More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_2511 on replicon NC_014212
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



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Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014212  Mesil_2511  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 172 aa  338  2.9999999999999998e-92  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2620  TetR family transcriptional regulator  36.57 
 
 		 194 aa  91.7  4e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.727172  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2794  transcriptional regulator, TetR family  32.78 
 
 		 184 aa  89.7  2e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4211  transcriptional regulator, TetR family  34.73 
 
 		 178 aa  87  1e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.954356 
 
 
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NC_009921  Franean1_5284  TetR family transcriptional regulator  37.22 
 
 		 208 aa  85.5  3e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0597036  normal  0.356444 
 
 
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NC_008347  Mmar10_2114  TetR family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 183 aa  85.5  3e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.328011  normal  1 
 
 
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NC_010184  BcerKBAB4_0981  TetR family transcriptional regulator  35.33 
 
 		 178 aa  85.1  4e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0622  transcriptional regulator, TetR family  35.39 
 
 		 181 aa  84.7  5e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_012917  PC1_1451  transcriptional regulator, TetR family  35.33 
 
 		 428 aa  83.2  0.000000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011725  BCB4264_A1094  transcriptional regulator, TetR family  35 
 
 		 168 aa  82.8  0.000000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2362  TetR family transcriptional regulator  31.4 
 
 		 179 aa  82.4  0.000000000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3570  transcriptional regulator, TetR family  36.31 
 
 		 175 aa  79.3  0.00000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00083347  n/a   
 
 
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NC_009636  Smed_2329  TetR family transcriptional regulator  35 
 
 		 186 aa  78.2  0.00000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.148714  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13730  transcriptional regulator, TetR family  34.5 
 
 		 181 aa  78.2  0.00000000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.839534  normal  0.161793 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2801  TetR family transcriptional regulator  36.77 
 
 		 189 aa  77.8  0.00000000000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1498  TetR family transcriptional regulator  36.77 
 
 		 189 aa  77.4  0.00000000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.437225  normal  0.170332 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0827  transcriptional regulator, TetR family  31.14 
 
 		 179 aa  76.3  0.0000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.843783  normal  0.883408 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2157  TetR family transcriptional regulator  36.18 
 
 		 187 aa  75.9  0.0000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.105803  normal  1 
 
 
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NC_013421  Pecwa_1840  transcriptional regulator, TetR family  33.73 
 
 		 415 aa  75.1  0.0000000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1320  TetR family transcriptional regulator  40.11 
 
 		 203 aa  74.7  0.0000000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.010897  n/a   
 
 
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NC_007511  Bcep18194_B0953  TetR family transcriptional regulator  31.79 
 
 		 184 aa  74.7  0.0000000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.712721  normal  1 
 
 
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NC_009428  Rsph17025_1153  TetR family transcriptional regulator  40.4 
 
 		 189 aa  73.6  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.23421  normal  1 
 
 
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NC_009972  Haur_2002  TetR family transcriptional regulator  32.2 
 
 		 183 aa  73.6  0.000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.700466  n/a   
 
 
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NC_008463  PA14_47610  putative transcriptional regulator  36.47 
 
 		 186 aa  73.9  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007958  RPD_3328  regulatory protein, TetR  35.9 
 
 		 187 aa  72.4  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_012850  Rleg_3260  transcriptional regulator, TetR family  30.99 
 
 		 187 aa  72  0.000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.323175 
 
 
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NC_011369  Rleg2_3009  transcriptional regulator, TetR family  31.58 
 
 		 187 aa  71.2  0.000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009832  Spro_2686  TetR family transcriptional regulator  32.74 
 
 		 181 aa  71.2  0.000000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.39833  hitchhiker  0.00361312 
 
 
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NC_013947  Snas_4974  transcriptional regulator, TetR family  34.24 
 
 		 186 aa  70.9  0.000000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0603654 
 
 
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NC_007614  Nmul_A0041  TetR family transcriptional regulator  32.32 
 
 		 192 aa  70.5  0.00000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013526  Tter_2838  transcriptional regulator, TetR family  36.97 
 
 		 183 aa  70.5  0.00000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_003295  RSc2560  putative transcription regulator protein  36.36 
 
 		 209 aa  69.7  0.00000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0102643  normal  1 
 
