More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_2483 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_2483  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 217 aa  430  1e-120  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000117416  hitchhiker  0.00899265 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6181  transcriptional regulator, TetR family  51.92 
 
 		 202 aa  202  5e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.685616  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3049  transcriptional regulator, TetR family  50.71 
 
 		 214 aa  191  7e-48  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26580  transcriptional regulator, TetR family  46.8 
 
 		 205 aa  180  1e-44  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0994293 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1436  TetR family transcriptional regulator  53.09 
 
 		 197 aa  173  1.9999999999999998e-42  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4066  transcriptional regulator, TetR family  52.3 
 
 		 211 aa  172  3.9999999999999995e-42  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1909  transcriptional regulator, TetR family  51 
 
 		 209 aa  163  1.0000000000000001e-39  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0574085  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3248  TetR family transcriptional regulator  48.17 
 
 		 201 aa  161  7e-39  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20320  transcriptional regulator, TetR family  47.18 
 
 		 203 aa  157  9e-38  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1471  TetR family transcriptional regulator  28.21 
 
 		 219 aa  90.9  1e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1768  TetR family transcriptional regulator  30.85 
 
 		 211 aa  84.7  0.000000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.570427  normal  0.275415 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0306  TetR family transcriptional regulator  23.92 
 
 		 219 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0641939  normal  0.172302 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0370  TetR family transcriptional regulator  29.35 
 
 		 223 aa  82.8  0.000000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0234884  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2065  transcriptional regulator, TetR family  30.27 
 
 		 188 aa  82.4  0.000000000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.704626  normal  0.605366 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5293  TetR family transcriptional regulator  27.13 
 
 		 210 aa  79.3  0.00000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.199638  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0117  TetR family transcriptional regulator  29.53 
 
 		 208 aa  78.6  0.00000000000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.966538  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1571  TetR family transcriptional regulator  30.36 
 
 		 201 aa  78.6  0.00000000000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.038411 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2696  TetR family transcriptional regulator  30.48 
 
 		 196 aa  78.6  0.00000000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.834085 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0832  transcriptional regulator, TetR family  30.89 
 
 		 211 aa  77.4  0.0000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.933061 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16730  transcriptional regulator, TetR family  27.03 
 
 		 213 aa  76.6  0.0000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1775  transcriptional regulator, TetR family  23.62 
 
 		 207 aa  77  0.0000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2922  transcriptional regulator, TetR family  30.11 
 
 		 204 aa  74.3  0.000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.404278 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4171  TetR family transcriptional regulator  26.9 
 
 		 203 aa  74.3  0.000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0201849  hitchhiker  0.000462956 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4304  TetR family transcriptional regulator  27.41 
 
 		 202 aa  73.6  0.000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.148025  normal  0.676238 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4378  transcriptional regulator, TetR family  30.69 
 
 		 200 aa  73.9  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.136582 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4711  TetR family transcriptional regulator  29.48 
 
 		 228 aa  73.2  0.000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.133874 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2723  transcriptional regulator, TetR family  26.42 
 
 		 224 aa  73.2  0.000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0252111  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4802  TetR family transcriptional regulator  31.63 
 
 		 199 aa  73.2  0.000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.386552  normal  0.120275 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2109  TetR family transcriptional regulator  26.64 
 
 		 206 aa  72.8  0.000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.901149 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0571  TetR family transcriptional regulator  32 
 
 		 219 aa  72.4  0.000000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.22949  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7113  TetR family transcriptional regulator  27.33 
 
 		 240 aa  72  0.000000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2438  transcriptional regulator, TetR family  25.45 
 
 		 208 aa  71.6  0.000000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0033  TetR family transcriptional regulator  26.17 
 
 		 256 aa  71.2  0.00000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4464  TetR family transcriptional regulator  25.74 
 
 		 204 aa  70.9  0.00000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0680244 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3836  TetR family transcriptional regulator  28.88 
 
 		 246 aa  70.9  0.00000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.487675  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1934  TetR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 202 aa  69.7  0.00000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0322407  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0117  transcriptional regulator, TetR family  29.5 
 
 		 225 aa  68.9  0.00000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.678219 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2055  putative transcriptional regulator, TetR family  26.13 
 
 		 229 aa  69.3  0.00000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0410393  normal  0.8778 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0043  regulatory protein, TetR  30.12 
 
 		 211 aa  68.9  0.00000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2499  transcriptional regulator, TetR family  26.15 
 
 		 208 aa  68.6  0.00000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0293  TetR family transcriptional regulator  28.79 
 
 		 226 aa  68.6  0.00000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3991  regulatory protein TetR  29.95 
 
 		 197 aa  68.2  0.0000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0385  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 219 aa  67.8  0.0000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.464521 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1804  transcriptional regulator, TetR family  25.84 
 
 		 189 aa  68.2  0.0000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0252  TetR family transcriptional regulator  31.41 
 
 		 201 aa  66.2  0.0000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00323074 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4824  TetR family transcriptional regulator  23.43 
 
 		 228 aa  66.6  0.0000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0289  TetR family transcriptional regulator  29.53 
 
