More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE0332 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002967  TDE0332  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 208 aa  421  1e-117  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0674  transcriptional regulator, TetR family  42.61 
 
 		 200 aa  80.5  0.00000000000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0684  transcriptional regulator, TetR family  29.38 
 
 		 197 aa  79  0.00000000000005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.84339  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1736  transcriptional regulator TetR family  23.76 
 
 		 197 aa  59.3  0.00000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1843  transcriptional regulatory protein  30.4 
 
 		 201 aa  59.3  0.00000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.677238  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1665  transcriptional regulator, TetR family  38.33 
 
 		 223 aa  59.3  0.00000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.117381  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0429  TetR family transcriptional regulator  40.35 
 
 		 213 aa  58.5  0.00000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0148562 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0369  transcriptional regulator, TetR family  34.02 
 
 		 204 aa  58.5  0.00000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.238864 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3923  TetR family transcriptional regulator  33.67 
 
 		 214 aa  57.8  0.0000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1014  TetR family transcriptional regulator  36.51 
 
 		 212 aa  57.8  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6228  transcriptional regulator, TetR family  40.62 
 
 		 194 aa  57  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.301912  normal  0.923303 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0657  TetR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 205 aa  57  0.0000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.184165  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3781  TetR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 214 aa  57  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0464  transcriptional regulator, TetR family  24.24 
 
 		 211 aa  56.2  0.0000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.128175  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0626  TetR family transcriptional regulator  39.34 
 
 		 199 aa  56.2  0.0000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3998  transcriptional regulator, TetR family  25 
 
 		 205 aa  55.8  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0825494  normal  0.0160725 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1719  transcriptional regulator, TetR family  43.4 
 
 		 196 aa  56.2  0.0000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1426  transcriptional regulator, TetR family  38.46 
 
 		 204 aa  55.5  0.0000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0803354  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7736  putative transcriptional regulator, TetR family  25.13 
 
 		 205 aa  55.1  0.0000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.97147  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0395  regulatory protein TetR  35.59 
 
 		 211 aa  54.7  0.0000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.796791 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0428  transcriptional regulator, TetR family  25.5 
 
 		 211 aa  54.7  0.000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0231  transcriptional regulator, TetR family  35.82 
 
 		 200 aa  54.3  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.336394 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3508  TetR family transcriptional regulator  37.31 
 
 		 227 aa  54.7  0.000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.343043  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3750  TetR family transcriptional regulator  38.6 
 
 		 230 aa  53.9  0.000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3546  transcriptional regulator, TetR family  39.19 
 
 		 206 aa  54.3  0.000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.726096  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1550  transcriptional regulator, TetR family  45.28 
 
 		 201 aa  54.3  0.000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2175  TetR family transcriptional regulator  38.81 
 
 		 218 aa  54.3  0.000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4729  TetR family transcriptional regulator  28.93 
 
 		 240 aa  54.3  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2502  transcriptional regulator, TetR family  43.33 
 
 		 291 aa  54.3  0.000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1845  transcriptional regulator, TetR family  25.57 
 
 		 211 aa  54.7  0.000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.025211  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4024  TetR family transcriptional regulator  25.58 
 
 		 199 aa  53.9  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.497962  normal  0.530155 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3148  transcriptional regulator, TetR family  43.1 
 
 		 310 aa  53.5  0.000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0781  transcriptional regulator, TetR family  21.72 
 
 		 197 aa  53.5  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2495  transcriptional regulator, TetR family  31.58 
 
 		 287 aa  53.5  0.000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0937177  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3299  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 307 aa  53.9  0.000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0018  TetR family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 196 aa  53.5  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1173  regulatory protein, TetR  25.87 
 
 		 202 aa  53.1  0.000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.959952 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1496  transcriptional regulator, TetR family  30.93 
 
 		 206 aa  53.1  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1218  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 206 aa  53.1  0.000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0698  putative transcription regulator protein  39.68 
 
 		 264 aa  52.8  0.000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00682473  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5559  transcriptional regulator, TetR family  27.61 
 
 		 289 aa  52.4  0.000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4533  TetR family transcriptional regulator  41.82 
 
 		 218 aa  52.8  0.000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.505005  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5390  transcriptional regulator, TetR family  27.61 
 
 		 291 aa  52.8  0.000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.787919  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3920  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 227 aa  52.4  0.000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.62554  normal  0.13671 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5717  transcriptional regulator, TetR family  21.5 
 
 		 197 aa  52.4  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.985195 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47240  putative transcriptional regulator  41.38 
 
 		 204 aa  52.4  0.000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0719  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 408 aa  52.4  0.000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0260522 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3952  TetR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 291 aa  52.4  0.000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1571  TetR family transcriptional regulator  31.65 
 
 		 201 aa  52  0.000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.038411 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1971  transcriptional regulator, TetR family  39.06 
 
 		 261 aa  52  0.000006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000614274  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2434  transcriptional regulator, TetR family  46.3 
 
