More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Elen_2734 on replicon NC_013204
Organism: Eggerthella lenta DSM 2243



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013204  Elen_2734  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 225 aa  458  9.999999999999999e-129  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1380  transcriptional regulator, TetR family  38.27 
 
 		 214 aa  152  4e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000685689  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1604  AcrR family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 221 aa  142  5e-33  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.388293  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0067  TetR family transcriptional regulator  29.11 
 
 		 212 aa  84.3  0.000000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000826521  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4729  TetR family transcriptional regulator  33.17 
 
 		 240 aa  74.3  0.000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3170  transcriptional regulator, TetR family  32.02 
 
 		 216 aa  72  0.000000000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0750  transcriptional regulator, TetR family  31.43 
 
 		 236 aa  70.1  0.00000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0322855 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3750  TetR family transcriptional regulator  28.49 
 
 		 230 aa  68.9  0.00000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26580  transcriptional regulator, TetR family  37.89 
 
 		 205 aa  63.2  0.000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0994293 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1103  transcriptional regulator, TetR family  30.43 
 
 		 248 aa  63.2  0.000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.575371  normal  0.523139 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2067  TetR family transcriptional regulator  39.56 
 
 		 216 aa  62  0.000000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3299  transcriptional regulator, TetR family  39.29 
 
 		 307 aa  61.6  0.000000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0687  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 261 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.794796  normal  0.223624 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2304  TetR family transcriptional regulator  26.9 
 
 		 211 aa  61.2  0.00000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.373552  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2537  TetR family transcriptional regulator  46.97 
 
 		 87 aa  61.2  0.00000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2479  TetR family transcriptional regulator  26.9 
 
 		 211 aa  61.2  0.00000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.660065  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2104  TetR family transcriptional regulator  47.69 
 
 		 191 aa  61.2  0.00000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.230608 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3148  transcriptional regulator, TetR family  43.28 
 
 		 310 aa  61.2  0.00000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0949  transcriptional regulator, TetR family  37.33 
 
 		 286 aa  60.5  0.00000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6222  transcriptional regulator, TetR family  35.9 
 
 		 186 aa  60.5  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.366462  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1804  transcriptional regulator, TetR family  29.94 
 
 		 189 aa  60.8  0.00000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2434  transcriptional regulator, TetR family  25.89 
 
 		 211 aa  59.7  0.00000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6181  transcriptional regulator, TetR family  39.77 
 
 		 202 aa  60.1  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.685616  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0170  TetR family transcriptional regulator  44.29 
 
 		 192 aa  59.7  0.00000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.652591  normal  0.659974 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0355  transcriptional regulator, TetR family  33.67 
 
 		 195 aa  59.3  0.00000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2226  TetR family transcriptional regulator  26.4 
 
 		 211 aa  59.3  0.00000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0397604  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2272  TetR family transcriptional regulator  25.63 
 
 		 211 aa  58.5  0.00000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000566042  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1436  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 197 aa  58.9  0.00000007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2500  transcriptional regulator, TetR family  25.63 
 
 		 211 aa  58.5  0.00000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2285  TetR family transcriptional regulator  25.65 
 
 		 211 aa  57.8  0.0000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0118465  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0117  TetR family transcriptional regulator  26.46 
 
 		 208 aa  57.8  0.0000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.966538  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5941  TetR family transcriptional regulator  38.95 
 
 		 213 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.272965 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2000  TetR family transcriptional regulator  38.95 
 
 		 234 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.920156  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2657  TetR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 213 aa  57  0.0000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2530  TetR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 213 aa  57  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.704068 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2502  transcriptional regulator, TetR family  29.29 
 
 		 291 aa  57.4  0.0000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2639  TetR family transcriptional regulator  38.95 
 
 		 213 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2610  TetR family transcriptional regulator  38.95 
 
 		 234 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.341012  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0765  TetR family transcriptional regulator  41.77 
 
 		 196 aa  56.6  0.0000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.448904  normal  0.172153 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2460  TetR family transcriptional regulator  34.88 
 
 		 201 aa  57  0.0000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.315446  normal  0.37249 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2723  transcriptional regulator, TetR family  53.85 
 
 		 224 aa  56.6  0.0000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0252111  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3469  transcriptional regulator, TetR family  38.55 
 
 		 219 aa  56.6  0.0000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.930137  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3587  TetR family transcriptional regulator  46.55 
 
 		 242 aa  56.6  0.0000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4194  TetR family transcriptional regulator  36.05 
 
 		 201 aa  56.6  0.0000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1550  transcriptional regulator, TetR family  41.94 
 
 		 201 aa  56.2  0.0000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0817  TetR family transcriptional regulator  45.71 
 
 		 332 aa  56.2  0.0000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5186  transcriptional regulator, TetR family  45.61 
 
 		 185 aa  55.8  0.0000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.225373  normal  0.188797 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1560  transcriptional regulator, TetR family  49.12 
 
 		 221 aa  55.8  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16730  transcriptional regulator, TetR family  29.11 
 
 		 213 aa  55.5  0.0000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3259  transcriptional regulator, TetR family  47.37 
 
