289 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_2659 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



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Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008347  Mmar10_2659  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 418 aa  859    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4414  transcriptional regulator, TetR family  44.39 
 
 		 419 aa  320  1.9999999999999998e-86  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.617294  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0810  TetR family transcriptional regulator  41.08 
 
 		 437 aa  290  3e-77  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1610  TetR family transcriptional regulator  42.62 
 
 		 424 aa  285  1.0000000000000001e-75  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3407  TetR family transcriptional regulator  42.89 
 
 		 422 aa  279  8e-74  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.282297 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4581  TetR family transcriptional regulator  35.98 
 
 		 453 aa  234  2.0000000000000002e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0520678  hitchhiker  0.00576912 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4955  TetR family transcriptional regulator  33.81 
 
 		 424 aa  225  9e-58  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.868884 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4061  TetR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 240 aa  74.7  0.000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4073  TetR family transcriptional regulator  30.54 
 
 		 223 aa  72  0.00000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0033  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 256 aa  70.9  0.00000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3836  TetR family transcriptional regulator  27.33 
 
 		 246 aa  70.5  0.00000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.487675  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3449  TetR family transcriptional regulator  27.21 
 
 		 209 aa  68.9  0.0000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.772262  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6295  transcriptional regulator, TetR family  28.67 
 
 		 212 aa  68.6  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.100221  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4066  transcriptional regulator, TetR family  30.99 
 
 		 211 aa  67  0.0000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4079  TetR family transcriptional regulator  27.55 
 
 		 244 aa  65.9  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.780842  normal  0.246764 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0832  transcriptional regulator, TetR family  28.29 
 
 		 211 aa  63.5  0.000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.933061 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3068  TetR family transcriptional regulator  30.63 
 
 		 214 aa  63.2  0.000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.493248  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0370  TetR family transcriptional regulator  30.11 
 
 		 223 aa  62  0.00000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0234884  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3721  transcriptional regulator, TetR family  26.97 
 
 		 260 aa  62  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.249433  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1011  TetR family transcriptional regulator  30.41 
 
 		 770 aa  61.2  0.00000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2747  TetR family transcriptional regulator  29.3 
 
 		 233 aa  60.8  0.00000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.02505  normal  0.237475 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3815  regulatory protein, TetR  28.12 
 
 		 252 aa  59.3  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00651597  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0626  TetR family transcriptional regulator  28 
 
 		 215 aa  58.2  0.0000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1137  transcriptional regulator, TetR family  26.73 
 
 		 209 aa  57.8  0.0000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.13929  normal  0.961099 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0557  TetR family transcriptional regulator  25.45 
 
 		 297 aa  57.4  0.0000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1436  TetR family transcriptional regulator  27.66 
 
 		 197 aa  56.6  0.0000008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26580  transcriptional regulator, TetR family  29.56 
 
 		 205 aa  56.2  0.000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0994293 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0806  transcriptional regulator, TetR family  25.32 
 
 		 202 aa  56.2  0.000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.265645  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1045  transcriptional regulator, TetR family  26.24 
 
 		 222 aa  55.5  0.000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0571  TetR family transcriptional regulator  26.6 
 
 		 219 aa  55.5  0.000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.22949  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0153  TetR family transcriptional regulator  26.92 
 
 		 210 aa  54.7  0.000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0781  transcriptional regulator, TetR family  26.09 
 
 		 197 aa  54.7  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1909  transcriptional regulator, TetR family  28.4 
 
 		 209 aa  54.3  0.000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0574085  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47520  putative transcriptional regulator  55 
 
 		 197 aa  53.5  0.000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2041  TetR family transcriptional regulator  29.9 
 
 		 211 aa  53.1  0.000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2742  TetR family transcriptional regulator  30.28 
 
 		 188 aa  53.1  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.845467  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2692  TetR family transcriptional regulator  30.28 
 
 		 188 aa  53.1  0.00001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0469224  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2671  TetR family transcriptional regulator  30.28 
 
 		 188 aa  53.1  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.083497  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1000  regulatory protein, TetR  32.26 
 
 		 242 aa  52.4  0.00001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.6882 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2710  TetR family transcriptional regulator  31.86 
 
 		 231 aa  53.1  0.00001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.324102  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2951  TetR family transcriptional regulator  30.28 
 
 		 188 aa  53.1  0.00001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3604  TetR family transcriptional regulator  24.66 
 
 		 207 aa  52.8  0.00001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.461648 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2951  transcriptional regulator, TetR family  30.28 
 
 		 188 aa  53.1  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.418779999999999e-31 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4863  transcriptional regulator, TetR family  30.3 
 
 		 209 aa  51.6  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6181  transcriptional regulator, TetR family  26.92 
 
 		 202 aa  52.4  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.685616  normal  1 
 
 
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NC_013739  Cwoe_0870  transcriptional regulator, TetR family  32.98 
 
 		 186 aa  52  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.65823  normal  0.649746 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9073  putative transcriptional regulator, TetR family  35.66 
 
 		 193 aa  52  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2696  TetR family transcriptional regulator  26.42 
 
 		 196 aa  52  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.834085 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2152  transcriptional regulator, TetR family  34.48 
 
 		 185 aa  51.6  0.00002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1158  transcriptional regulator, TetR family  32.26 
 
 		 218 aa  51.6  0.00003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.91676  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5351  TetR family transcriptional regulator  37.35 
 
 		 195 aa  51.2  0.00003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0124857 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16730  transcriptional regulator, TetR family  29.5 
 