 		 211 aa  52  0.000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0700  TetR family transcriptional regulator  32.84 
 
 		 178 aa  52  0.000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.665559 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1456  transcriptional regulator, TetR family  33.85 
 
 		 211 aa  52  0.000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5567  TetR family transcriptional regulator  28.91 
 
 		 290 aa  51.6  0.000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5615  transcriptional regulator, TetR family  28.91 
 
 		 291 aa  51.6  0.000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5130  TetR family transcriptional regulator  28.91 
 
 		 290 aa  51.6  0.000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1933  AcrR family transcriptional regulator  30.49 
 
 		 243 aa  51.6  0.000008  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.189914  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0972  TetR family transcriptional regulator  31.75 
 
 		 233 aa  51.6  0.000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.93446  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0074  TetR/AcrR family transcriptional regulator  26.92 
 
 		 196 aa  51.6  0.000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2134  TetR family transcriptional regulator  34.85 
 
 		 205 aa  51.6  0.000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.269562  normal  0.11419 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3360  transcriptional regulator, TetR family  34.83 
 
 		 194 aa  51.6  0.000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.372466  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5288  TetR family transcriptional regulator  28.91 
 
 		 290 aa  51.2  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5685  TetR family transcriptional regulator  28.91 
 
 		 290 aa  51.2  0.00001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2148  TetR family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 228 aa  51.2  0.00001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.726576 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1090  transcriptional regulator, TetR family  28.89 
 
 		 204 aa  50.8  0.00001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.141216  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5529  transcriptional regulator, TetR family  28.91 
 
 		 290 aa  51.2  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1372  TetR family transcriptional regulator  35.59 
 
 		 212 aa  51.2  0.00001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00027491 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2482  transcriptional regulator, TetR family  30.77 
 
 		 196 aa  50.8  0.00001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0282  TetR family transcriptional regulator  39.34 
 
 		 201 aa  51.2  0.00001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.356366  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8100  transcriptional regulator, TetR family  39.06 
 
 		 218 aa  51.2  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.978856  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4076  putative transcriptional regulator  41.38 
 
 		 204 aa  50.8  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.462339  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5113  TetR family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 290 aa  50.1  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0067  TetR family transcriptional regulator  35 
 
 		 212 aa  50.4  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000826521  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1015  transcriptional regulator, TetR family  46.67 
 
 		 201 aa  50.1  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3317  TetR family transcriptional regulator  32.47 
 
 		 214 aa  50.1  0.00002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.305506  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00486  transcriptional regulator, TetR family protein  23.85 
 
 		 224 aa  50.1  0.00002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4666  TetR family transcriptional regulator  41.27 
 
 		 214 aa  50.8  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.441468  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2468  TetR family transcriptional regulator  32.79 
 
 		 198 aa  50.4  0.00002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5076  TetR family transcriptional regulator  40.74 
 
 		 209 aa  50.8  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0402  transcriptional regulator, TetR family  32.81 
 
 		 219 aa  50.1  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.67084  normal  0.0771341 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3170  transcriptional regulator, TetR family  44.64 
 
 		 216 aa  50.1  0.00002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0607  transcriptional regulator, TetR family  36.51 
 
 		 255 aa  50.4  0.00002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.118397  normal  0.590685 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6345  transcriptional regulator, TetR family  42.59 
 
 		 241 aa  50.1  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5784  TetR family transcriptional regulator  40.74 
 
 		 209 aa  50.8  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.907377 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4394  TetR family transcriptional regulator  40.74 
 
 		 198 aa  50.4  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0648  transcriptional regulator, TetR family  37.29 
 
 		 247 aa  50.4  0.00002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0672593 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4165  TetR family transcriptional regulator  22.1 
 
 		 198 aa  50.4  0.00002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.774051  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4044  TetR family transcriptional regulator  32.47 
 
 		 214 aa  50.1  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1218  transcriptional regulator, TetR family  25.41 
 
 		 206 aa  49.7  0.00003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2304  TetR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 211 aa  49.7  0.00003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.373552  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2272  TetR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 211 aa  49.7  0.00003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000566042  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2226  TetR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 211 aa  49.7  0.00003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0397604  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0184  TetR family transcriptional regulator  27.74 
 
 		 197 aa  50.1  0.00003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0196  transcriptional regulator, TetR family  30 
 
 		 200 aa  49.7  0.00003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2479  TetR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 211 aa  49.7  0.00003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.660065  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1538  TetR family transcriptional regulator  24.59 
 
 		 394 aa  49.7  0.00003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.112139  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2500  transcriptional regulator, TetR family  44.44 
 
 		 211 aa  49.7  0.00003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1561  TetR family transcriptional regulator  24.59 
 
 		 394 aa  49.7  0.00003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.447454  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0496  TetR family transcriptional regulator  33.72 
 
 		 202 aa  50.1  0.00003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.250936 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1509  TetR family transcriptional regulator  24.59 
 
 		 394 aa  49.7  0.00003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.27867  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>