More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_0132 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_0132  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 204 aa  410  1e-114  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.410533  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1538  TetR family transcriptional regulator  32.65 
 
 		 222 aa  78.6  0.00000000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.891192  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1179  TetR family transcriptional regulator  28.43 
 
 		 290 aa  75.1  0.0000000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.669252  normal  0.155031 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3516  TetR family transcriptional regulator  28.33 
 
 		 235 aa  74.7  0.0000000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3540  TetR family transcriptional regulator  30.69 
 
 		 250 aa  73.2  0.000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5281  TetR family transcriptional regulator  35.92 
 
 		 257 aa  72.8  0.000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3533  TetR family transcriptional regulator  36.43 
 
 		 237 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0909277  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5804  TetR family transcriptional regulator  37.24 
 
 		 254 aa  68.9  0.00000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000000100556  hitchhiker  0.000892453 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5273  TetR family transcriptional regulator  32.32 
 
 		 241 aa  65.5  0.0000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0264263  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2297  TetR family transcriptional regulator  31.07 
 
 		 305 aa  64.3  0.000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0935054  hitchhiker  0.00257224 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0358  regulatory protein, TetR  34.51 
 
 		 240 aa  61.2  0.000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000667156 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4043  TetR family transcriptional regulator  42.68 
 
 		 228 aa  60.8  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.168546 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3329  transcriptional regulator, TetR family  30 
 
 		 217 aa  60.5  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.181798  normal  0.116616 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5087  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 259 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5773  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 259 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.669739 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4405  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 259 aa  59.7  0.00000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.630882  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3022  TetR family transcriptional regulator  24.24 
 
 		 233 aa  59.7  0.00000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1516  TetR family transcriptional regulator  57.69 
 
 		 218 aa  59.3  0.00000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.875223  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3748  TetR family transcriptional regulator  24.24 
 
 		 275 aa  59.3  0.00000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0646  TetR family transcriptional regulator  52.63 
 
 		 213 aa  58.5  0.00000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.545029 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7278  Transcriptional regulator  23.56 
 
 		 216 aa  57  0.0000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1550  transcriptional regulator, TetR family  50 
 
 		 201 aa  56.2  0.0000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0557  TetR family transcriptional regulator  44.83 
 
 		 297 aa  56.6  0.0000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4172  TetR family transcriptional regulator  31.31 
 
 		 205 aa  56.2  0.0000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.928216  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4014  transcriptional regulator, TetR family  33.99 
 
 		 225 aa  55.5  0.0000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4909  TetR family transcriptional regulator  30.57 
 
 		 237 aa  55.5  0.0000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.69589  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2990  TetR family transcriptional regulator  31.47 
 
 		 288 aa  55.1  0.0000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.989251  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1071  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  28.06 
 
 		 213 aa  55.1  0.0000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0117133  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22630  transcriptional regulator  37.5 
 
 		 202 aa  55.1  0.0000008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4343  transcriptional regulator, TetR family  34.21 
 
 		 225 aa  54.7  0.0000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0349599  decreased coverage  0.000000750918 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1458  TetR family transcriptional regulator  29.31 
 
 		 209 aa  54.7  0.0000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.121951 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1253  TetR family transcriptional regulator  46.88 
 
 		 200 aa  54.7  0.0000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000989157 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0870  transcriptional regulator, TetR family  48.28 
 
 		 186 aa  54.7  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.65823  normal  0.649746 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2460  TetR family transcriptional regulator  45.76 
 
 		 201 aa  53.9  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.315446  normal  0.37249 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5271  transcriptional regulator, TetR family  29.27 
 
 		 223 aa  54.3  0.000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1821  transcriptional regulator, TetR family  50 
 
 		 212 aa  53.5  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6467  transcriptional regulator, TetR family  32.99 
 
 		 217 aa  53.9  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.146665  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4907  TetR family transcriptional regulator  49.15 
 
 		 196 aa  53.5  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.724417 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1788  TetR family transcriptional regulator  31.06 
 
 		 195 aa  52.8  0.000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000202922  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2867  TetR family transcriptional regulator  24.75 
 
 		 211 aa  53.1  0.000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.451195  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0727  transcriptional regulator, TetR family  27.84 
 
 		 216 aa  52.8  0.000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2824  TetR family transcriptional regulator  32.89 
 
 		 211 aa  52.8  0.000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.551621  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1927  TetR family transcriptional regulator  31.06 
 
 		 195 aa  52.8  0.000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00399738  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2131  transcriptional regulator, TetR family  26.14 
 
 		 205 aa  52.8  0.000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1709  transcriptional regulator, TetR family  29.85 
 
 		 198 aa  53.1  0.000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3910  TetR family transcriptional regulator  44.23 
 
 		 242 aa  53.1  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.104674 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2893  TetR family transcriptional regulator  37.29 
 
 		 205 aa  53.1  0.000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0699347  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3722  TetR family transcriptional regulator  45.76 
 
 		 202 aa  52.8  0.000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.869277  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4244  TetR family transcriptional regulator  45.1 
 
 		 212 aa  52.8  0.000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.950938  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3795  TetR family transcriptional regulator  45.76 
 
