More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GWCH70_2502 on replicon NC_012793
Organism: Geobacillus sp. WCH70



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012793  GWCH70_2502  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 291 aa  598  1e-170  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0949  transcriptional regulator, TetR family  57.79 
 
 		 286 aa  332  4e-90  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3148  transcriptional regulator, TetR family  33.93 
 
 		 310 aa  188  8e-47  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3299  transcriptional regulator, TetR family  35.19 
 
 		 307 aa  170  3e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5228  TetR family transcriptional regulator  40.72 
 
 		 290 aa  163  3e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5615  transcriptional regulator, TetR family  39.82 
 
 		 291 aa  159  6e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5113  TetR family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 290 aa  158  9e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5130  TetR family transcriptional regulator  39.37 
 
 		 290 aa  157  1e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5567  TetR family transcriptional regulator  39.37 
 
 		 290 aa  157  2e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5288  TetR family transcriptional regulator  39.37 
 
 		 290 aa  157  2e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5529  transcriptional regulator, TetR family  39.37 
 
 		 290 aa  157  2e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5685  TetR family transcriptional regulator  39.37 
 
 		 290 aa  157  2e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3952  TetR family transcriptional regulator  35.93 
 
 		 291 aa  156  5.0000000000000005e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5390  transcriptional regulator, TetR family  40.1 
 
 		 291 aa  152  4e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.787919  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5559  transcriptional regulator, TetR family  36.99 
 
 		 289 aa  149  4e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0034  TetR family transcriptional regulator  29.15 
 
 		 189 aa  68.6  0.0000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.345685  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0034  TetR family transcriptional regulator  29.15 
 
 		 189 aa  68.6  0.0000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6228  transcriptional regulator, TetR family  33.71 
 
 		 194 aa  68.6  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.301912  normal  0.923303 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0355  transcriptional regulator, TetR family  34.95 
 
 		 195 aa  68.2  0.0000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2853  transcriptional regulator, TetR family  24.39 
 
 		 195 aa  67  0.0000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.597651 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0719  TetR family transcriptional regulator  37.36 
 
 		 209 aa  67.4  0.0000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0126  TetR family transcriptional regulator  36.26 
 
 		 224 aa  66.6  0.0000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0571  TetR family transcriptional regulator  28.73 
 
 		 219 aa  66.2  0.0000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.22949  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2781  TetR family transcriptional regulator  39.47 
 
 		 206 aa  65.9  0.0000000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000487748 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1028  transcriptional regulator, TetR family  24.53 
 
 		 200 aa  65.1  0.000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0479484  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2765  regulatory protein, TetR  32.38 
 
 		 210 aa  65.1  0.000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.267077  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0807  TetR family transcriptional regulator  27.88 
 
 		 211 aa  64.3  0.000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.271007  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0108  TetR family transcriptional regulator  35.56 
 
 		 219 aa  64.3  0.000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.244027  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2065  transcriptional regulator, TetR family  29.68 
 
 		 188 aa  64.3  0.000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.704626  normal  0.605366 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48190  putative transcriptional regulator  27.07 
 
 		 186 aa  64.3  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0114913  normal  0.0538885 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0117  TetR family transcriptional regulator  35.56 
 
 		 219 aa  64.3  0.000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0523426 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1380  transcriptional regulator, TetR family  36.7 
 
 		 214 aa  64.7  0.000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000685689  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0098  TetR family transcriptional regulator  35.56 
 
 		 219 aa  64.3  0.000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.31231  normal  0.349087 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1426  transcriptional regulator, TetR family  37.66 
 
 		 204 aa  63.9  0.000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0803354  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3170  transcriptional regulator, TetR family  39.74 
 
 		 216 aa  63.5  0.000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2226  TetR family transcriptional regulator  30.06 
 
 		 210 aa  63.5  0.000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1949  hypothetical protein  37.04 
 
 		 186 aa  63.2  0.000000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0992  putative transcriptional regulator of paa operon  31.76 
 
 		 208 aa  62.8  0.000000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.332152  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2110  transcriptional regulator, TetR family  42.37 
 
 		 200 aa  63.2  0.000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0942807  normal  0.362877 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0265  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 200 aa  62.8  0.000000007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00630944 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1936  transcriptional regulator, TetR family  30.68 
 
 		 193 aa  62.8  0.000000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0557  regulatory protein TetR  44.44 
 
 		 251 aa  62.4  0.000000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1592  transcriptional regulator, TetR family  30.6 
 
 		 198 aa  62.4  0.000000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2962  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 201 aa  62.4  0.000000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1938  hypothetical protein  37.04 
 
 		 186 aa  62  0.00000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0067  TetR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 212 aa  62  0.00000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000826521  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1381  transcriptional regulator, TetR family  37.11 
 
 		 184 aa  62  0.00000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.419771  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1582  transcriptional regulator, TetR family  26.56 
 
 		 194 aa  61.6  0.00000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000313158  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1636  TetR family transcriptional regulator  54.9 
 
 		 200 aa  62  0.00000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0231  transcriptional regulator, TetR family  31.76 
 
 		 200 aa  61.6  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.336394 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3438  transcriptional regulator, TetR family  40.62 
 
