More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_3407 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_3407  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 422 aa  843    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.282297 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4414  transcriptional regulator, TetR family  89.95 
 
 		 419 aa  711    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.617294  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4581  TetR family transcriptional regulator  47.02 
 
 		 453 aa  363  4e-99  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0520678  hitchhiker  0.00576912 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0810  TetR family transcriptional regulator  49.14 
 
 		 437 aa  349  4e-95  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4955  TetR family transcriptional regulator  41.94 
 
 		 424 aa  308  1.0000000000000001e-82  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.868884 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2659  TetR family transcriptional regulator  42.89 
 
 		 418 aa  305  1.0000000000000001e-81  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1610  TetR family transcriptional regulator  41.78 
 
 		 424 aa  275  8e-73  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3068  TetR family transcriptional regulator  31.69 
 
 		 214 aa  73.6  0.000000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.493248  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4061  TetR family transcriptional regulator  27.59 
 
 		 240 aa  71.2  0.00000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0370  TetR family transcriptional regulator  32.64 
 
 		 223 aa  71.2  0.00000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0234884  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3449  TetR family transcriptional regulator  26.47 
 
 		 209 aa  67.4  0.0000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.772262  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4066  transcriptional regulator, TetR family  29.57 
 
 		 211 aa  65.9  0.000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3721  transcriptional regulator, TetR family  25.73 
 
 		 260 aa  65.5  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.249433  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4079  TetR family transcriptional regulator  26.09 
 
 		 244 aa  64.3  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.780842  normal  0.246764 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0153  TetR family transcriptional regulator  26.02 
 
 		 210 aa  62.4  0.00000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1739  tetracycline transcriptional regulator YcdC domain-containing protein  40.57 
 
 		 213 aa  62  0.00000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26580  transcriptional regulator, TetR family  28.79 
 
 		 205 aa  61.6  0.00000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0994293 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2058  transcriptional regulator, TetR family  39.62 
 
 		 213 aa  60.8  0.00000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.00904468  normal  0.0313266 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1074  transcriptional regulator, TetR family  39.81 
 
 		 213 aa  60.5  0.00000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.739181  hitchhiker  0.00943768 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0306  TetR family transcriptional regulator  41.57 
 
 		 219 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0641939  normal  0.172302 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0571  TetR family transcriptional regulator  29.38 
 
 		 219 aa  58.9  0.0000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.22949  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3836  TetR family transcriptional regulator  26.06 
 
 		 246 aa  57.8  0.0000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.487675  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1380  transcriptional regulator, TetR family  26.73 
 
 		 214 aa  58.2  0.0000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000685689  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1666  transcriptional regulator, TetR family  26.67 
 
 		 209 aa  57.4  0.0000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.40268  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0033  TetR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 256 aa  57.4  0.0000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3950  TetR family transcriptional regulator  28.87 
 
 		 212 aa  57.4  0.0000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.390353  normal  0.629082 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16730  transcriptional regulator, TetR family  29.24 
 
 		 213 aa  56.6  0.0000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0445  transcriptional regulator, TetR family  32.56 
 
 		 209 aa  57  0.0000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.740524  decreased coverage  0.00376288 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4073  TetR family transcriptional regulator  25.43 
 
 		 223 aa  56.6  0.0000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2836  transcriptional regulator, TetR family  36.54 
 
 		 207 aa  56.2  0.000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00562159  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6181  transcriptional regulator, TetR family  29.09 
 
 		 202 aa  55.1  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.685616  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1261  TetR family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 214 aa  55.1  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.100849  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0949  transcriptional regulator, TetR family  34.52 
 
 		 286 aa  55.8  0.000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2811  putative DNA-binding transcriptional regulator  43.28 
 
 		 236 aa  55.8  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2899  putative DNA-binding transcriptional regulator  43.28 
 
 		 236 aa  55.8  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0760  TetR family transcriptional regulator  30.23 
 
 		 192 aa  54.7  0.000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0913287  normal  0.16222 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3815  regulatory protein, TetR  26.26 
 
 		 252 aa  55.1  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00651597  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00759  transcriptional regulator, TetR family protein  27.55 
 
 		 224 aa  54.7  0.000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1538  TetR family transcriptional regulator  24.62 
 
 		 394 aa  54.3  0.000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.112139  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1240  transcriptional regulator, TetR family  28.14 
 
 		 211 aa  54.3  0.000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.567777  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1561  TetR family transcriptional regulator  24.62 
 
 		 394 aa  54.3  0.000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.447454  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2997  transcriptional regulator, TetR family  29.9 
 
 		 213 aa  54.3  0.000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47520  putative transcriptional regulator  36.36 
 
 		 197 aa  53.9  0.000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2109  TetR family transcriptional regulator  25.7 
 
 		 206 aa  53.9  0.000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.901149 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3604  TetR family transcriptional regulator  27.65 
 
 		 207 aa  54.3  0.000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.461648 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0992  putative transcriptional regulator of paa operon  29.38 
 
 		 208 aa  53.9  0.000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.332152  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1934  TetR family transcriptional regulator  26.09 
 
 		 202 aa  53.9  0.000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0322407  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1824  TetR family transcriptional regulator  33.98 
 
 		 224 aa  53.1  0.000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.87921  normal  0.175095 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0441  TetR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 198 aa  53.5  0.000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.805705 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3457  TetR family transcriptional regulator  34.02 
 
