More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_5492 on replicon NC_011758
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



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Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011758  Mchl_5492  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 177 aa  355  1.9999999999999998e-97  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.56711 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0286  TetR family transcriptional regulator  80.23 
 
 		 177 aa  258  3e-68  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.945519  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2686  TetR family transcriptional regulator  48.33 
 
 		 181 aa  173  9.999999999999999e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.39833  hitchhiker  0.00361312 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4107  transcriptional regulator  50.28 
 
 		 187 aa  172  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.198218  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47610  putative transcriptional regulator  49.15 
 
 		 186 aa  169  3e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1884  TetR family transcriptional regulator  43.5 
 
 		 189 aa  157  8e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.652086  n/a   
 
 
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NC_011883  Ddes_2192  transcriptional regulator, TetR family  47.78 
 
 		 191 aa  148  3e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008752  Aave_2157  TetR family transcriptional regulator  46.33 
 
 		 187 aa  143  2e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.105803  normal  1 
 
 
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NC_013421  Pecwa_1840  transcriptional regulator, TetR family  38.98 
 
 		 415 aa  124  1e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_012917  PC1_1451  transcriptional regulator, TetR family  36.26 
 
 		 428 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3701  TetR family transcriptional regulator  31.52 
 
 		 178 aa  73.6  0.000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.076632  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13730  transcriptional regulator, TetR family  32.84 
 
 		 181 aa  73.2  0.000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.839534  normal  0.161793 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5284  TetR family transcriptional regulator  32.48 
 
 		 208 aa  72  0.000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0597036  normal  0.356444 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3984  TetR family transcriptional regulator  33.74 
 
 		 191 aa  69.3  0.00000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.567303 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1320  TetR family transcriptional regulator  33.85 
 
 		 203 aa  66.6  0.0000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.010897  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3009  transcriptional regulator, TetR family  31.61 
 
 		 187 aa  65.5  0.0000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2940  TetR family transcriptional regulator  29.12 
 
 		 188 aa  65.5  0.0000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.333542  normal  1 
 
 
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NC_010725  Mpop_4859  transcriptional regulator, TetR family  32.95 
 
 		 186 aa  64.7  0.0000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.205859 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4211  transcriptional regulator, TetR family  27.27 
 
 		 178 aa  64.3  0.000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.954356 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3570  transcriptional regulator, TetR family  34.46 
 
 		 175 aa  63.9  0.000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00083347  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2620  TetR family transcriptional regulator  28.73 
 
 		 194 aa  63.9  0.000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.727172  n/a   
 
 
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NC_013526  Tter_2838  transcriptional regulator, TetR family  33.11 
 
 		 183 aa  63.2  0.000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010184  BcerKBAB4_0981  TetR family transcriptional regulator  26.62 
 
 		 178 aa  62.8  0.000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0052  transcriptional regulator, TetR family  32.45 
 
 		 188 aa  62.8  0.000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.612692  normal  0.466149 
 
 
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NC_014212  Mesil_2511  transcriptional regulator, TetR family  42.47 
 
 		 172 aa  62  0.000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1991  transcriptional regulator, TetR family  31.37 
 
 		 188 aa  61.2  0.000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2113  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 182 aa  61.6  0.000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1153  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 189 aa  61.6  0.000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.23421  normal  1 
 
 
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NC_007511  Bcep18194_B0583  TetR family transcriptional regulator  31.86 
 
 		 205 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4404  TetR family transcriptional regulator  37.63 
 
 		 199 aa  60.1  0.00000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0114676  normal  0.191291 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2794  transcriptional regulator, TetR family  26.16 
 
 		 184 aa  59.7  0.00000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2783  TetR family transcriptional regulator  30.29 
 
 		 187 aa  59.7  0.00000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0439  transcriptional regulator, TetR family  31.58 
 
 		 180 aa  59.3  0.00000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1090  TetR family transcriptional regulator  26.21 
 
 		 188 aa  59.3  0.00000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3260  transcriptional regulator, TetR family  29.31 
 
 		 187 aa  59.3  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.323175 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1067  transcriptional regulator, TetR family  35.87 
 
 		 212 aa  58.9  0.00000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.530116 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1051  TetR family transcriptional regulator  26.21 
 
 		 188 aa  59.3  0.00000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2152  transcriptional regulator, TetR family  30.58 
 
 		 185 aa  58.9  0.00000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2426  TetR family transcriptional regulator  36.96 
 
 		 205 aa  58.5  0.00000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5248  transcriptional regulator, TetR family  36.15 
 
 		 178 aa  58.2  0.00000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2362  TetR family transcriptional regulator  27.33 
 
 		 179 aa  58.2  0.00000006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2546  TetR family transcriptional regulator  39.76 
 
 		 213 aa  57.8  0.00000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.768933 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0041  TetR family transcriptional regulator  30.16 
 
 		 192 aa  57  0.0000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2175  TetR family transcriptional regulator  25.5 
 
 		 205 aa  57.4  0.0000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1094  transcriptional regulator, TetR family  26.39 
 
 		 168 aa  56.6  0.0000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0622  transcriptional regulator, TetR family  26.57 
 
 		 181 aa  55.8  0.0000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1768  TetR family transcriptional regulator  30.22 
 
 		 211 aa  55.8  0.0000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.570427  normal  0.275415 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1498  TetR family transcriptional regulator  29.78 
 
 		 189 aa  56.2  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.437225  normal  0.170332 
 
