More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_3641 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007413  Ava_3641  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 200 aa  419  1e-116  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.798229 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2094  transcriptional regulator, TetR family  49.2 
 
 		 186 aa  189  2.9999999999999997e-47  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000324065 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4972  transcriptional regulator, TetR family  23.63 
 
 		 317 aa  82.4  0.000000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.377224 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2194  TetR family transcriptional regulator  28.25 
 
 		 193 aa  72  0.000000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.789913  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2147  TetR family transcriptional regulator  26.92 
 
 		 193 aa  67  0.0000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.576982  hitchhiker  0.00198138 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5954  transcriptional regulator TetR family  31.91 
 
 		 219 aa  63.2  0.000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2422  transcriptional regulator, TetR family  35.87 
 
 		 197 aa  61.6  0.000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000265027  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0565  transcriptional regulator BetI  23.27 
 
 		 202 aa  61.2  0.000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.359685 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3160  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 205 aa  61.2  0.000000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000883166 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3756  TetR family transcriptional regulator  45.1 
 
 		 193 aa  60.8  0.00000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4128  TetR family transcriptional regulator  35.9 
 
 		 241 aa  60.8  0.00000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.860792 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3573  transcriptional regulator, TetR family  30.36 
 
 		 196 aa  60.5  0.00000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2007  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 193 aa  59.7  0.00000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.382346 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0809  regulatory protein, TetR  26.97 
 
 		 200 aa  60.1  0.00000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.732229  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1921  transcriptional regulator, TetR family  43.1 
 
 		 197 aa  59.7  0.00000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0409606  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2076  transcriptional regulator, TetR family  33.75 
 
 		 209 aa  59.7  0.00000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.954712 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0966  transcriptional regulator, TetR family  26.4 
 
 		 218 aa  58.9  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00645846  normal  0.836206 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1244  TetR family transcriptional regulator  32.29 
 
 		 206 aa  58.9  0.00000005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0166  TetR family transcriptional regulator  27.48 
 
 		 193 aa  58.2  0.00000008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.141555  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0068  transcriptional regulator, TetR family  26.72 
 
 		 185 aa  58.2  0.00000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.139926 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4367  transcriptional regulator, TetR family  30.99 
 
 		 201 aa  57.8  0.0000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1218  transcriptional regulator, TetR family  32.94 
 
 		 206 aa  57.8  0.0000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1697  hypothetical protein  31.46 
 
 		 199 aa  57.8  0.0000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.280342 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2510  TetR family transcriptional regulator  34.33 
 
 		 209 aa  57  0.0000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00262483  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3833  transcriptional regulator, TetR family  39.68 
 
 		 204 aa  57.4  0.0000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5607  transcriptional regulator, TetR family  27.66 
 
 		 209 aa  56.6  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.897418  normal  0.557491 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3503  TetR family transcriptional regulator  45.61 
 
 		 198 aa  56.2  0.0000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2515  TetR family transcriptional regulator  33 
 
 		 202 aa  56.2  0.0000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.326335 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2304  TetR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 211 aa  55.8  0.0000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.373552  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2272  TetR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 211 aa  55.8  0.0000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000566042  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2226  TetR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 211 aa  55.8  0.0000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0397604  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2500  transcriptional regulator, TetR family  34.78 
 
 		 211 aa  55.8  0.0000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2479  TetR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 211 aa  55.8  0.0000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.660065  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2434  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 211 aa  55.8  0.0000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04380  transcriptional regulator, TetR family  38.71 
 
 		 72 aa  55.8  0.0000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2856  TetR family transcriptional regulator  39.44 
 
 		 194 aa  55.8  0.0000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.661308  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3637  TetR family transcriptional regulator  34.85 
 
 		 228 aa  55.8  0.0000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3459  TetR family transcriptional regulator  30.71 
 
 		 324 aa  55.5  0.0000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000855252 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2669  transcriptional regulator, TetR family  32.14 
 
 		 226 aa  55.1  0.0000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00411812  normal  0.199475 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0110  transcriptional regulator, TetR family  29.6 
 
 		 225 aa  55.5  0.0000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4543  putative transcriptional regulator, TetR family  36.21 
 
 		 205 aa  55.5  0.0000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0569885  normal  0.220748 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2575  transcriptional regulator, TetR family  34.33 
 
 		 211 aa  55.1  0.0000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000582548  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4290  transcriptional regulator, TetR family  31.18 
 
 		 226 aa  54.3  0.000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.000567463  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1788  TetR family transcriptional regulator  34.67 
 
 		 195 aa  54.3  0.000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000202922  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4897  TetR family transcriptional regulator  24.22 
 
 		 231 aa  54.3  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.043246  normal  0.757086 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1927  TetR family transcriptional regulator  34.67 
 
 		 195 aa  54.3  0.000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00399738  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0557  regulatory protein TetR  48.98 
 
 		 251 aa  54.3  0.000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5183  putative transcriptional regulator, TetR family  38.6 
 
 		 212 aa  53.9  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0142854 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3241  TetR family transcriptional regulator  40.98 
 
