More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_5284 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



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PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_5284  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 
208 aa  406  1.0000000000000001e-112  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0597036  normal  0.356444 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5248  transcriptional regulator, TetR family  46.15 
 
 
178 aa  133  1.9999999999999998e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1320  TetR family transcriptional regulator  44.92 
 
 
203 aa  124  1e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.010897  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0981  TetR family transcriptional regulator  34.1 
 
 
178 aa  122  4e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4211  transcriptional regulator, TetR family  35.09 
 
 
178 aa  119  3e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.954356 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1094  transcriptional regulator, TetR family  33.95 
 
 
168 aa  108  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2794  transcriptional regulator, TetR family  36.25 
 
 
184 aa  108  6e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2362  TetR family transcriptional regulator  32.75 
 
 
179 aa  106  2e-22  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3570  transcriptional regulator, TetR family  43.31 
 
 
175 aa  102  4e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00083347  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3009  transcriptional regulator, TetR family  37.21 
 
 
187 aa  100  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3260  transcriptional regulator, TetR family  36.05 
 
 
187 aa  99  5e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.323175 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0953  TetR family transcriptional regulator  30.39 
 
 
184 aa  89.4  3e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.712721  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5697  TetR family transcriptional regulator  37.7 
 
 
227 aa  89  4e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.949992  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5991  TetR family transcriptional regulator  39.47 
 
 
244 aa  89  4e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0553876 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6545  TetR family transcriptional regulator  37.16 
 
 
227 aa  89  5e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.129926 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6061  TetR family transcriptional regulator  37.7 
 
 
191 aa  89  5e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.660328  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6105  TetR family transcriptional regulator  37.63 
 
 
201 aa  88.2  7e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.93473  normal  0.666323 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2002  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
183 aa  85.5  5e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.700466  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5866  TetR family transcriptional regulator  37.1 
 
 
236 aa  85.5  6e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2329  TetR family transcriptional regulator  36 
 
 
186 aa  85.1  7e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.148714  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2175  TetR family transcriptional regulator  32.4 
 
 
205 aa  83.2  0.000000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0622  transcriptional regulator, TetR family  32.08 
 
 
181 aa  84  0.000000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4404  TetR family transcriptional regulator  35.9 
 
 
199 aa  82.8  0.000000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0114676  normal  0.191291 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1051  TetR family transcriptional regulator  32.39 
 
 
188 aa  81.6  0.000000000000007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1114  transcriptional regulator, TetR family  33.16 
 
 
186 aa  81.6  0.000000000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.213128 
 
 
-
 
NC_004310  BR1090  TetR family transcriptional regulator  32.39 
 
 
188 aa  81.6  0.000000000000008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0041  TetR family transcriptional regulator  33.76 
 
 
192 aa  81.3  0.00000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0827  transcriptional regulator, TetR family  32.18 
 
 
179 aa  79  0.00000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.843783  normal  0.883408 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1067  transcriptional regulator, TetR family  33.69 
 
 
212 aa  78.6  0.00000000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.530116 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2838  transcriptional regulator, TetR family  40.13 
 
 
183 aa  78.2  0.00000000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1991  transcriptional regulator, TetR family  36.31 
 
 
188 aa  77.4  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0052  transcriptional regulator, TetR family  35.48 
 
 
188 aa  76.6  0.0000000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.612692  normal  0.466149 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3701  TetR family transcriptional regulator  34.59 
 
 
178 aa  77  0.0000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.076632  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2620  TetR family transcriptional regulator  31.43 
 
 
194 aa  77  0.0000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.727172  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13730  transcriptional regulator, TetR family  30.27 
 
 
181 aa  76.6  0.0000000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.839534  normal  0.161793 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1840  transcriptional regulator, TetR family  35.03 
 
 
415 aa  76.3  0.0000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4803  transcriptional regulator, TetR family  36 
 
 
193 aa  75.9  0.0000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.539659  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4107  transcriptional regulator  32.61 
 
 
187 aa  74.7  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.198218  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1451  transcriptional regulator, TetR family  32.97 
 
 
428 aa  73.6  0.000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0730  TetR family transcriptional regulator  27.49 
 
 
187 aa  73.6  0.000000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2511  transcriptional regulator, TetR family  37.22 
 
 
172 aa  73.6  0.000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0872  TetR family transcriptional regulator  30.19 
 
 
190 aa  73.6  0.000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.956466  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0439  transcriptional regulator, TetR family  34.67 
 
 
180 aa  73.6  0.000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3407  transcriptional regulator, TetR family  35.93 
 
 
178 aa  73.9  0.000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3328  regulatory protein, TetR  30.85 
 
 
187 aa  72.8  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8111  putative transcriptional regulator, TetR family  36 
 
 
168 aa  72.4  0.000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47610  putative transcriptional regulator  37.61 
 
 
186 aa  72  0.000000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0763  TetR family transcriptional regulator  34.59 
 
 
183 aa  72  0.000000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.673415  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2202  transcriptional regulator, TetR family  34.55 
 
 
186 aa  71.6  0.000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.243165 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2157  TetR family transcriptional regulator  30.72 
 
 
187 aa  72  0.000000000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.105803  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2560  putative transcription regulator protein  33.33 
 
 
209 aa  71.6  0.000000000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0102643  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2686  TetR family transcriptional regulator  29.61 
 
 
181 aa  70.9  0.00000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.39833  hitchhiker  0.00361312 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2114  TetR family transcriptional regulator  32.47 
 
