More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcer98_3324 on replicon NC_009674
Organism: Bacillus cytotoxicus NVH 391-98



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009674  Bcer98_3324  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 212 aa  435  1e-121  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.272078  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4396  TetR family transcriptional regulator  83.49 
 
 		 212 aa  377  1e-104  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4386  TetR family transcriptional regulator  83.49 
 
 		 212 aa  376  1e-103  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0474  transcriptional regulator, TetR family  83.02 
 
 		 212 aa  375  1e-103  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.542957  hitchhiker  4.20035e-18 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4770  transcriptional regulator, TetR family  83.49 
 
 		 212 aa  377  1e-103  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4787  transcriptional regulator, TetR family  83.02 
 
 		 212 aa  374  1e-103  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0422575  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4789  transcriptional regulator  82.08 
 
 		 212 aa  370  1e-102  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4761  transcriptional regulator, TetR family  82.55 
 
 		 212 aa  372  1e-102  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.107387  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4482  TetR family transcriptional regulator  80.66 
 
 		 212 aa  366  1e-100  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4551  transcriptional regulator, N-terminus  83.5 
 
 		 112 aa  182  3e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4550  transcriptional regulator, C-terminus  81.25 
 
 		 96 aa  170  1e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4259  regulatory protein TetR  28.82 
 
 		 208 aa  68.9  0.00000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.344931  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2022  transcriptional regulator, TetR family  32.72 
 
 		 225 aa  68.2  0.00000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.613149  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4901  TetR family transcriptional regulator  26.89 
 
 		 209 aa  67.8  0.0000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1586  TetR family transcriptional regulator  38.04 
 
 		 215 aa  64.3  0.000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.377059  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3411  transcriptional regulator, TetR family  53.85 
 
 		 206 aa  62.4  0.000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.945663  normal  0.0722688 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2576  TetR family transcriptional regulator  31.48 
 
 		 233 aa  62.4  0.000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2643  TetR family transcriptional regulator  31.48 
 
 		 233 aa  62.4  0.000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10333  TetR/AcrR family transcriptional regulator  34.15 
 
 		 200 aa  62  0.000000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7226  putative transcriptional regulator, TetR family  24.74 
 
 		 209 aa  61.6  0.000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.373834 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1862  TetR family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 213 aa  60.8  0.00000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5720  TetR family transcriptional regulator  36.14 
 
 		 291 aa  61.2  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.649137  normal  0.760569 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2811  putative DNA-binding transcriptional regulator  32.17 
 
 		 236 aa  60.1  0.00000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2899  putative DNA-binding transcriptional regulator  32.17 
 
 		 236 aa  60.1  0.00000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2561  transcriptional regulator, TetR family  44.07 
 
 		 203 aa  60.1  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0170  TetR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 233 aa  60.1  0.00000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000323068 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4301  transcriptional regulator, TetR family  23.56 
 
 		 221 aa  60.1  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1650  TetR family transcriptional regulator  27.59 
 
 		 196 aa  59.3  0.00000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00305011  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1731  TetR family transcriptional regulator  21.79 
 
 		 199 aa  59.3  0.00000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.206322 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1888  transcriptional regulator, TetR family protein  28.26 
 
 		 213 aa  59.7  0.00000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3104  TetR family transcriptional regulator  27.54 
 
 		 194 aa  58.9  0.00000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.428011 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1807  TetR family transcriptional regulator  28.68 
 
 		 218 aa  58.9  0.00000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.237257  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0560  transcriptional regulator, TetR family  29.94 
 
 		 208 aa  58.9  0.00000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4630  TetR family transcriptional regulator  27.38 
 
 		 206 aa  58.9  0.00000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.110827  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3684  TetR family transcriptional regulator  23.91 
 
 		 202 aa  58.9  0.00000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1867  transcriptional regulator, TetR family  27.11 
 
 		 201 aa  58.5  0.00000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.129849  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5593  TetR family transcriptional regulator  37.66 
 
 		 233 aa  58.9  0.00000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.531399  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2712  TetR family transcriptional regulator  24.32 
 
 		 206 aa  58.5  0.00000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1987  TetR family transcriptional regulator  25.84 
 
 		 210 aa  58.2  0.00000009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2155  TetR family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 212 aa  58.2  0.00000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.116273  normal  0.663988 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2050  TetR family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 212 aa  58.2  0.00000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00274298  normal  0.196014 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1925  TetR family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 212 aa  58.2  0.00000009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00396712  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2144  TetR family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 235 aa  57.8  0.0000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0903799 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3598  TetR family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 235 aa  57.8  0.0000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.153473  normal  0.929745 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1684  TetR family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 235 aa  57.4  0.0000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.46279  normal  0.0995016 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00759  transcriptional regulator, TetR family protein  27.97 
 
 		 224 aa  57.8  0.0000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2493  TetR family transcriptional regulator  28.74 
 
 		 239 aa  57.8  0.0000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2153  transcriptional regulator PsrA  33.33 
 
 		 233 aa  58.2  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.64739  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2834  transcriptional regulator, TetR family  27.16 
 
 		 233 aa  57.4  0.0000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.170846  normal  0.770206 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1006  TetR family transcriptional regulator  22.3 
 
