119 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_0270 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_0270  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 204 aa  415  9.999999999999999e-116  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2620  TetR family transcriptional regulator  36.17 
 
 		 194 aa  57.4  0.0000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.727172  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0986  TetR family transcriptional regulator  27.33 
 
 		 197 aa  50.1  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4630  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 206 aa  49.7  0.00003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.110827  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2002  TetR family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 183 aa  49.3  0.00004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.700466  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3825  regulatory protein TetR  43.33 
 
 		 203 aa  49.3  0.00004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.141016  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0452  transcriptional regulator, TetR family  29.17 
 
 		 207 aa  49.3  0.00004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2114  TetR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 183 aa  48.5  0.00006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.328011  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0066  TetR family transcriptional regulator  22.15 
 
 		 215 aa  48.1  0.00008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000605842  hitchhiker  0.0000133916 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3227  transcriptional regulator, TetR family  43.08 
 
 		 204 aa  48.1  0.00009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0817  TetR family transcriptional regulator  32.97 
 
 		 332 aa  47.8  0.0001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2560  transcriptional regulator, TetR family  42.42 
 
 		 196 aa  47.4  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.199189  normal  0.158626 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4404  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 199 aa  47.4  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0114676  normal  0.191291 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0102  TetR family transcriptional regulator  21.68 
 
 		 218 aa  48.1  0.0001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.478027 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1508  transcriptional regulator, TetR family  29.24 
 
 		 215 aa  47.4  0.0001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0994502  normal  0.123569 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0214  TetR family transcriptional regulator  27.7 
 
 		 218 aa  47  0.0002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.705047  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4020  TetR family transcriptional regulator  26.99 
 
 		 258 aa  47  0.0002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.12217  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3892  transcriptional regulator, TetR family  28.22 
 
 		 211 aa  47  0.0002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35350  transcriptional regulator, TetR family  44.64 
 
 		 223 aa  47.4  0.0002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.147408 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3260  transcriptional regulator, TetR family  34.78 
 
 		 187 aa  46.2  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.323175 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5316  transcriptional regulator, TetR family  37.5 
 
 		 215 aa  46.2  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.505659  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3360  putative transcriptional regulator, TetR family  38.37 
 
 		 195 aa  45.8  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0575014  normal  0.0807522 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3312  transcriptional regulator UidR  37.1 
 
 		 198 aa  45.8  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0170  TetR family transcriptional regulator  27.12 
 
 		 233 aa  45.8  0.0005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000323068 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3159  putative transcriptional regulator, TetR family  41.07 
 
 		 221 aa  45.4  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.251281  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1756  transcriptional regulator, TetR family  42.86 
 
 		 205 aa  45.8  0.0005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000229906 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3171  transcriptional regulator, TetR family  41.67 
 
 		 216 aa  45.4  0.0006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.323724  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3164  transcriptional regulator, TetR family  41.94 
 
 		 208 aa  45.1  0.0007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.859639  normal  0.0513104 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5174  putative transcriptional regulator, TetR family  37.5 
 
 		 199 aa  45.1  0.0007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0107413  hitchhiker  0.00860579 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0827  transcriptional regulator, TetR family  39.34 
 
 		 179 aa  45.1  0.0007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.843783  normal  0.883408 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3937  transcriptional regulator, TetR family protein  22.3 
 
 		 220 aa  44.7  0.0008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.353211  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4350  TetR family transcriptional regulator  24.29 
 
 		 225 aa  45.1  0.0008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0820  TetR family transcriptional regulator  36.51 
 
 		 219 aa  44.7  0.0009  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0110693  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3036  regulatory protein, TetR  41.67 
 
 		 216 aa  44.7  0.0009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0300267  normal  0.0658454 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3641  TetR family transcriptional regulator  22.67 
 
 		 200 aa  44.3  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.798229 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5031  TetR family transcriptional regulator  24.29 
 
 		 258 aa  44.3  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0201359  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5829  TetR family transcriptional regulator  24.29 
 
 		 258 aa  44.3  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3529  TetR family transcriptional regulator  44.64 
 
 		 224 aa  44.7  0.001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4362  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 228 aa  44.7  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0699129  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2892  TetR family transcriptional regulator  36.59 
 
 		 207 aa  44.3  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.39024 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5720  TetR family transcriptional regulator  36.21 
 
 		 291 aa  44.7  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.649137  normal  0.760569 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0267  HTH-type transcriptional regulator, tetR-family  25 
 
 		 214 aa  44.3  0.001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3359  transcriptional regulator, TetR family  39.13 
 
 		 192 aa  44.3  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000478711  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3833  transcriptional regulator, TetR family  29.07 
 
 		 204 aa  43.5  0.002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1780  regulatory protein, TetR  32.98 
 
 		 212 aa  43.9  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.407505  normal  0.506261 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2190  TetR family transcriptional regulator  37.7 
 
 		 277 aa  43.9  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.168858  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2902  regulatory protein, TetR  27.93 
 
 		 253 aa  43.9  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.271799  normal  0.100562 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0106  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 214 aa  43.9  0.002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.156451  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0268  TetR family transcriptional regulator  37.29 
 