 
183 aa  70.9  0.00000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.328011  normal 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5492  transcriptional regulator, TetR family  32.48 
 
 
177 aa  71.2  0.00000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.56711 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4428  transcriptional regulator, TetR family  36.78 
 
 
187 aa  70.1  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.89429  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5533  transcriptional regulator, TetR family  31.15 
 
 
222 aa  69.3  0.00000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0286  TetR family transcriptional regulator  33.87 
 
 
177 aa  68.9  0.00000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.945519  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2786  transcriptional regulator, TetR family  32.89 
 
 
190 aa  68.2  0.00000000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.06199  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7518  TetR family transcriptional regulator  31.96 
 
 
185 aa  68.2  0.00000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2389  TetR family transcriptional regulator  31.41 
 
 
200 aa  67.8  0.0000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.979129  normal  0.861655 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2113  transcriptional regulator, TetR family  29.55 
 
 
182 aa  67  0.0000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3641  transcriptional regulator, TetR family  36.05 
 
 
197 aa  66.2  0.0000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.334684 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2360  regulatory protein, TetR  30 
 
 
190 aa  66.2  0.0000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.173305 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2025  transcriptional regulator, TetR family  28.86 
 
 
196 aa  65.1  0.0000000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0232401  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0538  transcriptional regulator, TetR family  53.57 
 
 
195 aa  65.1  0.0000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0880  transcriptional regulator, TetR family  32.28 
 
 
181 aa  64.7  0.000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4488  transcriptional regulator, TetR family  32.39 
 
 
190 aa  63.9  0.000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.14916  normal  0.0536152 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2801  TetR family transcriptional regulator  39.52 
 
 
189 aa  61.2  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1498  TetR family transcriptional regulator  39.52 
 
 
189 aa  61.2  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.437225  normal  0.170332 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48420  putative transcriptional regulator  37.6 
 
 
202 aa  60.5  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0011363  normal  0.230392 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4342  regulatory protein TetR  49.18 
 
 
186 aa  59.7  0.00000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.525641  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4711  transcriptional regulator, TetR family  49.18 
 
 
186 aa  59.7  0.00000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.492793  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3073  TetR family transcriptional regulator  35.43 
 
 
198 aa  59.7  0.00000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5494  transcriptional regulator, TetR family  36.99 
 
 
141 aa  59.3  0.00000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.769028  normal  0.39499 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0121  regulatory protein, TetR  34.13 
 
 
209 aa  58.9  0.00000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.602969 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2349  TetR family transcriptional regulator  34.29 
 
 
357 aa  58.2  0.00000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00426882  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20280  transcriptional regulator, TetR family  43.94 
 
 
213 aa  58.2  0.00000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.612683  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0778  TetR family transcriptional regulator  29.63 
 
 
192 aa  58.2  0.00000009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0124  transcriptional regulator, TetR family  30.69 
 
 
298 aa  57.8  0.0000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3089  TetR family transcriptional regulator  50.85 
 
 
194 aa  57.8  0.0000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.544244  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2753  transcriptional regulator, TetR family  43.96 
 
 
197 aa  57.8  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.920315  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2152  transcriptional regulator, TetR family  31.03 
 
 
185 aa  56.6  0.0000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2973  transcriptional regulator, TetR family  45.07 
 
 
198 aa  57.4  0.0000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2479  transcriptional regulator, TetR family  32.19 
 
 
230 aa  57.4  0.0000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0366  TetR family transcriptional regulator  42.25 
 
 
232 aa  56.2  0.0000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.024079 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3067  TetR family transcriptional regulator  33.76 
 
 
199 aa  56.6  0.0000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3535  TetR family transcriptional regulator  35.2 
 
 
210 aa  56.2  0.0000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.926686  normal  0.288543 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4859  transcriptional regulator, TetR family  31.33 
 
 
186 aa  55.8  0.0000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.205859 
 
 
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NC_010505  Mrad2831_2783  TetR family transcriptional regulator  29.67 
 
 
187 aa  55.8  0.0000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4974  transcriptional regulator, TetR family  30.67 
 
 
186 aa  55.8  0.0000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0603654 
 
 
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NC_009428  Rsph17025_1153  TetR family transcriptional regulator  38.84 
 
 
189 aa  55.5  0.0000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.23421  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3888  transcriptional regulator, TetR family  36.67 
 
 
206 aa  55.8  0.0000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.693202 
 
 
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NC_008726  Mvan_4342  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 
218 aa  55.5  0.0000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0243053 
 
 
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NC_010322  PputGB1_2069  TetR family transcriptional regulator  34.13 
 
 
198 aa  55.1  0.0000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_009656  PSPA7_4161  putative transcriptional regulator  34.68 
 
 
202 aa  55.1  0.0000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.674844  n/a   
 
 
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NC_008726  Mvan_5881  TetR family transcriptional regulator  38.71 
 
 
197 aa  54.7  0.0000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.752924 
 
 
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NC_008463  PA14_47520  putative transcriptional regulator  41.38 
 
 
197 aa  54.7  0.000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_009338  Mflv_2304  TetR family transcriptional regulator  41.57 
 
 
225 aa  53.9  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.808365 
 
 
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NC_014210  Ndas_1836  transcriptional regulator, TetR family  27.23 
 
 
207 aa  54.7  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0359893  normal  0.350648 
 
 
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NC_009485  BBta_5162  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 
193 aa  54.7  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.186575 
 
 
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