More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_1550 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011883  Ddes_1550  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 201 aa  406  1.0000000000000001e-112  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3546  transcriptional regulator, TetR family  39.38 
 
 		 206 aa  128  6e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.726096  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4076  putative transcriptional regulator  35.5 
 
 		 204 aa  126  3e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.462339  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47240  putative transcriptional regulator  35.5 
 
 		 204 aa  124  1e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0432  TetR family transcriptional regulator  34.04 
 
 		 237 aa  118  7.999999999999999e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2028  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 222 aa  114  1.0000000000000001e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.578288  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0024  TetR family transcriptional regulator  37.43 
 
 		 212 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4561  TetR family transcriptional regulator  36.26 
 
 		 212 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.286179  normal  0.0846577 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5185  TetR family transcriptional regulator  36.65 
 
 		 212 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5674  TetR family transcriptional regulator  36.65 
 
 		 212 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.166194  hitchhiker  0.00758562 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2156  transcriptional regulator, TetR family  32.5 
 
 		 207 aa  98.2  7e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.362049 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2411  transcriptional regulator, TetR family  33.54 
 
 		 205 aa  97.8  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.147912 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0870  transcriptional regulator, TetR family  33.7 
 
 		 186 aa  94.7  8e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.65823  normal  0.649746 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2434  transcriptional regulator, TetR family  38.96 
 
 		 211 aa  70.9  0.00000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2226  TetR family transcriptional regulator  26.06 
 
 		 211 aa  69.7  0.00000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0397604  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2272  TetR family transcriptional regulator  26.06 
 
 		 211 aa  68.9  0.00000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000566042  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2500  transcriptional regulator, TetR family  26.06 
 
 		 211 aa  68.9  0.00000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2304  TetR family transcriptional regulator  26.06 
 
 		 211 aa  68.9  0.00000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.373552  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2479  TetR family transcriptional regulator  26.06 
 
 		 211 aa  68.9  0.00000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.660065  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2575  transcriptional regulator, TetR family  26.06 
 
 		 211 aa  68.2  0.00000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000582548  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2510  TetR family transcriptional regulator  26.06 
 
 		 209 aa  67.4  0.0000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00262483  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6345  transcriptional regulator, TetR family  50 
 
 		 241 aa  66.6  0.0000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4221  TetR family transcriptional regulator  36.78 
 
 		 206 aa  65.9  0.0000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.360052  normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0067  TetR family transcriptional regulator  46.55 
 
 		 212 aa  65.5  0.0000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000826521  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4729  TetR family transcriptional regulator  42.35 
 
 		 240 aa  64.3  0.000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3170  transcriptional regulator, TetR family  39.24 
 
 		 216 aa  63.9  0.000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3148  transcriptional regulator, TetR family  36.96 
 
 		 310 aa  62.8  0.000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1606  TetR family transcriptional regulator  35.63 
 
 		 206 aa  61.6  0.000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0686792  normal  0.0717181 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2285  TetR family transcriptional regulator  24.39 
 
 		 211 aa  61.2  0.000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0118465  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2475  TetR family transcriptional regulator  29.49 
 
 		 197 aa  61.2  0.00000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.000212819  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2231  TetR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 194 aa  60.8  0.00000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.558633  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5197  transcriptional regulator, TetR family  29.53 
 
 		 211 aa  60.8  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.128867  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5954  TetR family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 206 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.419182  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3353  TetR family transcriptional regulator  27.97 
 
 		 195 aa  60.1  0.00000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3750  TetR family transcriptional regulator  39.06 
 
 		 230 aa  59.7  0.00000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3964  TetR family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 206 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1637  transcriptional regulator, TetR family  28.33 
 
 		 227 aa  60.5  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0178246  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4403  TetR family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 206 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.504175 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4194  TetR family transcriptional regulator  32.37 
 
 		 201 aa  60.5  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0750  transcriptional regulator, TetR family  37.18 
 
 		 236 aa  60.5  0.00000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0322855 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6228  transcriptional regulator, TetR family  35.05 
 
 		 194 aa  59.3  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.301912  normal  0.923303 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3299  transcriptional regulator, TetR family  40.32 
 
 		 307 aa  59.3  0.00000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3722  TetR family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 202 aa  58.9  0.00000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.869277  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2460  TetR family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 201 aa  59.3  0.00000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.315446  normal  0.37249 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3795  TetR family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 202 aa  58.9  0.00000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.796114  normal  0.124585 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3734  TetR family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 202 aa  58.9  0.00000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0165853  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2109  TetR family transcriptional regulator  40.85 
 
 		 206 aa  58.5  0.00000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.901149 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4395  transcriptional regulator, TetR family  33.7 
 
 		 196 aa  57.8  0.00000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.724029  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3608  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 198 aa  58.2  0.00000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0118  TetR family transcriptional regulator  39.33 
 
 		 247 aa  57.4  0.0000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.211628  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3545  transcriptional regulator, TetR family  40.7 
 
