75 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmur_1971 on replicon NC_014150
Organism: Brachyspira murdochii DSM 12563



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014150  Bmur_1971  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 261 aa  513  1e-144  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000614274  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0369  transcriptional regulator, TetR family  25.37 
 
 		 204 aa  60.5  0.00000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.238864 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1090  transcriptional regulator, TetR family  29.67 
 
 		 204 aa  60.1  0.00000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.141216  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6228  transcriptional regulator, TetR family  34.72 
 
 		 194 aa  59.3  0.00000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.301912  normal  0.923303 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0700  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 178 aa  58.5  0.00000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.665559 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00350  transcriptional regulator  37.29 
 
 		 199 aa  54.3  0.000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1173  regulatory protein, TetR  35.48 
 
 		 202 aa  53.5  0.000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.959952 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0332  TetR family transcriptional regulator  39.06 
 
 		 208 aa  52.4  0.000007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1426  transcriptional regulator, TetR family  34.38 
 
 		 204 aa  51.6  0.00001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0803354  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2134  TetR family transcriptional regulator  33.87 
 
 		 205 aa  52  0.00001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.269562  normal  0.11419 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1535  transcriptional regulator, TetR family  27.66 
 
 		 204 aa  51.6  0.00001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0674  transcriptional regulator, TetR family  30.82 
 
 		 200 aa  50.1  0.00003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0684  transcriptional regulator, TetR family  45.45 
 
 		 197 aa  48.9  0.00008  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.84339  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2537  TetR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 87 aa  47.4  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2783  TetR family transcriptional regulator  31.88 
 
 		 187 aa  47.8  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0726  transcriptional regulator, TetR family  36 
 
 		 203 aa  48.1  0.0002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4859  transcriptional regulator, TetR family  17.76 
 
 		 186 aa  47.4  0.0003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.205859 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2111  transcriptional regulator, TetR family  33.93 
 
 		 214 aa  47.4  0.0003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.780559 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0018  TetR family transcriptional regulator  30.65 
 
 		 196 aa  47  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1401  TetR family transcriptional regulator  31.18 
 
 		 222 aa  47  0.0003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.513329  normal  0.505278 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1015  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 201 aa  47  0.0003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1571  TetR family transcriptional regulator  27.55 
 
 		 207 aa  46.6  0.0004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0074  TetR/AcrR family transcriptional regulator  27.69 
 
 		 196 aa  47  0.0004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1372  TetR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 212 aa  46.2  0.0005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00027491 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0228  TetR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 205 aa  45.8  0.0008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.728602  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0428  transcriptional regulator, TetR family  22.39 
 
 		 211 aa  44.7  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4711  transcriptional regulator, TetR family  27.27 
 
 		 186 aa  45.4  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.492793  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6448  transcriptional regulator, TetR family  34 
 
 		 222 aa  44.7  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000000264064  hitchhiker  1.59583e-16 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6941  transcriptional regulator, TetR family  29.82 
 
 		 221 aa  45.1  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7736  putative transcriptional regulator, TetR family  22.54 
 
 		 205 aa  45.1  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.97147  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4342  regulatory protein TetR  27.27 
 
 		 186 aa  45.1  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.525641  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1772  TetR family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 202 aa  45.1  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.706828  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2740  TetR family transcriptional regulator  35.94 
 
 		 230 aa  45.1  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0291953  hitchhiker  0.000390237 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1694  TetR family transcriptional regulator  20.38 
 
 		 219 aa  45.1  0.001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.0960426 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0395  regulatory protein TetR  22.39 
 
 		 211 aa  44.7  0.002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.796791 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1281  TetR family transcriptional regulator  25.51 
 
 		 210 aa  44.3  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.781108  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3205  TetR family transcriptional regulator  21.48 
 
 		 197 aa  44.7  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38380  putative transcriptional regulator  29.69 
 
