247 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_1464 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010581  Bind_1464  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 210 aa  422  1e-117  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.856721  normal  0.959808 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0513  transcriptional regulator, TetR family  58.12 
 
 		 193 aa  222  4e-57  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.826847 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5351  TetR family transcriptional regulator  51.32 
 
 		 195 aa  198  3.9999999999999996e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0124857 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2560  transcriptional regulator, TetR family  51.3 
 
 		 196 aa  186  2e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.199189  normal  0.158626 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5814  transcriptional regulator, TetR family  48.94 
 
 		 195 aa  170  1e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2609  TetR family transcriptional regulator  43.81 
 
 		 194 aa  168  7e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000163063  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2324  transcriptional regulator, TetR family  42.41 
 
 		 195 aa  130  2.0000000000000002e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3517  trancscriptional regulator MtrR, putative  28.88 
 
 		 197 aa  109  3e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.178393  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1522  regulatory protein TetR  33.9 
 
 		 207 aa  98.2  8e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.855326  normal  0.485337 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1801  transcriptional regulator, TetR family  33.9 
 
 		 207 aa  98.2  8e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0882167  normal  0.119004 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3603  TetR family transcriptional regulator  34.16 
 
 		 205 aa  92  6e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.162578  normal  0.242533 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1520  transcriptional regulator, TetR family  32.54 
 
 		 208 aa  91.7  8e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.431113 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0918  TetR family transcriptional regulator  33.69 
 
 		 191 aa  90.1  2e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.141078 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4377  transcriptional regulator, TetR family  31.18 
 
 		 205 aa  87  2e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.314155  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5473  TetR family transcriptional regulator  30.91 
 
 		 201 aa  86.7  3e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.968436  normal  0.0284284 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1642  regulatory protein TetR  31.91 
 
 		 243 aa  84.3  0.000000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.906249  normal  0.298485 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1780  transcriptional regulator, TetR family  30.57 
 
 		 200 aa  84.7  0.000000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1588  transcriptional regulator, TetR family  31.91 
 
 		 243 aa  84.3  0.000000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.556176  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1924  transcriptional regulator, TetR family  31.91 
 
 		 243 aa  84.3  0.000000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.436993 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2750  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 205 aa  82.4  0.000000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.172363  normal  0.153941 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1507  TetR family transcriptional regulator  28.92 
 
 		 224 aa  82  0.000000000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0289697  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2216  TetR family transcriptional regulator  27.6 
 
 		 203 aa  79.3  0.00000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0817319 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0096  transcriptional regulator, TetR family  29.3 
 
 		 196 aa  77  0.0000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2825  TetR family transcriptional regulator  26.88 
 
 		 204 aa  76.3  0.0000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0304388 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4900  transcriptional regulator, TetR family  29.49 
 
 		 204 aa  73.9  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.909356  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1344  TetR family transcriptional regulator  28.43 
 
 		 208 aa  73.9  0.000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000662672 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4072  TetR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 204 aa  71.2  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.404237  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3471  transcriptional regulator, TetR family  28.02 
 
 		 202 aa  71.2  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1358  TetR family transcriptional regulator  28.03 
 
 		 211 aa  70.5  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.824963  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2160  TetR family transcriptional regulator  35.9 
 
 		 242 aa  70.5  0.00000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.308493 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3772  TetR family transcriptional regulator  31.41 
 
 		 201 aa  70.1  0.00000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.392718  normal  0.705056 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4220  TetR family transcriptional regulator  28.85 
 
 		 204 aa  69.3  0.00000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.267151 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5655  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 205 aa  68.6  0.00000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0301112  normal  0.0166104 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3759  transcriptional regulator, TetR family  29.34 
 
 		 202 aa  68.2  0.00000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.341264  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3745  transcriptional regulator, TetR family  30.86 
 
 		 201 aa  67.8  0.0000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1122  transcriptional regulator, TetR family  34.78 
 
 		 242 aa  67  0.0000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0273535  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0045  transcriptional regulator  23.16 
 
 		 181 aa  65.5  0.0000000005  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0375278  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6030  transcriptional regulator TetR family  26.88 
 
 		 222 aa  63.5  0.000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1083  TetR family transcriptional regulator  30.19 
 
 		 203 aa  60.8  0.00000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.243709  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1755  TetR family transcriptional regulator  31.36 
 
 		 209 aa  60.5  0.00000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0144  TetR family transcriptional regulator  24.74 
 
 		 181 aa  60.8  0.00000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0822  transcriptional regulator, TetR family  28.12 
 
 		 205 aa  59.7  0.00000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.752802  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1788  TetR family transcriptional regulator  23.65 
 
 		 195 aa  59.3  0.00000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000202922  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1927  TetR family transcriptional regulator  23.65 
 
 		 195 aa  59.3  0.00000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00399738  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1963  transcriptional regulator, TetR family  23.27 
 
 		 201 aa  58.5  0.00000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000168283 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6365  putative transcriptional regulator, TetR family  32.16 
 
 		 210 aa  58.2  0.00000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.277737  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3548  TetR family transcriptional regulator  27.14 
 
 		 207 aa  58.5  0.00000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.842454  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3444  TetR family transcriptional regulator  25.71 
 
 		 205 aa  57.8  0.0000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.349562  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3319  transcriptional regulator, TetR family  25.14 
 
 		 205 aa  57.8  0.0000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3207  putative transcription regulator protein  25.71 
 
