More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_1836 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_1836  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 
207 aa  402  1e-111  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0359893  normal  0.350648 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2212  TetR family transcriptional regulator  68.72 
 
 
198 aa  215  2.9999999999999998e-55  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.326547  normal  0.584634 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2069  regulatory protein, TetR  66.16 
 
 
206 aa  208  6e-53  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.168032  normal  0.867534 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19310  hypothetical protein  41.26 
 
 
215 aa  90.9  1e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0818404  normal  0.200215 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31350  hypothetical protein  35.29 
 
 
203 aa  90.5  2e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.112877  normal  0.357558 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5734  transcriptional regulator, TetR family  35.47 
 
 
199 aa  87.4  1e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.801726 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2774  transcriptional regulator, TetR family  37.79 
 
 
208 aa  85.5  6e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2422  transcriptional regulator, TetR family  37.06 
 
 
197 aa  84  0.000000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000265027  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0541  transcriptional regulator, TetR family  35.08 
 
 
192 aa  83.2  0.000000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.451413  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1664  transcriptional regulator, TetR family  32.18 
 
 
197 aa  77.4  0.0000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.294171  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4915  transcriptional regulator, TetR family  31.61 
 
 
206 aa  76.6  0.0000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.259096  normal  0.574827 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5235  transcriptional regulator  33.7 
 
 
207 aa  75.9  0.0000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.16745 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1591  TetR family transcriptional regulator  30.85 
 
 
215 aa  72.8  0.000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.194821 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7124  transcriptional regulator  34.3 
 
 
203 aa  68.2  0.00000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8695  transcriptional regulator, TetR family  33.16 
 
 
203 aa  68.2  0.00000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.650286 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1335  transcriptional regulator, TetR family  41.28 
 
 
194 aa  67.4  0.0000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.293374 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2076  transcriptional regulator, TetR family  33.51 
 
 
209 aa  66.6  0.0000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.954712 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2813  TetR family transcriptional regulator  30.56 
 
 
215 aa  65.9  0.0000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0254  transcriptional regulator, TetR family  33.93 
 
 
198 aa  64.3  0.000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.631026 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3495  putative transcriptional regulator, TetR family  28.92 
 
 
177 aa  63.5  0.000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0130  TetR family transcriptional regulator  34.12 
 
 
197 aa  63.2  0.000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.943831  normal  0.482465 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0452  transcriptional regulator, TetR family  31.21 
 
 
207 aa  62.8  0.000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2881  transcriptional regulator, TetR family  27.81 
 
 
367 aa  62.8  0.000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0280  TetR family transcriptional regulator  28.82 
 
 
196 aa  62  0.000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5790  hypothetical protein  29.41 
 
 
207 aa  61.6  0.000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.209005  normal  0.0606988 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3781  TetR family transcriptional regulator  30.12 
 
 
214 aa  60.8  0.00000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014159  Tpau_4308  transcriptional regulator, TetR family  36.78 
 
 
195 aa  60.1  0.00000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0100295  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2281  regulatory protein, TetR  31.07 
 
 
205 aa  60.1  0.00000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.45314 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2399  TetR family transcriptional regulator  31.4 
 
 
204 aa  59.3  0.00000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0482124  hitchhiker  0.0000585185 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2314  transcriptional regulator, TetR family  30.64 
 
 
213 aa  58.9  0.00000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.251224 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1012  transcriptional regulator, TetR family  29.05 
 
 
212 aa  58.9  0.00000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.156612  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2687  transcriptional regulator, TetR family  39.13 
 
 
202 aa  58.2  0.00000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.782088  normal  0.486602 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1339  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 
308 aa  57.4  0.0000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.752137  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3573  transcriptional regulator, TetR family  29.37 
 
 
196 aa  57.4  0.0000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0301  transcriptional regulator, TetR family  31.95 
 
 
199 aa  57  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0864199  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5773  TetR family transcriptional regulator  33.54 
 
 
198 aa  57  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6138  TetR family transcriptional regulator  33.54 
 
 
198 aa  57  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.890581 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6767  transcriptional regulator, TetR family  33.92 
 
 
177 aa  57.4  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.979262  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7752  putative transcriptional regulator, TetR family  29.59 
 
 
202 aa  56.6  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25180  transcriptional regulator, tetR family  38.75 
 
 
206 aa  57  0.0000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25560  transcriptional regulator  29.34 
 
 
207 aa  57.4  0.0000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1921  transcriptional regulator, TetR family  28.74 
 
 
197 aa  56.6  0.0000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0409606  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3314  transcriptional regulator, TetR family  24.86 
 
 
194 aa  56.2  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5992  transcriptional regulator, TetR family  28.93 
 
 
199 aa  55.8  0.0000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.396143  normal  0.47391 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2803  transcriptional regulator, TetR family  24.86 
 
 
194 aa  55.8  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.014286  normal  0.214284 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5404  transcriptional regulator, TetR family  27.98 
 
 
192 aa  55.8  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0587042  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2855  transcriptional regulator, TetR family  23.24 
 
 
199 aa  55.8  0.0000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00414349  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0378  TetR family transcriptional regulator  23.37 
 
 
199 aa  55.5  0.0000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.585496  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0555  transcriptional regulator BetI  30.12 
 
 
194 aa  55.5  0.0000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3466  TetR family transcriptional regulator  25.32 
 
