101 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A1116 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A1116  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 184 aa  370  1e-102  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0778  TetR family transcriptional regulator  50.27 
 
 		 192 aa  185  4e-46  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0124  transcriptional regulator, TetR family  50.27 
 
 		 298 aa  182  3e-45  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3984  TetR family transcriptional regulator  38.25 
 
 		 191 aa  106  2e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.567303 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2940  TetR family transcriptional regulator  36.51 
 
 		 188 aa  88.2  6e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.333542  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47610  putative transcriptional regulator  31.87 
 
 		 186 aa  70.9  0.000000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4107  transcriptional regulator  31.69 
 
 		 187 aa  66.6  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.198218  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1451  transcriptional regulator, TetR family  28.18 
 
 		 428 aa  65.5  0.0000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1840  transcriptional regulator, TetR family  29.51 
 
 		 415 aa  63.5  0.000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2686  TetR family transcriptional regulator  28.4 
 
 		 181 aa  60.5  0.00000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.39833  hitchhiker  0.00361312 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2783  TetR family transcriptional regulator  32.56 
 
 		 187 aa  59.7  0.00000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2511  transcriptional regulator, TetR family  33.73 
 
 		 172 aa  59.7  0.00000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2157  TetR family transcriptional regulator  33.13 
 
 		 187 aa  58.2  0.00000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.105803  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2329  TetR family transcriptional regulator  32.65 
 
 		 186 aa  58.2  0.00000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.148714  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1884  TetR family transcriptional regulator  28.49 
 
 		 189 aa  57  0.0000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.652086  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2620  TetR family transcriptional regulator  27.81 
 
 		 194 aa  53.1  0.000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.727172  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2114  TetR family transcriptional regulator  49.21 
 
 		 183 aa  53.1  0.000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.328011  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1153  TetR family transcriptional regulator  35 
 
 		 189 aa  53.5  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.23421  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2192  transcriptional regulator, TetR family  28.49 
 
 		 191 aa  53.1  0.000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2801  TetR family transcriptional regulator  46.43 
 
 		 189 aa  51.6  0.000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1498  TetR family transcriptional regulator  46.43 
 
 		 189 aa  51.6  0.000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.437225  normal  0.170332 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4342  regulatory protein TetR  46.43 
 
 		 186 aa  51.2  0.000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.525641  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4711  transcriptional regulator, TetR family  46.43 
 
 		 186 aa  51.2  0.000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.492793  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4859  transcriptional regulator, TetR family  44.19 
 
 		 186 aa  50.4  0.00001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.205859 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1051  TetR family transcriptional regulator  28.33 
 
 		 188 aa  49.3  0.00003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5492  transcriptional regulator, TetR family  38.27 
 
 		 177 aa  49.7  0.00003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.56711 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4211  transcriptional regulator, TetR family  46.55 
 
 		 178 aa  49.3  0.00003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.954356 
 
 
-
 
NC_004310  BR1090  TetR family transcriptional regulator  28.33 
 
 		 188 aa  48.9  0.00004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0286  TetR family transcriptional regulator  38.27 
 
 		 177 aa  48.5  0.00006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.945519  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5527  transcriptional regulator, TetR family  37.65 
 
 		 203 aa  48.5  0.00006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3701  TetR family transcriptional regulator  42.62 
 
 		 178 aa  47.4  0.0001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.076632  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2179  TetR family transcriptional regulator  41.43 
 
 		 218 aa  47.8  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.905523 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6105  TetR family transcriptional regulator  27.32 
 
 		 201 aa  46.2  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.93473  normal  0.666323 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5284  TetR family transcriptional regulator  27.37 
 
 		 208 aa  47  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0597036  normal  0.356444 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5991  TetR family transcriptional regulator  25.57 
 
 		 244 aa  46.6  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0553876 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0981  TetR family transcriptional regulator  43.1 
 
 		 178 aa  46.6  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5866  TetR family transcriptional regulator  27.32 
 
 		 236 aa  46.2  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5248  transcriptional regulator, TetR family  42.11 
 
 		 178 aa  46.6  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2362  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 179 aa  46.2  0.0003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6545  TetR family transcriptional regulator  32 
 
 		 227 aa  45.8  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.129926 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1329  transcriptional regulator, TetR family  27.61 
 
 		 205 aa  46.2  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.851315 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3260  transcriptional regulator, TetR family  31.93 
 
 		 187 aa  45.8  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.323175 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13730  transcriptional regulator, TetR family  28.92 
 
 		 181 aa  46.2  0.0003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.839534  normal  0.161793 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2838  transcriptional regulator, TetR family  42.11 
 
 		 183 aa  46.2  0.0003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2560  putative transcription regulator protein  30.19 
 
 		 209 aa  45.8  0.0004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0102643  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3493  TetR family transcriptional regulator  46.3 
 
 		 222 aa  45.4  0.0004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.50615  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01665  transcriptional regulator  27.67 
 
 		 202 aa  45.4  0.0004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.152407  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1114  transcriptional regulator, TetR family  40.74 
 
 		 186 aa  45.8  0.0004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.213128 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1790  TetR family transcriptional regulator  30.25 
 