 		 202 aa  43.5  0.002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.329049 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4464  TetR family transcriptional regulator  37.7 
 
 		 278 aa  43.5  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0871  TetR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 202 aa  43.1  0.002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3902  TetR family transcriptional regulator  37.7 
 
 		 278 aa  43.5  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2323  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 206 aa  43.9  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.169023  normal  0.0173664 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5283  TetR family transcriptional regulator  37.1 
 
 		 208 aa  43.9  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.261053 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1697  hypothetical protein  34.94 
 
 		 199 aa  43.9  0.002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.280342 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2369  TetR family transcriptional regulator  43.64 
 
 		 202 aa  43.9  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0143  TetR family transcriptional regulator  37.29 
 
 		 266 aa  43.5  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.170765  normal  0.0134311 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2889  TetR family transcriptional regulator  35.94 
 
 		 216 aa  43.5  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00514184  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3625  TetR family transcriptional regulator  37.7 
 
 		 278 aa  43.5  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.662049  normal  0.863638 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5419  TetR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 211 aa  43.5  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.752491  normal  0.799332 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0059  transcriptional regulator, TetR family  27.37 
 
 		 194 aa  43.5  0.002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00007304  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21920  transcriptional regulator  48 
 
 		 191 aa  43.9  0.002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.048177  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10440  transcriptional regulator  32.86 
 
 		 211 aa  43.9  0.002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0189255  normal  0.0235057 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1906  transcriptional regulator, TetR family  38.98 
 
 		 193 aa  43.9  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.812491 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3570  transcriptional regulator, TetR family  38.36 
 
 		 175 aa  43.5  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00083347  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3723  transcriptional regulator, TetR family  42 
 
 		 187 aa  43.9  0.002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.000000134359  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1745  TetR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 195 aa  42.7  0.003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0399082  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6831  TetR family transcriptional regulator  25.4 
 
 		 223 aa  43.1  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.1423  normal  0.362364 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3151  TetR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 202 aa  43.1  0.003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2856  TetR family transcriptional regulator  35.59 
 
 		 194 aa  43.1  0.003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.661308  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3163  putative transcriptional regulator, TetR family  33.96 
 
 		 223 aa  43.1  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2175  TetR family transcriptional regulator  46.3 
 
 		 205 aa  42.7  0.003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2186  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 214 aa  43.1  0.003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0785456  normal  0.820524 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3009  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 187 aa  43.1  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0423  transcriptional regulator, TetR family  32.06 
 
 		 184 aa  43.1  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.567311  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1598  TetR family transcriptional regulator  30.68 
 
 		 239 aa  42.4  0.004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.235097  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3212  TetR family transcriptional regulator  26.4 
 
 		 223 aa  42.7  0.004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.59703  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4073  TetR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 245 aa  42.4  0.004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3850  TetR family transcriptional regulator  32.2 
 
 		 207 aa  42.7  0.004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.349935 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0059  TetR family transcriptional regulator  22.82 
 
 		 215 aa  42.7  0.004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0273669  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2348  transcriptional regulator, TetR family  35.62 
 
 		 222 aa  42.4  0.004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0187157  normal  0.0306872 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4339  TetR family transcriptional regulator  22.82 
 
 		 215 aa  42.7  0.004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4479  TetR family transcriptional regulator  22.82 
 
 		 215 aa  42.7  0.004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.2045 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4284  transcriptional regulator, TetR family  22.82 
 
 		 215 aa  42.7  0.004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000936887 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3370  transcriptional regulator, TetR family  26.58 
 
 		 228 aa  42.7  0.004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.0063882  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3630  transcriptional regulator, TetR family  40.62 
 
 		 203 aa  42.7  0.004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0460373 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2316  transcriptional regulator, TetR family  32.47 
 
 		 220 aa  42.7  0.004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.166278  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3550  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 209 aa  42.4  0.005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.123962  normal  0.200142 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1260  transcriptional regulator, TetR family  39.34 
 
 		 222 aa  42.4  0.005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.194739 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5284  TetR family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 208 aa  42.4  0.005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0597036  normal  0.356444 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5866  TetR family transcriptional regulator  27.7 
 
 		 236 aa  42.4  0.005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2591  transcriptional regulator, TetR family  43.4 
 
 		 192 aa  42.4  0.005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.266738 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0868  transcriptional regulator, TetR family  25.77 
 
 		 222 aa  42.4  0.005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000000486929  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1096  transcriptional regulator, TetR family  30.36 
 
 		 192 aa  42.4  0.005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7672  TetR family transcriptional regulator  40.32 
 
 		 198 aa  42  0.006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.245363  normal  0.688993 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1498  TetR family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 183 aa  42  0.006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.548232  normal  0.295378 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3544  transcriptional regulator, TetR family  34.21 
 
 		 258 aa  42  0.006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.164716  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1236  TetR family transcriptional regulator  27.88 
 
 		 196 aa  42  0.006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0369519 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3252  TetR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 200 aa  42  0.006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0538  transcriptional regulator, TetR family  33.77 
 
 		 254 aa  42  0.006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>