 		 202 aa  66.6  0.0000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0347  TetR family transcriptional regulator  29.49 
 
 		 200 aa  66.6  0.0000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0154637  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0110  transcriptional regulator, TetR family  28.42 
 
 		 225 aa  66.2  0.0000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1858  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 234 aa  65.9  0.0000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.543066  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2765  regulatory protein, TetR  27.13 
 
 		 210 aa  66.2  0.0000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.267077  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3140  TetR family transcriptional regulator  53.33 
 
 		 197 aa  65.9  0.0000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.137738  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3950  TetR family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 212 aa  65.9  0.0000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.390353  normal  0.629082 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0516  TetR family transcriptional regulator  26.82 
 
 		 195 aa  65.5  0.0000000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7768  putative transcriptional regulator, TetR family  27.89 
 
 		 194 aa  65.5  0.0000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3668  transcriptional regulator, TetR family  29.26 
 
 		 202 aa  65.1  0.0000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.0040426  hitchhiker  0.0000000599644 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1253  transcriptional regulator, TetR family  30.1 
 
 		 210 aa  65.5  0.0000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0477994 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48190  putative transcriptional regulator  36.08 
 
 		 186 aa  65.1  0.0000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0114913  normal  0.0538885 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4061  TetR family transcriptional regulator  25.39 
 
 		 240 aa  65.1  0.0000000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3423  TetR family transcriptional regulator  31.32 
 
 		 201 aa  64.3  0.000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0304  TetR family transcriptional regulator  31.32 
 
 		 201 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.826155  hitchhiker  0.000375508 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2767  TetR family transcriptional regulator  27.37 
 
 		 225 aa  64.3  0.000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.284138 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0226  TetR family transcriptional regulator  31.32 
 
 		 201 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.312291  hitchhiker  0.00018932 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2402  TetR family transcriptional regulator  30.73 
 
 		 205 aa  64.3  0.000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.584484 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2782  TetR family transcriptional regulator  31.32 
 
 		 201 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.522237  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0243  TetR family transcriptional regulator  31.32 
 
 		 201 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0324  TetR family transcriptional regulator  31.32 
 
 		 201 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1617  TetR family transcriptional regulator  29.47 
 
 		 202 aa  64.3  0.000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0133761 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2755  TetR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 200 aa  63.9  0.000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1844  transcriptional regulator, TetR family  21.82 
 
 		 214 aa  63.9  0.000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2863  TetR family transcriptional regulator  29.84 
 
 		 204 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000603343 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5283  TetR family transcriptional regulator  29.53 
 
 		 208 aa  63.9  0.000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.261053 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2800  TetR family transcriptional regulator  29.08 
 
 		 224 aa  63.9  0.000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.697977  decreased coverage  0.000162176 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2579  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 199 aa  63.2  0.000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1958  TetR family transcriptional regulator  25.15 
 
 		 251 aa  63.2  0.000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.455038  normal  0.501183 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3531  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 199 aa  63.2  0.000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1394  TetR family transcriptional regulator  34.69 
 
 		 214 aa  63.2  0.000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0006  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 199 aa  63.2  0.000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0589242  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3117  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 199 aa  63.2  0.000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.100627  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1978  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 199 aa  63.2  0.000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0013  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 199 aa  62.8  0.000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3103  TetR family transcriptional regulator  29.1 
 
 		 199 aa  62.8  0.000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.454868  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3842  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 199 aa  62.8  0.000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.391648  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3781  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 199 aa  62.8  0.000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0109  TetR family transcriptional regulator  29.45 
 
 		 207 aa  62.8  0.000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30200  transcriptional regulator, TetR family  28.16 
 
 		 231 aa  62.4  0.000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.296423  normal  0.124528 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2710  transcriptional regulator, TetR family  28.43 
 
 		 218 aa  62.4  0.000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.448517  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0806  transcriptional regulator, TetR family  23.83 
 
 		 202 aa  62  0.000000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.265645  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3494  transcriptional regulator, TetR family  27.22 
 
 		 208 aa  61.6  0.000000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5551  TetR family transcriptional regulator  30.13 
 
 		 203 aa  61.6  0.000000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.1306  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0531  TetR family transcriptional regulator  27.69 
 
 		 218 aa  61.6  0.000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13590  TetR family transcriptional regulator  27.23 
 
 		 200 aa  61.2  0.00000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.332381  normal  0.0844747 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2692  TetR family transcriptional regulator  27.08 
 
 		 195 aa  61.2  0.00000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.728372  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1145  TetR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 224 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.770966  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2924  TetR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 224 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.288766  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1603  transcriptional regulator, TetR family  28.12 
 
 		 189 aa  60.8  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0115969  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2768  TetR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 224 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.379756  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2779  transcriptional regulator, TetR family  28.27 
 
 		 200 aa  61.2  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.192265  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1312  TetR family transcriptional regulator  41.33 
 
 		 211 aa  60.5  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000673566 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1327  TetR family transcriptional regulator  41.33 
 
 		 211 aa  60.5  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000128792 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>