133 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smon_0674 on replicon NC_013515
Organism: Streptobacillus moniliformis DSM 12112



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013515  Smon_0674  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 200 aa  400  1e-111  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0684  transcriptional regulator, TetR family  34.05 
 
 		 197 aa  103  2e-21  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.84339  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0332  TetR family transcriptional regulator  42.61 
 
 		 208 aa  80.5  0.00000000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2226  TetR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 211 aa  52.8  0.000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0397604  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0369  transcriptional regulator, TetR family  31.51 
 
 		 204 aa  52.8  0.000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.238864 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2304  TetR family transcriptional regulator  30.89 
 
 		 211 aa  52.4  0.000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.373552  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2479  TetR family transcriptional regulator  30.89 
 
 		 211 aa  52.4  0.000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.660065  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0657  TetR family transcriptional regulator  45.1 
 
 		 205 aa  52.4  0.000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.184165  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5992  transcriptional regulator, TetR family  30.95 
 
 		 199 aa  52.8  0.000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.396143  normal  0.47391 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2575  transcriptional regulator, TetR family  29.41 
 
 		 211 aa  52.8  0.000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000582548  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2510  TetR family transcriptional regulator  28.68 
 
 		 209 aa  52.4  0.000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00262483  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22050  transcriptional regulator  24.06 
 
 		 199 aa  52.4  0.000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0903673 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2272  TetR family transcriptional regulator  30.83 
 
 		 211 aa  52  0.000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000566042  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2500  transcriptional regulator, TetR family  30.83 
 
 		 211 aa  52  0.000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1665  transcriptional regulator, TetR family  23.53 
 
 		 223 aa  50.8  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.117381  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1971  transcriptional regulator, TetR family  30.82 
 
 		 261 aa  50.1  0.00002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000614274  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0282  TetR family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 201 aa  50.4  0.00002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.356366  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1426  transcriptional regulator, TetR family  32.97 
 
 		 204 aa  49.3  0.00003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0803354  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2434  transcriptional regulator, TetR family  38.18 
 
 		 211 aa  49.7  0.00003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2148  TetR family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 228 aa  49.3  0.00004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.726576 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3493  TetR family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 211 aa  49.3  0.00004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.729173  normal  0.75311 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0018  TetR family transcriptional regulator  31.73 
 
 		 196 aa  48.9  0.00005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5390  transcriptional regulator, TetR family  28.85 
 
 		 291 aa  48.9  0.00005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.787919  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1526  transcriptional regulator, TetR family  20.77 
 
 		 189 aa  48.5  0.00006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000234923  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2285  TetR family transcriptional regulator  31.17 
 
 		 211 aa  48.1  0.00008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0118465  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2502  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 291 aa  48.1  0.00009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0184  TetR family transcriptional regulator  48.98 
 
 		 197 aa  48.1  0.00009  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0429  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 213 aa  48.1  0.00009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0148562 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3750  TetR family transcriptional regulator  40.38 
 
 		 230 aa  47.8  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4076  putative transcriptional regulator  33.33 
 
 		 204 aa  47.8  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.462339  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5392  transcriptional regulator, TetR family protein  28.92 
 
 		 190 aa  47.8  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47240  putative transcriptional regulator  35.42 
 
 		 204 aa  46.6  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2540  transcriptional regulator, TetR family  35.59 
 
 		 220 aa  47.4  0.0002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.34282 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2297  TetR family transcriptional regulator  26.97 
 
 		 305 aa  47.4  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0935054  hitchhiker  0.00257224 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7736  putative transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 205 aa  47  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.97147  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0166  TetR family transcriptional regulator  30.28 
 
 		 193 aa  46.6  0.0002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.141555  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5559  transcriptional regulator, TetR family  28.21 
 
 		 289 aa  47  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1623  transcriptional regulator, TetR family  27.78 
 
 		 205 aa  47  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3299  transcriptional regulator, TetR family  20.39 
 
 		 307 aa  46.2  0.0003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0700  TetR family transcriptional regulator  36.96 
 
 		 178 aa  46.2  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.665559 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1550  transcriptional regulator, TetR family  34 
 
 		 201 aa  46.6  0.0003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2411  transcriptional regulator, TetR family  32.35 
 
 		 205 aa  46.2  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.147912 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3096  TetR family transcriptional regulator  27.47 
 
 		 202 aa  46.2  0.0004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0203472  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0231  transcriptional regulator, TetR family  28.77 
 
 		 200 aa  45.8  0.0004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.336394 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2527  TetR family transcriptional regulator  24.81 
 
 		 194 aa  45.8  0.0005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.490074  normal  0.267005 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5710  TetR family transcriptional regulator  21.79 
 
 		 222 aa  45.4  0.0005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.572132  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2537  TetR family transcriptional regulator  32.73 
 
 		 87 aa  45.1  0.0006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3170  transcriptional regulator, TetR family  44.44 
 
 		 216 aa  45.4  0.0006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6228  transcriptional regulator, TetR family  41.86 
 
 		 194 aa  45.4  0.0006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.301912  normal  0.923303 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0457  TetR family transcriptional regulator  29.58 
 