 		 204 aa  56.6  0.0000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00713158  normal  0.0476395 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4342  regulatory protein TetR  36.8 
 
 		 186 aa  57  0.0000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.525641  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4711  transcriptional regulator, TetR family  36.8 
 
 		 186 aa  57.4  0.0000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.492793  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4859  transcriptional regulator, TetR family  38.26 
 
 		 186 aa  56.6  0.0000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.205859 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0939  TetR family transcriptional regulator  26.43 
 
 		 205 aa  57.4  0.0000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3444  transcriptional regulator, TetR family  27.27 
 
 		 200 aa  56.2  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.700957 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0359  TetR family transcriptional regulator  27.84 
 
 		 193 aa  56.2  0.0000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.717722  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3154  transcriptional regulator, TetR family  25.77 
 
 		 200 aa  55.8  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1297  TetR family transcriptional regulator  28.37 
 
 		 205 aa  54.7  0.000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.843552  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6140  TetR family transcriptional regulator  28.37 
 
 		 205 aa  54.7  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.943652 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6533  TetR family transcriptional regulator  28.37 
 
 		 205 aa  54.7  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6291  TetR family transcriptional regulator  27.46 
 
 		 205 aa  53.1  0.000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.170422  normal  0.0225355 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0707  TetR family transcriptional regulator  29.45 
 
 		 219 aa  52.8  0.000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5361  transcriptional regulator, TetR family  26.24 
 
 		 205 aa  52.4  0.000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.296046  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1984  TetR family transcriptional regulator  25.93 
 
 		 196 aa  52.4  0.000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6577  TetR family transcriptional regulator  27.46 
 
 		 205 aa  52.4  0.000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7205  transcriptional regulator, TetR family  25.41 
 
 		 188 aa  51.6  0.000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.61042  normal  0.776649 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0090  transcriptional regulator, TetR family  34.09 
 
 		 216 aa  51.6  0.000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3259  transcriptional regulator, TetR family  30.71 
 
 		 219 aa  51.6  0.000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.147915  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46570  putative transcriptional regulator  25.61 
 
 		 205 aa  50.8  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000161907  hitchhiker  0.00000116969 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0199  transcriptional regulator, TetR family  26.94 
 
 		 202 aa  50.4  0.00002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.251087  normal  0.943452 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3905  transcriptional regulator, TetR family  39.47 
 
 		 194 aa  50.1  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3141  TetR family transcriptional regulator  24.29 
 
 		 204 aa  50.1  0.00002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2816  hypothetical protein  32.04 
 
 		 222 aa  49.7  0.00003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0366008  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0578  TetR family transcriptional regulator  42.17 
 
 		 204 aa  50.1  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.209309 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1416  TetR family transcriptional regulator  30.59 
 
 		 197 aa  49.7  0.00003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.305494  hitchhiker  0.0000141576 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0873  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 196 aa  49.7  0.00003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.682179 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0314  TetR family transcriptional regulator  31.29 
 
 		 211 aa  49.3  0.00004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5507  transcriptional regulator, TetR family  30.95 
 
 		 219 aa  49.3  0.00004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1017  repressor protein  31.29 
 
 		 211 aa  49.3  0.00004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0679  TetR family transcriptional regulator  31.29 
 
 		 211 aa  49.3  0.00004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2065  transcriptional regulator, TetR family  25.64 
 
 		 188 aa  49.3  0.00004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.704626  normal  0.605366 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2659  TetR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 418 aa  49.3  0.00004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0675  transcriptional regulator, TetR family  47.27 
 
 		 271 aa  49.3  0.00004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.886772  normal  0.300779 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0609  multidrug efflux pump repressor protein BpeR  31.29 
 
 		 211 aa  49.3  0.00004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.780096  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2443  multidrug efflux pump repressor protein BpeR  31.29 
 
 		 211 aa  49.3  0.00004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0852  multidrug efflux pump repressor protein BpeR  31.29 
 
 		 211 aa  49.3  0.00004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0857  multidrug efflux pump repressor protein BpeR  31.29 
 
 		 211 aa  49.3  0.00004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2679  transcriptional regulator, TetR family  24.19 
 
 		 204 aa  49.3  0.00004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0057  multidrug efflux pump repressor protein BpeR  31.29 
 
 		 211 aa  49.3  0.00004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0477  TetR family transcriptional regulator  27.4 
 
 		 211 aa  49.3  0.00005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.178939  normal  0.0289146 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2481  TetR family transcriptional regulator  25.45 
 
 		 206 aa  48.9  0.00006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.685434 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5132  transcriptional regulator, TetR family  32.32 
 
 		 214 aa  48.5  0.00006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.493019  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1139  TetR family transcriptional regulator  26.35 
 
 		 193 aa  48.5  0.00007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.564798  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5104  TetR family transcriptional regulator  25.26 
 
 		 205 aa  48.5  0.00007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2686  TetR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 181 aa  48.5  0.00007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.39833  hitchhiker  0.00361312 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0612  transcriptional regulator, TetR family  25.83 
 
 		 204 aa  48.5  0.00008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1014  TetR family transcriptional regulator  28.21 
 
 		 212 aa  48.1  0.00009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0806  transcriptional regulator, TetR family  23.68 
 
 		 202 aa  48.1  0.00009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.265645  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2773  TetR family transcriptional regulator  27.89 
 
 		 191 aa  48.1  0.00009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.704113  normal  0.8573 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4327  regulatory protein, TetR  29.07 
 
 		 182 aa  48.1  0.0001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.809003  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>