 		 219 aa  55.5  0.0000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.147915  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3944  putative transcriptional regulator, TetR family  43.08 
 
 		 183 aa  55.5  0.0000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.000137534  hitchhiker  0.00939559 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2575  transcriptional regulator, TetR family  26.26 
 
 		 211 aa  55.5  0.0000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000582548  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2349  TetR family transcriptional regulator  39.73 
 
 		 357 aa  55.1  0.0000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00426882  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3734  TetR family transcriptional regulator  32.97 
 
 		 202 aa  55.1  0.0000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0165853  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2636  transcriptional regulator, TetR family  26.25 
 
 		 198 aa  55.1  0.0000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3722  TetR family transcriptional regulator  32.97 
 
 		 202 aa  55.1  0.0000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.869277  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3795  TetR family transcriptional regulator  32.97 
 
 		 202 aa  55.1  0.0000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.796114  normal  0.124585 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1014  TetR family transcriptional regulator  43.08 
 
 		 212 aa  54.7  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3439  TetR family transcriptional regulator  37.21 
 
 		 239 aa  54.3  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0661  transcriptional regulator, TetR family  45 
 
 		 205 aa  54.7  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2426  TetR family transcriptional regulator  46.03 
 
 		 205 aa  54.3  0.000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0707  TetR family transcriptional regulator  48.21 
 
 		 219 aa  54.7  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3524  TetR family transcriptional regulator  35.44 
 
 		 187 aa  54.7  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1775  transcriptional regulator, TetR family  36 
 
 		 207 aa  54.7  0.000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2495  transcriptional regulator, TetR family  38.96 
 
 		 287 aa  53.5  0.000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0937177  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2510  TetR family transcriptional regulator  25.51 
 
 		 209 aa  53.9  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00262483  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4066  transcriptional regulator, TetR family  28.1 
 
 		 211 aa  54.3  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2411  transcriptional regulator, TetR family  37.62 
 
 		 205 aa  53.9  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.147912 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5720  TetR family transcriptional regulator  51.92 
 
 		 291 aa  54.3  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.649137  normal  0.760569 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13590  TetR family transcriptional regulator  39.76 
 
 		 200 aa  54.3  0.000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.332381  normal  0.0844747 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10440  transcriptional regulator  39.24 
 
 		 211 aa  53.5  0.000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0189255  normal  0.0235057 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0282  TetR family transcriptional regulator  40.85 
 
 		 201 aa  53.9  0.000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.356366  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2147  TetR family transcriptional regulator  39.02 
 
 		 193 aa  54.3  0.000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.576982  hitchhiker  0.00198138 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3756  TetR family transcriptional regulator  39.02 
 
 		 193 aa  53.5  0.000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1114  TetR family transcriptional regulator  32.48 
 
 		 223 aa  53.1  0.000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3376  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 197 aa  53.5  0.000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.423093  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32320  transcriptional regulator, TetR family  43.33 
 
 		 200 aa  53.1  0.000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.247928 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0469  transcriptional regulator, TetR family  34.21 
 
 		 224 aa  53.1  0.000003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0074  TetR/AcrR family transcriptional regulator  46.43 
 
 		 196 aa  53.1  0.000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1909  transcriptional regulator, TetR family  46.15 
 
 		 209 aa  53.1  0.000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0574085  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3944  TetR family transcriptional regulator  40.3 
 
 		 215 aa  53.1  0.000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2575  transcriptional regulator, TetR family  33.78 
 
 		 196 aa  53.1  0.000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.230257  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2704  TetR family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 203 aa  53.1  0.000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.187148 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4222  TetR family transcriptional regulator  28.71 
 
 		 221 aa  53.1  0.000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.42669  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4600  TetR family transcriptional regulator  28.71 
 
 		 221 aa  53.1  0.000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0411306  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4288  TetR family transcriptional regulator  28.71 
 
 		 221 aa  53.1  0.000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.458199  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0057  multidrug efflux pump repressor protein BpeR  45.45 
 
 		 211 aa  52.8  0.000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0944  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  39.73 
 
 		 217 aa  52.8  0.000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0314  TetR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 211 aa  52.8  0.000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4955  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 424 aa  53.1  0.000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.868884 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2696  TetR family transcriptional regulator  46.67 
 
 		 196 aa  53.1  0.000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.834085 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1017  repressor protein  45.45 
 
 		 211 aa  53.1  0.000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0857  multidrug efflux pump repressor protein BpeR  45.45 
 
 		 211 aa  53.1  0.000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0679  TetR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 211 aa  52.8  0.000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2443  multidrug efflux pump repressor protein BpeR  45.45 
 
 		 211 aa  52.8  0.000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0852  multidrug efflux pump repressor protein BpeR  45.45 
 
 		 211 aa  53.1  0.000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0324  TetR family transcriptional regulator  37.63 
 
 		 203 aa  53.1  0.000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.720161 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0609  multidrug efflux pump repressor protein BpeR  45.45 
 
 		 211 aa  52.8  0.000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.780096  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5392  transcriptional regulator, TetR family protein  34.52 
 
 		 190 aa  52.4  0.000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0421  transcriptional regulator, TetR family  40.32 
 
 		 198 aa  52.8  0.000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>