More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_1520 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



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Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_1520  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 208 aa  424  1e-118  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.431113 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1801  transcriptional regulator, TetR family  89.86 
 
 		 207 aa  379  1e-104  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0882167  normal  0.119004 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1522  regulatory protein TetR  89.86 
 
 		 207 aa  379  1e-104  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.855326  normal  0.485337 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1780  transcriptional regulator, TetR family  67.53 
 
 		 200 aa  253  1.0000000000000001e-66  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5473  TetR family transcriptional regulator  64.8 
 
 		 201 aa  248  7e-65  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.968436  normal  0.0284284 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1755  TetR family transcriptional regulator  61.19 
 
 		 209 aa  210  2e-53  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4377  transcriptional regulator, TetR family  45.54 
 
 		 205 aa  179  2.9999999999999997e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.314155  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2750  TetR family transcriptional regulator  44.85 
 
 		 205 aa  173  9.999999999999999e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.172363  normal  0.153941 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2216  TetR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 203 aa  164  5.9999999999999996e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0817319 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4900  transcriptional regulator, TetR family  44.85 
 
 		 204 aa  160  2e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.909356  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4220  TetR family transcriptional regulator  42.35 
 
 		 204 aa  156  2e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.267151 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4072  TetR family transcriptional regulator  43.65 
 
 		 204 aa  156  2e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.404237  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1358  TetR family transcriptional regulator  45.21 
 
 		 211 aa  156  3e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.824963  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1083  TetR family transcriptional regulator  42.35 
 
 		 203 aa  153  2e-36  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.243709  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0096  transcriptional regulator, TetR family  44.2 
 
 		 196 aa  152  4e-36  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3745  transcriptional regulator, TetR family  39.46 
 
 		 201 aa  139  3e-32  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3772  TetR family transcriptional regulator  37.43 
 
 		 201 aa  121  8e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.392718  normal  0.705056 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3759  transcriptional regulator, TetR family  38.89 
 
 		 202 aa  118  6e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.341264  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3471  transcriptional regulator, TetR family  36.87 
 
 		 202 aa  117  7.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2825  TetR family transcriptional regulator  36.65 
 
 		 204 aa  114  1.0000000000000001e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0304388 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2192  regulatory protein, TetR  30.05 
 
 		 204 aa  92.8  3e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0820152  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1464  TetR family transcriptional regulator  32.54 
 
 		 210 aa  91.7  7e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.856721  normal  0.959808 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3207  putative transcription regulator protein  33.73 
 
 		 204 aa  91.3  9e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00713158  normal  0.0476395 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3548  TetR family transcriptional regulator  32.32 
 
 		 207 aa  90.9  1e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.842454  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2560  transcriptional regulator, TetR family  36.36 
 
 		 196 aa  91.3  1e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.199189  normal  0.158626 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1000  transcriptional regulator, TetR family  28.34 
 
 		 202 aa  91.3  1e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3444  TetR family transcriptional regulator  32.53 
 
 		 205 aa  89.4  3e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.349562  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3141  TetR family transcriptional regulator  30.99 
 
 		 204 aa  89.4  3e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2481  TetR family transcriptional regulator  27.81 
 
 		 206 aa  87.4  2e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.685434 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1297  TetR family transcriptional regulator  28.88 
 
 		 205 aa  87.4  2e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.843552  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6140  TetR family transcriptional regulator  28.88 
 
 		 205 aa  87.4  2e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.943652 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6533  TetR family transcriptional regulator  28.88 
 
 		 205 aa  87.4  2e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1344  TetR family transcriptional regulator  30.54 
 
 		 208 aa  85.5  5e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000662672 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6030  transcriptional regulator TetR family  29.71 
 
 		 222 aa  85.1  7e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0822  transcriptional regulator, TetR family  30.49 
 
 		 205 aa  85.1  7e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.752802  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6291  TetR family transcriptional regulator  31.1 
 
