More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_6291 on replicon NC_010557
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



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PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010557  BamMC406_6291  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 
205 aa  425  1e-118  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.170422  normal  0.0225355 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6577  TetR family transcriptional regulator  99.51 
 
 
205 aa  424  1e-118  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6140  TetR family transcriptional regulator  92.68 
 
 
205 aa  390  1e-108  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.943652 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1297  TetR family transcriptional regulator  92.68 
 
 
205 aa  390  1e-108  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.843552  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6533  TetR family transcriptional regulator  92.68 
 
 
205 aa  390  1e-108  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3548  TetR family transcriptional regulator  86.6 
 
 
207 aa  353  7.999999999999999e-97  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.842454  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3444  TetR family transcriptional regulator  79.38 
 
 
205 aa  324  7e-88  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.349562  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3207  putative transcription regulator protein  78.01 
 
 
204 aa  314  7e-85  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00713158  normal  0.0476395 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0822  transcriptional regulator, TetR family  72.92 
 
 
205 aa  301  6.000000000000001e-81  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.752802  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3319  transcriptional regulator, TetR family  73.71 
 
 
205 aa  299  2e-80  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5361  transcriptional regulator, TetR family  69.76 
 
 
205 aa  299  2e-80  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.296046  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5655  TetR family transcriptional regulator  67.8 
 
 
205 aa  295  3e-79  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0301112  normal  0.0166104 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46570  putative transcriptional regulator  70.98 
 
 
205 aa  292  2e-78  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000161907  hitchhiker  0.00000116969 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0939  TetR family transcriptional regulator  64.88 
 
 
205 aa  273  1.0000000000000001e-72  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2192  regulatory protein, TetR  62.94 
 
 
204 aa  266  1e-70  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0820152  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2425  TetR family transcriptional regulator  62.5 
 
 
204 aa  263  8.999999999999999e-70  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.520855  normal  0.599881 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3300  TetR family transcriptional regulator  61.19 
 
 
204 aa  263  2e-69  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.161696 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2679  transcriptional regulator, TetR family  63.41 
 
 
204 aa  262  2e-69  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2481  TetR family transcriptional regulator  60.98 
 
 
206 aa  261  4.999999999999999e-69  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.685434 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3141  TetR family transcriptional regulator  66.29 
 
 
204 aa  250  8.000000000000001e-66  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1558  transcriptional regulator, TetR family  65.46 
 
 
204 aa  246  1e-64  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.231141  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1872  TetR family transcriptional regulator  65 
 
 
204 aa  244  6e-64  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.598992  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5641  regulatory protein, TetR  65.46 
 
 
205 aa  236  2e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5104  TetR family transcriptional regulator  54.63 
 
 
205 aa  226  1e-58  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1000  transcriptional regulator, TetR family  48.45 
 
 
202 aa  201  7e-51  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6237  transcriptional regulator, TetR family  43.59 
 
 
204 aa  181  6e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.250294  normal  0.446462 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1358  TetR family transcriptional regulator  29.63 
 
 
211 aa  96.7  2e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.824963  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2825  TetR family transcriptional regulator  29.41 
 
 
204 aa  94  1e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0304388 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1083  TetR family transcriptional regulator  29.1 
 
 
203 aa  92.4  4e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.243709  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4220  TetR family transcriptional regulator  28.19 
 
 
204 aa  89.4  4e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.267151 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5473  TetR family transcriptional regulator  31.1 
 
 
201 aa  88.2  9e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.968436  normal  0.0284284 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1522  regulatory protein TetR  31.32 
 
 
207 aa  86.7  2e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.855326  normal  0.485337 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4377  transcriptional regulator, TetR family  26.56 
 
 
205 aa  87  2e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.314155  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1801  transcriptional regulator, TetR family  31.32 
 
 
207 aa  86.7  2e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0882167  normal  0.119004 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0096  transcriptional regulator, TetR family  32.61 
 
 
196 aa  85.1  7e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1520  transcriptional regulator, TetR family  31.1 
 
 
208 aa  84.7  8e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.431113 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2750  TetR family transcriptional regulator  26.56 
 
 
205 aa  84  0.000000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.172363  normal  0.153941 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1780  transcriptional regulator, TetR family  29.45 
 
 
200 aa  82.8  0.000000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4072  TetR family transcriptional regulator  28.72 
 
 
204 aa  82.4  0.000000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.404237  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2216  TetR family transcriptional regulator  31.29 
 
 
203 aa  81.3  0.000000000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0817319 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3471  transcriptional regulator, TetR family  31.47 
 
 
202 aa  80.9  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3759  transcriptional regulator, TetR family  30.77 
 
 
202 aa  80.5  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.341264  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4900  transcriptional regulator, TetR family  31.69 
 
 
204 aa  79  0.00000000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.909356  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3745  transcriptional regulator, TetR family  26.09 
 
 
201 aa  76.6  0.0000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3772  TetR family transcriptional regulator  30.2 
 
 
201 aa  73.2  0.000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.392718  normal  0.705056 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1755  TetR family transcriptional regulator  29.38 
 
 
209 aa  66.2  0.0000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1887  TetR family transcriptional regulator  29.41 
 
 
202 aa  64.7  0.0000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.943502 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1588  transcriptional regulator, TetR family  26.29 
 
 
243 aa  62.8  0.000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.556176  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1642  regulatory protein TetR  26.29 
 
 
243 aa  62.8  0.000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.906249  normal  0.298485 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1924  transcriptional regulator, TetR family  26.29 
 
 
243 aa  62.8  0.000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.436993 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3361  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 
238 aa  62  0.000000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.752589  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3603  TetR family transcriptional regulator  31.65 
 
