More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_1380 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011830  Dhaf_1380  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 214 aa  446  1.0000000000000001e-124  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000685689  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2734  transcriptional regulator, TetR family  38.27 
 
 		 225 aa  152  2.9999999999999998e-36  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1604  AcrR family transcriptional regulator  38.61 
 
 		 221 aa  147  1.0000000000000001e-34  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.388293  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3170  transcriptional regulator, TetR family  33.52 
 
 		 216 aa  103  2e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2575  transcriptional regulator, TetR family  32.75 
 
 		 211 aa  97.8  1e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000582548  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2272  TetR family transcriptional regulator  31.55 
 
 		 211 aa  97.1  2e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000566042  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2226  TetR family transcriptional regulator  31.55 
 
 		 211 aa  96.7  2e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0397604  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2434  transcriptional regulator, TetR family  31.76 
 
 		 211 aa  97.1  2e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2500  transcriptional regulator, TetR family  31.55 
 
 		 211 aa  97.1  2e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2285  TetR family transcriptional regulator  32.75 
 
 		 211 aa  95.5  5e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0118465  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2304  TetR family transcriptional regulator  30.95 
 
 		 211 aa  94.7  9e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.373552  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2479  TetR family transcriptional regulator  30.95 
 
 		 211 aa  94.7  9e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.660065  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2510  TetR family transcriptional regulator  30.99 
 
 		 209 aa  90.5  2e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00262483  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3750  TetR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 230 aa  87.4  1e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0067  TetR family transcriptional regulator  29.15 
 
 		 212 aa  87  2e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000826521  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0750  transcriptional regulator, TetR family  34.46 
 
 		 236 aa  82.8  0.000000000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0322855 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3148  transcriptional regulator, TetR family  49.28 
 
 		 310 aa  71.2  0.00000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1623  transcriptional regulator, TetR family  28.25 
 
 		 205 aa  67  0.0000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0929  TetR family transcriptional regulator  30.46 
 
 		 205 aa  67.4  0.0000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.99421  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3299  transcriptional regulator, TetR family  47.54 
 
 		 307 aa  65.1  0.0000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2502  transcriptional regulator, TetR family  36.7 
 
 		 291 aa  64.7  0.0000000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1103  transcriptional regulator, TetR family  37.21 
 
 		 248 aa  63.9  0.000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.575371  normal  0.523139 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1780  transcriptional regulator, TetR family  28.98 
 
 		 200 aa  62.4  0.000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0355  transcriptional regulator, TetR family  35.87 
 
 		 195 aa  62.8  0.000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4729  TetR family transcriptional regulator  29.45 
 
 		 240 aa  62.4  0.000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1520  transcriptional regulator, TetR family  24.86 
 
 		 208 aa  61.6  0.000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.431113 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1804  transcriptional regulator, TetR family  25.95 
 
 		 189 aa  61.6  0.000000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0949  transcriptional regulator, TetR family  38.1 
 
 		 286 aa  60.8  0.00000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2308  transcriptional regulator, TetR family  39.08 
 
 		 200 aa  59.7  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.594902 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2269  putative transcriptional regulator  36.19 
 
 		 207 aa  59.3  0.00000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.629172  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26760  putative transcriptional regulator  36.19 
 
 		 198 aa  59.3  0.00000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3407  TetR family transcriptional regulator  26.73 
 
 		 422 aa  58.5  0.00000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.282297 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3897  TetR family transcriptional regulator  27.54 
 
 		 213 aa  58.5  0.00000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4079  TetR family transcriptional regulator  26.26 
 
 		 244 aa  58.2  0.00000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.780842  normal  0.246764 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2348  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 222 aa  58.2  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0187157  normal  0.0306872 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2213  putative transcription regulator transcription regulator protein  28.07 
 
 		 236 aa  57.8  0.0000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4600  TetR family transcriptional regulator  29.48 
 
 		 221 aa  57.8  0.0000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0411306  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4222  TetR family transcriptional regulator  29.48 
 
 		 221 aa  57.8  0.0000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.42669  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4288  TetR family transcriptional regulator  29.48 
 
 		 221 aa  57.8  0.0000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.458199  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2688  TetR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 207 aa  57  0.0000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.357002  normal  0.760245 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6173  transcriptional regulator, TetR family  35.16 
 
 		 202 aa  57  0.0000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1827  regulatory protein, TetR  27.32 
 
 		 196 aa  57  0.0000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2801  TetR family transcriptional regulator  43.64 
 
 		 209 aa  57.4  0.0000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0353  transcriptional regulator, TetR family  49.09 
 
 		 191 aa  56.6  0.0000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000439096  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1801  transcriptional regulator, TetR family  23.73 
 
 		 207 aa  56.6  0.0000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0882167  normal  0.119004 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1522  regulatory protein TetR  23.73 
 
 		 207 aa  56.6  0.0000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.855326  normal  0.485337 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5720  TetR family transcriptional regulator  48.08 
 
 		 291 aa  56.6  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.649137  normal  0.760569 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4395  transcriptional regulator, TetR family  25.14 
 
 		 196 aa  56.2  0.0000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.724029  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0817  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 332 aa  55.8  0.0000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2411  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 205 aa  56.2  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.147912 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3238  transcriptional regulator, TetR family  27.84 
 
