More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_4863 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013739  Cwoe_4863  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 209 aa  406  1.0000000000000001e-112  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6450  TetR family transcriptional regulator  31.55 
 
 		 205 aa  83.2  0.000000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.717411  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1203  TetR family transcriptional regulator  35 
 
 		 203 aa  82.8  0.000000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6844  TetR family transcriptional regulator  34.67 
 
 		 203 aa  81.3  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1824  TetR family transcriptional regulator  34.68 
 
 		 224 aa  76.6  0.0000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.87921  normal  0.175095 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6157  TetR family transcriptional regulator  30.05 
 
 		 190 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0999  transcriptional regulator, TetR family  25.5 
 
 		 204 aa  71.6  0.000000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.372995  normal  0.0457994 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1079  TetR family transcriptional regulator  33.82 
 
 		 215 aa  68.9  0.00000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1941  transcriptional regulator, TetR family  26.52 
 
 		 189 aa  66.6  0.0000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.842083  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00759  transcriptional regulator, TetR family protein  29.24 
 
 		 224 aa  66.2  0.0000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3091  TetR family transcriptional regulator  28.27 
 
 		 224 aa  65.5  0.0000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3060  TetR family transcriptional regulator  28.49 
 
 		 203 aa  64.3  0.000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1000  regulatory protein, TetR  29.61 
 
 		 242 aa  64.3  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.6882 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3314  TetR family transcriptional regulator  30.34 
 
 		 214 aa  64.3  0.000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1473  transcriptional regulator, TetR family  32.72 
 
 		 207 aa  63.5  0.000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.245471  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1158  transcriptional regulator, TetR family  29.61 
 
 		 218 aa  63.2  0.000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.91676  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1539  TetR family transcriptional regulator  30.34 
 
 		 212 aa  62.8  0.000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.162694 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1537  TetR family transcriptional regulator  22.66 
 
 		 257 aa  62.4  0.000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1086  transcriptional regulator, TetR family  38.83 
 
 		 239 aa  61.6  0.000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.566372  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6443  transcriptional regulator, TetR family  34.91 
 
 		 202 aa  60.8  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1250  transcriptional regulator RutR  30.29 
 
 		 212 aa  60.8  0.00000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3071  TetR family transcriptional regulator  37.74 
 
 		 210 aa  60.8  0.00000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2629  transcriptional regulator, TetR family  30.29 
 
 		 212 aa  60.1  0.00000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3493  TetR family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 211 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.729173  normal  0.75311 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2305  transcriptional regulator RutR  30.29 
 
 		 212 aa  60.1  0.00000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3833  transcriptional regulator, TetR family  34.06 
 
 		 212 aa  60.5  0.00000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2809  transcriptional regulator, TetR family  23.76 
 
 		 203 aa  60.1  0.00000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.167328  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0727  transcriptional regulator, TetR family  49.28 
 
 		 216 aa  60.5  0.00000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2692  TetR family transcriptional regulator  29.92 
 
 		 195 aa  59.7  0.00000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.728372  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5281  TetR family transcriptional regulator  49.23 
 
 		 257 aa  59.7  0.00000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1768  TetR family transcriptional regulator  38.53 
 
 		 211 aa  60.1  0.00000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.570427  normal  0.275415 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1965  TetR family transcriptional regulator  24.24 
 
 		 210 aa  59.3  0.00000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.885807  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2433  TetR family transcriptional regulator  39.36 
 
 		 211 aa  59.3  0.00000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1131  transcriptional regulator RutR  30.29 
 
 		 212 aa  59.3  0.00000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.33999  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4359  regulatory protein, TetR  33.92 
 
 		 196 aa  59.3  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00193568  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0130  TetR family transcriptional regulator  31.46 
 
 		 212 aa  59.3  0.00000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2582  TetR family transcriptional regulator  29.71 
 
 		 212 aa  58.9  0.00000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.120721 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01016  predicted DNA-binding transcriptional regulator  29.71 
 
 		 212 aa  58.9  0.00000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1128  transcriptional regulator RutR  29.71 
 
 		 212 aa  58.9  0.00000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2767  transcriptional regulator, TetR family  23.27 
 
 		 203 aa  58.9  0.00000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.430405  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4876  transcriptional regulator, TetR family  36.13 
 
 		 209 aa  58.9  0.00000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.217727  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2497  transcriptional regulator, TetR family  34.65 
 
 		 221 aa  58.9  0.00000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000693939 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3259  transcriptional regulator, TetR family  26.57 
 
 		 219 aa  58.9  0.00000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.147915  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3533  TetR family transcriptional regulator  44.58 
 
 		 237 aa  58.5  0.00000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0909277  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0707  TetR family transcriptional regulator  26.57 
 
 		 219 aa  58.5  0.00000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6011  transcriptional regulator, TetR family  24.85 
 
 		 203 aa  58.5  0.00000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2112  transcriptional regulator RutR  29.71 
 
 		 212 aa  58.2  0.00000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3540  TetR family transcriptional regulator  48.53 
 
 		 250 aa  58.2  0.00000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3212  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 223 aa  57.8  0.0000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.59703  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6345  transcriptional regulator, TetR family  31.43 
 
 		 241 aa  57.8  0.0000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3329  transcriptional regulator, TetR family  50.7 
 