 		 221 aa  54.3  0.000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8695  transcriptional regulator, TetR family  39.29 
 
 		 203 aa  54.3  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.650286 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6189  TetR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 210 aa  54.3  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.304814  normal  0.805788 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0270  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 192 aa  53.9  0.000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.522665  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5720  TetR family transcriptional regulator  35.56 
 
 		 291 aa  53.5  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.649137  normal  0.760569 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3781  TetR family transcriptional regulator  23.79 
 
 		 214 aa  53.5  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1236  TetR family transcriptional regulator  26.11 
 
 		 196 aa  53.9  0.000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0369519 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6827  putative transcriptional regulator, TetR family  26.71 
 
 		 200 aa  53.9  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0995041 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0441  TetR family transcriptional regulator  40.35 
 
 		 198 aa  53.5  0.000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.805705 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0651  TetR family transcriptional regulator  25.9 
 
 		 218 aa  53.9  0.000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0025795  normal  0.249536 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0936  transcriptional regulator, TetR family protein  31.65 
 
 		 206 aa  53.9  0.000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0778  transcriptional regulator BetI  24.6 
 
 		 211 aa  53.1  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.576335  normal  0.0961486 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2774  transcriptional regulator, TetR family  33.85 
 
 		 208 aa  53.9  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1461  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 197 aa  53.9  0.000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.0279876 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3221  TetR family transcriptional regulator  43.14 
 
 		 232 aa  53.5  0.000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1045  TetR family transcriptional regulator  38.98 
 
 		 226 aa  53.5  0.000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.446098  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3720  transcriptional regulator, TetR family  47.06 
 
 		 225 aa  53.9  0.000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.984063  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2630  TetR family transcriptional regulator  29.13 
 
 		 205 aa  53.5  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0697093  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3666  TetR family transcriptional regulator  36 
 
 		 187 aa  53.5  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.356922  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1218  TetR family transcriptional regulator  24 
 
 		 206 aa  53.1  0.000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1623  transcriptional regulator, TetR family  31.76 
 
 		 205 aa  52.8  0.000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3850  TetR family transcriptional regulator  30.25 
 
 		 207 aa  52.8  0.000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.349935 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13607  TetR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 295 aa  52.8  0.000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.20276 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0378  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 199 aa  52.4  0.000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.585496  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1674  TetR family transcriptional regulator  25.26 
 
 		 201 aa  52.4  0.000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.997457 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4464  TetR family transcriptional regulator  32.38 
 
 		 204 aa  52.8  0.000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0680244 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3038  transcriptional regulator  32.58 
 
 		 230 aa  52.8  0.000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2855  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 199 aa  52.4  0.000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00414349  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1838  transcriptional regulator, TetR family  38.46 
 
 		 221 aa  52.8  0.000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.834516  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0810  transcriptional regulator  32.39 
 
 		 206 aa  52.4  0.000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.490663  normal  0.19914 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2029  TetR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 220 aa  52.4  0.000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.107784  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17710  transcriptional regulator  34.57 
 
 		 203 aa  52.4  0.000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0632938  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1260  transcriptional regulator, TetR family  32 
 
 		 222 aa  52.4  0.000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.194739 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2800  TetR family transcriptional regulator  30.11 
 
 		 224 aa  52.4  0.000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.697977  decreased coverage  0.000162176 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3312  transcriptional regulator UidR  37.7 
 
 		 198 aa  52  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2285  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 211 aa  52  0.000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0118465  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2744  TetR family transcriptional regulator  34.67 
 
 		 187 aa  52.4  0.000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.184508  normal  0.510089 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2436  TetR family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 243 aa  52.4  0.000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.747053 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0726  transcriptional regulator, TetR family  36.23 
 
 		 203 aa  52.4  0.000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0085  TetR family transcriptional regulator  27.18 
 
 		 195 aa  52.4  0.000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  hitchhiker  0.0016021  decreased coverage  0.0000722764 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3788  transcriptional regulator, TetR family  26.9 
 
 		 208 aa  52  0.000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1225  TetR family transcriptional regulator  32.04 
 
 		 208 aa  52  0.000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.657492  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1027  transcriptional regulator, TetR family  39.68 
 
 		 201 aa  52  0.000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1869  TetR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 215 aa  52  0.000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1955  transcriptional regulator, TetR family  34.25 
 
 		 202 aa  52  0.000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.22623  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2765  regulatory protein, TetR  31.52 
 
 		 210 aa  52  0.000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.267077  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0117  transcriptional regulator, TetR family  28.8 
 
 		 225 aa  52  0.000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.678219 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4172  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 205 aa  52  0.000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.928216  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4150  transcriptional regulator, TetR family  22.63 
 
 		 200 aa  51.6  0.000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1103  transcriptional regulator, TetR family  34.29 
 
 		 248 aa  51.6  0.000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.575371  normal  0.523139 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05020  transcriptional regulator, TetR family  46.15 
 
 		 194 aa  51.6  0.000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4190  transcriptional regulator, TetR family  22.63 
 
 		 200 aa  51.6  0.000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.378174  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>