More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_2114 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008347  Mmar10_2114  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 183 aa  370  1e-102  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.328011  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1451  transcriptional regulator, TetR family  39.77 
 
 		 428 aa  99.4  2e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1840  transcriptional regulator, TetR family  37.65 
 
 		 415 aa  97.1  1e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4859  transcriptional regulator, TetR family  37.43 
 
 		 186 aa  94  1e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.205859 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1114  transcriptional regulator, TetR family  36.57 
 
 		 186 aa  93.2  2e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.213128 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4342  regulatory protein TetR  36.02 
 
 		 186 aa  91.7  5e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.525641  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4711  transcriptional regulator, TetR family  36.02 
 
 		 186 aa  92  5e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.492793  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2794  transcriptional regulator, TetR family  32 
 
 		 184 aa  91.7  6e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3570  transcriptional regulator, TetR family  32.75 
 
 		 175 aa  90.1  1e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00083347  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0622  transcriptional regulator, TetR family  32.79 
 
 		 181 aa  89.4  3e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4211  transcriptional regulator, TetR family  35.84 
 
 		 178 aa  88.2  6e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.954356 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3701  TetR family transcriptional regulator  38.01 
 
 		 178 aa  86.3  2e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.076632  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1094  transcriptional regulator, TetR family  34.32 
 
 		 168 aa  84  0.000000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2620  TetR family transcriptional regulator  31.61 
 
 		 194 aa  84  0.000000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.727172  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1051  TetR family transcriptional regulator  32.75 
 
 		 188 aa  82.4  0.000000000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1090  TetR family transcriptional regulator  32.56 
 
 		 188 aa  81.6  0.000000000000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0981  TetR family transcriptional regulator  31.18 
 
 		 178 aa  81.3  0.000000000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1320  TetR family transcriptional regulator  37.85 
 
 		 203 aa  80.1  0.00000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.010897  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2362  TetR family transcriptional regulator  30.18 
 
 		 179 aa  79  0.00000000000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2783  TetR family transcriptional regulator  35.96 
 
 		 187 aa  78.6  0.00000000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02650  transcriptional regulator, tetR family  33.15 
 
 		 179 aa  78.2  0.00000000000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5248  transcriptional regulator, TetR family  39.07 
 
 		 178 aa  77.8  0.00000000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5533  transcriptional regulator, TetR family  31.15 
 
 		 222 aa  76.3  0.0000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3407  transcriptional regulator, TetR family  37.5 
 
 		 178 aa  76.6  0.0000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3984  TetR family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 191 aa  75.9  0.0000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.567303 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8111  putative transcriptional regulator, TetR family  33.14 
 
 		 168 aa  76.3  0.0000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2002  TetR family transcriptional regulator  31.09 
 
 		 183 aa  75.5  0.0000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.700466  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2175  TetR family transcriptional regulator  30.05 
 
 		 205 aa  75.1  0.0000000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2838  transcriptional regulator, TetR family  35 
 
 		 183 aa  73.9  0.000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2157  TetR family transcriptional regulator  35.44 
 
 		 187 aa  73.6  0.000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.105803  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5162  TetR family transcriptional regulator  31.95 
 
 		 193 aa  72.4  0.000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.186575 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5284  TetR family transcriptional regulator  33.96 
 
 		 208 aa  71.6  0.000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0597036  normal  0.356444 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0052  transcriptional regulator, TetR family  34.19 
 
 		 188 aa  71.2  0.000000000007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.612692  normal  0.466149 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2389  TetR family transcriptional regulator  32.05 
 
 		 200 aa  70.5  0.00000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.979129  normal  0.861655 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2560  putative transcription regulator protein  32.93 
 
 		 209 aa  69.7  0.00000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0102643  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47610  putative transcriptional regulator  36.99 
 
 		 186 aa  70.1  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0763  TetR family transcriptional regulator  32.9 
 
 		 183 aa  69.3  0.00000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.673415  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2152  transcriptional regulator, TetR family  52.54 
 
 		 185 aa  68.6  0.00000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4404  TetR family transcriptional regulator  29.89 
 
 		 199 aa  68.9  0.00000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0114676  normal  0.191291 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0827  transcriptional regulator, TetR family  30.64 
 
 		 179 aa  68.6  0.00000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.843783  normal  0.883408 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2511  transcriptional regulator, TetR family  34.29 
 
 		 172 aa  67.4  0.0000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2686  TetR family transcriptional regulator  32.05 
 
 		 181 aa  67.4  0.0000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.39833  hitchhiker  0.00361312 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0439  transcriptional regulator, TetR family  33.12 
 
 		 180 aa  66.2  0.0000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4107  transcriptional regulator  36.11 
 
 		 187 aa  65.5  0.0000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.198218  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2113  transcriptional regulator, TetR family  29.61 
 
 		 182 aa  65.1  0.0000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0538  transcriptional regulator, TetR family  49.15 
 
 		 195 aa  64.3  0.0000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1067  transcriptional regulator, TetR family  32.16 
 
 		 212 aa  63.5  0.000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.530116 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0124  transcriptional regulator, TetR family  30.25 
 
 		 298 aa  62.4  0.000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2801  TetR family transcriptional regulator  34.84 
 
