More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_3494 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_3494  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 208 aa  420  1e-117  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17920  transcriptional regulator, tetR family  37.79 
 
 		 204 aa  115  3.9999999999999997e-25  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.330701  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1005  transcriptional regulator, TetR family  41.18 
 
 		 218 aa  108  8.000000000000001e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22560  transcriptional regulator, tetR family  30.65 
 
 		 208 aa  77.8  0.0000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0880115  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3979  transcriptional regulator, TetR family  27.87 
 
 		 222 aa  70.9  0.00000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.318215  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2067  transcriptional regulator, TetR family  31.07 
 
 		 213 aa  67  0.0000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.855193  normal  0.580158 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2734  putative transcriptional regulator, TetR family  29.02 
 
 		 206 aa  66.2  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.596696  normal  0.79417 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5570  transcriptional regulator, TetR family  40.23 
 
 		 198 aa  64.3  0.000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4596  regulatory protein TetR  29.12 
 
 		 196 aa  63.5  0.000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4165  TetR family transcriptional regulator  32.5 
 
 		 232 aa  63.2  0.000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.367589  normal  0.612517 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3692  TetR family transcriptional regulator  32.5 
 
 		 244 aa  63.2  0.000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.674174  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2290  transcriptional regulator, TetR family  29.9 
 
 		 208 aa  62.4  0.000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0794358  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1283  transcriptional regulator, TetR family  28.05 
 
 		 199 aa  61.6  0.000000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.255686  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2527  TetR family transcriptional regulator  29.29 
 
 		 194 aa  60.1  0.00000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.490074  normal  0.267005 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2089  transcriptional regulator, TetR family  28.7 
 
 		 220 aa  59.7  0.00000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0021127  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0832  transcriptional regulator, TetR family  25.16 
 
 		 196 aa  58.9  0.00000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9078  putative transcriptional regulator, TetR family  48.28 
 
 		 211 aa  58.9  0.00000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2164  regulatory protein, TetR  30.91 
 
 		 209 aa  58.5  0.00000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0425  transcriptional regulator, TetR family  26.4 
 
 		 199 aa  58.5  0.00000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.154596 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30200  transcriptional regulator, TetR family  32 
 
 		 231 aa  58.5  0.00000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.296423  normal  0.124528 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0828  transcriptional regulator, TetR family  22.63 
 
 		 195 aa  58.5  0.00000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2878  TetR family transcriptional regulator  26.74 
 
 		 202 aa  58.5  0.00000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3149  TetR family transcriptional regulator  28.89 
 
 		 205 aa  57.4  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1950  TetR family transcriptional regulator  26.19 
 
 		 240 aa  57.4  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.663338  normal  0.729107 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8489  putative transcriptional regulator, TetR family  28.65 
 
 		 203 aa  57.8  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.280909  normal  0.379927 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1050  transcriptional regulator, TetR family  33 
 
 		 225 aa  57.4  0.0000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.549541 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2422  transcriptional regulator, TetR family  30.29 
 
 		 197 aa  56.6  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000265027  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0457  TetR family transcriptional regulator  28.83 
 
 		 206 aa  56.2  0.0000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4330  TetR family transcriptional regulator  29.38 
 
 		 235 aa  56.2  0.0000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0658  TetR family transcriptional regulator  28.21 
 
 		 232 aa  55.8  0.0000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4481  transcriptional regulator, TetR family  35.45 
 
 		 216 aa  56.2  0.0000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.918639  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3148  transcriptional regulator, TetR family  34.31 
 
 		 310 aa  55.8  0.0000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2214  transcriptional regulator, TetR family  25.88 
 
 		 219 aa  55.5  0.0000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.411668  normal  0.665917 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2387  TetR family transcriptional regulator  28.21 
 
 		 232 aa  55.8  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2710  transcriptional regulator, TetR family  32 
 
 		 218 aa  55.8  0.0000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.448517  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3094  TetR family transcriptional regulator  26.26 
 
 		 212 aa  55.5  0.0000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2079  transcriptional regulator, TetR family  27.32 
 
 		 208 aa  55.5  0.0000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.674297  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0281  transcriptional regulator, TetR family  25.3 
 
 		 218 aa  55.5  0.0000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.645912  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2630  TetR family transcriptional regulator  34.58 
 
 		 205 aa  55.1  0.0000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0697093  n/a   
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3835  TetR family transcriptional regulator  24.12 
 
 		 202 aa  55.1  0.0000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3852  TetR family transcriptional regulator  24.12 
 
 		 202 aa  55.1  0.0000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1920  TetR family transcriptional regulator  24.12 
 
 		 202 aa  55.1  0.0000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4542  transcriptional regulator, TetR family  27.33 
 
 		 201 aa  55.1  0.0000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.204937  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2686  TetR family transcriptional regulator  24.12 
 
 		 202 aa  55.1  0.0000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0616794  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1250  TetR family transcriptional regulator  24.12 
 
 		 202 aa  55.1  0.0000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0994  transcriptional regulator, TetR family  33 
 
 		 271 aa  55.1  0.0000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3410  TetR family transcriptional regulator  28.66 
 
 		 196 aa  55.1  0.0000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000655293  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3152  transcriptional regulator, TetR family  30.71 
 
 		 248 aa  55.1  0.0000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.262017  normal  0.121031 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4602  TetR family transcriptional regulator  34.23 
 
