More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_2922 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



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Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_2922  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 204 aa  412  1e-114  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.404278 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2696  TetR family transcriptional regulator  67.82 
 
 		 196 aa  276  1e-73  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.834085 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7768  putative transcriptional regulator, TetR family  68.82 
 
 		 194 aa  266  1e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2755  TetR family transcriptional regulator  59.69 
 
 		 200 aa  245  3e-64  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16730  transcriptional regulator, TetR family  60.75 
 
 		 213 aa  238  5e-62  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1603  transcriptional regulator, TetR family  62.9 
 
 		 189 aa  238  6.999999999999999e-62  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0115969  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1867  transcriptional regulator, TetR family  40.31 
 
 		 201 aa  147  1.0000000000000001e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.129849  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4378  transcriptional regulator, TetR family  40.58 
 
 		 200 aa  141  6e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.136582 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0117  TetR family transcriptional regulator  31.69 
 
 		 208 aa  107  1e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.966538  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1775  transcriptional regulator, TetR family  28.72 
 
 		 207 aa  102  3e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1804  transcriptional regulator, TetR family  28.26 
 
 		 189 aa  100  1e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2499  transcriptional regulator, TetR family  28.49 
 
 		 208 aa  99.8  3e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0806  transcriptional regulator, TetR family  28.86 
 
 		 202 aa  99.4  4e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.265645  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6295  transcriptional regulator, TetR family  30.53 
 
 		 212 aa  92  5e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.100221  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2723  transcriptional regulator, TetR family  28.86 
 
 		 224 aa  91.7  7e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0252111  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5283  TetR family transcriptional regulator  30.11 
 
 		 208 aa  90.1  2e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.261053 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2065  transcriptional regulator, TetR family  26.37 
 
 		 188 aa  89.7  3e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.704626  normal  0.605366 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4691  TetR family transcriptional regulator  29.08 
 
 		 205 aa  89.4  3e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.771858  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4777  TetR family transcriptional regulator  29.08 
 
 		 205 aa  89.4  3e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.681727  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5076  TetR family transcriptional regulator  29.08 
 
 		 215 aa  89.4  4e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.175697 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4824  TetR family transcriptional regulator  25.53 
 
 		 228 aa  86.7  2e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0832  transcriptional regulator, TetR family  28.32 
 
 		 211 aa  82.8  0.000000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.933061 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0033  TetR family transcriptional regulator  25.36 
 
 		 256 aa  82.4  0.000000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3833  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 204 aa  82.8  0.000000000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2438  transcriptional regulator, TetR family  25 
 
 		 208 aa  82.4  0.000000000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1768  TetR family transcriptional regulator  29.89 
 
 		 211 aa  82  0.000000000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.570427  normal  0.275415 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1471  TetR family transcriptional regulator  24.34 
 
 		 219 aa  81.6  0.000000000000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33190  transcriptional regulator  29.84 
 
 		 202 aa  81.6  0.000000000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.284512  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4066  transcriptional regulator, TetR family  30.27 
 
 		 211 aa  81.6  0.000000000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2799  TetR family transcriptional regulator  30.22 
 
 		 217 aa  81.3  0.000000000000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.364827  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6181  transcriptional regulator, TetR family  30.81 
 
 		 202 aa  79.3  0.00000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.685616  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1844  transcriptional regulator, TetR family  22.53 
 
 		 214 aa  79.7  0.00000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0347  TetR family transcriptional regulator  29.95 
 
 		 200 aa  79.7  0.00000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0154637  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3604  TetR family transcriptional regulator  30.11 
 
 		 207 aa  79.3  0.00000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.461648 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0595  TetR family transcriptional regulator  26.56 
 
 		 204 aa  79.3  0.00000000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1483  TetR family transcriptional regulator  27.59 
 
 		 197 aa  79  0.00000000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4897  TetR family transcriptional regulator  30.48 
 
 		 231 aa  78.2  0.00000000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.043246  normal  0.757086 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0231  transcriptional regulator, TetR family  28.95 
 
 		 200 aa  78.2  0.00000000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.336394 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0913  TetR family transcriptional regulator  24.5 
 
 		 195 aa  77  0.0000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.269174  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1401  TetR family transcriptional regulator  30.39 
 
 		 222 aa  76.6  0.0000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.513329  normal  0.505278 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5488  TetR family transcriptional regulator  27.41 
 
 		 238 aa  75.9  0.0000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3721  transcriptional regulator, TetR family  30.05 
 
 		 260 aa  75.9  0.0000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.249433  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4073  TetR family transcriptional regulator  28.08 
 
 		 223 aa  75.1  0.0000000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1909  transcriptional regulator, TetR family  31.35 
 
 		 209 aa  75.1  0.0000000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0574085  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2765  regulatory protein, TetR  25.98 
 
 		 210 aa  75.1  0.0000000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.267077  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3836  TetR family transcriptional regulator  26.34 
 
 		 246 aa  74.7  0.0000000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.487675  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1858  TetR family transcriptional regulator  28.92 
 
 		 234 aa  74.7  0.0000000000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.543066  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2348  transcriptional regulator, TetR family  25.81 
 
 		 222 aa  74.7  0.0000000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0187157  normal  0.0306872 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2402  TetR family transcriptional regulator  33.65 
 
 		 205 aa  73.9  0.000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.584484 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0306  TetR family transcriptional regulator  22.75 
 
 		 219 aa  74.3  0.000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0641939  normal  0.172302 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1571  TetR family transcriptional regulator  25.74 
 
 		 201 aa  73.6  0.000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.038411 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3548  TetR family transcriptional regulator  28.18 
 
