More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A3550 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007951  Bxe_A3550  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 209 aa  431  1e-120  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.123962  normal  0.200142 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2892  TetR family transcriptional regulator  70.67 
 
 		 207 aa  306  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.39024 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3524  TetR family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 223 aa  151  5.9999999999999996e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0849134 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2908  TetR family transcriptional regulator  39.33 
 
 		 206 aa  139  3e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.906058 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4678  TetR family transcriptional regulator  29.26 
 
 		 221 aa  95.9  4e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.288116  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1550  transcriptional regulator, TetR family  29.1 
 
 		 209 aa  93.2  2e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.702649  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3418  TetR family transcriptional regulator  28.87 
 
 		 234 aa  84.3  0.000000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.111441  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0992  TetR family transcriptional regulator  23.86 
 
 		 226 aa  82.4  0.000000000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000245295 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1709  transcriptional regulator, TetR family  32.84 
 
 		 195 aa  80.9  0.00000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3227  transcriptional regulator, TetR family  27.14 
 
 		 204 aa  76.6  0.0000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5436  transcriptional regulator, TetR family  39.69 
 
 		 205 aa  74.3  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.770498 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24710  transcriptional regulator, tetR family  30.3 
 
 		 198 aa  74.3  0.000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4557  TetR family transcriptional regulator  27.5 
 
 		 199 aa  73.2  0.000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1206  regulatory protein TetR  33.15 
 
 		 194 aa  73.2  0.000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.790266  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2337  TetR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 214 aa  73.2  0.000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0181151 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2832  transcriptional regulator, TetR family  27.37 
 
 		 204 aa  71.2  0.000000000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1564  transcriptional regulator, TetR family  55.38 
 
 		 228 aa  70.9  0.00000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.127259  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5279  TetR family transcriptional regulator  29.35 
 
 		 211 aa  71.2  0.00000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00504673 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4763  TetR family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 201 aa  67  0.0000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.781145  decreased coverage  0.0000189499 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3825  regulatory protein TetR  27.5 
 
 		 203 aa  65.5  0.0000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.141016  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4323  regulatory protein, TetR  30 
 
 		 201 aa  65.5  0.0000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0245964 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2258  transcriptional regulator, TetR family  47.95 
 
 		 218 aa  65.1  0.0000000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0562664  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4004  TetR family transcriptional regulator  27.69 
 
 		 209 aa  63.2  0.000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0894492  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4436  transcriptional regulator, TetR family  26.15 
 
 		 202 aa  61.2  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0578844 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16550  transcriptional regulator, TetR family  28.25 
 
 		 207 aa  60.1  0.00000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.882037  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35210  TetR family transcriptional regulator  38.37 
 
 		 196 aa  59.3  0.00000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.831854 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3529  TetR family transcriptional regulator  44.12 
 
 		 224 aa  58.9  0.00000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2580  TetR family transcriptional regulator  30.17 
 
 		 211 aa  58.9  0.00000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.257801 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5646  TetR family transcriptional regulator  48.39 
 
 		 233 aa  57.8  0.0000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.176197  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2645  TetR family transcriptional regulator  29.29 
 
 		 194 aa  56.2  0.0000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.154552  normal  0.491764 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0527  TetR family transcriptional regulator  30.86 
 
 		 198 aa  55.8  0.0000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.18684  normal  0.990571 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0815  transcriptional regulator, TetR family  35.87 
 
 		 207 aa  55.8  0.0000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4581  TetR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 235 aa  55.8  0.0000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000712688 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5205  TetR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 235 aa  55.5  0.0000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.155344  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5654  TetR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 235 aa  55.5  0.0000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.346197  normal  0.300572 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3584  regulatory protein TetR  40 
 
 		 204 aa  55.5  0.0000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0125026  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0292  TetR family transcriptional regulator  29.58 
 
 		 203 aa  55.5  0.0000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000414466 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3727  TetR family transcriptional regulator  28.87 
 
 		 203 aa  55.5  0.0000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000227076 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0292  TetR family transcriptional regulator  29.58 
 
 		 203 aa  55.1  0.0000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000945067 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1428  TetR family transcriptional regulator  36.14 
 
 		 204 aa  54.7  0.0000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.530378  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4181  transcriptional regulator, TetR family  35.24 
 
 		 227 aa  54.3  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000221958 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3319  transcriptional regulator, TetR family  33.59 
 
 		 214 aa  54.3  0.000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00311946  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3117  TetR family transcriptional regulator  34.74 
 
 		 248 aa  54.3  0.000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2775  TetR family transcriptional regulator  36.47 
 
 		 228 aa  54.3  0.000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0212844  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3771  transcriptional regulator, TetR family  30.86 
 
 		 223 aa  53.5  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3413  transcriptional regulator, TetR family  32.26 
 
 		 246 aa  53.5  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0059  transcriptional regulator, TetR family  26.8 
 
 		 194 aa  53.5  0.000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00007304  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5093  transcriptional regulator, TetR family  35.71 
 
 		 233 aa  53.5  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0355233 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2426  TetR family transcriptional regulator  50.98 
 
