More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_3407 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_3407  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 178 aa  338  2e-92  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0439  transcriptional regulator, TetR family  47.09 
 
 		 180 aa  136  2e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37450  transcriptional regulator  58.86 
 
 		 177 aa  136  2e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0726232  normal  0.587989 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0052  transcriptional regulator, TetR family  45.91 
 
 		 188 aa  126  1.0000000000000001e-28  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.612692  normal  0.466149 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4488  transcriptional regulator, TetR family  42.54 
 
 		 190 aa  121  6e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.14916  normal  0.0536152 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0538  transcriptional regulator, TetR family  46.78 
 
 		 195 aa  115  1.9999999999999998e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02650  transcriptional regulator, tetR family  42.11 
 
 		 179 aa  106  2e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0763  TetR family transcriptional regulator  42.57 
 
 		 183 aa  105  3e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.673415  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1114  transcriptional regulator, TetR family  37.85 
 
 		 186 aa  100  1e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.213128 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0880  transcriptional regulator, TetR family  44.74 
 
 		 181 aa  89.4  2e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5248  transcriptional regulator, TetR family  36.93 
 
 		 178 aa  77.8  0.00000000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5284  TetR family transcriptional regulator  34.16 
 
 		 208 aa  74.3  0.0000000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0597036  normal  0.356444 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2114  TetR family transcriptional regulator  35.43 
 
 		 183 aa  73.6  0.000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.328011  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2002  TetR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 183 aa  67.4  0.0000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.700466  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3570  transcriptional regulator, TetR family  32.63 
 
 		 175 aa  65.9  0.0000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00083347  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4404  TetR family transcriptional regulator  36.31 
 
 		 199 aa  65.9  0.0000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0114676  normal  0.191291 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8111  putative transcriptional regulator, TetR family  36.13 
 
 		 168 aa  65.5  0.0000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2362  TetR family transcriptional regulator  28.33 
 
 		 179 aa  63.9  0.000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0981  TetR family transcriptional regulator  29.67 
 
 		 178 aa  63.5  0.000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4211  transcriptional regulator, TetR family  31.85 
 
 		 178 aa  63.5  0.000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.954356 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0622  transcriptional regulator, TetR family  27.95 
 
 		 181 aa  61.6  0.000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1320  TetR family transcriptional regulator  51.95 
 
 		 203 aa  61.2  0.000000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.010897  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2801  TetR family transcriptional regulator  46.34 
 
 		 189 aa  59.7  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1498  TetR family transcriptional regulator  59.26 
 
 		 189 aa  59.7  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.437225  normal  0.170332 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1153  TetR family transcriptional regulator  39.86 
 
 		 189 aa  58.5  0.00000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.23421  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0314  TetR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 211 aa  58.9  0.00000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0687  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 261 aa  58.5  0.00000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.794796  normal  0.223624 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1017  repressor protein  45.45 
 
 		 211 aa  58.9  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0857  multidrug efflux pump repressor protein BpeR  45.45 
 
 		 211 aa  58.9  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0057  multidrug efflux pump repressor protein BpeR  45.45 
 
 		 211 aa  58.9  0.00000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0679  TetR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 211 aa  58.9  0.00000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0852  multidrug efflux pump repressor protein BpeR  45.45 
 
 		 211 aa  58.9  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2443  multidrug efflux pump repressor protein BpeR  45.45 
 
 		 211 aa  58.9  0.00000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0609  multidrug efflux pump repressor protein BpeR  45.45 
 
 		 211 aa  58.9  0.00000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.780096  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1094  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 168 aa  58.9  0.00000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1090  TetR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 188 aa  58.5  0.00000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1051  TetR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 188 aa  58.5  0.00000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2794  transcriptional regulator, TetR family  28.65 
 
 		 184 aa  58.5  0.00000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2067  TetR family transcriptional regulator  46.3 
 
 		 216 aa  57.8  0.00000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5533  transcriptional regulator, TetR family  50 
 
 		 222 aa  57  0.0000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1543  TetR family transcriptional regulator  38.78 
 
 		 238 aa  57  0.0000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.176522 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2530  TetR family transcriptional regulator  41.07 
 
 		 213 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.704068 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5941  TetR family transcriptional regulator  41.07 
 
 		 213 aa  57  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.272965 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2000  TetR family transcriptional regulator  41.07 
 
 		 234 aa  57  0.0000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.920156  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3395  TetR family transcriptional regulator  24.4 
 
 		 193 aa  57  0.0000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.584176  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2657  TetR family transcriptional regulator  41.07 
 
 		 213 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2610  TetR family transcriptional regulator  41.07 
 
 		 234 aa  57  0.0000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.341012  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13730  transcriptional regulator, TetR family  31.52 
 
 		 181 aa  57.4  0.0000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.839534  normal  0.161793 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2639  TetR family transcriptional regulator  41.07 
 
 		 213 aa  57  0.0000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4436  transcriptional regulator, TetR family  39.18 
 