 		 238 aa  53.5  0.000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0807  TetR family transcriptional regulator  27.08 
 
 		 211 aa  53.1  0.000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.271007  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1509  TetR family transcriptional regulator  24.62 
 
 		 394 aa  53.1  0.000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.27867  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0557  TetR family transcriptional regulator  25.27 
 
 		 297 aa  52.8  0.00001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3212  TetR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 211 aa  52.8  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1011  TetR family transcriptional regulator  28.65 
 
 		 770 aa  52.8  0.00001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2041  TetR family transcriptional regulator  30.1 
 
 		 211 aa  52.8  0.00001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2695  transcriptional regulator, TetR family  27.96 
 
 		 226 aa  52.4  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0811  transcriptional regulator, TetR family  27.84 
 
 		 193 aa  52  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0177  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 208 aa  51.6  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.775643 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2737  TetR family transcriptional regulator  30.25 
 
 		 220 aa  51.6  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1459  TetR family transcriptional regulator  38.14 
 
 		 203 aa  52.4  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.540117  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3049  transcriptional regulator, TetR family  27.75 
 
 		 214 aa  52.4  0.00002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4221  TetR family transcriptional regulator  26.38 
 
 		 206 aa  51.6  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.360052  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26800  transcriptional regulator  31.03 
 
 		 184 aa  51.6  0.00002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.463482  normal  0.288316 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2442  transcriptional regulator, TetR family  37.63 
 
 		 218 aa  52  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.510523  normal  0.120027 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7768  putative transcriptional regulator, TetR family  29.75 
 
 		 194 aa  51.2  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3172  TetR family transcriptional regulator  30.1 
 
 		 216 aa  51.2  0.00003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.547125 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0371  TetR family transcriptional regulator  32.95 
 
 		 227 aa  51.2  0.00003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4897  TetR family transcriptional regulator  36.59 
 
 		 231 aa  50.8  0.00004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.043246  normal  0.757086 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4218  TetR family transcriptional regulator  24.39 
 
 		 202 aa  51.2  0.00004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.135159  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3500  transcriptional regulator, TetR family  48.08 
 
 		 209 aa  51.2  0.00004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00016281 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2696  TetR family transcriptional regulator  27.06 
 
 		 196 aa  51.2  0.00004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.834085 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2347  TetR family transcriptional regulator  28.99 
 
 		 194 aa  50.8  0.00005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.462347  normal  0.0620265 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3528  TetR family transcriptional regulator  30.1 
 
 		 216 aa  50.4  0.00005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1461  TetR family transcriptional regulator  27.88 
 
 		 197 aa  50.4  0.00005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.0279876 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4304  TetR family transcriptional regulator  25.52 
 
 		 202 aa  50.4  0.00005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.148025  normal  0.676238 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38090  TetR-family transcriptional regulatory protein  33.62 
 
 		 221 aa  50.8  0.00005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0395776  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2798  TetR family transcriptional regulator  38.16 
 
 		 251 aa  50.8  0.00005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.358212  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2710  TetR family transcriptional regulator  29.34 
 
 		 231 aa  50.4  0.00006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.324102  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2747  TetR family transcriptional regulator  23.7 
 
 		 233 aa  50.4  0.00006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.02505  normal  0.237475 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2602  transcriptional regulator, TetR family  27.42 
 
 		 214 aa  50.4  0.00006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.157273  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0170  TetR family transcriptional regulator  31.11 
 
 		 192 aa  50.4  0.00006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.652591  normal  0.659974 
 
 
-
 
NC_004310  BR0280  TetR family transcriptional regulator  28.16 
 
 		 227 aa  50.1  0.00007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.980178  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0294  TetR family transcriptional regulator  28.16 
 
 		 227 aa  50.1  0.00007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.136884  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4863  transcriptional regulator, TetR family  36.36 
 
 		 209 aa  50.1  0.00007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0556  TetR family transcriptional regulator  30.41 
 
 		 228 aa  50.1  0.00007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0557  regulatory protein TetR  37.93 
 
 		 251 aa  50.1  0.00007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4015  TetR family transcriptional regulator  42.03 
 
 		 239 aa  50.1  0.00008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.345828  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0064  TetR family transcriptional regulator  30.46 
 
 		 210 aa  50.1  0.00008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2392  TetR family transcriptional regulator  25.85 
 
 		 198 aa  50.1  0.00008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0101662  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1603  transcriptional regulator, TetR family  29.51 
 
 		 189 aa  50.1  0.00008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0115969  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1281  TetR family transcriptional regulator  33.91 
 
 		 210 aa  49.7  0.00009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.781108  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2402  TetR family transcriptional regulator  28.84 
 
 		 205 aa  49.7  0.00009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.584484 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5186  transcriptional regulator, TetR family  30.2 
 
 		 185 aa  49.3  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.225373  normal  0.188797 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0828  transcriptional regulator, TetR family  25.38 
 
 		 195 aa  49.3  0.0001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0140  TetR family transcriptional regulator  32.73 
 
 		 176 aa  49.3  0.0001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2165  transcriptional regulator, TetR family  34.69 
 
 		 263 aa  49.3  0.0001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1922  transcriptional regulator, TetR family  37.93 
 
 		 201 aa  49.7  0.0001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1909  transcriptional regulator, TetR family  29.32 
 
 		 209 aa  49.3  0.0001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0574085  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2829  transcriptional regulator BetI  33.75 
 
 		 198 aa  48.5  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>