 		 202 aa  52.8  0.000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.796114  normal  0.124585 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04830  transcriptional regulator  36.49 
 
 		 228 aa  53.1  0.000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.764774  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0130  TetR family transcriptional regulator  52.94 
 
 		 212 aa  52.8  0.000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3734  TetR family transcriptional regulator  45.76 
 
 		 202 aa  53.1  0.000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0165853  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0828  transcriptional regulator, TetR family  30.39 
 
 		 195 aa  52.8  0.000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2898  TetR family transcriptional regulator  37.29 
 
 		 205 aa  52.4  0.000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0412  TetR family transcriptional regulator  52.46 
 
 		 212 aa  52.4  0.000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.417244  normal  0.216002 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3118  transcriptional regulator, TetR family  37.29 
 
 		 205 aa  52.4  0.000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3115  TetR family transcriptional regulator  37.29 
 
 		 205 aa  52.4  0.000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4838  transcriptional regulator, TetR family  32.35 
 
 		 217 aa  52.8  0.000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23590  putative transcriptional regulator  31.85 
 
 		 180 aa  52.8  0.000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0142024 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4734  TetR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 242 aa  52.4  0.000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3106  transcriptional regulator, TetR family  37.29 
 
 		 205 aa  52.4  0.000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2817  transcriptional regulator, TetR family  39.74 
 
 		 210 aa  52.4  0.000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.318929  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3949  transcriptional regulator, TetR family  45.76 
 
 		 210 aa  52.4  0.000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0865952  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3888  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 193 aa  52.4  0.000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0944552  normal  0.0941974 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3139  transcriptional regulator, TetR family  35.59 
 
 		 205 aa  52  0.000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.145779  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1987  TetR family transcriptional regulator  49.02 
 
 		 211 aa  52  0.000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.15936  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5045  TetR family transcriptional regulator  42.42 
 
 		 206 aa  52  0.000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.906168  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5815  TetR family transcriptional regulator  42.42 
 
 		 206 aa  52  0.000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2683  transcriptional regulator, TetR family  35.44 
 
 		 219 aa  52  0.000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0774408  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1969  TetR family transcriptional regulator  40.32 
 
 		 205 aa  51.6  0.000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0320964 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0005  TetR family transcriptional regulator  41.07 
 
 		 195 aa  51.6  0.000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0931339  normal  0.381518 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2291  transcriptional regulator, TetR family  40.32 
 
 		 205 aa  51.6  0.000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.857741  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2108  TetR family transcriptional regulator  45.76 
 
 		 207 aa  51.6  0.000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1028  transcriptional regulator, TetR family  34.59 
 
 		 200 aa  51.2  0.000009  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0479484  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2703  TetR family transcriptional regulator  34.94 
 
 		 228 aa  51.6  0.000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4364  TetR family transcriptional regulator  43.94 
 
 		 206 aa  51.6  0.000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1128  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  31.91 
 
 		 227 aa  51.2  0.00001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000181094 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1523  TetR family transcriptional regulator  29.69 
 
 		 200 aa  50.8  0.00001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000120489 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1291  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 190 aa  51.2  0.00001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.170651  normal  0.326718 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1509  TetR family transcriptional regulator  29.84 
 
 		 179 aa  51.2  0.00001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0671702  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15710  transcriptional regulator  38.6 
 
 		 221 aa  50.8  0.00001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.274511  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07230  transcriptional regulator  25.51 
 
 		 205 aa  50.8  0.00001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.350601  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4467  TetR family transcriptional regulator  42.19 
 
 		 206 aa  50.8  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0963408 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0583  regulatory protein, TetR  25.42 
 
 		 197 aa  50.8  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2080  TetR family transcriptional regulator  55.32 
 
 		 219 aa  50.8  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.740876  hitchhiker  0.00831587 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0313  TetR family transcriptional regulator  52 
 
 		 202 aa  51.2  0.00001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.121906  hitchhiker  0.00929139 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1897  TetR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 202 aa  50.8  0.00001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2128  transcriptional regulator, TetR family  28.86 
 
 		 202 aa  51.2  0.00001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.190242  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4973  TetR family transcriptional regulator  45 
 
 		 201 aa  51.2  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0231413  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3353  TetR family transcriptional regulator  42.03 
 
 		 195 aa  50.1  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1264  TetR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 206 aa  50.4  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.599329  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3136  TetR family transcriptional regulator  24.32 
 
 		 205 aa  50.4  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.495546  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1999  putative transcriptional regulator  31.21 
 
 		 180 aa  50.4  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0444  TetR family transcriptional regulator  41.94 
 
 		 220 aa  50.1  0.00002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.275459  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4353  TetR family transcriptional regulator  26.75 
 
 		 195 aa  50.1  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2628  transcriptional regulator, TetR family  28.06 
 
 		 194 aa  50.8  0.00002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00732346  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0928  transcriptional regulator, TetR family  31.3 
 
 		 184 aa  50.1  0.00002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.312785  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2426  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 205 aa  50.1  0.00002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0960  TetR family transcriptional regulator  29.82 
 
 		 219 aa  50.1  0.00002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.115896  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>