More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_4436 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_4436  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 202 aa  395  1e-109  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0578844 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3227  transcriptional regulator, TetR family  58.76 
 
 		 204 aa  210  1e-53  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2832  transcriptional regulator, TetR family  58.38 
 
 		 204 aa  207  6e-53  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3825  regulatory protein TetR  60.11 
 
 		 203 aa  194  8.000000000000001e-49  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.141016  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16550  transcriptional regulator, TetR family  54.12 
 
 		 207 aa  176  2e-43  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.882037  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4557  TetR family transcriptional regulator  48.97 
 
 		 199 aa  172  1.9999999999999998e-42  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1709  transcriptional regulator, TetR family  50.52 
 
 		 195 aa  160  1e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4763  TetR family transcriptional regulator  50.51 
 
 		 201 aa  159  2e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.781145  decreased coverage  0.0000189499 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4323  regulatory protein, TetR  50.26 
 
 		 201 aa  159  3e-38  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0245964 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1206  regulatory protein TetR  40.11 
 
 		 194 aa  109  3e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.790266  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24710  transcriptional regulator, tetR family  34.57 
 
 		 198 aa  90.1  2e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2337  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 214 aa  89  4e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0181151 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4678  TetR family transcriptional regulator  31.94 
 
 		 221 aa  85.9  3e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.288116  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1550  transcriptional regulator, TetR family  32.84 
 
 		 209 aa  86.3  3e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.702649  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5436  transcriptional regulator, TetR family  36.56 
 
 		 205 aa  85.1  6e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.770498 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3418  TetR family transcriptional regulator  31.84 
 
 		 234 aa  83.2  0.000000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.111441  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1564  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 228 aa  73.2  0.000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.127259  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5279  TetR family transcriptional regulator  31.32 
 
 		 211 aa  72  0.000000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00504673 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3584  regulatory protein TetR  33.33 
 
 		 204 aa  72  0.000000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0125026  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3529  TetR family transcriptional regulator  52.24 
 
 		 224 aa  71.6  0.000000000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3524  TetR family transcriptional regulator  30.1 
 
 		 223 aa  68.6  0.00000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0849134 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2892  TetR family transcriptional regulator  28.04 
 
 		 207 aa  67  0.0000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.39024 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2908  TetR family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 206 aa  66.2  0.0000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.906058 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0268  TetR family transcriptional regulator  31.35 
 
 		 209 aa  63.5  0.000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.784596 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0992  TetR family transcriptional regulator  30.53 
 
 		 226 aa  62.4  0.000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000245295 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0402  transcriptional regulator, TetR family  29.59 
 
 		 219 aa  61.6  0.000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.67084  normal  0.0771341 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4004  TetR family transcriptional regulator  28.34 
 
 		 209 aa  61.2  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0894492  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3550  TetR family transcriptional regulator  26.15 
 
 		 209 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.123962  normal  0.200142 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5205  TetR family transcriptional regulator  34.59 
 
 		 235 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.155344  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5654  TetR family transcriptional regulator  34.59 
 
 		 235 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.346197  normal  0.300572 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4581  TetR family transcriptional regulator  32.02 
 
 		 235 aa  59.3  0.00000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000712688 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2304  TetR family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 225 aa  58.2  0.00000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.808365 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1428  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 204 aa  57.8  0.0000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.530378  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1218  TetR family transcriptional regulator  29.93 
 
 		 206 aa  57  0.0000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3407  transcriptional regulator, TetR family  39.18 
 
 		 178 aa  56.2  0.0000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2258  transcriptional regulator, TetR family  37.5 
 
 		 218 aa  55.8  0.0000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0562664  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5248  transcriptional regulator, TetR family  49.21 
 
 		 178 aa  55.8  0.0000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2273  TetR family transcriptional regulator  39.44 
 
 		 236 aa  55.8  0.0000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.702073 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3469  TetR family transcriptional regulator  32.05 
 
 		 258 aa  55.1  0.0000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0153  TetR family transcriptional regulator  40.54 
 
 		 205 aa  53.5  0.000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.10564  normal  0.9984 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2737  TetR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 220 aa  53.9  0.000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4342  TetR family transcriptional regulator  44.29 
 
 		 218 aa  53.5  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0243053 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5875  transcriptional regulator, TetR family  27.93 
 
 		 218 aa  53.1  0.000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2838  transcriptional regulator, TetR family  45.16 
 
 		 183 aa  53.1  0.000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1866  TetR family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 212 aa  53.1  0.000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.26917  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0281  transcriptional regulator, TetR family  42.62 
 
 		 218 aa  52.8  0.000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.645912  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6209  transcriptional regulator, TetR family  38.96 
 
 		 208 aa  52.4  0.000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1515  putative transcriptional regulator, TetR family  44.83 
 
 		 219 aa  52  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.254086  hitchhiker  0.00363064 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2304  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 201 aa  52  0.000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5773  TetR family transcriptional regulator  39.34 
 
