98 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_4350 on replicon NC_010515
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010515  Bcenmc03_4350  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 225 aa  454  1e-127  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5829  TetR family transcriptional regulator  99.11 
 
 		 258 aa  450  1.0000000000000001e-126  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5031  TetR family transcriptional regulator  99.11 
 
 		 258 aa  450  1.0000000000000001e-126  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0201359  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6843  TetR family transcriptional regulator  66.67 
 
 		 236 aa  282  2.0000000000000002e-75  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.163651  normal  0.317864 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6831  TetR family transcriptional regulator  58.53 
 
 		 223 aa  257  9e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.1423  normal  0.362364 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1498  TetR family transcriptional regulator  30.87 
 
 		 183 aa  66.2  0.0000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.548232  normal  0.295378 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0161  TetR family transcriptional regulator  25.44 
 
 		 221 aa  64.7  0.000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4623  TetR family transcriptional regulator  28.85 
 
 		 213 aa  57  0.0000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.317667  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6386  regulatory protein, TetR  24.3 
 
 		 510 aa  56.2  0.0000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1704  TetR family transcriptional regulator  22.28 
 
 		 285 aa  56.2  0.0000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0517004  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0556  TetR family transcriptional regulator  23.68 
 
 		 228 aa  53.5  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4362  TetR family transcriptional regulator  22.67 
 
 		 228 aa  51.6  0.000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0699129  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1684  TetR family transcriptional regulator  21.76 
 
 		 227 aa  50.8  0.00002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1991  transcriptional regulator, TetR family  29.76 
 
 		 188 aa  50.8  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4168  TetR family transcriptional regulator  26.83 
 
 		 244 aa  50.8  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0511823  normal  0.17991 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2260  transcriptional regulator, TetR family  36.14 
 
 		 201 aa  50.1  0.00003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0104994  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1153  TetR family transcriptional regulator  37.33 
 
 		 189 aa  49.7  0.00004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.23421  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2801  TetR family transcriptional regulator  37.33 
 
 		 189 aa  48.5  0.00007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1498  TetR family transcriptional regulator  41.27 
 
 		 189 aa  48.5  0.00009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.437225  normal  0.170332 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0409  TetR family transcriptional regulator  28.92 
 
 		 192 aa  47.8  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0397  TetR family transcriptional regulator  28.92 
 
 		 192 aa  48.1  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.188282 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4438  transcriptional regulator, TetR family  24.48 
 
 		 477 aa  47.8  0.0001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.829211  normal  0.875845 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4328  transcriptional regulator, TetR family  24.48 
 
 		 477 aa  47.8  0.0001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0701267  normal  0.0216349 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0418  TetR family transcriptional regulator  28.92 
 
 		 192 aa  47.8  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.602911  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0959  TetR family transcriptional regulator  32.11 
 
 		 225 aa  47.8  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2202  transcriptional regulator, TetR family  29.41 
 
 		 186 aa  47  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.243165 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1173  TetR family transcriptional regulator  23.26 
 
 		 189 aa  47  0.0002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1341  TetR family transcriptional regulator  30.12 
 
 		 224 aa  47.4  0.0002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2620  TetR family transcriptional regulator  40.54 
 
 		 194 aa  47  0.0002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.727172  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2175  TetR family transcriptional regulator  35.9 
 
 		 205 aa  47.4  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2838  transcriptional regulator, TetR family  26.15 
 
 		 183 aa  46.6  0.0003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1090  TetR family transcriptional regulator  40.68 
 
 		 188 aa  46.2  0.0004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1051  TetR family transcriptional regulator  40.68 
 
 		 188 aa  46.2  0.0004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6862  TetR family transcriptional regulator  24.42 
 
 		 224 aa  45.8  0.0005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000147849  normal  0.19991 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1359  TetR family transcriptional regulator  28.44 
 
 		 218 aa  45.8  0.0005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1747  TetR family transcriptional regulator  28.3 
 
 		 221 aa  45.8  0.0005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2329  TetR family transcriptional regulator  28.09 
 
 		 186 aa  45.4  0.0006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.148714  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4681  TetR family transcriptional regulator  40.51 
 
 		 283 aa  45.4  0.0006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.433841  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3284  TetR family transcriptional regulator  30.69 
 
 		 222 aa  45.4  0.0006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.961661 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4918  TetR family transcriptional regulator  36.14 
 
 		 208 aa  45.4  0.0006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.141388  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0799  TetR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 225 aa  45.4  0.0006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.126774  normal  0.374704 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5007  TetR family transcriptional regulator  36.14 
 
 		 208 aa  45.4  0.0006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.324898  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5300  TetR family transcriptional regulator  36.14 
 
 		 208 aa  45.4  0.0007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.104655  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4314  TetR family transcriptional regulator  32.29 
 
 		 212 aa  45.1  0.0008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.316546  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2190  TetR family transcriptional regulator  41.94 
 
 		 277 aa  45.1  0.0009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.168858  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3796  TetR family transcriptional regulator  40.51 
 
 		 275 aa  45.1  0.0009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.323175 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0270  transcriptional regulator, TetR family  24.29 
 
