More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mjls_3878 on replicon NC_009077
Organism: Mycobacterium sp. JLS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009077  Mjls_3878  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 198 aa  395  1e-109  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.348506 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3892  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 198 aa  395  1e-109  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3966  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 198 aa  395  1e-109  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.176455  normal  0.497396 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3873  regulatory protein TetR  62.56 
 
 		 205 aa  250  1e-65  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2304  TetR family transcriptional regulator  62.89 
 
 		 225 aa  249  2e-65  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.808365 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4342  TetR family transcriptional regulator  62.83 
 
 		 218 aa  247  9e-65  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0243053 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3024  TetR family transcriptional regulator  31.05 
 
 		 197 aa  82  0.000000000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.101312  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4624  TetR family transcriptional regulator  30.53 
 
 		 197 aa  75.9  0.0000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3234  TetR family transcriptional regulator  29.9 
 
 		 228 aa  75.1  0.0000000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.20483  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3223  TetR family transcriptional regulator  29.9 
 
 		 228 aa  75.1  0.0000000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3285  TetR family transcriptional regulator  29.9 
 
 		 228 aa  75.1  0.0000000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.678887  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3721  transcriptional regulator, TetR family  34.68 
 
 		 200 aa  70.1  0.00000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.522362  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9268  putative transcriptional regulator, TetR family  32.63 
 
 		 193 aa  63.2  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.596158 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0366  TetR family transcriptional regulator  29.95 
 
 		 232 aa  62  0.000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.024079 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1490  TetR family transcriptional regulator  27.23 
 
 		 210 aa  58.5  0.00000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5414  transcriptional regulator, TetR family  43.59 
 
 		 192 aa  58.5  0.00000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0653448  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1512  TetR family transcriptional regulator  27.23 
 
 		 210 aa  58.5  0.00000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1488  TetR family transcriptional regulator  27.23 
 
 		 210 aa  58.5  0.00000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4083  TetR family transcriptional regulator  30.23 
 
 		 214 aa  58.2  0.00000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.843798  normal  0.223709 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0170  transcriptional regulator, TetR family  38.1 
 
 		 201 aa  57.8  0.0000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.307357  hitchhiker  0.00190078 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1317  regulatory protein TetR  27.6 
 
 		 232 aa  57  0.0000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0987  regulatory protein TetR  29.26 
 
 		 192 aa  57  0.0000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.383045  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2461  transcriptional regulator, TetR family  31.15 
 
 		 196 aa  56.6  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000138739  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33280  transcriptional regulator  50 
 
 		 212 aa  56.6  0.0000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.815894  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0438  transcriptional regulator, TetR family  42.37 
 
 		 219 aa  57.4  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.275927  normal  0.867846 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2581  regulatory protein, TetR  36.21 
 
 		 197 aa  57  0.0000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.155315 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2067  TetR family transcriptional regulator  35.56 
 
 		 216 aa  56.6  0.0000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0265  TetR family transcriptional regulator  32.97 
 
 		 194 aa  55.8  0.0000004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.250901  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0303  transcriptional regulator, TetR family  43.33 
 
 		 200 aa  55.5  0.0000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.00708396  normal  0.627467 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4830  transcriptional regulator, TetR family  41.38 
 
 		 226 aa  55.1  0.0000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.456248  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2111  transcriptional regulator, TetR family  35.8 
 
 		 214 aa  54.3  0.000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.780559 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2426  TetR family transcriptional regulator  29.5 
 
 		 205 aa  54.3  0.000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4373  transcriptional regulator, TetR family  26.15 
 
 		 229 aa  54.3  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.335963  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1281  TetR family transcriptional regulator  37.18 
 
 		 210 aa  53.5  0.000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.781108  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2776  TetR family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 197 aa  53.1  0.000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.832438  hitchhiker  0.000578318 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3190  TetR family transcriptional regulator  43.66 
 
 		 202 aa  53.1  0.000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.0000000548437  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1027  TetR family transcriptional regulator  35.9 
 
 		 210 aa  53.1  0.000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0369  TetR family transcriptional regulator  29.02 
 
 		 190 aa  53.5  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.87327 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2888  TetR family transcriptional regulator  39.06 
 
 		 231 aa  53.5  0.000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.465905  normal  0.0499957 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3459  TetR family transcriptional regulator  34.17 
 
 		 324 aa  53.1  0.000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000855252 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0319  transcriptional regulator, TetR family  40.68 
 
 		 206 aa  53.1  0.000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4426  TetR family transcriptional regulator  35.9 
 
 		 210 aa  52.4  0.000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.062473  normal  0.279059 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0648  transcriptional regulator, TetR family  25.13 
 
 		 247 aa  52.8  0.000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0672593 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3714  TetR family transcriptional regulator  40.68 
 
 		 212 aa  52.4  0.000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3905  transcriptional regulator, TetR family  26.2 
 
 		 194 aa  52  0.000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1387  TetR family transcriptional regulator  35.9 
 
 		 210 aa  52  0.000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.649854  normal  0.844436 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3587  TetR family transcriptional regulator  38.98 
 
 		 242 aa  52  0.000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3421  transcriptional regulator, TetR family  38.98 
 