 		 205 aa  84.7  9e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.170422  normal  0.0225355 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2679  transcriptional regulator, TetR family  32.48 
 
 		 204 aa  84.3  0.000000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3319  transcriptional regulator, TetR family  31.71 
 
 		 205 aa  83.2  0.000000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6577  TetR family transcriptional regulator  31.1 
 
 		 205 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46570  putative transcriptional regulator  29.94 
 
 		 205 aa  83.6  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000161907  hitchhiker  0.00000116969 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1558  transcriptional regulator, TetR family  30.26 
 
 		 204 aa  82.8  0.000000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.231141  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5641  regulatory protein, TetR  31.79 
 
 		 205 aa  82.4  0.000000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5361  transcriptional regulator, TetR family  31.9 
 
 		 205 aa  82.4  0.000000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.296046  n/a   
 
 
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NC_009436  Ent638_1872  TetR family transcriptional regulator  31.36 
 
 		 204 aa  81.6  0.000000000000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.598992  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3300  TetR family transcriptional regulator  28.72 
 
 		 204 aa  80.9  0.00000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.161696 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5655  TetR family transcriptional regulator  33.1 
 
 		 205 aa  80.9  0.00000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0301112  normal  0.0166104 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6237  transcriptional regulator, TetR family  28.88 
 
 		 204 aa  80.5  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.250294  normal  0.446462 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0939  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 205 aa  80.1  0.00000000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5351  TetR family transcriptional regulator  32.53 
 
 		 195 aa  79.3  0.00000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0124857 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3603  TetR family transcriptional regulator  30.86 
 
 		 205 aa  79.3  0.00000000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.162578  normal  0.242533 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2425  TetR family transcriptional regulator  27.66 
 
 		 204 aa  78.2  0.00000000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.520855  normal  0.599881 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3444  transcriptional regulator, TetR family  30.36 
 
 		 200 aa  77.4  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.700957 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1507  TetR family transcriptional regulator  31.38 
 
 		 224 aa  76.6  0.0000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0289697  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3154  transcriptional regulator, TetR family  29.59 
 
 		 200 aa  73.6  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0918  TetR family transcriptional regulator  30.63 
 
 		 191 aa  69.7  0.00000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.141078 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5814  transcriptional regulator, TetR family  29.45 
 
 		 195 aa  68.6  0.00000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5104  TetR family transcriptional regulator  28.87 
 
 		 205 aa  67.8  0.0000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1588  transcriptional regulator, TetR family  29.27 
 
 		 243 aa  67  0.0000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.556176  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1924  transcriptional regulator, TetR family  29.88 
 
 		 243 aa  67  0.0000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.436993 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1642  regulatory protein TetR  29.88 
 
 		 243 aa  67  0.0000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.906249  normal  0.298485 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0513  transcriptional regulator, TetR family  26.99 
 
 		 193 aa  65.1  0.0000000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.826847 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2304  TetR family transcriptional regulator  25.64 
 
 		 211 aa  64.7  0.000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.373552  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2479  TetR family transcriptional regulator  25.64 
 
 		 211 aa  64.7  0.000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.660065  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1420  hypothetical protein  53.23 
 
 		 101 aa  64.7  0.000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.57852  normal  0.215319 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2226  TetR family transcriptional regulator  25.64 
 
 		 211 aa  63.5  0.000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0397604  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2575  transcriptional regulator, TetR family  26.28 
 
 		 211 aa  62.8  0.000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000582548  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2324  transcriptional regulator, TetR family  29.45 
 
 		 195 aa  61.6  0.000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1380  transcriptional regulator, TetR family  24.86 
 
 		 214 aa  61.6  0.000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000685689  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2272  TetR family transcriptional regulator  25.64 
 
 		 211 aa  61.2  0.00000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000566042  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2500  transcriptional regulator, TetR family  25.64 
 