 		 190 aa  61.2  0.00000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.547681  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1218  TetR family transcriptional regulator  46.3 
 
 		 206 aa  60.8  0.00000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1601  transcriptional regulator, TetR family  28 
 
 		 202 aa  61.2  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10159  TetR family transcriptional regulator  35 
 
 		 214 aa  60.8  0.00000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2495  transcriptional regulator, TetR family  25.16 
 
 		 287 aa  60.8  0.00000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0937177  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1015  transcriptional regulator, TetR family  41.67 
 
 		 201 aa  60.8  0.00000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1613  TetR family transcriptional regulator  31.15 
 
 		 189 aa  61.2  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.066311 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0571  TetR family transcriptional regulator  54.9 
 
 		 200 aa  61.6  0.00000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.530829  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3998  transcriptional regulator, TetR family  38.81 
 
 		 205 aa  61.2  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0825494  normal  0.0160725 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8100  transcriptional regulator, TetR family  32.97 
 
 		 218 aa  60.8  0.00000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.978856  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1922  transcriptional regulator, TetR family  28.85 
 
 		 201 aa  60.8  0.00000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1398  transcriptional regulator, TetR family  36.67 
 
 		 195 aa  60.8  0.00000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1571  TetR family transcriptional regulator  33.7 
 
 		 201 aa  60.8  0.00000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.038411 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3212  TetR family transcriptional regulator  24.56 
 
 		 223 aa  60.5  0.00000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.59703  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1014  TetR family transcriptional regulator  37.97 
 
 		 212 aa  60.1  0.00000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13590  TetR family transcriptional regulator  31.07 
 
 		 200 aa  60.1  0.00000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.332381  normal  0.0844747 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1439  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 196 aa  60.5  0.00000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.187037  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1720  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 200 aa  60.1  0.00000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1090  transcriptional regulator, TetR family  44.68 
 
 		 204 aa  60.1  0.00000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.141216  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3088  transcriptional regulator of TetR family protein  30 
 
 		 198 aa  60.5  0.00000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.119848 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0138  TetR family transcriptional regulator  36.14 
 
 		 218 aa  60.1  0.00000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2799  TetR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 217 aa  60.1  0.00000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.364827  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0144  TetR family transcriptional regulator  36.14 
 
 		 224 aa  59.7  0.00000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.522541  decreased coverage  0.0000264507 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1668  TetR family transcriptional regulator  31.36 
 
 		 204 aa  59.7  0.00000005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5283  TetR family transcriptional regulator  36.62 
 
 		 208 aa  59.7  0.00000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.261053 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0832  transcriptional regulator, TetR family  33.66 
 
 		 196 aa  59.7  0.00000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1483  TetR family transcriptional regulator  30.61 
 
 		 197 aa  60.1  0.00000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03730  transcriptional regulator, TetR family  28.12 
 
 		 215 aa  59.7  0.00000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0167  TetR family transcriptional regulator  41.54 
 
 		 213 aa  59.7  0.00000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0281  transcriptional regulator, TetR family  23.26 
 
 		 218 aa  59.3  0.00000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.645912  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0117  TetR family transcriptional regulator  30.28 
 
 		 208 aa  59.3  0.00000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.966538  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28480  transcriptional regulator  39.29 
 
 		 326 aa  59.3  0.00000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.552525 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5527  transcriptional regulator, TetR family  32.38 
 
 		 210 aa  59.3  0.00000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.107312  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1479  transcriptional regulator, TetR family  30.43 
 
 		 190 aa  59.3  0.00000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.210194  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3827  transcriptional regulator, TetR family  30.77 
 
 		 190 aa  58.9  0.00000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0787  TetR family transcriptional regulator  39.62 
 
 		 192 aa  59.3  0.00000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0101484 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33190  transcriptional regulator  26.35 
 
 		 202 aa  59.3  0.00000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.284512  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4242  transcriptional regulator, TetR family  32.98 
 
 		 200 aa  58.9  0.00000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1098  TetR family transcriptional regulator  36.49 
 
 		 209 aa  58.5  0.0000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0976848 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5790  transcriptional regulator, TetR family  30.17 
 
 		 220 aa  58.5  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0399068 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05020  transcriptional regulator, TetR family  35.62 
 
 		 194 aa  58.5  0.0000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2270  TetR family transcriptional regulator  36.96 
 
 		 189 aa  58.9  0.0000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0074  TetR/AcrR family transcriptional regulator  38.16 
 
 		 196 aa  58.5  0.0000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5186  transcriptional regulator, TetR family  49.06 
 
 		 185 aa  58.9  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.225373  normal  0.188797 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1775  transcriptional regulator, TetR family  40.51 
 
 		 207 aa  58.5  0.0000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0282  TetR family transcriptional regulator  44.23 
 
 		 201 aa  58.2  0.0000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.356366  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1649  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 192 aa  58.2  0.0000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.279043 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2996  TetR family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 237 aa  57.4  0.0000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0444  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 220 aa  58.2  0.0000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.275459  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2134  TetR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 205 aa  57.8  0.0000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.269562  normal  0.11419 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>