 
 		 208 aa  50.4  0.00002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5954  TetR family transcriptional regulator  28.99 
 
 		 206 aa  50.4  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.419182  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3323  TetR family transcriptional regulator  35.44 
 
 		 227 aa  50.8  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.481358  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0744  regulatory protein TetR  39.39 
 
 		 191 aa  50.4  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2773  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 295 aa  50.8  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00136461  normal  0.297144 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3964  TetR family transcriptional regulator  28.99 
 
 		 206 aa  50.4  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4403  TetR family transcriptional regulator  28.99 
 
 		 206 aa  50.4  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.504175 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003766  predicted transcriptional regulator for fatty acid degradation FadQ TetR family  41.18 
 
 		 214 aa  50.8  0.00002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1173  TetR family transcriptional regulator  22.96 
 
 		 189 aa  50.1  0.00002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0266  TetR family transcriptional regulator  26.52 
 
 		 207 aa  49.7  0.00003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.437766  hitchhiker  0.000931508 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1028  transcriptional regulator, TetR family  31.65 
 
 		 200 aa  49.7  0.00003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0479484  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2022  transcriptional regulator, TetR family  22.06 
 
 		 225 aa  50.1  0.00003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.613149  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0421  transcriptional regulator, TetR family  29.17 
 
 		 198 aa  50.1  0.00003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>