 
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NC_007511  Bcep18194_B0953  TetR family transcriptional regulator  27.98 
 
 		 184 aa  55.5  0.0000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.712721  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1486  TetR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 201 aa  55.1  0.0000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.260636  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2801  TetR family transcriptional regulator  28.65 
 
 		 189 aa  55.1  0.0000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0136  TetR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 201 aa  55.1  0.0000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.563717  normal  0.436061 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8111  putative transcriptional regulator, TetR family  44.44 
 
 		 168 aa  54.7  0.0000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4342  regulatory protein TetR  29.82 
 
 		 186 aa  55.1  0.0000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.525641  normal  1 
 
 
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NC_012848  Rleg_5257  transcriptional regulator, TetR family  29.89 
 
 		 194 aa  54.7  0.0000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.570583  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4711  transcriptional regulator, TetR family  29.82 
 
 		 186 aa  54.7  0.0000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.492793  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0872  TetR family transcriptional regulator  29.27 
 
 		 190 aa  54.7  0.0000007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.956466  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0778  TetR family transcriptional regulator  29.49 
 
 		 192 aa  54.7  0.0000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2433  TetR family transcriptional regulator  38.14 
 
 		 211 aa  54.3  0.0000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0827  transcriptional regulator, TetR family  29.07 
 
 		 179 aa  53.5  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.843783  normal  0.883408 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4799  TetR family transcriptional regulator  30.23 
 
 		 195 aa  53.5  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.914161 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2360  regulatory protein, TetR  39.06 
 
 		 190 aa  53.9  0.000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.173305 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0124  transcriptional regulator, TetR family  29.68 
 
 		 298 aa  53.5  0.000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2114  TetR family transcriptional regulator  28.19 
 
 		 183 aa  53.5  0.000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.328011  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5341  TetR family transcriptional regulator  30.23 
 
 		 194 aa  53.5  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.601109  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4488  transcriptional regulator, TetR family  43.75 
 
 		 190 aa  52.4  0.000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.14916  normal  0.0536152 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2202  transcriptional regulator, TetR family  29.7 
 
 		 186 aa  52.4  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.243165 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2329  TetR family transcriptional regulator  32.06 
 
 		 186 aa  52.4  0.000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.148714  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1798  TetR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 194 aa  52  0.000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1601  TetR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 194 aa  52.4  0.000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.105676  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1553  TetR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 194 aa  52  0.000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1775  transcriptional regulator, TetR family  31.25 
 
 		 194 aa  52  0.000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1725  TetR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 194 aa  52  0.000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5533  transcriptional regulator, TetR family  43.64 
 
 		 222 aa  52.4  0.000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0870  transcriptional regulator, TetR family  47.54 
 
 		 186 aa  52.4  0.000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.65823  normal  0.649746 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0763  TetR family transcriptional regulator  26.85 
 
 		 183 aa  52  0.000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.673415  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2560  putative transcription regulator protein  29.52 
 
 		 209 aa  52  0.000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0102643  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3475  TetR family transcriptional regulator  40.3 
 
 		 229 aa  51.6  0.000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.265474  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0730  TetR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 187 aa  51.6  0.000005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3407  transcriptional regulator, TetR family  46.3 
 
 		 178 aa  51.6  0.000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3256  transcriptional regulator, TetR family  33.96 
 
 		 220 aa  52  0.000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.757999  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5494  transcriptional regulator, TetR family  39.58 
 
 		 141 aa  52  0.000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.769028  normal  0.39499 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2165  transcriptional regulator, TetR family  29.76 
 
 		 263 aa  51.6  0.000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2205  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 202 aa  51.6  0.000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.270822 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5991  TetR family transcriptional regulator  47.17 
 
 		 244 aa  51.2  0.000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0553876 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1790  TetR family transcriptional regulator  47.37 
 
 		 209 aa  50.8  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0538  transcriptional regulator, TetR family  40.68 
 
 		 195 aa  50.1  0.00001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3845  TetR family transcriptional regulator  31.65 
 
 		 197 aa  50.4  0.00001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2922  transcriptional regulator, TetR family  34.78 
 
 		 204 aa  50.4  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.404278 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1114  transcriptional regulator, TetR family  44.64 
 
 		 186 aa  50.4  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.213128 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1116  TetR family transcriptional regulator  38.27 
 
 		 184 aa  49.7  0.00002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4194  TetR family transcriptional regulator  39.71 
 
 		 201 aa  50.1  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20280  transcriptional regulator, TetR family  35.87 
 
 		 213 aa  49.7  0.00002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.612683  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0432  TetR family transcriptional regulator  35.21 
 
 		 237 aa  49.3  0.00003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2460  TetR family transcriptional regulator  30.12 
 
 		 201 aa  49.3  0.00003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.315446  normal  0.37249 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0070  transcriptional regulator, TetR family  45.45 
 
 		 202 aa  49.3  0.00003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00707412 
 
 
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NC_009674  Bcer98_1394  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 185 aa  49.3  0.00003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.546688  n/a   
 
 
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NC_011883  Ddes_1550  transcriptional regulator, TetR family  30.95 
 
 		 201 aa  48.9  0.00004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007651  BTH_I0679  TetR family transcriptional regulator  35.06 
 
 		 211 aa  48.9  0.00004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008543  Bcen2424_5456  TetR family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 195 aa  48.9  0.00004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.31437 
 
 
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