More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_0827 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



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Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_0827  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 179 aa  367  1e-101  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.843783  normal  0.883408 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0730  TetR family transcriptional regulator  36.09 
 
 		 187 aa  97.4  1e-19  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3260  transcriptional regulator, TetR family  33.87 
 
 		 187 aa  95.5  3e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.323175 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3009  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 187 aa  94  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2329  TetR family transcriptional regulator  33.16 
 
 		 186 aa  92.4  3e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.148714  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0872  TetR family transcriptional regulator  31.9 
 
 		 190 aa  83.2  0.000000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.956466  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5284  TetR family transcriptional regulator  32.75 
 
 		 208 aa  79.3  0.00000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0597036  normal  0.356444 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1991  transcriptional regulator, TetR family  30.86 
 
 		 188 aa  78.6  0.00000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0041  TetR family transcriptional regulator  32.73 
 
 		 192 aa  78.2  0.00000000000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4211  transcriptional regulator, TetR family  29.65 
 
 		 178 aa  77  0.0000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.954356 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4404  TetR family transcriptional regulator  30.16 
 
 		 199 aa  77.4  0.0000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0114676  normal  0.191291 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2113  transcriptional regulator, TetR family  28.24 
 
 		 182 aa  75.9  0.0000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0981  TetR family transcriptional regulator  29.65 
 
 		 178 aa  75.5  0.0000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2511  transcriptional regulator, TetR family  29.94 
 
 		 172 aa  75.1  0.0000000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5866  TetR family transcriptional regulator  29.12 
 
 		 236 aa  74.3  0.0000000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6105  TetR family transcriptional regulator  29.44 
 
 		 201 aa  74.3  0.0000000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.93473  normal  0.666323 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3328  regulatory protein, TetR  29.88 
 
 		 187 aa  72.8  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2202  transcriptional regulator, TetR family  29.81 
 
 		 186 aa  72.8  0.000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.243165 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2362  TetR family transcriptional regulator  29.48 
 
 		 179 aa  71.2  0.000000000007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1094  transcriptional regulator, TetR family  29.09 
 
 		 168 aa  70.5  0.00000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2349  TetR family transcriptional regulator  29.7 
 
 		 357 aa  70.9  0.00000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00426882  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6061  TetR family transcriptional regulator  27.62 
 
 		 191 aa  68.6  0.00000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.660328  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5533  transcriptional regulator, TetR family  32 
 
 		 222 aa  67.8  0.00000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3570  transcriptional regulator, TetR family  33.11 
 
 		 175 aa  67  0.0000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00083347  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2794  transcriptional regulator, TetR family  29.76 
 
 		 184 aa  67  0.0000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2114  TetR family transcriptional regulator  30.64 
 
 		 183 aa  67.4  0.0000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.328011  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1451  transcriptional regulator, TetR family  28.83 
 
 		 428 aa  67  0.0000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6545  TetR family transcriptional regulator  27.62 
 
 		 227 aa  67  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.129926 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0439  transcriptional regulator, TetR family  29.48 
 
 		 180 aa  66.2  0.0000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5697  TetR family transcriptional regulator  28.09 
 
 		 227 aa  66.6  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.949992  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13730  transcriptional regulator, TetR family  25.58 
 
 		 181 aa  65.5  0.0000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.839534  normal  0.161793 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1840  transcriptional regulator, TetR family  29.27 
 
 		 415 aa  65.5  0.0000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5991  TetR family transcriptional regulator  27.62 
 
 		 244 aa  64.3  0.0000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0553876 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1320  TetR family transcriptional regulator  32.28 
 
 		 203 aa  63.9  0.000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.010897  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4428  transcriptional regulator, TetR family  31.52 
 
 		 187 aa  63.2  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.89429  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0763  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 183 aa  62.4  0.000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.673415  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5162  TetR family transcriptional regulator  33.78 
 
 		 193 aa  62  0.000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.186575 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2002  TetR family transcriptional regulator  26.26 
 
 		 183 aa  61.6  0.000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.700466  n/a   
 
 
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NC_013526  Tter_2838  transcriptional regulator, TetR family  33.97 
 
 		 183 aa  61.2  0.000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0880  transcriptional regulator, TetR family  54.39 
 
 		 181 aa  61.2  0.000000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7518  TetR family transcriptional regulator  24.7 
 
 		 185 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5494  transcriptional regulator, TetR family  48.48 
 
 		 141 aa  59.7  0.00000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.769028  normal  0.39499 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1153  TetR family transcriptional regulator  46.97 
 
 		 189 aa  58.9  0.00000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.23421  normal  1 
 
 
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NC_011071  Smal_2152  transcriptional regulator, TetR family  25.43 
 
 		 185 aa  58.9  0.00000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2801  TetR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 189 aa  58.5  0.00000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5248  transcriptional regulator, TetR family  37.93 
 
 		 178 aa  58.2  0.00000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1498  TetR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 189 aa  58.2  0.00000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.437225  normal  0.170332 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2175  TetR family transcriptional regulator  44.12 
 
 		 205 aa  57.4  0.0000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8111  putative transcriptional regulator, TetR family  29.53 
 
 		 168 aa  57.4  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2620  TetR family transcriptional regulator  31.29 
 