 		 217 aa  57.4  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.181798  normal  0.116616 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1848  TetR family transcriptional regulator  34.15 
 
 		 210 aa  57.8  0.0000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2175  TetR family transcriptional regulator  45.16 
 
 		 218 aa  58.2  0.0000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4405  TetR family transcriptional regulator  45.95 
 
 		 259 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.630882  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1265  transcriptional regulator, TetR family  30.83 
 
 		 249 aa  57.4  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0071426 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0167  transcriptional regulator, TetR family  30.41 
 
 		 200 aa  57.8  0.0000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0792  TetR family transcriptional regulator  35.97 
 
 		 212 aa  57.8  0.0000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5804  TetR family transcriptional regulator  50.82 
 
 		 254 aa  57  0.0000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000000100556  hitchhiker  0.000892453 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0908  transcriptional regulator, TetR family  32.86 
 
 		 207 aa  57  0.0000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.469028  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0687  TetR family transcriptional regulator  36.17 
 
 		 261 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.794796  normal  0.223624 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7734  TetR family transcriptional regulator  41.46 
 
 		 217 aa  57  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4215  TetR family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 269 aa  56.6  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.261755 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1074  transcriptional regulator, TetR family  31.61 
 
 		 213 aa  57  0.0000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.739181  hitchhiker  0.00943768 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0743  TetR family transcriptional regulator  44.12 
 
 		 230 aa  57.4  0.0000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.803231 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1623  transcriptional regulator, TetR family  42.86 
 
 		 205 aa  56.6  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5677  regulatory protein  40.3 
 
 		 201 aa  57.4  0.0000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.106455  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5087  TetR family transcriptional regulator  45.95 
 
 		 259 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2423  TetR family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 214 aa  56.6  0.0000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5773  TetR family transcriptional regulator  45.95 
 
 		 259 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.669739 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3421  transcriptional regulator, TetR family  46.77 
 
 		 223 aa  56.6  0.0000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.288907  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1118  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 201 aa  57  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00548751  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4588  transcriptional regulator, TetR family  35.57 
 
 		 206 aa  57  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.112472 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8486  putative transcriptional regulator, TetR family  35.25 
 
 		 201 aa  56.2  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.251281  normal  0.72211 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0412  TetR family transcriptional regulator  32.48 
 
 		 216 aa  56.6  0.0000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.742667  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3744  transcriptional regulator, TetR family  51.02 
 
 		 223 aa  56.6  0.0000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3198  TetR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 215 aa  56.2  0.0000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00193732  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0675  transcriptional regulator, TetR family  37.14 
 
 		 271 aa  56.6  0.0000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.886772  normal  0.300779 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0034  TetR family transcriptional regulator  22.92 
 
 		 189 aa  56.2  0.0000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.345685  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0034  TetR family transcriptional regulator  22.92 
 
 		 189 aa  56.2  0.0000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2292  TetR family transcriptional regulator  44.93 
 
 		 208 aa  56.2  0.0000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0929  TetR family transcriptional regulator  43.21 
 
 		 205 aa  56.2  0.0000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.99421  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0012  putative AcrAB operon repressor transcription regulator protein  40.58 
 
 		 219 aa  56.2  0.0000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.631075  normal  0.0464367 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3984  transcriptional regulator, TetR family  23.71 
 
 		 200 aa  55.8  0.0000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.562971  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2442  transcriptional regulator, TetR family  39.81 
 
 		 218 aa  55.8  0.0000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.510523  normal  0.120027 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9073  putative transcriptional regulator, TetR family  38.16 
 
 		 193 aa  56.2  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2970  putative transcriptional regulator  32.17 
 
 		 196 aa  56.2  0.0000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0889426  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2948  TetR family transcriptional regulator  24.6 
 
 		 191 aa  55.5  0.0000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3161  TetR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 195 aa  55.8  0.0000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000174477  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0683  TetR family transcriptional regulator  25.14 
 
 		 216 aa  55.5  0.0000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000557469  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0947  TetR family transcriptional regulator  27.66 
 
 		 205 aa  55.8  0.0000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0946183  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2436  TetR family transcriptional regulator  32.16 
 
 		 243 aa  55.8  0.0000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.747053 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2515  TetR family transcriptional regulator  37.96 
 
 		 238 aa  55.5  0.0000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.745235  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1045  TetR family transcriptional regulator  32.12 
 
 		 226 aa  55.5  0.0000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.446098  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1428  TetR family transcriptional regulator  26.51 
 
 		 204 aa  55.5  0.0000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.530378  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0402  transcriptional regulator, TetR family  37.14 
 
 		 219 aa  55.5  0.0000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.67084  normal  0.0771341 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1216  HTH-type transcriptional regulator RutR  28.4 
 
 		 212 aa  55.5  0.0000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.591915 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0868  transcriptional regulator, TetR family  30.86 
 
 		 230 aa  55.5  0.0000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.200185 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3183  transcriptional regulator, TetR family  37.84 
 
 		 220 aa  55.5  0.0000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2655  TetR family transcriptional regulator  28.14 
 
 		 226 aa  55.1  0.0000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1558  regulatory protein TetR  30.1 
 
 		 220 aa  55.1  0.0000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>