More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_4428 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



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Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011004  Rpal_4428  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 
187 aa  377  1e-104  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.89429  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1991  transcriptional regulator, TetR family  46.32 
 
 
188 aa  158  5e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0730  TetR family transcriptional regulator  45.5 
 
 
187 aa  157  8e-38  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2202  transcriptional regulator, TetR family  50.6 
 
 
186 aa  157  9e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.243165 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0041  TetR family transcriptional regulator  46.84 
 
 
192 aa  154  6e-37  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3328  regulatory protein, TetR  44.79 
 
 
187 aa  152  2e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0872  TetR family transcriptional regulator  43.85 
 
 
190 aa  149  2e-35  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.956466  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3009  transcriptional regulator, TetR family  43.85 
 
 
187 aa  145  3e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3260  transcriptional regulator, TetR family  42.25 
 
 
187 aa  142  2e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.323175 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2349  TetR family transcriptional regulator  46.91 
 
 
357 aa  135  2e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00426882  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2329  TetR family transcriptional regulator  40.96 
 
 
186 aa  135  3.0000000000000003e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.148714  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2786  transcriptional regulator, TetR family  37.11 
 
 
190 aa  102  3e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.06199  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6545  TetR family transcriptional regulator  38.89 
 
 
227 aa  99.4  3e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.129926 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5697  TetR family transcriptional regulator  38.89 
 
 
227 aa  98.2  7e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.949992  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6061  TetR family transcriptional regulator  38.89 
 
 
191 aa  98.2  7e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.660328  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4404  TetR family transcriptional regulator  38.1 
 
 
199 aa  97.4  1e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0114676  normal  0.191291 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5991  TetR family transcriptional regulator  37.16 
 
 
244 aa  96.7  2e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0553876 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6105  TetR family transcriptional regulator  35.68 
 
 
201 aa  91.3  8e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.93473  normal  0.666323 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5866  TetR family transcriptional regulator  35.68 
 
 
236 aa  90.9  9e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5494  transcriptional regulator, TetR family  43.97 
 
 
141 aa  89.4  3e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.769028  normal  0.39499 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5284  TetR family transcriptional regulator  36.78 
 
 
208 aa  87  2e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0597036  normal  0.356444 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3570  transcriptional regulator, TetR family  40.11 
 
 
175 aa  85.1  5e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00083347  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0622  transcriptional regulator, TetR family  30.64 
 
 
181 aa  84.3  9e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2362  TetR family transcriptional regulator  29.05 
 
 
179 aa  81.6  0.000000000000006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2025  transcriptional regulator, TetR family  34.42 
 
 
196 aa  81.3  0.000000000000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0232401  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0981  TetR family transcriptional regulator  30.06 
 
 
178 aa  80.1  0.00000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4211  transcriptional regulator, TetR family  28.83 
 
 
178 aa  79  0.00000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.954356 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1094  transcriptional regulator, TetR family  29.87 
 
 
168 aa  76.3  0.0000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0827  transcriptional regulator, TetR family  31.52 
 
 
179 aa  75.9  0.0000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.843783  normal  0.883408 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7518  TetR family transcriptional regulator  36.13 
 
 
185 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5248  transcriptional regulator, TetR family  33.15 
 
 
178 aa  71.2  0.000000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1320  TetR family transcriptional regulator  34.29 
 
 
203 aa  70.5  0.00000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.010897  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2002  TetR family transcriptional regulator  28.74 
 
 
183 aa  67  0.0000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.700466  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4803  transcriptional regulator, TetR family  32.97 
 
 
193 aa  63.9  0.000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.539659  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2511  transcriptional regulator, TetR family  31.67 
 
 
172 aa  63.2  0.000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13730  transcriptional regulator, TetR family  29.12 
 
 
181 aa  63.5  0.000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.839534  normal  0.161793 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2794  transcriptional regulator, TetR family  26.88 
 
 
184 aa  63.2  0.000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0880  transcriptional regulator, TetR family  35.03 
 
 
181 aa  62.4  0.000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8111  putative transcriptional regulator, TetR family  32.7 
 
 
168 aa  60.8  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0953  TetR family transcriptional regulator  28.25 
 
 
184 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.712721  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1933  AcrR family transcriptional regulator  40.26 
 
 
243 aa  60.5  0.00000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.189914  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0666  transcriptional regulator  30.43 
 
 
205 aa  60.1  0.00000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1067  transcriptional regulator, TetR family  27.68 
 
 
212 aa  58.9  0.00000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.530116 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5076  TetR family transcriptional regulator  42.62 
 
 
215 aa  58.5  0.00000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.175697 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4691  TetR family transcriptional regulator  42.62 
 
 
205 aa  58.5  0.00000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.771858  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4777  TetR family transcriptional regulator  42.62 
 
 
205 aa  58.5  0.00000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.681727  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0286  TetR family transcriptional regulator  33.85 
 
 
177 aa  57.8  0.00000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.945519  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5533  transcriptional regulator, TetR family  28.42 
 
 
222 aa  57.4  0.0000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2783  TetR family transcriptional regulator  28.06 
 
 
187 aa  56.6  0.0000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1216  TetR family transcriptional regulator  42.03 
 
 
204 aa  56.2  0.0000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1287  regulatory protein, TetR  43.33 
 
 
234 aa  55.8  0.0000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2157  TetR family transcriptional regulator  28.93 
 
