More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_4803 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



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Organism name
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Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_4803  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 193 aa  377  1e-104  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.539659  n/a   
 
 
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NC_013216  Dtox_2794  transcriptional regulator, TetR family  27.43 
 
 		 184 aa  80.1  0.00000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1320  TetR family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 203 aa  79.3  0.00000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.010897  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5248  transcriptional regulator, TetR family  35.52 
 
 		 178 aa  79  0.00000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5284  TetR family transcriptional regulator  36 
 
 		 208 aa  76.6  0.0000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0597036  normal  0.356444 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3570  transcriptional regulator, TetR family  38.4 
 
 		 175 aa  75.1  0.0000000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00083347  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2362  TetR family transcriptional regulator  27.33 
 
 		 179 aa  68.6  0.00000000006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4211  transcriptional regulator, TetR family  27.49 
 
 		 178 aa  67.4  0.0000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.954356 
 
 
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NC_009664  Krad_2479  transcriptional regulator, TetR family  43.18 
 
 		 230 aa  67.4  0.0000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0981  TetR family transcriptional regulator  27.68 
 
 		 178 aa  67.4  0.0000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1094  transcriptional regulator, TetR family  28.48 
 
 		 168 aa  65.5  0.0000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1991  transcriptional regulator, TetR family  37.5 
 
 		 188 aa  64.7  0.0000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2202  transcriptional regulator, TetR family  36.46 
 
 		 186 aa  63.2  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.243165 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2349  TetR family transcriptional regulator  39.78 
 
 		 357 aa  62.8  0.000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00426882  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13730  transcriptional regulator, TetR family  31.49 
 
 		 181 aa  61.6  0.000000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.839534  normal  0.161793 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2329  TetR family transcriptional regulator  38.04 
 
 		 186 aa  61.6  0.000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.148714  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2511  transcriptional regulator, TetR family  49.35 
 
 		 172 aa  60.8  0.00000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6545  TetR family transcriptional regulator  30.85 
 
 		 227 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.129926 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5866  TetR family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 236 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4404  TetR family transcriptional regulator  39.42 
 
 		 199 aa  60.1  0.00000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0114676  normal  0.191291 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0730  TetR family transcriptional regulator  27.01 
 
 		 187 aa  59.7  0.00000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5991  TetR family transcriptional regulator  29.57 
 
 		 244 aa  59.3  0.00000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0553876 
 
 
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NC_008062  Bcen_5697  TetR family transcriptional regulator  30.32 
 
 		 227 aa  59.3  0.00000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.949992  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2620  TetR family transcriptional regulator  43.24 
 
 		 194 aa  59.3  0.00000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.727172  n/a   
 
 
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NC_008392  Bamb_6105  TetR family transcriptional regulator  30.57 
 
 		 201 aa  59.3  0.00000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.93473  normal  0.666323 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6061  TetR family transcriptional regulator  30.32 
 
 		 191 aa  59.3  0.00000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.660328  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2801  TetR family transcriptional regulator  47.5 
 
 		 189 aa  58.9  0.00000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0041  TetR family transcriptional regulator  28.65 
 
 		 192 aa  58.9  0.00000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009049  Rsph17029_1498  TetR family transcriptional regulator  47.5 
 
 		 189 aa  58.9  0.00000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.437225  normal  0.170332 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0349  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 232 aa  58.9  0.00000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011369  Rleg2_3009  transcriptional regulator, TetR family  39.33 
 
 		 187 aa  58.2  0.00000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2629  transcriptional regulator, TetR family  35.71 
 
 		 212 aa  57.8  0.00000009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1824  TetR family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 224 aa  57.8  0.00000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.87921  normal  0.175095 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2305  transcriptional regulator RutR  35.71 
 
 		 212 aa  57.8  0.00000009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_004310  BR0280  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 227 aa  57.4  0.0000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.980178  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2838  transcriptional regulator, TetR family  32.12 
 
 		 183 aa  57.4  0.0000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0294  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 227 aa  57.4  0.0000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.136884  n/a   
 
 
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NC_013093  Amir_2113  transcriptional regulator, TetR family  40.66 
 
 		 182 aa  57.4  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3701  TetR family transcriptional regulator  37.37 
 
 		 178 aa  57.4  0.0000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.076632  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1250  transcriptional regulator RutR  35.71 
 
 		 212 aa  57.8  0.0000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2002  TetR family transcriptional regulator  37.11 
 
 		 183 aa  57.8  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.700466  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01016  predicted DNA-binding transcriptional regulator  35.71 
 
 		 212 aa  57  0.0000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1128  transcriptional regulator RutR  35.71 
 
 		 212 aa  57  0.0000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0872  TetR family transcriptional regulator  31.19 
 
 		 190 aa  56.6  0.0000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.956466  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1499  TetR family transcriptional regulator  36.71 
 
 		 203 aa  56.6  0.0000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0951967  normal  1 
 
 
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NC_009801  EcE24377A_1131  transcriptional regulator RutR  34.69 
 
 		 212 aa  56.6  0.0000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.33999  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0541  TetR family transcriptional regulator  32.39 
 
 		 220 aa  56.6  0.0000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2582  TetR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 212 aa  57  0.0000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.120721 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0622  transcriptional regulator, TetR family  37.5 
 
 		 181 aa  56.6  0.0000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0186  TetR family transcriptional regulator  47.27 
 
 		 203 aa  56.2  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.625871  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2112  transcriptional regulator RutR  34.78 
 
 		 212 aa  55.8  0.0000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1081  HTH-type transcriptional regulator RutR  34.69 
 
 		 212 aa  55.8  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1231  HTH-type transcriptional regulator RutR  27.72 
 
