More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_0811 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_0811  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 194 aa  371  1e-102  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.646976  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1493  transcriptional regulator, TetR family  39.16 
 
 		 198 aa  95.5  5e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.127102 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5076  TetR family transcriptional regulator  35.63 
 
 		 209 aa  85.5  5e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5784  TetR family transcriptional regulator  35.63 
 
 		 209 aa  85.5  5e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.907377 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4394  TetR family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 198 aa  83.2  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3781  TetR family transcriptional regulator  32.16 
 
 		 214 aa  72.4  0.000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7672  TetR family transcriptional regulator  28.14 
 
 		 198 aa  68.6  0.00000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.245363  normal  0.688993 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5773  TetR family transcriptional regulator  27.54 
 
 		 198 aa  68.6  0.00000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6138  TetR family transcriptional regulator  27.54 
 
 		 198 aa  68.6  0.00000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.890581 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1591  TetR family transcriptional regulator  36.42 
 
 		 215 aa  68.6  0.00000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.194821 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0452  transcriptional regulator, TetR family  31.52 
 
 		 207 aa  65.9  0.0000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2962  TetR family transcriptional regulator  30.64 
 
 		 201 aa  64.7  0.0000000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1777  regulatory protein, TetR  33.12 
 
 		 202 aa  62  0.000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.26768  normal  0.308935 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1843  transcriptional regulatory protein  32.76 
 
 		 201 aa  61.6  0.000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.677238  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2226  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 210 aa  61.2  0.000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4003  transcriptional regulator, TetR family  29.65 
 
 		 242 aa  60.5  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3958  transcriptional regulator, TetR family  29.65 
 
 		 242 aa  60.5  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3101  TetR family transcriptional regulator  30.59 
 
 		 230 aa  60.8  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.359837  normal  0.83525 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5928  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 215 aa  59.3  0.00000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.511087  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1061  transcriptional regulator, TetR family  30.82 
 
 		 196 aa  59.3  0.00000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0250707  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6166  putative transcriptional regulator, TetR family  32.9 
 
 		 197 aa  58.9  0.00000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.42038  normal  0.0100509 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3698  transcriptional regulator, TetR family  31.85 
 
 		 202 aa  58.5  0.00000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6580  transcriptional regulator, TetR family  31.65 
 
 		 242 aa  58.5  0.00000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.603144 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4313  transcriptional regulator, TetR family  35.14 
 
 		 238 aa  58.5  0.00000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0455  TetR family transcriptional regulator  33.54 
 
 		 224 aa  58.5  0.00000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.366206  normal  0.106872 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0018  TetR family transcriptional regulator  26.54 
 
 		 196 aa  57.4  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1419  TetR family transcriptional regulator  29.46 
 
 		 220 aa  57.8  0.0000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4306  TetR family transcriptional regulator  32.89 
 
 		 202 aa  57.8  0.0000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.651969  normal  0.688785 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3426  putative transcriptional regulator  32.96 
 
 		 216 aa  56.6  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3720  transcriptional regulator, TetR family  31.21 
 
 		 225 aa  55.8  0.0000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.984063  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2442  transcriptional regulator, TetR family  47.95 
 
 		 218 aa  56.2  0.0000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.510523  normal  0.120027 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4426  TetR family transcriptional regulator  29.56 
 
 		 210 aa  55.8  0.0000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.062473  normal  0.279059 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40380  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 216 aa  56.2  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3562  TetR family transcriptional regulator  31.06 
 
 		 216 aa  55.8  0.0000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.137861 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4280  transcriptional regulator, TetR family  30.34 
 
 		 203 aa  55.8  0.0000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.409841  normal  0.686522 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0679  TetR family transcriptional regulator  28.07 
 
 		 211 aa  55.5  0.0000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5174  putative transcriptional regulator, TetR family  31.72 
 
 		 199 aa  55.5  0.0000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0107413  hitchhiker  0.00860579 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3827  putative transcriptional regulator  37.66 
 
 		 216 aa  55.1  0.0000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2423  TetR family transcriptional regulator  28.93 
 
 		 214 aa  55.1  0.0000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44980  TetR family transcriptional regulator  37.66 
 
 		 216 aa  55.1  0.0000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0876  TetR family transcriptional regulator  27.85 
 
 		 226 aa  54.7  0.0000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.140831 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0314  TetR family transcriptional regulator  27.49 
 
 		 211 aa  54.7  0.0000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1017  repressor protein  27.49 
 
 		 211 aa  54.7  0.0000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0570  TetR family transcriptional regulator  31.21 
 
 		 209 aa  54.7  0.0000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0857  multidrug efflux pump repressor protein BpeR  27.49 
 
 		 211 aa  54.7  0.0000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0057  multidrug efflux pump repressor protein BpeR  27.49 
 
 		 211 aa  54.7  0.0000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4571  transcriptional regulator, TetR family  30 
 
 		 231 aa  54.7  0.0000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0609  multidrug efflux pump repressor protein BpeR  27.49 
 
 		 211 aa  54.7  0.0000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.780096  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2443  multidrug efflux pump repressor protein BpeR  27.49 
 