 		 189 aa  62  0.000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1498  TetR family transcriptional regulator  34.84 
 
 		 189 aa  61.2  0.000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.437225  normal  0.170332 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0778  TetR family transcriptional regulator  29.45 
 
 		 192 aa  61.2  0.000000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1884  TetR family transcriptional regulator  31.74 
 
 		 189 aa  60.8  0.00000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.652086  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0880  transcriptional regulator, TetR family  46.15 
 
 		 181 aa  60.8  0.00000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20280  transcriptional regulator, TetR family  34.65 
 
 		 213 aa  58.9  0.00000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.612683  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4488  transcriptional regulator, TetR family  29.79 
 
 		 190 aa  58.2  0.00000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.14916  normal  0.0536152 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2940  TetR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 188 aa  58.2  0.00000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.333542  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3009  transcriptional regulator, TetR family  27.93 
 
 		 187 aa  56.6  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2360  regulatory protein, TetR  40.51 
 
 		 190 aa  56.6  0.0000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.173305 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2192  transcriptional regulator, TetR family  29.61 
 
 		 191 aa  56.2  0.0000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1116  TetR family transcriptional regulator  32.72 
 
 		 184 aa  56.2  0.0000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13730  transcriptional regulator, TetR family  46.43 
 
 		 181 aa  55.8  0.0000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.839534  normal  0.161793 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5492  transcriptional regulator, TetR family  29.53 
 
 		 177 aa  55.5  0.0000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.56711 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0429  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 213 aa  55.8  0.0000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0148562 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1665  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 223 aa  55.5  0.0000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.117381  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2560  transcriptional regulator, TetR family  42.67 
 
 		 196 aa  55.1  0.0000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.199189  normal  0.158626 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4404  TetR family transcriptional regulator  28.46 
 
 		 213 aa  55.1  0.0000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1153  TetR family transcriptional regulator  52.83 
 
 		 189 aa  55.1  0.0000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.23421  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3260  transcriptional regulator, TetR family  27.37 
 
 		 187 aa  54.7  0.0000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.323175 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5527  transcriptional regulator, TetR family  27.55 
 
 		 203 aa  53.5  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3714  TetR family transcriptional regulator  44.64 
 
 		 212 aa  52.8  0.000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3457  TetR family transcriptional regulator  37.88 
 
 		 238 aa  52.8  0.000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0286  TetR family transcriptional regulator  32.28 
 
 		 177 aa  52  0.000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.945519  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4974  transcriptional regulator, TetR family  27.13 
 
 		 186 aa  51.6  0.000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0603654 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5155  TetR family transcriptional regulator  28.33 
 
 		 201 aa  51.2  0.000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1825  TetR family transcriptional regulator  27.2 
 
 		 198 aa  51.2  0.000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37450  transcriptional regulator  31.75 
 
 		 177 aa  51.2  0.000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0726232  normal  0.587989 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4534  TetR family transcriptional regulator  28.33 
 
 		 201 aa  51.2  0.000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5704  TetR family transcriptional regulator  28.33 
 
 		 201 aa  51.2  0.000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.013286 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3175  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 201 aa  50.4  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1991  transcriptional regulator, TetR family  29.21 
 
 		 188 aa  50.4  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3328  regulatory protein, TetR  27.84 
 
 		 187 aa  50.8  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32940  transcriptional regulator, TetR family  31.15 
 
 		 187 aa  50.4  0.00001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1201  transcription regulator protein  31.11 
 
 		 209 aa  50.1  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.582864  normal  0.871194 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0502  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 221 aa  50.1  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0929  transcriptional regulator, TetR family  33.9 
 
 		 180 aa  50.1  0.00002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0615031  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2329  TetR family transcriptional regulator  45.61 
 
 		 186 aa  49.7  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.148714  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8103  transcriptional regulator, TetR family  49.12 
 
 		 223 aa  49.7  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1045  transcriptional regulator, TetR family  32.56 
 
 		 222 aa  50.1  0.00002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1014  TetR family transcriptional regulator  35.21 
 
 		 212 aa  50.1  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3469  transcriptional regulator, TetR family  37.5 
 
 		 219 aa  49.7  0.00002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.930137  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2186  TetR family transcriptional regulator  36.76 
 
 		 214 aa  50.1  0.00002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0785456  normal  0.820524 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1985  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 206 aa  49.7  0.00002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0693  TetR family transcriptional regulator  41.82 
 
 		 207 aa  49.7  0.00003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.000000831417  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2067  TetR family transcriptional regulator  41.82 
 
 		 216 aa  49.3  0.00003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0319  transcriptional regulator, TetR family  32.91 
 
 		 206 aa  48.9  0.00004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4604  transcriptional regulator, TetR family  31.71 
 
 		 255 aa  48.9  0.00004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2580  TetR family transcriptional regulator  35.59 
 
 		 211 aa  48.9  0.00005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.257801 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1673  TetR family transcriptional regulator  32.94 
 
 		 216 aa  48.5  0.00005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.947806  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1778  TetR family transcriptional regulator  24.86 
 
 		 199 aa  48.5  0.00005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0789135  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2888  TetR family transcriptional regulator  32.18 
 
 		 231 aa  48.5  0.00005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.465905  normal  0.0499957 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>