 		 219 aa  54.7  0.0000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.904797 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0305  transcriptional regulator, TetR family  32 
 
 		 215 aa  54.7  0.0000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.437849  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4218  TetR family transcriptional regulator  30.34 
 
 		 202 aa  54.7  0.000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.135159  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4378  transcriptional regulator, TetR family  34.88 
 
 		 200 aa  53.9  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.136582 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1944  transcriptional regulator, TetR family  32 
 
 		 205 aa  54.7  0.000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.00538978  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0301  transcriptional regulator, TetR family  26.26 
 
 		 199 aa  54.7  0.000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0864199  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3565  transcriptional regulator, TetR family  31.69 
 
 		 189 aa  54.3  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0847285  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3459  putative transcriptional regulator  27.27 
 
 		 193 aa  54.3  0.000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.429515  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5318  transcriptional regulator, TetR family  32.67 
 
 		 197 aa  54.3  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4635  regulatory protein, TetR  29.35 
 
 		 226 aa  53.9  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1743  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 244 aa  53.5  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.065917  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4533  transcriptional regulator, TetR family  22.7 
 
 		 198 aa  53.9  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0169871 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26580  transcriptional regulator, TetR family  25.79 
 
 		 205 aa  53.5  0.000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0994293 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3587  TetR family transcriptional regulator  28.05 
 
 		 208 aa  53.5  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.997688  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5293  TetR family transcriptional regulator  29.36 
 
 		 210 aa  53.5  0.000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.199638  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0421  transcriptional regulator, TetR family  31.25 
 
 		 198 aa  53.9  0.000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1836  transcriptional regulator, TetR family  27.33 
 
 		 207 aa  53.5  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0359893  normal  0.350648 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2314  transcriptional regulator, TetR family  24.42 
 
 		 213 aa  53.9  0.000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.251224 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0872  transcriptional regulator, TetR family  31 
 
 		 211 aa  53.9  0.000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.678947 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4955  TetR family transcriptional regulator  25.29 
 
 		 424 aa  53.5  0.000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.868884 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1747  TetR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 221 aa  53.1  0.000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1985  transcriptional regulator, TetR family  33.03 
 
 		 269 aa  53.1  0.000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.351825 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40790  putative transcriptional regulator  26.26 
 
 		 193 aa  52.8  0.000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3647  DNA-binding transcriptional regulator EnvR  21.84 
 
 		 220 aa  52.8  0.000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0126984  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7862  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 240 aa  53.1  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0504045  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0039  transcriptional regulator, TetR family  27.97 
 
 		 201 aa  53.1  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1325  transcriptional regulator, TetR family  21.24 
 
 		 203 aa  52.8  0.000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.161657  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3157  TetR family transcriptional regulator  33 
 
 		 330 aa  53.1  0.000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2628  transcriptional regulator, TetR family  20.93 
 
 		 194 aa  52.8  0.000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00732346  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3559  DNA-binding transcriptional regulator EnvR  21.84 
 
 		 220 aa  52.8  0.000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00735263  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4604  transcriptional regulator, TetR family  29.46 
 
 		 255 aa  52.8  0.000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3049  transcriptional regulator, TetR family  26.42 
 
 		 214 aa  52.8  0.000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1636  TetR family transcriptional regulator  23.12 
 
 		 200 aa  52.8  0.000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1045  transcriptional regulator, TetR family  24.85 
 
 		 203 aa  52.4  0.000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00830488  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1398  TetR family transcriptional regulator  28.21 
 
 		 191 aa  52.8  0.000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03122  DNA-binding transcriptional regulator  21.84 
 
 		 220 aa  52.4  0.000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.889925  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0442  transcriptional regulator, TetR family  21.84 
 
 		 220 aa  52.4  0.000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.671353  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2192  TetR family transcriptional regulator  29.33 
 
 		 225 aa  52.4  0.000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03073  hypothetical protein  21.84 
 
 		 220 aa  52.4  0.000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.807649  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0602  transcriptional regulator, TetR family  21.11 
 
 		 195 aa  52.4  0.000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1817  TetR family transcriptional regulator  22.42 
 
 		 195 aa  52.4  0.000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4581  DNA-binding transcriptional regulator EnvR  21.84 
 
 		 220 aa  52.4  0.000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00305215  normal  0.159786 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3749  DNA-binding transcriptional regulator EnvR  21.84 
 
 		 220 aa  52.4  0.000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000431628  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1666  transcriptional regulator, TetR family  37.29 
 
 		 209 aa  52.4  0.000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.40268  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0620  TetR family transcriptional regulator  28 
 
 		 193 aa  52.4  0.000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0442  DNA-binding transcriptional regulator EnvR  21.84 
 
 		 220 aa  52.4  0.000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.114804  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0633  TetR family transcriptional regulator  28 
 
 		 193 aa  52.4  0.000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0611  TetR family transcriptional regulator  28 
 
 		 193 aa  52.4  0.000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4304  TetR family transcriptional regulator  25.64 
 
 		 202 aa  52.4  0.000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.148025  normal  0.676238 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3457  DNA-binding transcriptional regulator EnvR  21.84 
 
 		 220 aa  52.4  0.000005  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000315342  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1656  transcriptional regulator, TetR family  24.29 
 
 		 206 aa  52  0.000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1061  transcriptional regulator, TetR family  20.83 
 
 		 196 aa  52  0.000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0250707  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>