 		 204 aa  45.1  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0440  TetR/AcrR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 203 aa  44.3  0.001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4264  transcriptional regulator, TetR family  26.47 
 
 		 189 aa  44.7  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2511  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 172 aa  44.3  0.001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3421  transcriptional regulator, TetR family  20.48 
 
 		 205 aa  44.3  0.001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3625  TetR family transcriptional regulator  41.54 
 
 		 278 aa  44.7  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.662049  normal  0.863638 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4464  TetR family transcriptional regulator  41.54 
 
 		 278 aa  44.7  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1270  TetR family transcriptional regulator  34.21 
 
 		 208 aa  44.7  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0484434 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2813  TetR family transcriptional regulator  29.59 
 
 		 215 aa  44.7  0.001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3277  TetR family transcriptional regulator  40.51 
 
 		 275 aa  45.1  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3170  TetR family transcriptional regulator  26.47 
 
 		 202 aa  44.3  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.148676  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3099  TetR family transcriptional regulator  20.89 
 
 		 222 aa  44.3  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.296713  normal  0.219943 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3347  TetR family transcriptional regulator  36.99 
 
 		 187 aa  45.1  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.084846  normal  0.752924 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0706  TetR family transcriptional regulator  34 
 
 		 210 aa  45.1  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.25715 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3902  TetR family transcriptional regulator  41.54 
 
 		 278 aa  44.7  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3359  transcriptional regulator, TetR family  37.5 
 
 		 192 aa  43.9  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000478711  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0532  transcriptional regulator, TetR family  25.66 
 
 		 207 aa  43.9  0.002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0875801  normal  0.0277044 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0550  TetR family transcriptional regulator  29.8 
 
 		 283 aa  43.9  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1451  transcriptional regulator, TetR family  27.61 
 
 		 428 aa  43.9  0.002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4327  regulatory protein, TetR  32.14 
 
 		 182 aa  43.9  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.809003  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1092  transcriptional regulator, TetR family  34.21 
 
 		 205 aa  43.5  0.002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0623718  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1960  transcriptional regulator, TetR family  21.51 
 
 		 199 aa  43.9  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5494  transcriptional regulator, TetR family  30.14 
 
 		 141 aa  43.9  0.002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.769028  normal  0.39499 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05020  transcriptional regulator, TetR family  25.88 
 
 		 194 aa  43.1  0.003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7104  TetR family transcriptional regulator  31.65 
 
 		 206 aa  43.5  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2233  transcriptional regulator, TetR family  29.94 
 
 		 196 aa  43.5  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.943574  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3575  TetR family transcriptional regulator  24.86 
 
 		 200 aa  43.1  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9308  putative transcriptional regulator, TetR family  40.32 
 
 		 231 aa  42.7  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0733541  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0716  TetR family transcriptional regulator  31.72 
 
 		 223 aa  43.1  0.004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0951056 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0850  TetR family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 209 aa  43.1  0.004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0204358 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5420  TetR family transcriptional regulator  37.88 
 
 		 202 aa  42.7  0.004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.66162  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3501  TetR family transcriptional regulator  37.88 
 
 		 209 aa  43.1  0.004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.191946  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4865  TetR family transcriptional regulator  37.88 
 
 		 209 aa  43.1  0.004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4569  TetR family transcriptional regulator  32.61 
 
 		 221 aa  42.7  0.004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000147437  normal  0.0336832 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1196  HTH-type transcriptional regulator RutR  29.21 
 
 		 212 aa  42.4  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13075  TetR family transcriptional regulator  34.67 
 
 		 226 aa  42.7  0.005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.576817 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2539  transcriptional regulator, TetR family  29.41 
 
 		 196 aa  42.7  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4604  transcriptional regulator, TetR family  36.84 
 
 		 255 aa  42.4  0.006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1508  transcriptional regulator, TetR family  41.07 
 
 		 215 aa  42.4  0.006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0994502  normal  0.123569 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3566  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 225 aa  42  0.007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1543  TetR family transcriptional regulator  32.58 
 
 		 236 aa  42  0.007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.470889 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31350  hypothetical protein  28.03 
 
 		 203 aa  42  0.007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.112877  normal  0.357558 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1512  regulatory protein, TetR  30.67 
 
 		 246 aa  42  0.007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3256  transcriptional regulator, TetR family  33.78 
 
 		 220 aa  42  0.007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.757999  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2779  transcriptional regulator, TetR family  25.88 
 
 		 185 aa  42  0.008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.441306  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00523  transcriptional regulator, TetR family protein  29.29 
 
 		 200 aa  42  0.008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3570  transcriptional regulator, TetR family  36.11 
 
 		 175 aa  41.6  0.009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00083347  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3312  transcriptional regulator UidR  29.87 
 
 		 198 aa  41.6  0.009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0403  transcriptional regulator, TetR family  29.73 
 
 		 213 aa  41.6  0.01  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.472446  normal  0.522596 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0186  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 203 aa  41.6  0.01  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.625871  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1819  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 203 aa  41.6  0.01  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.191224 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1460  TetR family transcriptional regulator  35 
 
 		 210 aa  41.6  0.01  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>