 		 189 aa  58.2  0.0000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25180  transcriptional regulator PsrA  35.14 
 
 		 233 aa  57.8  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1660  TetR family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 235 aa  57.4  0.0000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.903697  normal  0.835101 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1027  transcriptional regulator, TetR family  21.58 
 
 		 201 aa  57.4  0.0000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1512  TetR family transcriptional regulator  27.16 
 
 		 233 aa  57.4  0.0000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3508  transcriptional regulator PsrA  36.49 
 
 		 238 aa  57.4  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2126  TetR family transcriptional regulator  28.44 
 
 		 212 aa  57.4  0.0000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00345057  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0666  transcriptional regulator  48.15 
 
 		 205 aa  57.4  0.0000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0813  AcrR/TetR family transcription regulator  27.61 
 
 		 227 aa  57  0.0000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2216  TetR family transcriptional regulator  26.06 
 
 		 189 aa  57  0.0000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.191802  normal  0.0189795 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2245  TetR family transcriptional regulator  28.44 
 
 		 212 aa  57.4  0.0000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2171  TetR family transcriptional regulator  28.44 
 
 		 212 aa  57.4  0.0000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.068169  normal  0.22854 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1521  TetR family transcriptional regulator  27.16 
 
 		 233 aa  57.4  0.0000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01897  transcriptional regulator, TetR family protein  47.06 
 
 		 207 aa  57  0.0000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0111118  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1548  TetR family transcriptional regulator  27.16 
 
 		 233 aa  57.4  0.0000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1039  TetR family transcriptional regulator  21.43 
 
 		 201 aa  57.4  0.0000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.747573 
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4531  hypothetical protein  28.44 
 
 		 227 aa  57.4  0.0000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2258  transcriptional regulator, TetR family  28.44 
 
 		 212 aa  57.4  0.0000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.968255  hitchhiker  0.0010637 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1419  TetR family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 232 aa  57.4  0.0000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0424  transcriptional regulator, TetR family  31.73 
 
 		 201 aa  56.2  0.0000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.315635  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3282  regulatory protein, TetR  35.14 
 
 		 238 aa  56.6  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003766  predicted transcriptional regulator for fatty acid degradation FadQ TetR family  35.82 
 
 		 214 aa  56.6  0.0000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2751  TetR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 232 aa  56.6  0.0000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3871  TetR family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 235 aa  56.6  0.0000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0817  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 332 aa  56.2  0.0000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3796  TetR family transcriptional regulator  36.96 
 
 		 275 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.323175 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3333  TetR family transcriptional regulator  21.58 
 
 		 201 aa  56.6  0.0000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2080  TetR family transcriptional regulator  29.01 
 
 		 219 aa  56.6  0.0000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.740876  hitchhiker  0.00831587 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0928  TetR family transcriptional regulator  25.48 
 
 		 461 aa  56.2  0.0000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000384359  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4128  TetR family transcriptional regulator  32.93 
 
 		 241 aa  56.2  0.0000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.860792 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28060  transcriptional regulator  35.21 
 
 		 204 aa  56.2  0.0000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.633688  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1330  putative DNA-binding transcriptional regulator  30.51 
 
 		 232 aa  55.8  0.0000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.745262  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0125  transcriptional regulator, TetR family  22.17 
 
 		 204 aa  55.8  0.0000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.247519  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2630  TetR family transcriptional regulator  25.62 
 
 		 205 aa  55.8  0.0000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0697093  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02639  transcriptional regulator  35.82 
 
 		 208 aa  55.8  0.0000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2679  transcriptional regulator, TetR family  23.43 
 
 		 210 aa  55.5  0.0000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.569392  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4186  TetR family transcriptional regulator  38.2 
 
 		 195 aa  55.5  0.0000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2129  TetR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 229 aa  55.8  0.0000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.101154  normal  0.382383 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1938  TetR family transcriptional regulator  34.25 
 
 		 225 aa  55.8  0.0000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1588  TetR family transcriptional regulator  35.21 
 
 		 235 aa  55.5  0.0000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.472704 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1341  TetR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 224 aa  55.5  0.0000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3172  transcriptional regulator, TetR family  33.71 
 
 		 198 aa  55.1  0.0000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2983  TetR family transcriptional regulator  22.46 
 
 		 190 aa  55.1  0.0000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14520  Transcriptional regulator PsrA  33.33 
 
 		 239 aa  55.1  0.0000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2052  TetR family transcriptional regulator  28.7 
 
 		 212 aa  55.1  0.0000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00634978  normal  0.379689 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1169  transcriptional regulator, TetR family  23.08 
 
 		 214 aa  55.1  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4520  regulatory protein TetR  30.22 
 
 		 228 aa  55.1  0.0000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3981  transcriptional regulator, TetR family  25.28 
 
 		 198 aa  54.7  0.0000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000890193 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3548  TetR family transcriptional regulator  25.15 
 
 		 216 aa  54.7  0.0000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2924  TetR family transcriptional regulator  29.1 
 
 		 235 aa  54.7  0.0000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.480778  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3681  TetR family transcriptional regulator  47.92 
 
 		 234 aa  54.7  0.0000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>