More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_6365 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_6365  putative transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 210 aa  417  1e-116  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.277737  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1574  regulatory protein, TetR  40.41 
 
 		 200 aa  143  2e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.979673 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1523  TetR family transcriptional regulator  39.38 
 
 		 200 aa  138  6e-32  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000120489 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6827  putative transcriptional regulator, TetR family  36.46 
 
 		 200 aa  127  8.000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0995041 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0452  transcriptional regulator, TetR family  28 
 
 		 207 aa  87.4  1e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1339  transcriptional regulator, TetR family  29.81 
 
 		 308 aa  78.2  0.00000000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.752137  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1591  TetR family transcriptional regulator  27.62 
 
 		 215 aa  77.4  0.0000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.194821 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2291  transcriptional regulator, TetR family  28.43 
 
 		 205 aa  74.3  0.000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.857741  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1969  TetR family transcriptional regulator  27.93 
 
 		 205 aa  73.6  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0320964 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16270  transcriptional regulator  30.12 
 
 		 287 aa  73.6  0.000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0681  transcriptional regulator, TetR family  33.66 
 
 		 217 aa  71.2  0.00000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1264  TetR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 206 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.599329  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3524  TetR family transcriptional regulator  28.19 
 
 		 187 aa  65.1  0.0000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2695  TetR family transcriptional regulator  28.25 
 
 		 204 aa  65.1  0.0000000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.945572  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6268  TetR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 182 aa  63.9  0.000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.700387  normal  0.409486 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6166  putative transcriptional regulator, TetR family  31.87 
 
 		 197 aa  63.9  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.42038  normal  0.0100509 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0626  TetR family transcriptional regulator  25.43 
 
 		 199 aa  63.2  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5351  TetR family transcriptional regulator  33.99 
 
 		 195 aa  63.2  0.000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0124857 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1909  transcriptional regulator, TetR family  23.64 
 
 		 197 aa  63.2  0.000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2337  TetR family transcriptional regulator  24.1 
 
 		 191 aa  60.8  0.00000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000766652  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2169  transcriptional regulator, TetR family  32.67 
 
 		 207 aa  61.2  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.821962  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5076  TetR family transcriptional regulator  32.64 
 
 		 215 aa  60.8  0.00000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.175697 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4280  transcriptional regulator, TetR family  28.95 
 
 		 203 aa  60.5  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.409841  normal  0.686522 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1014  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 212 aa  60.8  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4691  TetR family transcriptional regulator  32.64 
 
 		 205 aa  60.5  0.00000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.771858  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1935  transcriptional regulator, TetR family  29.41 
 
 		 233 aa  60.1  0.00000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4777  TetR family transcriptional regulator  32.64 
 
 		 205 aa  60.5  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.681727  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3581  TetR family transcriptional regulator  39.33 
 
 		 209 aa  60.5  0.00000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2602  transcriptional regulator, TetR family  31.61 
 
 		 214 aa  60.1  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.157273  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2272  TetR family transcriptional regulator  26.62 
 
 		 211 aa  59.7  0.00000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000566042  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2695  transcriptional regulator, TetR family  31.61 
 
 		 226 aa  59.7  0.00000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1261  TetR family transcriptional regulator  32.18 
 
 		 214 aa  59.7  0.00000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.100849  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0450  transcriptional regulator, TetR family  25.82 
 
 		 349 aa  59.7  0.00000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0035112 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2500  transcriptional regulator, TetR family  26.62 
 
 		 211 aa  59.7  0.00000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6487  transcriptional regulator, TetR family  29.03 
 
 		 195 aa  60.1  0.00000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13590  TetR family transcriptional regulator  27.03 
 
 		 200 aa  59.3  0.00000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.332381  normal  0.0844747 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2507  TetR family transcriptional regulator  28.07 
 
 		 211 aa  59.3  0.00000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00142913 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1353  regulatory protein TetR  32.21 
 
 		 210 aa  58.9  0.00000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.273808  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4729  TetR family transcriptional regulator  26.58 
 
 		 240 aa  58.9  0.00000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11350  transcriptional regulator  37.21 
 
 		 220 aa  58.9  0.00000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1401  TetR family transcriptional regulator  26.86 
 
 		 222 aa  58.5  0.00000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.513329  normal  0.505278 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1464  TetR family transcriptional regulator  32.16 
 
 		 210 aa  58.2  0.00000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.856721  normal  0.959808 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3299  transcriptional regulator, TetR family  37.35 
 
 		 307 aa  58.2  0.00000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7448  transcriptional regulator, TetR family  28.25 
 
 		 212 aa  58.2  0.00000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.58477 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2510  TetR family transcriptional regulator  26.8 
 
 		 209 aa  57.8  0.0000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00262483  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1807  transcriptional regulator, TetR family  29.52 
 
 		 199 aa  58.2  0.0000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.366594 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0651  TetR family transcriptional regulator  31.21 
 
 		 218 aa  57.8  0.0000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0025795  normal  0.249536 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2434  transcriptional regulator, TetR family  24.68 
 