 		 211 aa  61.2  0.00000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1122  transcriptional regulator, TetR family  32.1 
 
 		 242 aa  60.5  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0273535  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0626  TetR family transcriptional regulator  28.03 
 
 		 199 aa  60.5  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2067  TetR family transcriptional regulator  26.63 
 
 		 216 aa  59.3  0.00000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3750  TetR family transcriptional regulator  28.09 
 
 		 230 aa  59.3  0.00000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2609  TetR family transcriptional regulator  27.38 
 
 		 194 aa  58.5  0.00000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000163063  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3170  transcriptional regulator, TetR family  25.5 
 
 		 216 aa  57.8  0.0000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2434  transcriptional regulator, TetR family  24.52 
 
 		 211 aa  57  0.0000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2160  TetR family transcriptional regulator  33.12 
 
 		 242 aa  56.6  0.0000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.308493 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2510  TetR family transcriptional regulator  24.36 
 
 		 209 aa  55.8  0.0000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00262483  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1590  TetR family transcriptional regulator  26.63 
 
 		 192 aa  55.8  0.0000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2285  TetR family transcriptional regulator  24.36 
 
 		 211 aa  56.2  0.0000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0118465  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0429  TetR family transcriptional regulator  38.03 
 
 		 213 aa  55.5  0.0000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0148562 
 
 
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NC_011894  Mnod_1665  transcriptional regulator, TetR family  38.37 
 
 		 223 aa  55.5  0.0000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.117381  n/a   
 
 
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NC_007103  pE33L466_0067  TetR family transcriptional regulator  23.32 
 
 		 212 aa  55.1  0.0000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000826521  n/a   
 
 
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NC_013132  Cpin_0612  transcriptional regulator, TetR family  27.08 
 
 		 204 aa  55.1  0.0000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0312  TetR family transcriptional regulator  26.4 
 
 		 182 aa  53.5  0.000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011989  Avi_0659  transcriptional regulator TetR family  39.13 
 
 		 196 aa  53.9  0.000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010725  Mpop_0464  transcriptional regulator, TetR family  36.11 
 
 		 211 aa  53.1  0.000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.128175  normal  1 
 
 
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NC_010571  Oter_0915  TetR family transcriptional regulator  24.75 
 
 		 213 aa  52.8  0.000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009802  CCC13826_1641  transcriptional regulator, TetR family protein  35.8 
 
 		 145 aa  52  0.000006  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.216203  n/a   
 
 
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NC_007953  Bxe_C0306  TetR family transcriptional regulator  25.45 
 
 		 219 aa  52  0.000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0641939  normal  0.172302 
 
 
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NC_013595  Sros_9308  putative transcriptional regulator, TetR family  36 
 
 		 231 aa  51.6  0.000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0733541  normal  1 
 
 
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NC_011832  Mpal_1103  transcriptional regulator, TetR family  21.51 
 
 		 248 aa  51.6  0.000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.575371  normal  0.523139 
 
 
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NC_008009  Acid345_3574  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 187 aa  52  0.000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.383795  normal  1 
 
 
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NC_008146  Mmcs_3223  TetR family transcriptional regulator  39.78 
 
 		 228 aa  52  0.000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009077  Mjls_3234  TetR family transcriptional regulator  39.78 
 
 		 228 aa  52  0.000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.20483  normal  1 
 
 
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NC_008705  Mkms_3285  TetR family transcriptional regulator  39.78 
 
 		 228 aa  52  0.000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.678887  normal  1 
 
 
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NC_009921  Franean1_1636  TetR family transcriptional regulator  31.48 
 
 		 226 aa  51.6  0.000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.232227 
 
 
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NC_013501  Rmar_1776  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 218 aa  50.8  0.00001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0293549  n/a   
 
 
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NC_011661  Dtur_0355  transcriptional regulator, TetR family  32.14 
 
 		 195 aa  50.8  0.00001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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