 		 198 aa  56.2  0.0000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.210945  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5597  TetR family transcriptional regulator  27.84 
 
 		 198 aa  55.8  0.0000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.143469  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2755  TetR family transcriptional regulator  22.81 
 
 		 200 aa  55.8  0.0000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4378  transcriptional regulator, TetR family  39.39 
 
 		 200 aa  55.8  0.0000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.136582 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2411  transcriptional regulator, TetR family  27.65 
 
 		 236 aa  55.8  0.0000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2530  TetR family transcriptional regulator  35.79 
 
 		 213 aa  55.5  0.0000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.704068 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2657  TetR family transcriptional regulator  35.79 
 
 		 213 aa  55.5  0.0000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3944  TetR family transcriptional regulator  43.64 
 
 		 215 aa  55.5  0.0000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5473  TetR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 201 aa  55.5  0.0000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.968436  normal  0.0284284 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1550  transcriptional regulator, TetR family  40.98 
 
 		 201 aa  55.1  0.0000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1776  transcriptional regulator, TetR family  29.33 
 
 		 218 aa  55.1  0.0000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0293549  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0421  transcriptional regulator, TetR family  35.44 
 
 		 198 aa  55.1  0.0000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2460  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 201 aa  55.1  0.0000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.315446  normal  0.37249 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0043  regulatory protein, TetR  36.14 
 
 		 211 aa  55.1  0.0000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3734  TetR family transcriptional regulator  29.27 
 
 		 202 aa  54.7  0.0000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0165853  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2358  transcriptional regulator, TetR family  31.71 
 
 		 216 aa  54.7  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0281012 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2028  TetR family transcriptional regulator  31.96 
 
 		 222 aa  54.7  0.000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.578288  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2104  TetR family transcriptional regulator  44.23 
 
 		 191 aa  54.3  0.000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.230608 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2017  transcriptional regulator, TetR family  26.7 
 
 		 236 aa  54.3  0.000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1416  TetR family transcriptional regulator  43.33 
 
 		 197 aa  54.7  0.000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.305494  hitchhiker  0.0000141576 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3815  regulatory protein, TetR  28.16 
 
 		 252 aa  54.7  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00651597  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4501  putative transcriptional regulator, TetR family  28.48 
 
 		 198 aa  54.7  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.749355 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0170  TetR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 192 aa  54.7  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.652591  normal  0.659974 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0268  transcriptional regulator, TetR family  25.75 
 
 		 198 aa  54.3  0.000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2443  multidrug efflux pump repressor protein BpeR  33.61 
 
 		 211 aa  53.5  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3944  putative transcriptional regulator, TetR family  32.46 
 
 		 183 aa  53.9  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.000137534  hitchhiker  0.00939559 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0857  multidrug efflux pump repressor protein BpeR  33.61 
 
 		 211 aa  53.5  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0314  TetR family transcriptional regulator  33.61 
 
 		 211 aa  53.5  0.000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2426  TetR family transcriptional regulator  41.79 
 
 		 205 aa  53.9  0.000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1017  repressor protein  33.61 
 
 		 211 aa  53.5  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0852  multidrug efflux pump repressor protein BpeR  33.61 
 
 		 211 aa  53.5  0.000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2349  TetR family transcriptional regulator  39.68 
 
 		 357 aa  53.9  0.000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00426882  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3546  transcriptional regulator, TetR family  36.62 
 
 		 206 aa  53.5  0.000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.726096  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16730  transcriptional regulator, TetR family  25.44 
 
 		 213 aa  53.5  0.000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0057  multidrug efflux pump repressor protein BpeR  33.61 
 
 		 211 aa  53.5  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0679  TetR family transcriptional regulator  33.61 
 
 		 211 aa  53.5  0.000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3412  TetR family transcriptional regulator  24.38 
 
 		 206 aa  53.9  0.000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.430092  normal  0.661157 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3722  TetR family transcriptional regulator  29.27 
 
 		 202 aa  53.5  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.869277  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1775  transcriptional regulator, TetR family  25.9 
 
 		 207 aa  53.5  0.000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0265  TetR family transcriptional regulator  32.5 
 
 		 194 aa  53.9  0.000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.250901  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2109  TetR family transcriptional regulator  26.79 
 
 		 206 aa  53.5  0.000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.901149 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2765  regulatory protein, TetR  40.32 
 
 		 210 aa  53.9  0.000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.267077  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3795  TetR family transcriptional regulator  29.27 
 
 		 202 aa  53.5  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.796114  normal  0.124585 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3745  transcriptional regulator, TetR family  31.03 
 
 		 201 aa  53.5  0.000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0609  multidrug efflux pump repressor protein BpeR  33.61 
 
 		 211 aa  53.5  0.000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.780096  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3324  transcriptional regulator, TetR family  29.11 
 
 		 185 aa  53.1  0.000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3991  regulatory protein TetR  29.86 
 
 		 197 aa  53.1  0.000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4061  TetR family transcriptional regulator  28.27 
 
 		 240 aa  53.1  0.000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3721  transcriptional regulator, TetR family  29.45 
 
 		 260 aa  53.1  0.000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.249433  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13590  TetR family transcriptional regulator  32.95 
 
 		 200 aa  53.1  0.000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.332381  normal  0.0844747 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>