More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sterm_3723 on replicon NC_013517
Organism: Sebaldella termitidis ATCC 33386



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013517  Sterm_3723  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 187 aa  380  1e-105  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.000000134359  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3194  transcriptional regulator, TetR family  39.25 
 
 		 188 aa  138  6e-32  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3515  transcriptional regulator, TetR family  31.91 
 
 		 185 aa  94.7  6e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000109065  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1059  transcriptional regulator, TetR family  26.98 
 
 		 188 aa  64.3  0.0000000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0744  regulatory protein TetR  41.67 
 
 		 191 aa  60.1  0.00000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1769  transcriptional regulator, TetR family  25.44 
 
 		 198 aa  60.5  0.00000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6137  transcriptional regulator, TetR family  31.58 
 
 		 196 aa  57.8  0.0000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.780623 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2922  transcriptional regulator, TetR family  31.71 
 
 		 204 aa  56.6  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.404278 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2880  TetR family transcriptional regulator  42.31 
 
 		 195 aa  55.8  0.0000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1543  TetR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 238 aa  55.5  0.0000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.176522 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22630  transcriptional regulator  21.79 
 
 		 202 aa  55.1  0.0000007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4004  TetR family transcriptional regulator  48 
 
 		 196 aa  53.5  0.000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.638592  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1603  transcriptional regulator, TetR family  20.47 
 
 		 189 aa  53.5  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0115969  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1955  transcriptional regulator, TetR family  30 
 
 		 202 aa  52.4  0.000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.22623  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3475  TetR family transcriptional regulator  40.74 
 
 		 229 aa  52  0.000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.265474  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01587  DNA-binding transcriptional repressor  38.1 
 
 		 196 aa  51.6  0.000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2024  transcriptional regulator, TetR family  38.1 
 
 		 192 aa  51.6  0.000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.180766  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1805  transcriptional regulator UidR  38.1 
 
 		 196 aa  51.6  0.000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.947665  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1826  transcriptional regulator UidR  38.1 
 
 		 196 aa  51.6  0.000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1581  transcriptional regulator UidR  38.1 
 
 		 192 aa  51.6  0.000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01577  hypothetical protein  38.1 
 
 		 196 aa  51.6  0.000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.98021  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3312  transcriptional regulator UidR  36.76 
 
 		 198 aa  52  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1693  transcriptional regulator UidR  38.1 
 
 		 196 aa  51.6  0.000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2330  transcriptional regulator UidR  38.1 
 
 		 195 aa  51.6  0.000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2012  TetR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 196 aa  51.6  0.000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.952906  normal  0.615913 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5341  transcriptional regulator, TetR family  37.7 
 
 		 204 aa  51.6  0.000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.087744  normal  0.833644 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0666  transcriptional regulator  42.59 
 
 		 205 aa  50.4  0.00001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2546  TetR family transcriptional regulator  47.92 
 
 		 213 aa  50.8  0.00001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.768933 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0374  TetR family transcriptional regulator  22.27 
 
 		 215 aa  49.7  0.00002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.120665  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1801  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 216 aa  49.7  0.00003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1489  transcriptional regulator, TetR family  37.68 
 
 		 212 aa  49.3  0.00003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2696  TetR family transcriptional regulator  42.31 
 
 		 196 aa  49.3  0.00003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.834085 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7768  putative transcriptional regulator, TetR family  41.18 
 
 		 194 aa  48.9  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0053  transcriptional regulator, TetR family  46 
 
 		 188 aa  48.9  0.00004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.573004  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5720  TetR family transcriptional regulator  32.93 
 
 		 291 aa  48.9  0.00004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.649137  normal  0.760569 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0987  TetR family transcriptional regulator  29.35 
 
 		 203 aa  48.9  0.00005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0059  transcriptional regulator, TetR family  40.82 
 
 		 194 aa  48.5  0.00005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00007304  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3711  transcriptional regulator, TetR family  41.82 
 
 		 220 aa  48.5  0.00005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0806  transcriptional regulator, TetR family  40.58 
 
 		 202 aa  48.1  0.00007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.265645  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1255  TetR family transcriptional regulator  36.54 
 
 		 200 aa  48.1  0.00007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0503  TetR family transcriptional regulator  48.89 
 
 		 376 aa  48.1  0.00007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2205  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 202 aa  48.1  0.00007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.270822 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5533  transcriptional regulator, TetR family  38.46 
 
 		 222 aa  48.1  0.00007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16730  transcriptional regulator, TetR family  41.51 
 
 		 213 aa  48.1  0.00008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3299  transcriptional regulator, TetR family  37.93 
 
 		 307 aa  47.8  0.00009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1606  TetR family transcriptional regulator  46.81 
 
 		 225 aa  47.8  0.0001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.912424  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3117  transcriptional regulator, TetR family  48.89 
 
 		 204 aa  47.4  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3518  regulatory protein, TetR  28.41 
 
 		 215 aa  47.4  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.640434  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3260  putative transcriptional regulator, TetR family  24.26 
 
 		 309 aa  47.4  0.0001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.235559  hitchhiker  0.000147183 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1932  TetR family transcriptional regulator  39.06 
 
