More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_4362 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_4362  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 228 aa  467  1.0000000000000001e-131  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0699129  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1684  TetR family transcriptional regulator  53.42 
 
 		 227 aa  249  3e-65  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1704  TetR family transcriptional regulator  49.53 
 
 		 285 aa  214  9.999999999999999e-55  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0517004  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0556  TetR family transcriptional regulator  43.66 
 
 		 228 aa  204  1e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3099  TetR family transcriptional regulator  36.45 
 
 		 222 aa  160  1e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.296713  normal  0.219943 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0161  TetR family transcriptional regulator  37.07 
 
 		 221 aa  159  3e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3421  transcriptional regulator, TetR family  32.97 
 
 		 205 aa  111  9e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4438  transcriptional regulator, TetR family  32.93 
 
 		 477 aa  103  3e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.829211  normal  0.875845 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4328  transcriptional regulator, TetR family  32.93 
 
 		 477 aa  103  3e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0701267  normal  0.0216349 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1498  TetR family transcriptional regulator  29.94 
 
 		 183 aa  100  2e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.548232  normal  0.295378 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6386  regulatory protein, TetR  35.22 
 
 		 510 aa  92.8  4e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6862  TetR family transcriptional regulator  25.95 
 
 		 224 aa  72.8  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000147849  normal  0.19991 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4623  TetR family transcriptional regulator  24.84 
 
 		 213 aa  72  0.000000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.317667  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6831  TetR family transcriptional regulator  26.35 
 
 		 223 aa  68.9  0.00000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.1423  normal  0.362364 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4168  TetR family transcriptional regulator  25.47 
 
 		 244 aa  67.4  0.0000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0511823  normal  0.17991 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0959  TetR family transcriptional regulator  25.88 
 
 		 225 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2766  regulatory protein, TetR  29.01 
 
 		 198 aa  60.5  0.00000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.597397  hitchhiker  0.0084658 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1775  transcriptional regulator, TetR family  29.45 
 
 		 207 aa  59.7  0.00000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6843  TetR family transcriptional regulator  23.12 
 
 		 236 aa  59.3  0.00000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.163651  normal  0.317864 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4820  transcriptional regulator, TetR family  28.21 
 
 		 203 aa  58.5  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.353068 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2751  putative transcriptional regulator, TetR family  28.05 
 
 		 229 aa  58.5  0.00000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0359606 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22250  transcriptional regulator  26.35 
 
 		 196 aa  57  0.0000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0446991  normal  0.543201 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1277  transcriptional regulator, TetR family  28.24 
 
 		 211 aa  57.4  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0101868  normal  0.0726815 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2679  transcriptional regulator, TetR family  27.95 
 
 		 210 aa  55.8  0.0000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.569392  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0452  transcriptional regulator, TetR family  28.05 
 
 		 207 aa  55.1  0.0000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2779  transcriptional regulator, TetR family  23.42 
 
 		 185 aa  54.7  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.441306  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1768  TetR family transcriptional regulator  32.85 
 
 		 211 aa  53.9  0.000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.570427  normal  0.275415 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1591  TetR family transcriptional regulator  27.13 
 
 		 215 aa  53.1  0.000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.194821 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0604  TetR family transcriptional regulator  27.69 
 
 		 205 aa  52.8  0.000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.229279 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2481  TetR family transcriptional regulator  26.8 
 
 		 231 aa  53.1  0.000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02513  transcriptional regulator, TetR family protein  26.23 
 
 		 214 aa  52.8  0.000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3134  TetR family transcriptional regulator  25.71 
 
 		 220 aa  52.4  0.000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.471149  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1067  transcriptional regulator, TetR family  27.12 
 
 		 212 aa  52  0.000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.530116 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3570  transcriptional regulator, TetR family  38.81 
 
 		 175 aa  52  0.000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00083347  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3363  TetR family transcriptional regulator  38.67 
 
 		 244 aa  51.6  0.000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0676561  hitchhiker  0.0000000000000226443 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35350  transcriptional regulator, TetR family  42.86 
 
 		 223 aa  51.6  0.000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.147408 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3227  transcriptional regulator, TetR family  26.27 
 
 		 204 aa  51.6  0.000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4350  TetR family transcriptional regulator  22.67 
 
 		 225 aa  51.6  0.000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1834  transcriptional regulator, TetR family  28.7 
 
 		 196 aa  50.8  0.00001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.353647 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3149  TetR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 205 aa  51.2  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1359  TetR family transcriptional regulator  43.1 
 
 		 218 aa  51.2  0.00001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3359  transcriptional regulator, TetR family  44.44 
 
 		 192 aa  51.2  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000478711  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5293  TetR family transcriptional regulator  30.09 
 
 		 210 aa  51.2  0.00001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.199638  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5031  TetR family transcriptional regulator  22.67 
 
 		 258 aa  51.2  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0201359  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8111  putative transcriptional regulator, TetR family  37.31 
 
 		 168 aa  51.6  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1135  TetR family transcriptional regulator  24.05 
 
 		 206 aa  51.2  0.00001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3277  TetR family transcriptional regulator  41.27 
 
 		 275 aa  51.2  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4681  TetR family transcriptional regulator  39.68 
 
 		 283 aa  51.2  0.00001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.433841  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5829  TetR family transcriptional regulator  22.67 
 