 		 251 aa  45.4  0.0005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0538  transcriptional regulator, TetR family  40.38 
 
 		 195 aa  45.4  0.0005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0870  transcriptional regulator, TetR family  48.15 
 
 		 186 aa  45.4  0.0005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.65823  normal  0.649746 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0041  TetR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 192 aa  45.1  0.0006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3328  regulatory protein, TetR  29.2 
 
 		 187 aa  45.1  0.0006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6061  TetR family transcriptional regulator  30.47 
 
 		 191 aa  45.1  0.0006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.660328  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2175  TetR family transcriptional regulator  24.73 
 
 		 205 aa  45.1  0.0007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0985  transcriptional regulator, TetR family  34.72 
 
 		 222 aa  44.7  0.0007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1403  TetR family transcriptional regulator  36.99 
 
 		 241 aa  44.7  0.0008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5697  TetR family transcriptional regulator  30.47 
 
 		 227 aa  44.7  0.0008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.949992  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1360  TetR family transcriptional regulator  40.98 
 
 		 270 aa  44.7  0.0008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.100226  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02513  transcriptional regulator, TetR family protein  32.91 
 
 		 214 aa  44.7  0.0008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2389  TetR family transcriptional regulator  25.97 
 
 		 200 aa  44.3  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.979129  normal  0.861655 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0662  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 205 aa  43.9  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3009  transcriptional regulator, TetR family  30.25 
 
 		 187 aa  44.3  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1094  transcriptional regulator, TetR family  42.31 
 
 		 168 aa  43.9  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4440  transcriptional regulator, TetR family  38.98 
 
 		 220 aa  43.9  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2442  transcriptional regulator, TetR family  41.94 
 
 		 218 aa  43.9  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.510523  normal  0.120027 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1067  transcriptional regulator, TetR family  35.16 
 
 		 212 aa  44.3  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.530116 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2034  TetR family transcriptional regulator  38.16 
 
 		 216 aa  43.1  0.002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.480509  normal  0.0875613 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1790  TetR family transcriptional regulator  32.95 
 
 		 209 aa  43.1  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4488  transcriptional regulator, TetR family  39.34 
 
 		 190 aa  43.1  0.002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.14916  normal  0.0536152 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1774  TetR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 231 aa  43.5  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.277997  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3062  transcriptional regulator, TetR family  25.79 
 
 		 199 aa  43.1  0.002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0638813  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5494  transcriptional regulator, TetR family  39.24 
 
 		 141 aa  43.1  0.002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.769028  normal  0.39499 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2779  transcriptional regulator, TetR family  25 
 
 		 185 aa  43.5  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.441306  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5533  transcriptional regulator, TetR family  36.9 
 
 		 222 aa  43.1  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1515  putative transcriptional regulator, TetR family  34.83 
 
 		 219 aa  43.1  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.254086  hitchhiker  0.00363064 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8111  putative transcriptional regulator, TetR family  36.62 
 
 		 168 aa  43.5  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0361  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 212 aa  42.7  0.003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.23201  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1320  TetR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 203 aa  42.7  0.003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.010897  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0763  TetR family transcriptional regulator  35.09 
 
 		 183 aa  42.7  0.003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.673415  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2360  regulatory protein, TetR  42 
 
 		 190 aa  42.7  0.003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.173305 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1079  TetR family transcriptional regulator  37.31 
 
 		 215 aa  42.7  0.003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3234  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 191 aa  42.7  0.003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0439  transcriptional regulator, TetR family  44.44 
 
 		 180 aa  42.4  0.003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3407  transcriptional regulator, TetR family  41.07 
 
 		 178 aa  42.4  0.004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3570  transcriptional regulator, TetR family  39.62 
 
 		 175 aa  42.4  0.004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00083347  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2816  hypothetical protein  34.29 
 
 		 222 aa  42  0.005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0366008  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1121  TetR family transcriptional regulator  39.06 
 
 		 221 aa  42  0.005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4626  transcriptional regulator, TetR family  48.15 
 
 		 211 aa  42  0.005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.110176  hitchhiker  0.00755279 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3584  regulatory protein TetR  29.94 
 
 		 204 aa  42  0.005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0125026  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5337  putative transcriptional regulator, TetR family  33.91 
 
 		 215 aa  42  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.532852  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2556  transcriptional regulator, TetR family  41.82 
 
 		 208 aa  42  0.005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000000489141  normal  0.182844 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0748  transcriptional regulator, TetR family  28.68 
 
 		 194 aa  41.6  0.006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.866187  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5162  TetR family transcriptional regulator  32.69 
 
 		 193 aa  41.6  0.007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.186575 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0810  transcriptional regulator, TetR family  32.88 
 
 		 268 aa  41.6  0.007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8304  transcriptional regulator, TetR family  38.6 
 
 		 223 aa  41.6  0.007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.505381  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3380  regulatory protein, TetR  27.84 
 
 		 222 aa  41.2  0.008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.386273  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4041  TetR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 182 aa  41.2  0.008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.449289  normal  0.0505107 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4478  transcriptional regulator, TetR family  29.91 
 
 		 211 aa  41.2  0.008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5476  TetR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 240 aa  41.2  0.009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>