 		 192 aa  57.8  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3836  transcriptional regulator, TetR family  36.61 
 
 		 192 aa  57.4  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.410307  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0355  transcriptional regulator, TetR family  28.16 
 
 		 195 aa  57.8  0.0000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5533  transcriptional regulator, TetR family  49.06 
 
 		 222 aa  57.8  0.0000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0109  TetR family transcriptional regulator  39.33 
 
 		 247 aa  57.4  0.0000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0684  transcriptional regulator, TetR family  41.51 
 
 		 197 aa  57.4  0.0000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.84339  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0659  transcriptional regulator TetR family  38.75 
 
 		 196 aa  57.4  0.0000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2645  TetR family transcriptional regulator  29.06 
 
 		 194 aa  57.4  0.0000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.154552  normal  0.491764 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3736  TetR family transcriptional regulator  46.55 
 
 		 200 aa  57  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.042499  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1702  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 311 aa  57  0.0000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11350  transcriptional regulator  52.17 
 
 		 220 aa  56.6  0.0000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0985  transcriptional regulator, TetR family  35.94 
 
 		 222 aa  57  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3724  TetR family transcriptional regulator  46.55 
 
 		 200 aa  57  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.29601  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3888  TetR family transcriptional regulator  24.29 
 
 		 193 aa  57  0.0000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0944552  normal  0.0941974 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3797  TetR family transcriptional regulator  46.55 
 
 		 200 aa  57  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.388195  normal  0.0386626 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4292  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 206 aa  57  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2734  transcriptional regulator, TetR family  41.94 
 
 		 225 aa  56.2  0.0000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0084  TetR family transcriptional regulator  32.58 
 
 		 205 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3824  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 206 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.472754 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1014  TetR family transcriptional regulator  39.44 
 
 		 212 aa  56.6  0.0000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0132  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 204 aa  56.2  0.0000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.410533  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3100  putative transcriptional regulator  27.74 
 
 		 194 aa  55.8  0.0000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.209779  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0974  TetR family transcriptional regulator  32.1 
 
 		 200 aa  55.8  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.543907  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1408  TetR family transcriptional regulator  32.1 
 
 		 200 aa  55.8  0.0000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4122  TetR family transcriptional regulator  27.61 
 
 		 207 aa  55.8  0.0000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.389931  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1058  TetR family transcriptional regulator  32.1 
 
 		 200 aa  55.8  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2293  TetR family transcriptional regulator  32.1 
 
 		 247 aa  55.8  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.887651  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0121  TetR family transcriptional regulator  32.1 
 
 		 200 aa  55.8  0.0000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0901  TetR family transcriptional regulator  36.59 
 
 		 236 aa  55.8  0.0000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0527  TetR family transcriptional regulator  32.1 
 
 		 200 aa  55.8  0.0000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.474473  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2696  TetR family transcriptional regulator  33.06 
 
 		 196 aa  55.8  0.0000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.834085 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1944  TetR family transcriptional regulator  39.47 
 
 		 234 aa  55.8  0.0000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.358022  decreased coverage  0.0015067 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1493  TetR family transcriptional regulator  32.1 
 
 		 200 aa  55.8  0.0000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1188  transcriptional regulator, TetR family  40.82 
 
 		 193 aa  55.5  0.0000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28300  transcriptional regulator  33.33 
 
 		 280 aa  55.5  0.0000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2537  TetR family transcriptional regulator  50.94 
 
 		 87 aa  55.5  0.0000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0097  TetR family transcriptional regulator  43.06 
 
 		 207 aa  55.5  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1492  putative transcriptional regulator, TetR family  32.76 
 
 		 216 aa  55.1  0.0000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6173  transcriptional regulator, TetR family  50 
 
 		 202 aa  55.5  0.0000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3493  transcriptional regulator, TetR family  40.82 
 
 		 193 aa  55.1  0.0000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.74894  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1380  transcriptional regulator, TetR family  40.98 
 
 		 214 aa  55.1  0.0000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000685689  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0507  TetR family transcriptional regulator  31.97 
 
 		 211 aa  55.1  0.0000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.982351 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36300  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 194 aa  55.1  0.0000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.564712  normal  0.0790295 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1436  TetR family transcriptional regulator  34.07 
 
 		 197 aa  55.1  0.0000007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0390  TetR family transcriptional regulator  47.27 
 
 		 230 aa  55.1  0.0000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0635  transcription regulator protein  41.56 
 
 		 216 aa  55.1  0.0000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0324  TetR family transcriptional regulator  41.27 
 
 		 203 aa  54.7  0.0000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.720161 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0332  TetR family transcriptional regulator  45.28 
 
 		 208 aa  54.3  0.000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4225  TetR family transcriptional regulator  40.48 
 
 		 244 aa  54.3  0.000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.127157  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2592  transcriptional regulator, TetR family  26.95 
 
 		 192 aa  53.9  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.119823  normal  0.0690788 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>