 		 194 aa  57.4  0.0000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.727172  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1090  TetR family transcriptional regulator  36.17 
 
 		 188 aa  57  0.0000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1834  transcriptional regulator, TetR family  33.67 
 
 		 196 aa  56.2  0.0000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.353647 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1051  TetR family transcriptional regulator  36.17 
 
 		 188 aa  57  0.0000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3333  TetR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 201 aa  55.8  0.0000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0538  transcriptional regulator, TetR family  30 
 
 		 195 aa  56.2  0.0000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2783  TetR family transcriptional regulator  40.74 
 
 		 187 aa  55.8  0.0000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0622  transcriptional regulator, TetR family  40.91 
 
 		 181 aa  55.8  0.0000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4107  transcriptional regulator  27.22 
 
 		 187 aa  55.5  0.0000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.198218  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47610  putative transcriptional regulator  26.63 
 
 		 186 aa  55.1  0.0000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2786  transcriptional regulator, TetR family  29.7 
 
 		 190 aa  54.7  0.0000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.06199  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2479  transcriptional regulator, TetR family  45.9 
 
 		 230 aa  54.3  0.0000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4711  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 186 aa  53.9  0.000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.492793  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1884  TetR family transcriptional regulator  26.63 
 
 		 189 aa  53.9  0.000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.652086  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4342  regulatory protein TetR  40 
 
 		 186 aa  53.9  0.000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.525641  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0871  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 202 aa  53.9  0.000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3151  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 202 aa  53.9  0.000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1039  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 201 aa  53.5  0.000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.747573 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1027  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 201 aa  53.5  0.000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0974  TetR family transcriptional regulator  32.05 
 
 		 194 aa  52.8  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6292  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 210 aa  53.5  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4217  transcriptional regulator, TetR family  32.05 
 
 		 193 aa  53.1  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.152492 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1067  transcriptional regulator, TetR family  21.76 
 
 		 212 aa  53.1  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.530116 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4488  transcriptional regulator, TetR family  25 
 
 		 190 aa  53.5  0.000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.14916  normal  0.0536152 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5492  transcriptional regulator, TetR family  29.07 
 
 		 177 aa  53.5  0.000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.56711 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4065  TetR family transcriptional regulator  35.21 
 
 		 193 aa  53.1  0.000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4803  transcriptional regulator, TetR family  36.11 
 
 		 193 aa  52.8  0.000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.539659  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2816  hypothetical protein  31.11 
 
 		 222 aa  52.8  0.000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0366008  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0270  TetR family transcriptional regulator  26.11 
 
 		 192 aa  52.8  0.000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.522665  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2686  TetR family transcriptional regulator  29.87 
 
 		 181 aa  52.8  0.000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.39833  hitchhiker  0.00361312 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1088  transcriptional regulator, TetR family  32.05 
 
 		 193 aa  52.8  0.000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1508  transcriptional regulator, TetR family  27.33 
 
 		 215 aa  52.8  0.000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0994502  normal  0.123569 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4859  transcriptional regulator, TetR family  45 
 
 		 186 aa  52.4  0.000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.205859 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1006  TetR family transcriptional regulator  35.94 
 
 		 189 aa  52.4  0.000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1156  TetR family transcriptional regulator  32.05 
 
 		 193 aa  52  0.000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.813518  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1217  transcriptional regulator, TetR family  32.05 
 
 		 193 aa  52  0.000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0184  TetR family transcriptional regulator  29.13 
 
 		 197 aa  51.6  0.000006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0140  TetR family transcriptional regulator  32.56 
 
 		 176 aa  51.6  0.000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2087  transcriptional regulator, TetR family  36.67 
 
 		 206 aa  51.6  0.000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0227018  n/a   
 
 
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NC_009092  Shew_3104  TetR family transcriptional regulator  29.31 
 
 		 194 aa  51.2  0.000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.428011 
 
 
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NC_008577  Shewana3_3252  TetR family transcriptional regulator  35.94 
 
 		 200 aa  51.2  0.000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009438  Sputcn32_2983  TetR family transcriptional regulator  35.94 
 
 		 190 aa  51.2  0.000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007947  Mfla_2580  TetR family transcriptional regulator  32.29 
 
 		 211 aa  51.2  0.000009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.257801 
 
 
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NC_011832  Mpal_0855  transcriptional regulator, TetR family  20.83 
 
 		 223 aa  50.4  0.00001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.835032 
 
 
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NC_003295  RSc2560  putative transcription regulator protein  25.6 
 
 		 209 aa  50.4  0.00001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0102643  normal  1 
 
 
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NC_005945  BAS0982  TetR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 193 aa  50.8  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_005957  BT9727_0971  TetR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 193 aa  50.8  0.00001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_006274  BCZK0971  TetR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 193 aa  50.8  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007530  GBAA_1052  TetR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 193 aa  50.8  0.00001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007643  Rru_A3701  TetR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 178 aa  50.4  0.00001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.076632  n/a   
 
 
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NC_013595  Sros_1515  putative transcriptional regulator, TetR family  32.93 
 
 		 219 aa  50.8  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.254086  hitchhiker  0.00363064 
 
 
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