 
200 aa  55.1  0.0000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1671  TetR family transcriptional regulator  34.91 
 
 
201 aa  55.1  0.0000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.290262  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2737  TetR family transcriptional regulator  28.49 
 
 
220 aa  55.1  0.0000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3936  TetR family transcriptional regulator  30.73 
 
 
197 aa  55.1  0.0000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0494347  normal  0.157135 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4367  transcriptional regulator, TetR family  30.1 
 
 
201 aa  54.7  0.0000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3685  transcriptional regulator, TetR family  27.8 
 
 
199 aa  53.9  0.000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0145  TetR family transcriptional regulator  29.68 
 
 
202 aa  54.3  0.000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.437687  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9052  TetR family transcriptional regulator  31.15 
 
 
193 aa  54.3  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1493  transcriptional regulator, TetR family  31.84 
 
 
198 aa  54.3  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.127102 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2762  transcriptional regulator, TetR family  28.87 
 
 
207 aa  54.3  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.598965  normal  0.857853 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3494  transcriptional regulator, TetR family  27.33 
 
 
208 aa  53.5  0.000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5475  transcriptional regulator, TetR family  37.4 
 
 
202 aa  53.9  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7672  TetR family transcriptional regulator  30.18 
 
 
198 aa  53.1  0.000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.245363  normal  0.688993 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3692  TetR family transcriptional regulator  27.06 
 
 
244 aa  52.8  0.000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.674174  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4006  regulatory protein, TetR  29.67 
 
 
219 aa  52.4  0.000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.722695  normal  0.0616898 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2779  transcriptional regulator, TetR family  29.9 
 
 
185 aa  52.4  0.000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.441306  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4165  TetR family transcriptional regulator  27.06 
 
 
232 aa  52.4  0.000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.367589  normal  0.612517 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1218  transcriptional regulator, TetR family  37.37 
 
 
206 aa  51.6  0.000007  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0651  TetR family transcriptional regulator  30.05 
 
 
218 aa  51.6  0.000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0025795  normal  0.249536 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5711  TetR family transcriptional regulator  30.1 
 
 
245 aa  51.6  0.000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3377  transcriptional regulator, TetR family  26.35 
 
 
197 aa  51.6  0.000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.27921  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4918  TetR family transcriptional regulator  32.73 
 
 
208 aa  51.6  0.000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.141388  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3503  TetR family transcriptional regulator  26.8 
 
 
198 aa  51.6  0.000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5007  TetR family transcriptional regulator  32.73 
 
 
208 aa  51.6  0.000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.324898  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5300  TetR family transcriptional regulator  32.73 
 
 
208 aa  51.2  0.000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.104655  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5035  transcriptional regulator BetI  29.76 
 
 
194 aa  50.8  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.496722  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3270  transcriptional regulator BetI  30.88 
 
 
194 aa  51.2  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4510  transcriptional regulator BetI  29.76 
 
 
194 aa  50.8  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5184  transcriptional regulator BetI  30.88 
 
 
194 aa  51.2  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.14696  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2202  transcriptional regulator, TetR family  48.08 
 
 
186 aa  51.2  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.243165 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5098  transcriptional regulator BetI  30.88 
 
 
194 aa  51.2  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1436  TetR family transcriptional regulator  29.57 
 
 
197 aa  51.2  0.00001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5284  TetR family transcriptional regulator  28.03 
 
 
208 aa  50.4  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0597036  normal  0.356444 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3046  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  25.7 
 
 
216 aa  50.4  0.00002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.303422  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2507  TetR family transcriptional regulator  30.3 
 
 
211 aa  50.4  0.00002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00142913 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2129  TetR family transcriptional regulator  26.74 
 
 
210 aa  50.1  0.00002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3308  transcriptional regulator BetI  40.79 
 
 
196 aa  50.4  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1067  TetR family transcriptional regulator  23.7 
 
 
202 aa  49.7  0.00003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2742  transcriptional regulator, TetR family  30.11 
 
 
207 aa  49.7  0.00003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3704  TetR family transcriptional regulator  27.61 
 
 
202 aa  49.7  0.00003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1337  TetR family transcriptional regulator  27.59 
 
 
182 aa  50.1  0.00003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.143088 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0059  transcriptional regulator, TetR family  21.57 
 
 
194 aa  50.1  0.00003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00007304  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1270  TetR family transcriptional regulator  38.24 
 
 
208 aa  50.1  0.00003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0484434 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4302  transcriptional regulator, TetR family  29.07 
 
 
223 aa  49.3  0.00004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7097  TetR family transcriptional regulator  31.07 
 
 
206 aa  49.3  0.00004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3538  transcriptional regulator BetI  30.49 
 
 
194 aa  49.3  0.00004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0961  TetR family transcriptional regulator  29.53 
 
 
202 aa  49.7  0.00004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0186381 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0716  TetR family transcriptional regulator  40.58 
 
 
223 aa  49.3  0.00004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0951056 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1244  TetR family transcriptional regulator  35.63 
 
 
206 aa  49.3  0.00004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5060  transcriptional regulator BetI  42.11 
 
 
195 aa  48.9  0.00005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0255482 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5718  transcriptional regulator, TetR family  33.04 
 
 
212 aa  48.9  0.00005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.283499  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>