 		 211 aa  57.4  0.0000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5896  transcriptional regulator  29.73 
 
 		 199 aa  57.8  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.371414  normal  0.0197091 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5283  TetR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 208 aa  57.8  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.261053 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2285  TetR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 211 aa  57.4  0.0000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0118465  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1751  TetR family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 206 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2226  TetR family transcriptional regulator  25.49 
 
 		 211 aa  57  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0397604  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1313  transcriptional regulator TetR family  28.16 
 
 		 213 aa  57.4  0.0000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6341  TetR family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 206 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0497044  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1738  TetR family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 206 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3259  transcriptional regulator, TetR family  45.61 
 
 		 219 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.147915  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2304  TetR family transcriptional regulator  25.64 
 
 		 211 aa  56.2  0.0000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.373552  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0829  transcriptional regulator, TetR family  24.2 
 
 		 190 aa  56.2  0.0000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2200  transcriptional regulator, TetR family  27.38 
 
 		 203 aa  55.8  0.0000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2575  transcriptional regulator, TetR family  26.14 
 
 		 211 aa  56.2  0.0000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000582548  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2479  TetR family transcriptional regulator  25.64 
 
 		 211 aa  56.2  0.0000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.660065  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2109  TetR family transcriptional regulator  32.53 
 
 		 206 aa  55.8  0.0000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.901149 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4925  TetR family transcriptional regulator  31.61 
 
 		 228 aa  55.8  0.0000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.791426  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3092  transcriptional regulator, TetR family  28.83 
 
 		 185 aa  55.8  0.0000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0725563 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0513  transcriptional regulator, TetR family  32.93 
 
 		 193 aa  55.8  0.0000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.826847 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0870  transcriptional regulator, TetR family  35.16 
 
 		 186 aa  55.5  0.0000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.65823  normal  0.649746 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0370  TetR family transcriptional regulator  22.58 
 
 		 193 aa  55.1  0.0000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1866  TetR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 212 aa  55.1  0.0000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.26917  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0707  TetR family transcriptional regulator  45.61 
 
 		 219 aa  55.1  0.0000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0750  transcriptional regulator, TetR family  21.69 
 
 		 236 aa  55.1  0.0000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0322855 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2880  TetR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 187 aa  54.7  0.000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.924779 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2384  TetR family transcriptional regulator  37.36 
 
 		 187 aa  54.3  0.000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0464  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 215 aa  54.7  0.000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1710  transcriptional regulator, TetR family  21.08 
 
 		 200 aa  54.7  0.000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000037358  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3170  transcriptional regulator, TetR family  23.72 
 
 		 216 aa  54.3  0.000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2799  TetR family transcriptional regulator  24.85 
 
 		 217 aa  53.9  0.000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.364827  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2810  TetR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 187 aa  53.5  0.000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.226856  normal  0.933916 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1374  transcriptional regulator, TetR family  28.04 
 
 		 225 aa  53.9  0.000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.181966  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1944  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 234 aa  53.9  0.000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.358022  decreased coverage  0.0015067 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4222  TetR family transcriptional regulator  25.69 
 
 		 221 aa  53.9  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.42669  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12528  TetR family transcriptional regulator  27.59 
 
 		 215 aa  53.9  0.000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0275989 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4288  TetR family transcriptional regulator  25.69 
 
 		 221 aa  53.9  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.458199  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4600  TetR family transcriptional regulator  25.69 
 
 		 221 aa  53.9  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0411306  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1896  transcriptional regulator, TetR family  27.17 
 
 		 204 aa  53.1  0.000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3412  TetR family transcriptional regulator  28 
 
 		 206 aa  53.1  0.000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.430092  normal  0.661157 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0811  transcriptional regulator, TetR family  29.48 
 
 		 193 aa  53.1  0.000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3172  TetR family transcriptional regulator  26.8 
 
 		 216 aa  53.1  0.000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.547125 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3373  TetR family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 211 aa  52.8  0.000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4880  transcriptional regulator, TetR family  29.24 
 
 		 214 aa  52.8  0.000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0587  TetR family transcriptional regulator  35.05 
 
 		 198 aa  52.8  0.000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3892  regulatory protein TetR  29.85 
 
 		 214 aa  52.4  0.000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0955  TetR family transcriptional regulator  26.77 
 
 		 212 aa  52.4  0.000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2294  TetR family regulatory protein  26.77 
 
 		 206 aa  52.4  0.000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2036  regulatory protein, TetR  28 
 
 		 206 aa  52.4  0.000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.284785 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0177  TetR family transcriptional regulator  27.14 
 
 		 208 aa  52.4  0.000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.775643 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2102  TetR family transcriptional regulator  26.77 
 
 		 206 aa  52.4  0.000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.526616  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2161  TetR family transcriptional regulator  26.77 
 
 		 206 aa  52.4  0.000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.720901  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16730  transcriptional regulator, TetR family  30.13 
 
 		 213 aa  52  0.000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3991  regulatory protein TetR  28.97 
 
 		 197 aa  52  0.000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>