 		 212 aa  55.8  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.696174  normal  0.680174 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3328  regulatory protein, TetR  27.92 
 
 		 187 aa  56.2  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011094  SeSA_A1186  HTH-type transcriptional regulator RutR  34.69 
 
 		 212 aa  55.8  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.151745  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0763  TetR family transcriptional regulator  41.49 
 
 		 183 aa  55.8  0.0000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.673415  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1067  transcriptional regulator, TetR family  42.62 
 
 		 212 aa  55.8  0.0000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.530116 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1819  TetR family transcriptional regulator  47.27 
 
 		 203 aa  56.2  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.191224 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1216  HTH-type transcriptional regulator RutR  34.69 
 
 		 212 aa  55.8  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.591915 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3260  transcriptional regulator, TetR family  37.08 
 
 		 187 aa  55.5  0.0000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.323175 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1153  TetR family transcriptional regulator  45.65 
 
 		 189 aa  55.5  0.0000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.23421  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1196  HTH-type transcriptional regulator RutR  40.85 
 
 		 212 aa  55.1  0.0000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0639  TetR family transcriptional regulator  30.21 
 
 		 220 aa  54.3  0.0000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.307578  hitchhiker  0.000146714 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0594  TetR family transcriptional regulator  30.21 
 
 		 247 aa  54.3  0.000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0201579  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4569  TetR family transcriptional regulator  28.15 
 
 		 220 aa  53.9  0.000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.0000245113  hitchhiker  0.00602594 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2816  hypothetical protein  45.45 
 
 		 222 aa  53.9  0.000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0366008  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8111  putative transcriptional regulator, TetR family  31.11 
 
 		 168 aa  53.9  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0634  TetR family transcriptional regulator  30.21 
 
 		 220 aa  54.3  0.000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000435144  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0675  regulatory protein, TetR  35.37 
 
 		 220 aa  53.5  0.000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1000  regulatory protein, TetR  35.16 
 
 		 242 aa  53.1  0.000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.6882 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1014  TetR family transcriptional regulator  37.84 
 
 		 212 aa  53.5  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0953  TetR family transcriptional regulator  29.65 
 
 		 184 aa  53.9  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.712721  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6560  transcriptional regulator, TetR family  38.67 
 
 		 203 aa  53.1  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0439  transcriptional regulator, TetR family  33.08 
 
 		 180 aa  53.5  0.000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4974  transcriptional regulator, TetR family  38.82 
 
 		 186 aa  53.9  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0603654 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0880  transcriptional regulator, TetR family  56.86 
 
 		 181 aa  53.1  0.000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3206  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  47.27 
 
 		 218 aa  52.8  0.000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1451  transcriptional regulator, TetR family  46.15 
 
 		 428 aa  53.1  0.000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3066  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  47.27 
 
 		 218 aa  52.8  0.000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.283852  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1444  transcriptional regulator, TetR family  35.44 
 
 		 225 aa  52.8  0.000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0101817  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1539  TetR family transcriptional regulator  32.61 
 
 		 212 aa  52.8  0.000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.162694 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2881  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  47.27 
 
 		 218 aa  52.8  0.000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.531949 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2723  transcriptional regulator, TetR family  38.71 
 
 		 224 aa  52.4  0.000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0252111  n/a   
 
 
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NC_007802  Jann_2710  TetR family transcriptional regulator  38.33 
 
 		 203 aa  52.4  0.000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.466457  normal  0.498996 
 
 
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NC_014210  Ndas_1114  transcriptional regulator, TetR family  37.93 
 
 		 186 aa  52.8  0.000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.213128 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2157  TetR family transcriptional regulator  34.81 
 
 		 187 aa  52.4  0.000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.105803  normal  1 
 
 
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NC_009428  Rsph17025_1459  TetR family transcriptional regulator  42.03 
 
 		 203 aa  52.4  0.000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.540117  normal  1 
 
 
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NC_013730  Slin_0827  transcriptional regulator, TetR family  36.11 
 
 		 179 aa  52.8  0.000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.843783  normal  0.883408 
 
 
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NC_013421  Pecwa_1840  transcriptional regulator, TetR family  45.28 
 
 		 415 aa  52.4  0.000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010505  Mrad2831_2783  TetR family transcriptional regulator  37.97 
 
 		 187 aa  52  0.000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010622  Bphy_0477  TetR family transcriptional regulator  38.2 
 
 		 211 aa  52  0.000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.178939  normal  0.0289146 
 
 
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NC_002967  TDE0339  TetR family transcriptional regulator  42.19 
 
 		 205 aa  51.6  0.000007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_004578  PSPTO_1158  transcriptional regulator, TetR family  35.16 
 
 		 218 aa  51.6  0.000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.91676  n/a   
 
 
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NC_008146  Mmcs_5134  TetR family transcriptional regulator  47.37 
 
 		 198 aa  51.6  0.000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008705  Mkms_5223  TetR family transcriptional regulator  45.9 
 
 		 195 aa  51.6  0.000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009077  Mjls_5515  TetR family transcriptional regulator  45.9 
 
 		 195 aa  51.6  0.000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.674737 
 
 
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NC_004578  PSPTO_0771  transcriptional regulator, TetR family  31.52 
 
 		 218 aa  51.2  0.000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.353788  n/a   
 
 
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NC_009439  Pmen_3699  TetR family transcriptional regulator  30.21 
 
 		 220 aa  51.2  0.000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008726  Mvan_0170  TetR family transcriptional regulator  44.12 
 
 		 192 aa  51.2  0.000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.652591  normal  0.659974 
 
 
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NC_014165  Tbis_2871  TetR family transcriptional regulator  37.78 
 
 		 213 aa  51.2  0.000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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