 		 213 aa  51.2  0.00003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00759  transcriptional regulator, TetR family protein  30 
 
 		 224 aa  51.6  0.00003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4464  TetR family transcriptional regulator  26.97 
 
 		 204 aa  50.8  0.00004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0680244 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0148  transcriptional regulator  31.07 
 
 		 179 aa  50.8  0.00004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4304  TetR family transcriptional regulator  27.33 
 
 		 202 aa  50.8  0.00004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.148025  normal  0.676238 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7768  putative transcriptional regulator, TetR family  28.3 
 
 		 194 aa  50.4  0.00006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2175  TetR family transcriptional regulator  35.87 
 
 		 214 aa  50.4  0.00006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.595394  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1201  transcription regulator protein  26.26 
 
 		 209 aa  50.1  0.00007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.582864  normal  0.871194 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4222  TetR family transcriptional regulator  27.03 
 
 		 221 aa  50.1  0.00007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.42669  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4288  TetR family transcriptional regulator  27.03 
 
 		 221 aa  50.1  0.00007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.458199  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4600  TetR family transcriptional regulator  27.03 
 
 		 221 aa  50.1  0.00007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0411306  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1603  transcriptional regulator, TetR family  25.15 
 
 		 189 aa  50.1  0.00008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0115969  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3731  TetR family transcriptional regulator  35.87 
 
 		 214 aa  49.7  0.00009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2032  TetR family transcriptional regulator  35.87 
 
 		 214 aa  49.7  0.00009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.874631  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4015  TetR family transcriptional regulator  37.89 
 
 		 239 aa  49.3  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.345828  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2991  TetR family transcriptional regulator  28.87 
 
 		 188 aa  48.9  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0384605  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1464  TetR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 210 aa  49.3  0.0001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.856721  normal  0.959808 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2438  transcriptional regulator, TetR family  21.58 
 
 		 208 aa  48.9  0.0001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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NC_007643  Rru_A1934  TetR family transcriptional regulator  29.08 
 
 		 202 aa  48.9  0.0001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0322407  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1539  TetR family transcriptional regulator  30.11 
 
 		 212 aa  49.3  0.0001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.162694 
 
 
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NC_009511  Swit_4218  TetR family transcriptional regulator  30.12 
 
 		 202 aa  49.7  0.0001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.135159  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2997  transcriptional regulator, TetR family  28.87 
 
 		 188 aa  48.9  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000711023  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2954  transcriptional regulator, TetR family  28.87 
 
 		 188 aa  49.7  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.68265  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3699  TetR family transcriptional regulator  30.61 
 
 		 220 aa  49.3  0.0001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0073  TetR family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 210 aa  49.3  0.0001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0092  transcriptional regulator, TetR family  34.29 
 
 		 210 aa  48.9  0.0001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.367108  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2286  transcriptional regulator, TetR family  28.87 
 
 		 188 aa  48.9  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000280215 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6034  TetR family transcriptional regulator  32.76 
 
 		 223 aa  48.9  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9154  putative transcriptional regulator, TetR family  29.28 
 
 		 226 aa  48.9  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.231214  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4838  transcriptional regulator, TetR family  27.56 
 
 		 217 aa  48.5  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1903  transcriptional regulator, TetR family  28 
 
 		 192 aa  48.5  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0461172  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3570  transcriptional regulator, TetR family  29.13 
 
 		 175 aa  48.9  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00083347  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3621  TetR family transcriptional regulator  31.75 
 
 		 203 aa  48.5  0.0002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.941769  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5796  transcriptional regulator, TetR family  31.48 
 
 		 207 aa  48.1  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0048122 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4432  TetR family transcriptional regulator  34.67 
 
 		 208 aa  48.1  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.21103  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4824  TetR family transcriptional regulator  23.76 
 
 		 228 aa  48.1  0.0003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1216  HTH-type transcriptional regulator RutR  31.4 
 
 		 212 aa  47.8  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.591915 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1775  transcriptional regulator, TetR family  20.86 
 
 		 207 aa  47.8  0.0003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2948  TetR family transcriptional regulator  23.23 
 
 		 191 aa  48.1  0.0003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1081  HTH-type transcriptional regulator RutR  31.4 
 
 		 212 aa  47.4  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4897  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 231 aa  47.8  0.0004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.043246  normal  0.757086 
 
 
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NC_011094  SeSA_A1186  HTH-type transcriptional regulator RutR  31.4 
 
 		 212 aa  47.4  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.151745  normal  1 
 
 
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NC_011366  Rleg2_5717  transcriptional regulator, TetR family  25.77 
 
 		 197 aa  47.8  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.985195 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2922  transcriptional regulator, TetR family  38.89 
 
 		 204 aa  47.8  0.0004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.404278 
 
 
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NC_014212  Mesil_2511  transcriptional regulator, TetR family  35.79 
 
 		 172 aa  47.8  0.0004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008062  Bcen_6341  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 206 aa  47.4  0.0005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0497044  n/a   
 
 
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NC_012793  GWCH70_1844  transcriptional regulator, TetR family  24.52 
 
 		 214 aa  47.4  0.0005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009667  Oant_0349  TetR family transcriptional regulator  31.52 
 
 		 232 aa  47.4  0.0005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013739  Cwoe_2697  transcriptional regulator, TetR family  32.26 
 
 		 195 aa  47.4  0.0005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0366203  normal  0.310239 
 
 
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