 		 210 aa  47  0.0001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0166  TetR family transcriptional regulator  34.83 
 
 		 193 aa  47  0.0001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.141555  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1039  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 213 aa  47.8  0.0001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0390412  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0043  regulatory protein, TetR  39.62 
 
 		 211 aa  47.4  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0788  TetR family transcriptional regulator  26.92 
 
 		 221 aa  47.4  0.0001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.796627 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5257  transcriptional regulator, TetR family  36.36 
 
 		 194 aa  47.8  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.570583  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35210  TetR family transcriptional regulator  25.56 
 
 		 196 aa  47.8  0.0001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.831854 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0662  TetR family transcriptional regulator  32.65 
 
 		 205 aa  47.4  0.0001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1867  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 201 aa  47.8  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.129849  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2766  regulatory protein, TetR  24.35 
 
 		 198 aa  47.4  0.0001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.597397  hitchhiker  0.0084658 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1987  TetR family transcriptional regulator  44.9 
 
 		 210 aa  47.4  0.0001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2155  TetR family transcriptional regulator  31.87 
 
 		 195 aa  46.2  0.0002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4873  transcriptional regulator, TetR family  32 
 
 		 193 aa  47  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3587  TetR family transcriptional regulator  34.92 
 
 		 208 aa  46.6  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.997688  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2970  putative transcriptional regulator  31.75 
 
 		 196 aa  47  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0889426  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3833  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 204 aa  46.6  0.0002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28270  transcriptional regulator  44.68 
 
 		 205 aa  47  0.0002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.188874 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2732  TetR family transcriptional regulator  38 
 
 		 179 aa  47  0.0002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.748169 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2548  TetR family transcriptional regulator  24.14 
 
 		 482 aa  46.6  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.470429  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3836  transcriptional regulator, TetR family  50 
 
 		 192 aa  46.6  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.410307  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3894  TetR family transcriptional regulator  42.59 
 
 		 223 aa  47  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0466911 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2587  TetR family transcriptional regulator  24.14 
 
 		 434 aa  46.6  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.308714  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1988  TetR family transcriptional regulator  43.14 
 
 		 208 aa  46.6  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0795  TetR family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 199 aa  47  0.0002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00985009  normal  0.205797 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3286  transcriptional regulator, TetR family  27.96 
 
 		 192 aa  46.6  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2917  TetR family transcriptional regulator  41.3 
 
 		 218 aa  46.6  0.0002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2593  TetR family transcriptional regulator  24.14 
 
 		 482 aa  46.6  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1076  transcriptional regulator, TetR family  37.74 
 
 		 220 aa  46.2  0.0002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.66869  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5077  TetR family transcriptional regulator  31.87 
 
 		 202 aa  47  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1632  transcriptional regulator, TetR family  38.1 
 
 		 239 aa  46.2  0.0003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01897  transcriptional regulator, TetR family protein  42.86 
 
 		 207 aa  46.2  0.0003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0111118  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2755  TetR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 200 aa  45.8  0.0003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1341  TetR family transcriptional regulator  44.23 
 
 		 224 aa  46.2  0.0003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2508  TetR family transcriptional regulator  21.58 
 
 		 195 aa  45.8  0.0003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0332011  normal  0.924216 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1647  TetR family transcriptional regulator  21.47 
 
 		 215 aa  46.2  0.0003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1991  transcriptional regulator, TetR family  20.71 
 
 		 188 aa  46.2  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0336  transcriptional regulator, TetR family  32.26 
 
 		 191 aa  46.2  0.0003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.510139 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9308  putative transcriptional regulator, TetR family  29.59 
 
 		 231 aa  46.2  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0733541  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2801  TetR family transcriptional regulator  32.69 
 
 		 209 aa  46.2  0.0003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1684  TetR family transcriptional regulator  42.31 
 
 		 235 aa  45.4  0.0004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.46279  normal  0.0995016 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3871  TetR family transcriptional regulator  42.31 
 
 		 235 aa  45.4  0.0004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5087  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 196 aa  45.4  0.0004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.305126  normal  0.842071 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2575  transcriptional regulator, TetR family  22.28 
 
 		 196 aa  45.8  0.0004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.230257  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1655  transcriptional regulator, TetR family  38.33 
 
 		 222 aa  45.8  0.0004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.721526  normal  0.229233 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1660  TetR family transcriptional regulator  42.31 
 
 		 235 aa  45.4  0.0004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.903697  normal  0.835101 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3598  TetR family transcriptional regulator  42.31 
 
 		 235 aa  45.4  0.0004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.153473  normal  0.929745 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0312  transcriptional regulator, TetR family  32.81 
 
 		 206 aa  45.8  0.0004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000380117  normal  0.28635 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5527  transcriptional regulator, TetR family  29 
 
 		 203 aa  45.8  0.0004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4729  TetR family transcriptional regulator  34.72 
 
 		 240 aa  45.8  0.0004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1588  TetR family transcriptional regulator  42.31 
 
 		 235 aa  45.4  0.0005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.472704 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2411  transcriptional regulator, TetR family  34 
 
 		 205 aa  45.4  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.147912 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>