 
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NC_009656  PSPA7_4107  transcriptional regulator  35.29 
 
 		 187 aa  69.7  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.198218  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5248  transcriptional regulator, TetR family  38.41 
 
 		 178 aa  69.3  0.00000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1991  transcriptional regulator, TetR family  31.69 
 
 		 188 aa  69.3  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3701  TetR family transcriptional regulator  34.16 
 
 		 178 aa  68.9  0.00000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.076632  n/a   
 
 
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NC_013093  Amir_2113  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 182 aa  68.6  0.00000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009667  Oant_2175  TetR family transcriptional regulator  32.4 
 
 		 205 aa  68.6  0.00000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013093  Amir_4803  transcriptional regulator, TetR family  37.12 
 
 		 193 aa  67.8  0.00000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.539659  n/a   
 
 
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NC_014210  Ndas_1067  transcriptional regulator, TetR family  51.56 
 
 		 212 aa  67  0.0000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.530116 
 
 
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NC_009505  BOV_1051  TetR family transcriptional regulator  30.94 
 
 		 188 aa  67  0.0000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_004310  BR1090  TetR family transcriptional regulator  30.94 
 
 		 188 aa  66.2  0.0000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011071  Smal_2152  transcriptional regulator, TetR family  50 
 
 		 185 aa  66.2  0.0000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011886  Achl_0880  transcriptional regulator, TetR family  38.38 
 
 		 181 aa  66.2  0.0000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
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NC_014210  Ndas_1114  transcriptional regulator, TetR family  32.77 
 
 		 186 aa  66.6  0.0000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.213128 
 
 
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NC_013174  Jden_0052  transcriptional regulator, TetR family  32.49 
 
 		 188 aa  66.2  0.0000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.612692  normal  0.466149 
 
 
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NC_007643  Rru_A1116  TetR family transcriptional regulator  33.13 
 
 		 184 aa  64.7  0.0000000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007794  Saro_0532  TetR family transcriptional regulator  38.28 
 
 		 424 aa  64.3  0.0000000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011758  Mchl_5492  transcriptional regulator, TetR family  32.08 
 
 		 177 aa  64.7  0.0000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.56711 
 
 
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NC_010338  Caul_3984  TetR family transcriptional regulator  31.55 
 
 		 191 aa  64.3  0.0000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.567303 
 
 
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NC_013595  Sros_8111  putative transcriptional regulator, TetR family  42.67 
 
 		 168 aa  62.4  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007974  Rmet_4404  TetR family transcriptional regulator  32.16 
 
 		 199 aa  61.2  0.000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0114676  normal  0.191291 
 
 
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NC_010505  Mrad2831_0286  TetR family transcriptional regulator  36.07 
 
 		 177 aa  61.2  0.000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.945519  normal  1 
 
 
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NC_013235  Namu_0538  transcriptional regulator, TetR family  53.45 
 
 		 195 aa  60.8  0.000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010172  Mext_4342  regulatory protein TetR  47.22 
 
 		 186 aa  60.8  0.000000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.525641  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4711  transcriptional regulator, TetR family  47.22 
 
 		 186 aa  60.8  0.000000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.492793  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0763  TetR family transcriptional regulator  58.18 
 
 		 183 aa  60.8  0.000000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.673415  n/a   
 
 
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NC_009667  Oant_1884  TetR family transcriptional regulator  27.03 
 
 		 189 aa  60.5  0.00000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.652086  n/a   
 
 
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NC_009485  BBta_5162  TetR family transcriptional regulator  41.77 
 
 		 193 aa  60.5  0.00000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.186575 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5866  TetR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 236 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010505  Mrad2831_2783  TetR family transcriptional regulator  61.54 
 
 		 187 aa  59.7  0.00000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4859  transcriptional regulator, TetR family  35.5 
 
 		 186 aa  60.1  0.00000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.205859 
 
 
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NC_012850  Rleg_2202  transcriptional regulator, TetR family  28.42 
 
 		 186 aa  59.3  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.243165 
 
 
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NC_008044  TM1040_1499  TetR family transcriptional regulator  46.25 
 
 		 203 aa  58.9  0.00000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0951967  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5533  transcriptional regulator, TetR family  31.28 
 
 		 222 aa  58.9  0.00000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2192  transcriptional regulator, TetR family  30.86 
 
