More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_2087 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_2087  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 206 aa  412  1e-114  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0227018  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1490  TetR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 210 aa  79.7  0.00000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1512  TetR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 210 aa  79.7  0.00000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1488  TetR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 210 aa  79.7  0.00000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3721  transcriptional regulator, TetR family  33.12 
 
 		 200 aa  76.6  0.0000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.522362  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5157  putative transcriptional regulator, TetR family  30.68 
 
 		 233 aa  64.7  0.0000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.23435  normal  0.1595 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1317  regulatory protein TetR  30.86 
 
 		 232 aa  63.5  0.000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9268  putative transcriptional regulator, TetR family  29.81 
 
 		 193 aa  63.5  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.596158 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0733  TetR family transcriptional regulator  28.32 
 
 		 205 aa  61.6  0.000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0614739  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0747  TetR family transcriptional regulator  28.32 
 
 		 205 aa  61.6  0.000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.15327 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0727  TetR family transcriptional regulator  28.32 
 
 		 205 aa  61.6  0.000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.329451 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4400  regulatory protein TetR  27.68 
 
 		 184 aa  61.2  0.00000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3038  transcriptional regulator  30.29 
 
 		 230 aa  58.9  0.00000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4373  transcriptional regulator, TetR family  27.85 
 
 		 229 aa  58.9  0.00000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.335963  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0106  transcriptional regulator, TetR family  27.16 
 
 		 227 aa  58.9  0.00000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0202  TetR family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 186 aa  56.2  0.0000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0085  transcriptional regulator, TetR family  28.74 
 
 		 219 aa  56.2  0.0000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3963  TetR family transcriptional regulator  31.37 
 
 		 193 aa  55.5  0.0000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4037  TetR family transcriptional regulator  31.37 
 
 		 193 aa  55.5  0.0000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3977  TetR family transcriptional regulator  31.37 
 
 		 193 aa  55.5  0.0000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.698976  normal  0.0354344 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3845  transcriptional regulator, TetR family  31.52 
 
 		 209 aa  53.9  0.000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00359694  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1957  transcriptional regulator, TetR family  30.48 
 
 		 205 aa  53.9  0.000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5414  transcriptional regulator, TetR family  29.41 
 
 		 192 aa  53.5  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0653448  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3271  transcriptional regulator, TetR family  26.94 
 
 		 201 aa  53.1  0.000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.377871  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4689  transcriptional regulator, TetR family  28.16 
 
 		 259 aa  52  0.000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0827  transcriptional regulator, TetR family  36.67 
 
 		 179 aa  51.6  0.000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.843783  normal  0.883408 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01587  DNA-binding transcriptional repressor  35.71 
 
 		 196 aa  50.8  0.00001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2024  transcriptional regulator, TetR family  35.71 
 
 		 192 aa  50.8  0.00001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.180766  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1581  transcriptional regulator UidR  35.71 
 
 		 192 aa  50.8  0.00001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0059  TetR family transcriptional regulator  28.82 
 
 		 197 aa  51.2  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.227701 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1826  transcriptional regulator UidR  35.71 
 
 		 196 aa  50.8  0.00001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1944  TetR family transcriptional regulator  32.03 
 
 		 234 aa  50.8  0.00001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.358022  decreased coverage  0.0015067 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01577  hypothetical protein  35.71 
 
 		 196 aa  50.8  0.00001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.98021  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1805  transcriptional regulator UidR  35.71 
 
 		 196 aa  50.8  0.00001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.947665  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2330  transcriptional regulator UidR  35.71 
 
 		 195 aa  50.8  0.00001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03540  transcriptional regulator, tetR family  33.33 
 
 		 241 aa  51.2  0.00001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1693  transcriptional regulator UidR  35.71 
 
 		 196 aa  50.8  0.00001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2012  TetR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 196 aa  50.8  0.00001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.952906  normal  0.615913 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0511  TetR family transcriptional regulator  35.24 
 
 		 194 aa  50.8  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3704  TetR family transcriptional regulator  25.16 
 
 		 202 aa  50.1  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17960  transcriptional regulator, TetR family  31.58 
 
 		 208 aa  50.4  0.00002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.134645  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0123  regulatory protein, TetR  36.76 
 
 		 187 aa  50.1  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.156619  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1922  transcriptional regulator, TetR family  32.98 
 
 		 201 aa  49.7  0.00003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12190  hypothetical protein  40.62 
 
 		 211 aa  50.1  0.00003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  3.52928e-50  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3220  TetR family transcriptional regulator  26.7 
 
 		 206 aa  49.7  0.00003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.626936  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3282  TetR family transcriptional regulator  26.7 
 
 		 206 aa  49.7  0.00003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0688565  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3943  transcriptional regulator, TetR family  34.19 
 
 		 218 aa  49.7  0.00003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.938406  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3231  TetR family transcriptional regulator  26.7 
 
 		 206 aa  49.7  0.00003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.140653  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3412  TetR family transcriptional regulator  28.08 
 
 		 206 aa  49.3  0.00004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.430092  normal  0.661157 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0330  transcriptional regulator, TetR family  34.02 
 
 		 233 aa  48.9  0.00005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7183  TetR family transcriptional regulator  23.08 
 