 		 216 aa  73.9  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4464  TetR family transcriptional regulator  26.57 
 
 		 204 aa  72.8  0.000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0680244 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3944  TetR family transcriptional regulator  27.01 
 
 		 215 aa  72.4  0.000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13590  TetR family transcriptional regulator  25.25 
 
 		 200 aa  72.4  0.000000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.332381  normal  0.0844747 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0043  regulatory protein, TetR  30.81 
 
 		 211 aa  72.4  0.000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1823  TetR family transcriptional regulator  27.87 
 
 		 222 aa  72.4  0.000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.331222  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0108  TetR family transcriptional regulator  25.74 
 
 		 219 aa  71.6  0.000000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.244027  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0117  TetR family transcriptional regulator  25.74 
 
 		 219 aa  71.6  0.000000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0523426 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0126  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 224 aa  71.6  0.000000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0098  TetR family transcriptional regulator  25.74 
 
 		 219 aa  71.6  0.000000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.31231  normal  0.349087 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4938  transcriptional regulator, TetR family  28.14 
 
 		 223 aa  71.6  0.000000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.262917  normal  0.206147 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0719  TetR family transcriptional regulator  25.4 
 
 		 209 aa  70.9  0.00000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1436  TetR family transcriptional regulator  28.36 
 
 		 197 aa  70.9  0.00000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0433  TetR family transcriptional regulator  25.41 
 
 		 204 aa  70.9  0.00000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.376909  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1934  TetR family transcriptional regulator  26.14 
 
 		 202 aa  70.1  0.00000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0322407  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2747  TetR family transcriptional regulator  27.53 
 
 		 233 aa  70.1  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.02505  normal  0.237475 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26580  transcriptional regulator, TetR family  27.51 
 
 		 205 aa  70.1  0.00000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0994293 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1623  transcriptional regulator, TetR family  25.32 
 
 		 205 aa  70.5  0.00000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4074  TetR family transcriptional regulator  30.29 
 
 		 194 aa  70.5  0.00000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.137574 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2109  TetR family transcriptional regulator  27.98 
 
 		 206 aa  70.1  0.00000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.901149 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0293  TetR family transcriptional regulator  26.06 
 
 		 226 aa  69.7  0.00000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1011  TetR family transcriptional regulator  28.42 
 
 		 770 aa  69.3  0.00000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3352  transcriptional regulator, TetR family  26.92 
 
 		 183 aa  69.7  0.00000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0512596  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3991  regulatory protein TetR  23.65 
 
 		 197 aa  68.6  0.00000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4004  TetR family transcriptional regulator  31.13 
 
 		 196 aa  68.2  0.00000000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.638592  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1145  TetR family transcriptional regulator  25.39 
 
 		 224 aa  68.2  0.00000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.770966  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2924  TetR family transcriptional regulator  25.39 
 
 		 224 aa  68.2  0.00000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.288766  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4061  TetR family transcriptional regulator  26.56 
 
 		 240 aa  68.2  0.00000000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1071  TetR family transcriptional regulator  28.65 
 
 		 240 aa  68.2  0.00000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.457023 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0571  TetR family transcriptional regulator  30.09 
 
 		 219 aa  68.2  0.00000000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.22949  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2483  transcriptional regulator, TetR family  30.65 
 
 		 217 aa  68.2  0.00000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000117416  hitchhiker  0.00899265 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4290  transcriptional regulator, TetR family  26.23 
 
 		 226 aa  67.4  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.000567463  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2768  TetR family transcriptional regulator  25.39 
 
 		 224 aa  67.8  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.379756  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2235  transcriptional regulator, TetR family  29.67 
 
 		 235 aa  67.8  0.0000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.170733  normal  0.3149 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4901  TetR family transcriptional regulator  26.88 
 
 		 209 aa  67.8  0.0000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0807  TetR family transcriptional regulator  28.8 
 
 		 211 aa  66.6  0.0000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.271007  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1372  transcriptional regulator, TetR family  26.92 
 
 		 210 aa  67  0.0000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.487007  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0516  TetR family transcriptional regulator  25.67 
 
 		 195 aa  66.6  0.0000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3815  regulatory protein, TetR  27.81 
 
 		 252 aa  67  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00651597  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3212  TetR family transcriptional regulator  26.46 
 
 		 211 aa  65.5  0.0000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010551  BamMC406_0252  TetR family transcriptional regulator  25.77 
 
 		 201 aa  65.5  0.0000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00323074 
 
 
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NC_008148  Rxyl_0370  TetR family transcriptional regulator  27.6 
 
 		 223 aa  65.5  0.0000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0234884  n/a   
 
 
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NC_008699  Noca_4300  transcriptional regulator  31.71 
 
 		 225 aa  65.5  0.0000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4079  TetR family transcriptional regulator  26.78 
 
 		 244 aa  65.1  0.0000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.780842  normal  0.246764 
 
 
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NC_011886  Achl_3049  transcriptional regulator, TetR family  28.98 
 
 		 214 aa  64.7  0.0000000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
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NC_007778  RPB_3642  TetR family transcriptional regulator  26.78 
 
 		 227 aa  64.7  0.0000000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.494269 
 
 
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NC_007950  Bpro_5293  TetR family transcriptional regulator  29.44 
 
 		 210 aa  64.7  0.0000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.199638  normal  1 
 
 
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NC_009483  Gura_0817  TetR family transcriptional regulator  35.58 
 
 		 212 aa  64.3  0.000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013510  Tcur_0772  transcriptional regulator, TetR family  28.18 
 
 		 223 aa  63.9  0.000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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