 
205 aa  61.2  0.00000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.162578  normal  0.242533 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2601  regulatory protein, TetR  28.26 
 
 
224 aa  60.5  0.00000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.354794  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0626  TetR family transcriptional regulator  33.11 
 
 
199 aa  59.7  0.00000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2799  TetR family transcriptional regulator  32.43 
 
 
217 aa  56.6  0.0000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.364827  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2636  TetR family transcriptional regulator  38.96 
 
 
205 aa  57  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000132236  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2704  TetR family transcriptional regulator  29.27 
 
 
203 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.187148 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4517  TetR family transcriptional regulator  38.96 
 
 
205 aa  57  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000667757  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1827  regulatory protein, TetR  28.87 
 
 
196 aa  56.6  0.0000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5814  transcriptional regulator, TetR family  26.6 
 
 
195 aa  57  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4711  TetR family transcriptional regulator  30.46 
 
 
228 aa  57  0.0000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.133874 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1122  transcriptional regulator, TetR family  25.37 
 
 
242 aa  56.2  0.0000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0273535  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20320  transcriptional regulator, TetR family  33.87 
 
 
203 aa  56.6  0.0000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2434  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 
211 aa  55.8  0.0000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1290  AcrR family transcriptional regulator  35.37 
 
 
199 aa  55.5  0.0000005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5813  transcriptional regulator, TetR family  26.97 
 
 
243 aa  55.5  0.0000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.393234  hitchhiker  0.00386056 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0918  TetR family transcriptional regulator  26.25 
 
 
191 aa  55.5  0.0000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.141078 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1419  TetR family transcriptional regulator  39.53 
 
 
220 aa  55.1  0.0000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5318  transcriptional regulator, TetR family  41.54 
 
 
197 aa  55.1  0.0000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0452  regulatory protein TetR  29.45 
 
 
221 aa  54.7  0.0000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1211  transcriptional regulator, TetR family  36.78 
 
 
227 aa  54.3  0.000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2560  transcriptional regulator, TetR family  24.53 
 
 
196 aa  54.3  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.199189  normal  0.158626 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0612  TetR family transcriptional regulator  31.19 
 
 
202 aa  54.3  0.000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.136679  normal  0.487596 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2962  TetR family transcriptional regulator  37.97 
 
 
201 aa  54.3  0.000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3444  transcriptional regulator, TetR family  23.78 
 
 
200 aa  53.9  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.700957 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2236  TetR family transcriptional regulator  31.46 
 
 
211 aa  53.5  0.000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.226682  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2800  TetR family transcriptional regulator  28.28 
 
 
224 aa  53.5  0.000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.697977  decreased coverage  0.000162176 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3625  regulatory protein TetR  44.44 
 
 
191 aa  53.9  0.000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0166  TetR family transcriptional regulator  28.15 
 
 
193 aa  53.5  0.000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.141555  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0513  transcriptional regulator, TetR family  26.42 
 
 
193 aa  53.9  0.000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.826847 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5122  TetR family transcriptional regulator  24.88 
 
 
240 aa  53.9  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.243003  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2272  TetR family transcriptional regulator  25.87 
 
 
211 aa  52.8  0.000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000566042  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2500  transcriptional regulator, TetR family  25.87 
 
 
211 aa  52.8  0.000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1590  TetR family transcriptional regulator  25.58 
 
 
192 aa  53.1  0.000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3126  TetR family transcriptional regulator  25.24 
 
 
248 aa  53.1  0.000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.068587  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1464  TetR family transcriptional regulator  27.46 
 
 
210 aa  53.1  0.000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.856721  normal  0.959808 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5241  TetR family transcriptional regulator  25.24 
 
 
248 aa  53.1  0.000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.927318 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3154  transcriptional regulator, TetR family  23.17 
 
 
200 aa  53.1  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_010511  M446_2160  TetR family transcriptional regulator  24.44 
 
 
242 aa  52.8  0.000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.308493 
 
 
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NC_007333  Tfu_2816  hypothetical protein  40.62 
 
 
222 aa  52.4  0.000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0366008  n/a   
 
 
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NC_009717  Xaut_4925  TetR family transcriptional regulator  30.72 
 
 
228 aa  52.4  0.000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.791426  normal 
 
 
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NC_008391  Bamb_4589  TetR family transcriptional regulator  23.9 
 
 
248 aa  52.8  0.000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.954889 
 
 
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NC_010676  Bphyt_5134  transcriptional regulator, TetR family  28.24 
 
 
197 aa  52.4  0.000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_013159  Svir_33190  transcriptional regulator  24.49 
 
 
202 aa  52.4  0.000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.284512  normal 
 
 
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NC_011658  BCAH187_A2575  transcriptional regulator, TetR family  32.18 
 
 
211 aa  52  0.000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000582548  n/a   
 
 
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NC_010524  Lcho_2402  TetR family transcriptional regulator  31.82 
 
 
205 aa  52.4  0.000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.584484 
 
 
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NC_005945  BAS2304  TetR family transcriptional regulator  32.18 
 
 
211 aa  52  0.000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.373552  n/a   
 
 
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NC_009972  Haur_2609  TetR family transcriptional regulator  23.6 
 
 
194 aa  52  0.000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000163063  n/a   
 
 
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NC_006274  BCZK2226  TetR family transcriptional regulator  32.18 
 
 
211 aa  52  0.000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0397604  n/a   
 
 
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NC_010515  Bcenmc03_5031  TetR family transcriptional regulator  23.9 
 
 
248 aa  52  0.000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
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