 		 202 aa  56.2  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0578844 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0947  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 205 aa  56.2  0.0000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0946183  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5257  transcriptional regulator, TetR family  30.23 
 
 		 194 aa  56.6  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.570583  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1067  transcriptional regulator, TetR family  29.73 
 
 		 212 aa  56.6  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.530116 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3259  transcriptional regulator, TetR family  42.11 
 
 		 219 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.147915  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3397  TetR family transcriptional regulator  45.28 
 
 		 222 aa  56.6  0.0000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.15089  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0707  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 219 aa  55.8  0.0000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0477  TetR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 211 aa  55.8  0.0000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.178939  normal  0.0289146 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1965  TetR family transcriptional regulator  36.59 
 
 		 206 aa  55.1  0.0000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0526053  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2113  transcriptional regulator, TetR family  31.69 
 
 		 182 aa  54.7  0.0000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3439  TetR family transcriptional regulator  40.35 
 
 		 239 aa  54.7  0.0000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2888  TetR family transcriptional regulator  41.82 
 
 		 231 aa  54.3  0.0000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.465905  normal  0.0499957 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2152  transcriptional regulator, TetR family  42.86 
 
 		 185 aa  53.9  0.000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0985  transcriptional regulator, TetR family  37.5 
 
 		 222 aa  54.3  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0502  TetR family transcriptional regulator  40.98 
 
 		 221 aa  53.5  0.000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2157  TetR family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 187 aa  53.9  0.000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.105803  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2026  transcriptional regulator, TetR family  45.83 
 
 		 218 aa  53.1  0.000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.148832  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0281  transcriptional regulator, TetR family  39.56 
 
 		 218 aa  53.1  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.645912  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0693  TetR family transcriptional regulator  36.92 
 
 		 207 aa  53.5  0.000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.000000831417  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4830  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 226 aa  53.1  0.000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.456248  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2034  TetR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 228 aa  52.8  0.000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.743283  decreased coverage  0.000716409 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3587  TetR family transcriptional regulator  38.6 
 
 		 242 aa  53.5  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2996  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 237 aa  52.8  0.000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2511  transcriptional regulator, TetR family  47.69 
 
 		 172 aa  53.1  0.000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0225  TetR family transcriptional regulator  31.29 
 
 		 240 aa  53.1  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.512739 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1451  transcriptional regulator, TetR family  41.25 
 
 		 428 aa  53.5  0.000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3457  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 238 aa  53.1  0.000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0205  TetR family transcriptional regulator  32.1 
 
 		 208 aa  52.8  0.000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.555741  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0361  TetR family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 212 aa  52.4  0.000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.23201  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2692  TetR family transcriptional regulator  25.57 
 
 		 195 aa  52.4  0.000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.728372  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2304  TetR family transcriptional regulator  47.46 
 
 		 225 aa  52.8  0.000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.808365 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0596  TetR family transcriptional regulator  30.89 
 
 		 203 aa  52.8  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0286  TetR family transcriptional regulator  48.15 
 
 		 177 aa  52.8  0.000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.945519  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2245  TetR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 212 aa  52.4  0.000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2171  TetR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 212 aa  52.4  0.000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.068169  normal  0.22854 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1840  transcriptional regulator, TetR family  50 
 
 		 415 aa  52.4  0.000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2126  TetR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 212 aa  52.4  0.000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00345057  n/a   
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4531  hypothetical protein  38.46 
 
 		 227 aa  52  0.000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2258  transcriptional regulator, TetR family  38.46 
 
 		 212 aa  52.4  0.000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.968255  hitchhiker  0.0010637 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2773  TetR family transcriptional regulator  43.55 
 
 		 295 aa  52  0.000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00136461  normal  0.297144 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2116  regulatory protein, TetR  42.37 
 
 		 214 aa  51.6  0.000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000000093152  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5492  transcriptional regulator, TetR family  46.3 
 
 		 177 aa  51.6  0.000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.56711 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1862  TetR family transcriptional regulator  42.37 
 
 		 213 aa  51.6  0.000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1888  transcriptional regulator, TetR family protein  42.37 
 
 		 213 aa  51.6  0.000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2066  TetR family transcriptional regulator  42.37 
 
 		 211 aa  51.6  0.000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.612632  hitchhiker  0.000107098 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2493  TetR family transcriptional regulator  42.37 
 
 		 239 aa  51.6  0.000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2339  TetR family transcriptional regulator  42.37 
 
 		 215 aa  51.6  0.000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.519522  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1281  TetR family transcriptional regulator  38.98 
 
 		 210 aa  51.6  0.000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.781108  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2543  TetR family transcriptional regulator  42.37 
 
 		 211 aa  51.6  0.000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.214617 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1665  transcriptional regulator, TetR family  38.38 
 
 		 223 aa  51.6  0.000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.117381  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1699  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 290 aa  51.6  0.000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0964215  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>