 		 211 aa  54.7  0.0000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0852  multidrug efflux pump repressor protein BpeR  27.49 
 
 		 211 aa  54.7  0.0000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4024  TetR family transcriptional regulator  33.83 
 
 		 199 aa  54.3  0.000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.497962  normal  0.530155 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0081  transcriptional regulator, TetR family  28.92 
 
 		 211 aa  53.9  0.000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2767  TetR family transcriptional regulator  43.1 
 
 		 214 aa  53.9  0.000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0855812  normal  0.684751 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0736  transcriptional regulator  30.83 
 
 		 219 aa  54.3  0.000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0112088  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3995  TetR family transcriptional regulator  31.74 
 
 		 243 aa  53.9  0.000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0570  transcriptional regulator, TetR family  28.74 
 
 		 188 aa  53.9  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1387  TetR family transcriptional regulator  28.93 
 
 		 210 aa  53.1  0.000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.649854  normal  0.844436 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1150  TetR family transcriptional regulator  32.89 
 
 		 222 aa  53.5  0.000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02063  putative transcription regulator transcription regulator protein  31.58 
 
 		 224 aa  53.5  0.000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0495626  normal  0.936254 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3953  TetR family transcriptional regulator  27.47 
 
 		 232 aa  53.1  0.000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0396138  normal  0.024229 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1281  TetR family transcriptional regulator  30.34 
 
 		 210 aa  53.5  0.000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.781108  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0886  TetR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 231 aa  53.5  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0972  TetR family transcriptional regulator  28.22 
 
 		 233 aa  53.1  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.93446  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6397  TetR family transcriptional regulator  49.15 
 
 		 218 aa  53.5  0.000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.467706 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3703  DNA-binding transcriptional regulator EnvR  26.35 
 
 		 215 aa  53.1  0.000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.83778 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2402  transcriptional regulator, TetR family  30.95 
 
 		 259 aa  53.1  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0404395  hitchhiker  0.00830545 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2536  transcriptional regulator, TetR family  26.95 
 
 		 210 aa  52.8  0.000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.018218  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4578  TetR family transcriptional regulator  49.18 
 
 		 238 aa  52.8  0.000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.127543  normal  0.45553 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4336  TetR family transcriptional regulator  28.93 
 
 		 210 aa  53.1  0.000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.426629 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3161  TetR family transcriptional regulator  49.21 
 
 		 195 aa  52.8  0.000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000174477  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6801  transcriptional regulator, TetR family  48.39 
 
 		 217 aa  52.8  0.000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.142519  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1807  transcriptional regulator, TetR family  31.68 
 
 		 199 aa  52.4  0.000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.366594 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5306  TetR family transcriptional regulator  37.25 
 
 		 219 aa  52.4  0.000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.190126 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03730  transcriptional regulator, TetR family  27.65 
 
 		 215 aa  52.4  0.000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0891  TetR family transcriptional regulator  27.91 
 
 		 211 aa  52.4  0.000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2599  TetR family transcriptional regulator  30.22 
 
 		 233 aa  52.4  0.000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.87329  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0440  TetR family transcriptional regulator  36.07 
 
 		 207 aa  52.4  0.000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2217  transcriptional regulator, TetR family  29.52 
 
 		 199 aa  52.4  0.000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1045  TetR family transcriptional regulator  36.07 
 
 		 226 aa  52.4  0.000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.446098  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0675  regulatory protein, TetR  28.57 
 
 		 220 aa  52  0.000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3117  TetR family transcriptional regulator  30.38 
 
 		 248 aa  52  0.000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4502  TetR family transcriptional regulator  31.93 
 
 		 241 aa  52.4  0.000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.595773 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5419  TetR family transcriptional regulator  47.54 
 
 		 211 aa  52  0.000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.752491  normal  0.799332 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0228  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 205 aa  52  0.000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.728602  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0477  TetR family transcriptional regulator  28.29 
 
 		 211 aa  51.6  0.000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.178939  normal  0.0289146 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0557  regulatory protein TetR  39.13 
 
 		 251 aa  52  0.000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1638  TetR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 232 aa  52  0.000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0773  TetR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 224 aa  52  0.000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4604  transcriptional regulator, TetR family  38.89 
 
 		 255 aa  51.6  0.000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0502  TetR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 224 aa  52  0.000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1600  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 201 aa  52  0.000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0652187  normal  0.362821 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2087  TetR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 232 aa  52  0.000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.390005  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0573  TetR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 232 aa  52  0.000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0810713  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1991  TetR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 232 aa  52  0.000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0685  TetR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 232 aa  52  0.000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4577  transcriptional regulator, TetR family  45.9 
 
 		 196 aa  51.6  0.000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.957651 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0199  TetR family regulatory protein  26.95 
 
 		 214 aa  51.6  0.000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04039  hypothetical protein  22.58 
 
 		 215 aa  51.6  0.000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000282396  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1669  TetR family transcriptional regulator  26.74 
 
 		 235 aa  51.6  0.000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4427  TetR family transcriptional regulator  28.95 
 
 		 216 aa  51.2  0.000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>