 		 206 aa  45.1  0.0006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0750  transcriptional regulator, TetR family  40.82 
 
 		 236 aa  45.4  0.0006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0322855 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5567  TetR family transcriptional regulator  24.84 
 
 		 290 aa  45.1  0.0007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5288  TetR family transcriptional regulator  24.84 
 
 		 290 aa  45.1  0.0007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5113  TetR family transcriptional regulator  25.16 
 
 		 290 aa  45.1  0.0007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5130  TetR family transcriptional regulator  24.84 
 
 		 290 aa  45.1  0.0007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5685  TetR family transcriptional regulator  24.84 
 
 		 290 aa  45.1  0.0007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5529  transcriptional regulator, TetR family  24.84 
 
 		 290 aa  45.1  0.0007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1845  transcriptional regulator, TetR family  21.05 
 
 		 211 aa  45.1  0.0008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.025211  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1933  AcrR family transcriptional regulator  27.15 
 
 		 243 aa  45.1  0.0008  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.189914  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5615  transcriptional regulator, TetR family  24.84 
 
 		 291 aa  44.7  0.0008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0698  putative transcription regulator protein  29.63 
 
 		 264 aa  44.3  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00682473  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3466  TetR family transcriptional regulator  31.75 
 
 		 200 aa  44.7  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0370  TetR family transcriptional regulator  32.05 
 
 		 223 aa  44.3  0.001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0234884  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3546  transcriptional regulator, TetR family  29.63 
 
 		 206 aa  43.9  0.001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.726096  normal  1 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5404  transcriptional regulator, TetR family  28.18 
 
 		 192 aa  44.3  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0587042  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0012  putative AcrAB operon repressor transcription regulator protein  24.47 
 
 		 219 aa  43.5  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.631075  normal  0.0464367 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0067  TetR family transcriptional regulator  36.54 
 
 		 212 aa  43.9  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000826521  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3923  TetR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 214 aa  43.5  0.002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3536  TetR family transcriptional regulator  23.03 
 
 		 208 aa  43.5  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.296099 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0024  TetR family transcriptional regulator  23.46 
 
 		 212 aa  43.5  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0104  TetR family transcriptional regulator  29.9 
 
 		 190 aa  43.9  0.002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0228  TetR family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 205 aa  43.1  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.728602  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5228  TetR family transcriptional regulator  27.56 
 
 		 290 aa  43.5  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1936  transcriptional regulator, TetR family  27.27 
 
 		 193 aa  43.5  0.002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1290  AcrR family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 199 aa  43.5  0.002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2156  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 207 aa  43.5  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.362049 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2914  transcriptional regulator, TetR family  27 
 
 		 202 aa  43.5  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1103  transcriptional regulator, TetR family  34.62 
 
 		 248 aa  43.5  0.002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.575371  normal  0.523139 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3641  TetR family transcriptional regulator  23.59 
 
 		 200 aa  42.7  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.798229 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4455  transcriptional regulator, TetR family  30.77 
 
 		 215 aa  43.1  0.003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0390638 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1260  transcriptional regulator, TetR family  23.78 
 
 		 222 aa  42.7  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.194739 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1216  TetR family transcriptional regulator  21.79 
 
 		 204 aa  43.1  0.003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1440  TetR family transcriptional regulator  20.77 
 
 		 213 aa  42.7  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0208928 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0949  transcriptional regulator, TetR family  26.67 
 
 		 286 aa  42.7  0.003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3198  TetR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 215 aa  42.7  0.003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00193732  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0444  TetR family transcriptional regulator  34.33 
 
 		 220 aa  42.7  0.003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.275459  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0646  TetR family transcriptional regulator  32.81 
 
 		 213 aa  43.1  0.003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.545029 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0355  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 195 aa  43.1  0.003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1594  TetR family transcriptional regulator  23.14 
 
 		 210 aa  42.7  0.004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.000000000148614  unclonable  0.000000209189 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2468  TetR family transcriptional regulator  29.51 
 
 		 198 aa  42.4  0.004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5185  TetR family transcriptional regulator  31.37 
 
 		 212 aa  42.4  0.004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4222  TetR family transcriptional regulator  29.23 
 
 		 221 aa  42.7  0.004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.42669  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5674  TetR family transcriptional regulator  31.37 
 
 		 212 aa  42.4  0.004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.166194  hitchhiker  0.00758562 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4288  TetR family transcriptional regulator  29.23 
 
 		 221 aa  42.7  0.004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.458199  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1794  TetR family transcriptional regulator  37.25 
 
 		 218 aa  42.4  0.004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4600  TetR family transcriptional regulator  29.23 
 
 		 221 aa  42.7  0.004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0411306  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3397  TetR family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 222 aa  42.7  0.004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.15089  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3952  TetR family transcriptional regulator  25.64 
 
 		 291 aa  42.4  0.004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2482  transcriptional regulator, TetR family  29.79 
 
 		 196 aa  42.4  0.004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6365  putative transcriptional regulator, TetR family  38.64 
 
 		 210 aa  42.7  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.277737  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>