 		 258 aa  51.2  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2644  putative transcriptional regulator, TetR family  32.61 
 
 		 205 aa  50.4  0.00002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2502  transcriptional regulator, TetR family  27.47 
 
 		 291 aa  50.8  0.00002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3796  TetR family transcriptional regulator  39.68 
 
 		 275 aa  50.8  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.323175 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4464  TetR family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 204 aa  50.8  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0680244 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3088  transcriptional regulator of TetR family protein  21.05 
 
 		 198 aa  50.8  0.00002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.119848 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1734  TetR family transcriptional regulator  28.9 
 
 		 207 aa  50.4  0.00002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0246488  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1636  TetR family transcriptional regulator  35.64 
 
 		 226 aa  50.4  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.232227 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3035  transcriptional regulator, TetR family  39.06 
 
 		 225 aa  50.1  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.489456  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0410  TetR family transcriptional regulator  23.08 
 
 		 245 aa  49.7  0.00003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.560758  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27500  transcriptional regulator  41.38 
 
 		 214 aa  50.1  0.00003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3625  TetR family transcriptional regulator  39.68 
 
 		 278 aa  50.1  0.00003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.662049  normal  0.863638 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0177  TetR family transcriptional regulator  24.22 
 
 		 208 aa  49.7  0.00003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.775643 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2767  TetR family transcriptional regulator  44.9 
 
 		 225 aa  50.1  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.284138 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1499  TetR family transcriptional regulator  34.85 
 
 		 203 aa  50.1  0.00003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0951967  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4464  TetR family transcriptional regulator  39.68 
 
 		 278 aa  50.1  0.00003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3902  TetR family transcriptional regulator  39.68 
 
 		 278 aa  50.1  0.00003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3290  transcriptional regulator, TetR family  38.46 
 
 		 225 aa  50.1  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.413178  normal  0.0802991 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3888  transcriptional regulator, TetR family  31.94 
 
 		 206 aa  49.7  0.00004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.693202 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0186  TetR family transcriptional regulator  40.98 
 
 		 203 aa  49.7  0.00004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.625871  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3500  transcriptional regulator, TetR family  26.11 
 
 		 209 aa  49.3  0.00004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00016281 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05020  transcriptional regulator, TetR family  40.98 
 
 		 194 aa  49.3  0.00004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1139  TetR family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 220 aa  49.7  0.00004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0501486 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1819  TetR family transcriptional regulator  40.98 
 
 		 203 aa  49.7  0.00004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.191224 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3685  transcriptional regulator, TetR family  23.03 
 
 		 199 aa  49.7  0.00004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0280  TetR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 227 aa  49.3  0.00005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.980178  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2799  TetR family transcriptional regulator  32.65 
 
 		 217 aa  49.3  0.00005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.364827  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0294  TetR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 227 aa  49.3  0.00005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.136884  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2796  TetR family transcriptional regulator  25.14 
 
 		 178 aa  49.3  0.00005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.117516  normal  0.243308 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0999  transcriptional regulator, TetR family  25.14 
 
 		 178 aa  49.3  0.00005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.252522 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0786  transcriptional regulator, TetR family  30.63 
 
 		 202 aa  49.3  0.00005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.536081  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4264  transcriptional regulator, TetR family  34.21 
 
 		 189 aa  49.3  0.00005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2365  TetR family transcriptional regulator  36.92 
 
 		 213 aa  49.3  0.00005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.227272  normal  0.96994 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0918  TetR family transcriptional regulator  25.14 
 
 		 178 aa  49.3  0.00005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1768  TetR family transcriptional regulator  25.6 
 
 		 181 aa  49.3  0.00005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0908345  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2499  transcriptional regulator, TetR family  25.14 
 
 		 178 aa  49.3  0.00005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0811  transcriptional regulator, TetR family  29.22 
 
 		 194 aa  48.9  0.00006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.646976  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1516  transcriptional regulator BetI  23.9 
 
 		 197 aa  49.3  0.00006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.026336  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3905  TetR family transcriptional regulator  25.75 
 
 		 211 aa  48.9  0.00006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2800  transcriptional regulator, TetR family  29.53 
 
 		 206 aa  48.9  0.00006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19310  hypothetical protein  25.36 
 
 		 215 aa  48.9  0.00006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0818404  normal  0.200215 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4103  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 215 aa  48.9  0.00006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0350269  normal  0.346351 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1337  TetR family transcriptional regulator  24.57 
 
 		 182 aa  48.9  0.00006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.143088 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3766  transcriptional regulator, TetR family  45.61 
 
 		 237 aa  48.5  0.00007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4873  transcriptional regulator, TetR family  38.71 
 
 		 193 aa  48.5  0.00007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2152  transcriptional regulator, TetR family  26.79 
 
 		 185 aa  48.9  0.00007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4691  TetR family transcriptional regulator  32.22 
 
 		 205 aa  48.9  0.00007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.771858  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1121  TetR family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 221 aa  48.5  0.00007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4777  TetR family transcriptional regulator  32.22 
 
 		 205 aa  48.9  0.00007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.681727  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16270  transcriptional regulator  28.57 
 
 		 287 aa  48.5  0.00008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0282  TetR family transcriptional regulator  25.9 
 
 		 201 aa  48.5  0.00008  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.356366  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5076  TetR family transcriptional regulator  32.22 
 
 		 215 aa  48.5  0.00008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.175697 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>