 		 210 aa  43.9  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0126427 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1665  transcriptional regulator, TetR family  31.15 
 
 		 223 aa  44.7  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.117381  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1493  TetR family transcriptional regulator  24.24 
 
 		 200 aa  44.7  0.002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3267  TetR family transcriptional regulator  21.48 
 
 		 197 aa  44.7  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0261097  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3216  TetR family transcriptional regulator  21.48 
 
 		 197 aa  44.7  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.278224  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6580  transcriptional regulator, TetR family  27.91 
 
 		 242 aa  43.9  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.603144 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6345  transcriptional regulator, TetR family  38.33 
 
 		 241 aa  43.9  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2502  transcriptional regulator, TetR family  28.85 
 
 		 291 aa  43.9  0.003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4074  TetR family transcriptional regulator  20.45 
 
 		 194 aa  43.9  0.003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.137574 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3416  transcriptional regulator, TetR family  25.32 
 
 		 226 aa  43.5  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.180038  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0429  TetR family transcriptional regulator  31.15 
 
 		 213 aa  43.9  0.003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0148562 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3148  transcriptional regulator, TetR family  25.58 
 
 		 310 aa  43.5  0.004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4225  TetR family transcriptional regulator  36.54 
 
 		 244 aa  43.5  0.004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.127157  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3714  transcriptional regulator, TetR family  25.32 
 
 		 226 aa  43.5  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.576002 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3443  TetR family transcriptional regulator  19.71 
 
 		 212 aa  43.5  0.004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.61751 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2525  transcriptional regulator, TetR family  27.66 
 
 		 203 aa  43.1  0.005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.905424  hitchhiker  0.00170542 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1843  transcriptional regulatory protein  30.51 
 
 		 201 aa  42.7  0.005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.677238  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5896  transcriptional regulator  31.43 
 
 		 199 aa  42.7  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.371414  normal  0.0197091 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2796  TetR family transcriptional regulator  30.67 
 
 		 231 aa  42.7  0.005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.252593 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3838  transcriptional regulator TetR family  32.14 
 
 		 230 aa  43.1  0.005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.606304  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1656  TetR family transcriptional regulator  32.39 
 
 		 196 aa  43.1  0.005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0515046  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1479  transcriptional regulator, TetR family  35.85 
 
 		 190 aa  43.1  0.005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.210194  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0231  transcriptional regulator, TetR family  24.24 
 
 		 200 aa  42.7  0.006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.336394 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1149  transcriptional regulator, TetR family protein  26.83 
 
 		 226 aa  42.7  0.006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3965  transcriptional regulator, TetR family  18.34 
 
 		 208 aa  42.7  0.007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1067  TetR family transcriptional regulator  23.72 
 
 		 202 aa  42.4  0.007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2507  TetR family transcriptional regulator  30.14 
 
 		 211 aa  42.4  0.007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00142913 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1601  transcriptional regulator, TetR family  34.62 
 
 		 202 aa  42.4  0.007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0118  TetR family transcriptional regulator  36.54 
 
 		 247 aa  42.4  0.008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.211628  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2179  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 192 aa  42.4  0.008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0464  transcriptional regulator, TetR family  25 
 
 		 211 aa  42.4  0.008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.128175  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0109  TetR family transcriptional regulator  36.54 
 
 		 247 aa  42.4  0.008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0947  TetR family transcriptional regulator  26.83 
 
 		 205 aa  42.4  0.008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0946183  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0427  transcriptional regulator, TetR family  31.48 
 
 		 180 aa  42.4  0.009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4533  TetR family transcriptional regulator  18.25 
 
 		 218 aa  42.4  0.009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.505005  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0084  TetR family transcriptional regulator  27.42 
 
 		 205 aa  42  0.009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3212  TetR family transcriptional regulator  33.96 
 
 		 223 aa  42  0.009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.59703  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1507  TetR family transcriptional regulator  24.1 
 
 		 412 aa  42  0.01  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>