 		 223 aa  52  0.000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.288907  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0324  TetR family transcriptional regulator  30.61 
 
 		 203 aa  52  0.000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.720161 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3744  transcriptional regulator, TetR family  38.98 
 
 		 223 aa  51.6  0.000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0010  TetR family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 205 aa  51.6  0.000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2034  TetR family transcriptional regulator  39.66 
 
 		 228 aa  51.6  0.000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.743283  decreased coverage  0.000716409 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0570  transcriptional regulator, TetR family  40.54 
 
 		 188 aa  51.6  0.000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4336  TetR family transcriptional regulator  35.9 
 
 		 210 aa  51.6  0.000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.426629 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0679  TetR family transcriptional regulator  39.47 
 
 		 211 aa  51.6  0.000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0314  TetR family transcriptional regulator  39.47 
 
 		 211 aa  51.2  0.000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2773  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 191 aa  51.2  0.000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.704113  normal  0.8573 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1017  repressor protein  39.47 
 
 		 211 aa  51.2  0.000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0857  multidrug efflux pump repressor protein BpeR  39.47 
 
 		 211 aa  51.2  0.000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0057  multidrug efflux pump repressor protein BpeR  39.47 
 
 		 211 aa  51.2  0.000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0852  multidrug efflux pump repressor protein BpeR  39.47 
 
 		 211 aa  51.2  0.000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2443  multidrug efflux pump repressor protein BpeR  39.47 
 
 		 211 aa  51.2  0.000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0390  TetR family transcriptional regulator  38.98 
 
 		 230 aa  51.2  0.000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0609  multidrug efflux pump repressor protein BpeR  39.47 
 
 		 211 aa  51.2  0.000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.780096  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0698  putative transcription regulator protein  26.18 
 
 		 264 aa  50.8  0.00001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00682473  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1797  transcriptional regulator, TetR family  36.04 
 
 		 197 aa  50.8  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000197435  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3195  transcriptional regulator, TetR family  32.94 
 
 		 200 aa  51.2  0.00001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3439  TetR family transcriptional regulator  38.98 
 
 		 239 aa  51.2  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0942  TetR family transcriptional regulator  35.87 
 
 		 208 aa  51.2  0.00001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.0072348  normal  0.323203 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3570  transcriptional regulator, TetR family  44.83 
 
 		 175 aa  51.2  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00083347  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2657  TetR family transcriptional regulator  33.68 
 
 		 213 aa  50.8  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02650  transcriptional regulator, tetR family  49.12 
 
 		 179 aa  50.8  0.00001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2530  TetR family transcriptional regulator  33.68 
 
 		 213 aa  50.8  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.704068 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3457  TetR family transcriptional regulator  41.38 
 
 		 238 aa  51.2  0.00001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0477  TetR family transcriptional regulator  39.66 
 
 		 211 aa  51.2  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.178939  normal  0.0289146 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5054  TetR family transcriptional regulator  49.15 
 
 		 207 aa  50.1  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.817621 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12279  transcriptional regulator  31.69 
 
 		 189 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000321459  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0012  putative AcrAB operon repressor transcription regulator protein  27.04 
 
 		 219 aa  50.1  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.631075  normal  0.0464367 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7001  transcriptional regulator, TetR family  31.75 
 
 		 221 aa  50.4  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4004  TetR family transcriptional regulator  24.39 
 
 		 196 aa  50.1  0.00002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.638592  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1926  TetR family transcriptional regulator  32.93 
 
 		 224 aa  50.4  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.857726  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0008  TetR family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 205 aa  50.1  0.00002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0081  transcriptional regulator, TetR family  31.03 
 
 		 202 aa  50.1  0.00002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0518  TetR family transcriptional regulator  33.72 
 
 		 206 aa  50.1  0.00002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.290772  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5621  transcriptional regulator, TetR family  42.59 
 
 		 195 aa  50.1  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00254336 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2116  transcriptional regulator, TetR family  51.06 
 
 		 192 aa  50.1  0.00002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1515  TetR family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 205 aa  50.1  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.512381  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0010  TetR family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 205 aa  50.1  0.00002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28390  transcriptional regulator  40.91 
 
 		 195 aa  50.1  0.00002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0011  TetR family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 205 aa  50.1  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1405  TetR family transcriptional regulator  41.27 
 
 		 203 aa  50.4  0.00002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.520137 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3779  transcriptional regulator, TetR family  29.23 
 
 		 194 aa  49.7  0.00002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B3018  TetR family transcriptional regulator  41.27 
 
 		 221 aa  50.1  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1035  TetR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 214 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0687  TetR family transcriptional regulator  38.16 
 
 		 261 aa  50.1  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.794796  normal  0.223624 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0010  TetR family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 205 aa  50.1  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.387363  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3399  TetR family transcriptional regulator  28.5 
 
 		 206 aa  50.1  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0861975  normal  0.425291 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1156  TetR family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 205 aa  50.1  0.00002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0394  TetR family transcriptional regulator  41.54 
 
 		 186 aa  50.1  0.00002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.509635  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1436  TetR family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 205 aa  50.1  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>