 		 198 aa  52  0.000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6138  TetR family transcriptional regulator  39.34 
 
 		 198 aa  52  0.000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.890581 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0435  TetR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 217 aa  51.6  0.000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.839793 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7672  TetR family transcriptional regulator  37.7 
 
 		 198 aa  51.6  0.000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.245363  normal  0.688993 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28390  transcriptional regulator  30.53 
 
 		 195 aa  51.6  0.000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1944  TetR family transcriptional regulator  36.96 
 
 		 429 aa  51.6  0.000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0410  TetR family transcriptional regulator  30.97 
 
 		 245 aa  51.2  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.560758  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1939  TetR family transcriptional regulator  31.34 
 
 		 257 aa  50.8  0.00001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2589  transcriptional regulator BetI  27.52 
 
 		 196 aa  50.8  0.00001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3943  transcriptional regulator, TetR family  29.29 
 
 		 218 aa  51.2  0.00001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.938406  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3979  transcriptional regulator, TetR family  35.62 
 
 		 222 aa  50.1  0.00002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.318215  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0069  transcriptional regulator, TetR family  36.23 
 
 		 219 aa  50.1  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1567  TetR family transcriptional regulator  32.73 
 
 		 261 aa  50.8  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.865657 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2610  TetR family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 207 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.965658  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3570  transcriptional regulator, TetR family  33.6 
 
 		 175 aa  50.1  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00083347  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1473  TetR family transcriptional regulator  38.03 
 
 		 195 aa  50.4  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2654  TetR family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 207 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.569555  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02851  putative transcriptional repressor for the cellular response to osmotic stress (TetR/AcrR family) protein  32.14 
 
 		 186 aa  50.4  0.00002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2640  TetR family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 207 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1114  transcriptional regulator, TetR family  38.18 
 
 		 186 aa  49.7  0.00003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.213128 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3842  transcriptional regulator BetI  32.84 
 
 		 197 aa  49.7  0.00003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5284  TetR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 208 aa  49.3  0.00004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0597036  normal  0.356444 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4876  transcriptional regulator, TetR family  33.82 
 
 		 209 aa  49.3  0.00004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.217727  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5941  TetR family transcriptional regulator  38.57 
 
 		 213 aa  49.3  0.00004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.272965 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3892  TetR family transcriptional regulator  49.09 
 
 		 198 aa  48.9  0.00004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3966  TetR family transcriptional regulator  49.09 
 
 		 198 aa  48.9  0.00004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.176455  normal  0.497396 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3878  TetR family transcriptional regulator  49.09 
 
 		 198 aa  48.9  0.00004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.348506 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2518  TetR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 221 aa  49.3  0.00004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.382378  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2639  TetR family transcriptional regulator  38.57 
 
 		 213 aa  49.3  0.00004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2511  transcriptional regulator, TetR family  40.26 
 
 		 172 aa  48.9  0.00005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4896  transcriptional regulator, TetR family  28.32 
 
 		 222 aa  48.9  0.00005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2000  TetR family transcriptional regulator  38.57 
 
 		 234 aa  48.9  0.00005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.920156  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8864  transcriptional regulator, TetR family  30.43 
 
 		 202 aa  48.9  0.00005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2610  TetR family transcriptional regulator  38.57 
 
 		 234 aa  48.9  0.00005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.341012  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3148  transcriptional regulator, TetR family  31.58 
 
 		 310 aa  48.9  0.00005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3641  TetR family transcriptional regulator  23.57 
 
 		 200 aa  48.5  0.00006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.798229 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2647  TetR family transcriptional regulator  40.32 
 
 		 74 aa  48.5  0.00006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2214  transcriptional regulator, TetR family  34.25 
 
 		 219 aa  48.5  0.00007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.411668  normal  0.665917 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4193  TetR family transcriptional regulator  41.27 
 
 		 200 aa  48.5  0.00007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3888  TetR family transcriptional regulator  27.55 
 
 		 193 aa  48.1  0.00008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0944552  normal  0.0941974 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2310  TetR family transcriptional regulator  47.83 
 
 		 198 aa  48.1  0.00008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.145827  normal  0.0377448 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0772  transcriptional regulator, TetR family  41.38 
 
 		 223 aa  48.1  0.00009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1745  TetR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 216 aa  48.1  0.00009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1098  TetR family transcriptional regulator  34.18 
 
 		 209 aa  48.1  0.00009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0976848 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25560  transcriptional regulator  44.23 
 
 		 207 aa  48.1  0.00009  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0483  transcriptional regulator, TetR family  37.08 
 
 		 226 aa  48.1  0.00009  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1792  TetR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 216 aa  48.1  0.00009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.651799  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1726  TetR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 216 aa  48.1  0.00009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.379747  normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0067  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 212 aa  47.4  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000826521  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35350  transcriptional regulator, TetR family  35.44 
 
 		 223 aa  47.8  0.0001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.147408 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0059  transcriptional regulator, TetR family  34.48 
 
 		 194 aa  47.8  0.0001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00007304  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>