 		 205 aa  53.9  0.000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1467  transcriptional regulator, TetR family  35.24 
 
 		 217 aa  53.9  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2970  putative transcriptional regulator  40 
 
 		 196 aa  53.5  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0889426  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7734  TetR family transcriptional regulator  41.94 
 
 		 217 aa  52.8  0.000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6158  TetR family transcriptional regulator  39.34 
 
 		 212 aa  52.8  0.000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.488727  normal  0.104212 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2249  transcriptional regulator, TetR family  35.4 
 
 		 228 aa  52.8  0.000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.115177  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4322  transcriptional regulator, TetR family  26.49 
 
 		 242 aa  53.1  0.000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47520  putative transcriptional regulator  39.34 
 
 		 197 aa  52.8  0.000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1098  TetR family transcriptional regulator  35.96 
 
 		 209 aa  52.4  0.000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0976848 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0894  TetR family transcriptional regulator  30.89 
 
 		 215 aa  52.4  0.000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0749762 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0402  transcriptional regulator, TetR family  32.93 
 
 		 219 aa  52.4  0.000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.67084  normal  0.0771341 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4955  TetR family transcriptional regulator  29.13 
 
 		 424 aa  52  0.000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.868884 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4427  TetR family transcriptional regulator  38.57 
 
 		 216 aa  51.6  0.000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0268  TetR family transcriptional regulator  37.66 
 
 		 209 aa  51.6  0.000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.784596 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6667  TetR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 217 aa  51.6  0.000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.33995  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2273  TetR family transcriptional regulator  39.06 
 
 		 236 aa  50.8  0.00001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.702073 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2347  transcriptional regulator, TetR family  36.9 
 
 		 223 aa  50.8  0.00001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.123383  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1885  transcriptional regulator, TetR family  43.1 
 
 		 204 aa  50.8  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.393011  normal  0.0927704 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6229  transcriptional regulator TetR family  29.52 
 
 		 240 aa  51.2  0.00001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.93873  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3445  TetR family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 208 aa  51.2  0.00001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2801  TetR family transcriptional regulator  51.79 
 
 		 189 aa  51.2  0.00001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1320  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 199 aa  50.8  0.00001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0653  TetR family transcriptional regulator  25.67 
 
 		 239 aa  51.2  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.895019 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2152  transcriptional regulator, TetR family  38.96 
 
 		 185 aa  50.8  0.00001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1498  TetR family transcriptional regulator  51.79 
 
 		 189 aa  51.2  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.437225  normal  0.170332 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2029  TetR family transcriptional regulator  45.76 
 
 		 220 aa  50.8  0.00001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.107784  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2963  TetR family transcriptional regulator  31.34 
 
 		 189 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.412295 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3376  TetR family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 197 aa  50.1  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.423093  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1838  transcriptional regulator, TetR family  45.76 
 
 		 221 aa  50.8  0.00002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.834516  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2131  regulatory protein, TetR  38.89 
 
 		 218 aa  50.1  0.00002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00771887  normal  0.859247 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3154  regulatory protein, TetR  31.9 
 
 		 214 aa  50.4  0.00002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0193225  normal  0.108939 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10440  transcriptional regulator  30.87 
 
 		 211 aa  50.8  0.00002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0189255  normal  0.0235057 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1387  transcriptional regulator, TetR family  35.79 
 
 		 213 aa  50.1  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1587  TetR family transcriptional regulator  27.22 
 
 		 255 aa  50.4  0.00002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0494603  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1129  TetR family transcriptional regulator  36.26 
 
 		 231 aa  50.4  0.00002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0297  TetR family transcriptional regulator  26.14 
 
 		 203 aa  50.1  0.00002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5823  TetR family transcriptional regulator  35.8 
 
 		 217 aa  50.4  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2095  TetR family transcriptional regulator  44.12 
 
 		 210 aa  50.4  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0799745 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5875  transcriptional regulator, TetR family  24.32 
 
 		 218 aa  50.4  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6188  TetR family transcriptional regulator  35.8 
 
 		 217 aa  50.4  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.301672  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1601  TetR family transcriptional regulator  29.91 
 
 		 215 aa  50.1  0.00003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1150  TetR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 222 aa  50.1  0.00003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1014  TetR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 212 aa  49.7  0.00003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0027  TetR family transcriptional regulator  41.27 
 
 		 209 aa  49.7  0.00003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.790094 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3059  TetR family transcriptional regulator  36.47 
 
 		 205 aa  49.7  0.00003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3540  TetR family transcriptional regulator  27.93 
 
 		 250 aa  49.7  0.00003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5087  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 259 aa  49.7  0.00003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2948  TetR family transcriptional regulator  31.34 
 
 		 191 aa  49.7  0.00003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5773  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 259 aa  49.7  0.00003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.669739 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2992  TetR family transcriptional regulator  31.34 
 
 		 191 aa  49.7  0.00003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.385096  normal  0.373192 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4343  transcriptional regulator, TetR family  32.81 
 
 		 225 aa  49.7  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0349599  decreased coverage  0.000000750918 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3054  TetR family transcriptional regulator  36.07 
 
 		 126 aa  49.3  0.00004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0108952 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>