 		 191 aa  58.2  0.00000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0439  transcriptional regulator, TetR family  53.57 
 
 		 180 aa  57.4  0.00000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3092  transcriptional regulator, TetR family  40.79 
 
 		 185 aa  57  0.0000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0725563 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6105  TetR family transcriptional regulator  29.65 
 
 		 201 aa  57  0.0000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.93473  normal  0.666323 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1515  putative transcriptional regulator, TetR family  43.84 
 
 		 219 aa  56.6  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.254086  hitchhiker  0.00363064 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5257  transcriptional regulator, TetR family  38.83 
 
 		 194 aa  56.2  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.570583  normal  1 
 
 
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NC_007511  Bcep18194_B2389  TetR family transcriptional regulator  31.07 
 
 		 200 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.979129  normal  0.861655 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3227  transcriptional regulator, TetR family  50.88 
 
 		 204 aa  56.6  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0778  TetR family transcriptional regulator  27.53 
 
 		 192 aa  56.2  0.0000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02650  transcriptional regulator, tetR family  34.07 
 
 		 179 aa  55.8  0.0000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0730  TetR family transcriptional regulator  26.7 
 
 		 187 aa  55.8  0.0000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4488  transcriptional regulator, TetR family  52.83 
 
 		 190 aa  55.8  0.0000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.14916  normal  0.0536152 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3347  TetR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 187 aa  55.5  0.0000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.084846  normal  0.752924 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5494  transcriptional regulator, TetR family  50 
 
 		 141 aa  55.5  0.0000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.769028  normal  0.39499 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0186  TetR family transcriptional regulator  42.53 
 
 		 203 aa  55.1  0.0000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.625871  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1819  TetR family transcriptional regulator  42.53 
 
 		 203 aa  55.1  0.0000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.191224 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0081  transcriptional regulator, TetR family  45.21 
 
 		 202 aa  55.5  0.0000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2360  regulatory protein, TetR  41.79 
 
 		 190 aa  55.1  0.0000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.173305 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2349  TetR family transcriptional regulator  37.38 
 
 		 357 aa  55.1  0.0000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00426882  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5991  TetR family transcriptional regulator  50.94 
 
 		 244 aa  54.7  0.0000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0553876 
 
 
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NC_011071  Smal_2786  transcriptional regulator, TetR family  42.22 
 
 		 190 aa  54.7  0.0000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.06199  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2779  transcriptional regulator, TetR family  34.29 
 
 		 185 aa  54.3  0.0000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.441306  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1196  HTH-type transcriptional regulator RutR  51.72 
 
 		 212 aa  53.9  0.0000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011080  SNSL254_A1216  HTH-type transcriptional regulator RutR  50 
 
 		 212 aa  53.5  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.591915 
 
 
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NC_011094  SeSA_A1186  HTH-type transcriptional regulator RutR  51.72 
 
 		 212 aa  53.9  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.151745  normal  1 
 
 
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NC_011083  SeHA_C1231  HTH-type transcriptional regulator RutR  51.72 
 
 		 212 aa  53.9  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.696174  normal  0.680174 
 
 
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NC_009636  Smed_2365  TetR family transcriptional regulator  43.06 
 
 		 213 aa  53.5  0.000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.227272  normal  0.96994 
 
 
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NC_011666  Msil_1985  transcriptional regulator, TetR family  38.14 
 
 		 206 aa  53.9  0.000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
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NC_008061  Bcen_3501  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 209 aa  53.9  0.000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.191946  n/a   
 
 
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NC_008062  Bcen_5697  TetR family transcriptional regulator  29.61 
 
 		 227 aa  53.9  0.000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.949992  n/a   
 
 
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NC_011894  Mnod_4995  transcriptional regulator, TetR family  34.27 
 
 		 198 aa  53.9  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011832  Mpal_1535  transcriptional regulator, TetR family  27.95 
 
 		 204 aa  53.5  0.000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008543  Bcen2424_4865  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 209 aa  53.9  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008544  Bcen2424_6061  TetR family transcriptional regulator  29.05 
 
 		 191 aa  53.5  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.660328  normal  1 
 
 
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NC_011149  SeAg_B1081  HTH-type transcriptional regulator RutR  51.72 
 
 		 212 aa  53.9  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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