56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_5669 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013739  Cwoe_5669  regulatory protein TetR  100 
 
 		 190 aa  366  1e-100  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3882  transcriptional regulator, TetR family  39.41 
 
 		 190 aa  88.2  7e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2766  regulatory protein, TetR  33.87 
 
 		 198 aa  84  0.000000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.597397  hitchhiker  0.0084658 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2679  transcriptional regulator, TetR family  35.93 
 
 		 210 aa  82.4  0.000000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.569392  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8769  putative transcriptional regulator, TetR family  30.11 
 
 		 202 aa  74.7  0.0000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22250  transcriptional regulator  34.36 
 
 		 196 aa  74.7  0.0000000000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0446991  normal  0.543201 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1492  putative transcriptional regulator, TetR family  30.05 
 
 		 216 aa  67  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10333  TetR/AcrR family transcriptional regulator  30.81 
 
 		 200 aa  66.6  0.0000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5621  transcriptional regulator, TetR family  30.05 
 
 		 195 aa  64.3  0.000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00254336 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0023  transcriptional regulator, TetR family  46.67 
 
 		 205 aa  60.1  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3751  putative transcriptional regulator, TetR family  32.08 
 
 		 178 aa  51.2  0.000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0636766  normal  0.384261 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2175  TetR family transcriptional regulator  28.99 
 
 		 214 aa  48.5  0.00006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.595394  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3731  TetR family transcriptional regulator  28.99 
 
 		 214 aa  48.1  0.00007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2032  TetR family transcriptional regulator  28.99 
 
 		 214 aa  47.4  0.0001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.874631  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1798  TetR family transcriptional regulator  21.79 
 
 		 194 aa  46.6  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5058  TetR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 213 aa  46.2  0.0003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2052  TetR family transcriptional regulator  32.46 
 
 		 212 aa  46.2  0.0003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00634978  normal  0.379689 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1601  TetR family transcriptional regulator  21.23 
 
 		 194 aa  45.4  0.0004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.105676  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1725  TetR family transcriptional regulator  21.23 
 
 		 194 aa  45.8  0.0004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1775  transcriptional regulator, TetR family  21.23 
 
 		 194 aa  45.8  0.0004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1173  TetR family transcriptional regulator  29.58 
 
 		 189 aa  45.8  0.0004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1553  TetR family transcriptional regulator  21.23 
 
 		 194 aa  45.4  0.0005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4477  TetR family transcriptional regulator  34.72 
 
 		 208 aa  45.1  0.0006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.47529  normal  0.773196 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2823  transcriptional regulator, TetR family  40.38 
 
 		 208 aa  45.1  0.0006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.00548665  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3212  TetR family transcriptional regulator  26.98 
 
 		 213 aa  43.9  0.001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.402928  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1989  hypothetical protein  41.94 
 
 		 226 aa  43.9  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  decreased coverage  0.00163154  normal  0.392807 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4464  TetR family transcriptional regulator  41.94 
 
 		 204 aa  43.9  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0680244 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1982  transcriptional regulator, TetR family  48.48 
 
 		 209 aa  44.3  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.142001  hitchhiker  0.0000322137 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2070  transcriptional regulator BetI  24.84 
 
 		 202 aa  43.9  0.001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3469  TetR family transcriptional regulator  41.51 
 
 		 258 aa  43.5  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2259  TetR family transcriptional regulator  52.27 
 
 		 221 aa  43.1  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.289727  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2158  transcriptional regulator, TetR family  47.62 
 
 		 244 aa  43.1  0.002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0555  transcriptional regulator BetI  27.04 
 
 		 194 aa  43.5  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3211  regulatory protein, TetR  52.27 
 
 		 221 aa  42.7  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.878438  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2609  TetR family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 194 aa  42.7  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000163063  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38620  hypothetical protein  37.04 
 
 		 186 aa  42.7  0.003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6235  transcriptional regulator, TetR family  38.81 
 
 		 230 aa  42.7  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.319409  normal  0.706195 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3257  transcriptional regulator, TetR family protein  38 
 
 		 195 aa  42.4  0.004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.696599 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5106  TetR family transcriptional regulator  53.85 
 
 		 223 aa  42.4  0.004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.146428  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3711  transcriptional regulator, TetR family  53.85 
 
 		 220 aa  42  0.005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2514  TetR family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 191 aa  42.4  0.005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.348132 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3483  TetR family transcriptional regulator  58.62 
 
 		 218 aa  42  0.005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.961452  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3270  transcriptional regulator BetI  27.04 
 
 		 194 aa  42  0.006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5098  transcriptional regulator BetI  27.04 
 
 		 194 aa  42  0.006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2410  transcriptional regulator, TetR family  33.75 
 
 		 214 aa  41.6  0.006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0794  transcriptional regulator, TetR family  48.72 
 
 		 221 aa  42  0.006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5184  transcriptional regulator BetI  27.04 
 
 		 194 aa  42  0.006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.14696  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0560  transcriptional regulator, TetR family  30.3 
 
 		 208 aa  41.6  0.007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02720  transcriptional regulator, tetR family  31.14 
 
 		 211 aa  41.6  0.007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.460979  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4259  regulatory protein TetR  43.18 
 
 		 208 aa  41.6  0.007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.344931  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3149  TetR family transcriptional regulator  31.97 
 
 		 205 aa  41.6  0.007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2543  TetR family transcriptional regulator  29.35 
 
 		 211 aa  41.6  0.008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.214617 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2617  TetR family transcriptional regulator  40.74 
 
 		 207 aa  41.2  0.009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.923721  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4510  transcriptional regulator BetI  26.42 
 
 		 194 aa  41.2  0.01  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01897  transcriptional regulator, TetR family protein  33.33 
 
 		 207 aa  41.2  0.01  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0111118  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5035  transcriptional regulator BetI  26.42 
 
 		 194 aa  41.2  0.01  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.496722  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>