 
187 aa  55.8  0.0000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.105803  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3750  TetR family transcriptional regulator  45.61 
 
 
230 aa  55.8  0.0000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13590  TetR family transcriptional regulator  44.64 
 
 
200 aa  55.5  0.0000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.332381  normal  0.0844747 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0205  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 
208 aa  55.1  0.0000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.555741  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4463  transcriptional regulator, TetR family  53.7 
 
 
204 aa  55.1  0.0000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9308  putative transcriptional regulator, TetR family  32.67 
 
 
231 aa  54.7  0.0000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0733541  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1679  TetR family transcriptional regulator  42.42 
 
 
185 aa  54.7  0.0000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  unclonable  0.00000226335 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2620  TetR family transcriptional regulator  39.13 
 
 
194 aa  54.7  0.0000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.727172  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1483  TetR family transcriptional regulator  39.39 
 
 
197 aa  54.7  0.0000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10440  transcriptional regulator  38.27 
 
 
211 aa  54.7  0.0000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0189255  normal  0.0235057 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5283  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 
208 aa  54.7  0.0000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.261053 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3684  TetR family transcriptional regulator  45.1 
 
 
202 aa  54.7  0.0000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1922  transcriptional regulator, TetR family  35.58 
 
 
201 aa  53.9  0.000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4488  transcriptional regulator, TetR family  39.66 
 
 
190 aa  53.9  0.000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.14916  normal  0.0536152 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2113  transcriptional regulator, TetR family  27.22 
 
 
182 aa  54.3  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7768  putative transcriptional regulator, TetR family  44.44 
 
 
194 aa  53.9  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02650  transcriptional regulator, tetR family  44.05 
 
 
179 aa  53.9  0.000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1039  TetR family transcriptional regulator  38.89 
 
 
201 aa  53.9  0.000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.747573 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1286  transcriptional regulator, TetR family  39.13 
 
 
199 aa  53.5  0.000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000123202 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1702  TetR family transcriptional regulator  34.33 
 
 
311 aa  53.5  0.000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2996  TetR family transcriptional regulator  36.84 
 
 
237 aa  53.5  0.000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3347  TetR family transcriptional regulator  30.46 
 
 
187 aa  53.5  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.084846  normal  0.752924 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0439  transcriptional regulator, TetR family  43.64 
 
 
180 aa  53.5  0.000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3333  TetR family transcriptional regulator  38.57 
 
 
201 aa  53.1  0.000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1027  transcriptional regulator, TetR family  43.14 
 
 
201 aa  53.1  0.000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2293  TetR family transcriptional regulator  34.33 
 
 
247 aa  52.8  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.887651  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0170  transcriptional regulator, TetR family  34.65 
 
 
201 aa  52.8  0.000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.307357  hitchhiker  0.00190078 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1606  TetR family transcriptional regulator  27.88 
 
 
206 aa  52.8  0.000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0686792  normal  0.0717181 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2358  transcriptional regulator, TetR family  37.04 
 
 
216 aa  52.8  0.000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0281012 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4974  transcriptional regulator, TetR family  29.57 
 
 
186 aa  52.8  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0603654 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1006  TetR family transcriptional regulator  43.14 
 
 
189 aa  52.4  0.000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1604  AcrR family transcriptional regulator  29.55 
 
 
221 aa  52.8  0.000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.388293  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1493  TetR family transcriptional regulator  34.33 
 
 
200 aa  52.4  0.000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1408  TetR family transcriptional regulator  34.33 
 
 
200 aa  52.4  0.000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0974  TetR family transcriptional regulator  34.33 
 
 
200 aa  52.4  0.000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.543907  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1153  TetR family transcriptional regulator  33.91 
 
 
189 aa  52.4  0.000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.23421  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3742  transcriptional regulator, TetR family  37.14 
 
 
192 aa  52.4  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0527  TetR family transcriptional regulator  34.33 
 
 
200 aa  52.4  0.000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.474473  n/a   
 
 
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NC_008835  BMA10229_0121  TetR family transcriptional regulator  34.33 
 
 
200 aa  52.4  0.000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_009075  BURPS668_A1058  TetR family transcriptional regulator  34.33 
 
 
200 aa  52.4  0.000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2765  regulatory protein, TetR  37.5 
 
 
210 aa  52  0.000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.267077  n/a   
 
 
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NC_013595  Sros_4583  putative transcriptional regulator, TetR family  37.86 
 
 
200 aa  52  0.000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.181423  normal  0.302497 
 
 
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NC_010501  PputW619_2186  TetR family transcriptional regulator  28.68 
 
 
214 aa  52  0.000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0785456  normal  0.820524 
 
 
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NC_010552  BamMC406_4292  TetR family transcriptional regulator  25.96 
 
 
206 aa  51.6  0.000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_013441  Gbro_3898  regulatory protein TetR  46.97 
 
 
200 aa  51.6  0.000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_011988  Avi_5954  transcriptional regulator TetR family  34.78 
 
 
219 aa  51.6  0.000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_010725  Mpop_0427  transcriptional regulator, TetR family  41.27 
 
 
180 aa  51.6  0.000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_011830  Dhaf_1380  transcriptional regulator, TetR family  37.29 
 
 
214 aa  51.6  0.000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000685689  n/a   
 
 
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NC_011658  BCAH187_A3236  transcriptional regulator, TetR family  27.14 
 
 
194 aa  51.2  0.000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0469246  n/a   
 
 
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