 		 219 aa  48.9  0.00006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00902217 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27720  transcriptional regulator  36.11 
 
 		 190 aa  48.9  0.00006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.754006  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2600  TetR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 185 aa  48.5  0.00007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2654  regulatory protein TetR  27.27 
 
 		 185 aa  48.5  0.00007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3466  TetR family transcriptional regulator  27.07 
 
 		 200 aa  48.1  0.00009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3984  transcriptional regulator, TetR family  31.49 
 
 		 216 aa  48.1  0.00009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.765993  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4251  transcriptional regulator, TetR family  29.89 
 
 		 216 aa  47.8  0.0001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.22701  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5178  putative transcriptional regulator, TetR family  31.58 
 
 		 197 aa  47.4  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.519918  hitchhiker  0.00157317 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2036  regulatory protein, TetR  27.74 
 
 		 206 aa  47.8  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.284785 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4466  TetR family transcriptional regulator  31.39 
 
 		 193 aa  47.8  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3578  TetR family transcriptional regulator  38.3 
 
 		 198 aa  47  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00935563  normal  0.0256006 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1797  transcriptional regulator, TetR family  27.82 
 
 		 197 aa  47.4  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000197435  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0651  TetR family transcriptional regulator  39.24 
 
 		 218 aa  47  0.0002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0025795  normal  0.249536 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2378  transcriptional repressor TetR  31.82 
 
 		 260 aa  46.6  0.0002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0287531  normal  0.0684522 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3603  TetR family transcriptional regulator  27.71 
 
 		 205 aa  47  0.0002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.162578  normal  0.242533 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3413  transcriptional regulator, TetR family  36.54 
 
 		 196 aa  47  0.0002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000152623  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4024  TetR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 199 aa  47.4  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.497962  normal  0.530155 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0907  transcriptional regulator, TetR family  25.42 
 
 		 202 aa  47  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3312  transcriptional regulator UidR  32.86 
 
 		 198 aa  47.4  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8390  putative transcriptional regulator, TetR family  31.03 
 
 		 222 aa  47.4  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0832  transcriptional regulator, TetR family  24.29 
 
 		 196 aa  47  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2765  regulatory protein, TetR  26.97 
 
 		 210 aa  47  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.267077  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0855  TetR family transcriptional regulator  27.1 
 
 		 196 aa  46.6  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.179371  normal  0.0690104 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2650  transcriptional regulator, TetR family  32.56 
 
 		 211 aa  47.4  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1358  TetR family transcriptional regulator  39.68 
 
 		 202 aa  46.2  0.0003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1078  TetR family transcriptional regulator  30.15 
 
 		 211 aa  46.2  0.0003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0215  transcriptional regulator, TetR family  31.71 
 
 		 246 aa  46.2  0.0003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.674801 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2316  transcriptional regulator, TetR family  36.23 
 
 		 220 aa  46.2  0.0003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.166278  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04830  transcriptional regulator  35.29 
 
 		 228 aa  46.2  0.0003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.764774  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2856  TetR family transcriptional regulator  35.44 
 
 		 194 aa  46.6  0.0003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.661308  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2540  transcriptional regulator, TetR family  35.14 
 
 		 220 aa  46.2  0.0003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.34282 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3195  transcriptional regulator, TetR family  26.67 
 
 		 200 aa  46.6  0.0003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3111  transcriptional regulator, TetR family  33.14 
 
 		 203 aa  46.6  0.0003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.268901  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1327  TetR family transcriptional regulator  28.92 
 
 		 191 aa  46.2  0.0003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00385081  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0346  TetR family transcriptional regulator  27.75 
 
 		 221 aa  45.8  0.0004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.202764  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4458  transcriptional regulator, TetR family  36.23 
 
 		 263 aa  45.8  0.0004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0794126 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1118  transcriptional regulator, TetR family  27.05 
 
 		 201 aa  45.8  0.0004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00548751  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3311  putative transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 192 aa  46.2  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.160159 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3500  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 191 aa  45.8  0.0005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00541119  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1536  TetR family transcriptional regulator  26.03 
 
 		 217 aa  45.4  0.0005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  decreased coverage  0.000773904  normal  0.689031 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13232  TetR family transcriptional regulator  33.75 
 
 		 228 aa  45.8  0.0005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.414971 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0981  TetR family transcriptional regulator  32.31 
 
 		 178 aa  45.8  0.0005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2734  putative transcriptional regulator, TetR family  32.32 
 
 		 206 aa  45.4  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.596696  normal  0.79417 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3625  regulatory protein TetR  33.93 
 
 		 191 aa  45.4  0.0005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6030  transcriptional regulator TetR family  33.33 
 
 		 222 aa  45.8  0.0005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3960  TetR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 201 aa  45.4  0.0006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.110455  normal  0.471806 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4623  TetR family transcriptional regulator  36.47 
 
 		 213 aa  45.4  0.0006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.317667  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06720  transcriptional regulator, TetR family  33.75 
 
 		 221 aa  45.4  0.0006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5954  transcriptional regulator TetR family  32.58 
 
 		 219 aa  45.4  0.0006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3176  transcriptional regulator, TetR family  43.33 
 
 		 193 aa  45.4  0.0006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00199059 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>