More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC6_1817 on replicon NC_009975
Organism: Methanococcus maripaludis C6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009975  MmarC6_1817  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 195 aa  396  1e-109  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1100  TetR family transcriptional regulator  85.57 
 
 		 196 aa  338  4e-92  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0085  TetR family transcriptional regulator  75.9 
 
 		 195 aa  308  5e-83  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  hitchhiker  0.0016021  decreased coverage  0.0000722764 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1620  TetR family transcriptional regulator  54.12 
 
 		 196 aa  216  2e-55  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.0021024  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0282  TetR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 201 aa  112  5e-24  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.356366  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0265  TetR family transcriptional regulator  30.86 
 
 		 200 aa  73.2  0.000000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00630944 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1636  TetR family transcriptional regulator  28.81 
 
 		 200 aa  67.4  0.0000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0571  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 200 aa  66.2  0.0000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.530829  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1745  TetR family transcriptional regulator  25.68 
 
 		 216 aa  62  0.000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1792  TetR family transcriptional regulator  25.68 
 
 		 216 aa  62  0.000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.651799  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1726  TetR family transcriptional regulator  25.68 
 
 		 216 aa  62  0.000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.379747  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1955  transcriptional regulator, TetR family  36.76 
 
 		 202 aa  59.3  0.00000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.22623  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3221  TetR family transcriptional regulator  37.35 
 
 		 232 aa  57.8  0.0000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3160  TetR family transcriptional regulator  31.33 
 
 		 205 aa  56.6  0.0000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000883166 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3742  transcriptional regulator, TetR family  28.81 
 
 		 192 aa  55.8  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3694  TetR family transcriptional regulator  52.08 
 
 		 222 aa  56.2  0.0000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1493  TetR family transcriptional regulator  43.64 
 
 		 200 aa  56.2  0.0000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4897  transcriptional regulator, TetR family  23.23 
 
 		 193 aa  55.8  0.0000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.684326  normal  0.293164 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0265  TetR family transcriptional regulator  29.13 
 
 		 194 aa  55.8  0.0000004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.250901  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1988  TetR family transcriptional regulator  27.63 
 
 		 208 aa  55.5  0.0000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1694  TetR family transcriptional regulator  27.22 
 
 		 219 aa  55.5  0.0000005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.0960426 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1668  TetR family transcriptional regulator  28.77 
 
 		 204 aa  55.1  0.0000007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1571  TetR family transcriptional regulator  29.09 
 
 		 207 aa  54.7  0.0000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2977  transcriptional regulator, TetR family  28.32 
 
 		 196 aa  54.7  0.0000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4666  TetR family transcriptional regulator  24.69 
 
 		 214 aa  54.7  0.0000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.441468  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3312  transcriptional regulator UidR  25.83 
 
 		 198 aa  54.3  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0959  transcriptional regulator, TetR family  22.99 
 
 		 219 aa  54.3  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.783426  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0839  transcriptional regulator, TetR family  20.47 
 
 		 203 aa  54.3  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1976  putative transcriptional regulator, TetR family  35.87 
 
 		 181 aa  54.3  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3014  TetR family transcriptional regulator  25.68 
 
 		 195 aa  53.9  0.000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0191  transcriptional regulator, TetR family  26.9 
 
 		 243 aa  53.5  0.000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.00113557  decreased coverage  0.000257741 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2740  TetR family transcriptional regulator  25.15 
 
 		 230 aa  53.1  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0291953  hitchhiker  0.000390237 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1044  TetR family transcriptional regulator  28.03 
 
 		 180 aa  53.9  0.000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0206033 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1118  transcriptional regulator, TetR family  26.78 
 
 		 201 aa  53.1  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00548751  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3259  transcriptional regulator, TetR family  37.5 
 
 		 219 aa  53.1  0.000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.147915  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2545  TetR family transcriptional regulator  24.71 
 
 		 194 aa  53.1  0.000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5186  transcriptional regulator, TetR family  28.38 
 
 		 185 aa  52.8  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.225373  normal  0.188797 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0707  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 219 aa  53.1  0.000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2392  TetR family transcriptional regulator  26.74 
 
 		 198 aa  52.8  0.000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0101662  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6560  transcriptional regulator, TetR family  42.86 
 
 		 203 aa  53.1  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3494  transcriptional regulator, TetR family  22.42 
 
 		 208 aa  52.4  0.000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2948  TetR family transcriptional regulator  23.59 
 
 		 191 aa  52.4  0.000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4260  putative transcriptional regulator, TetR family  22.03 
 
 		 192 aa  52.4  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.370014  normal  0.537998 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1326  TetR family transcriptional regulator  27.5 
 
 		 205 aa  52  0.000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.892925  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0659  transcriptional regulator TetR family  24.58 
 
 		 196 aa  52  0.000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05020  transcriptional regulator, TetR family  34.04 
 
 		 194 aa  51.6  0.000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1260  transcriptional regulator, TetR family  37.14 
 
 		 222 aa  51.6  0.000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.194739 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0502  TetR family transcriptional regulator  22.28 
 
 		 221 aa  51.6  0.000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2110  transcriptional regulator, TetR family  23.15 
 
 		 200 aa  51.6  0.000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0942807  normal  0.362877 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3637  TetR family transcriptional regulator  19.21 
 
 		 228 aa  51.6  0.000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2430  transcriptional regulator, TetR family  32.53 
 
 		 207 aa  51.2  0.000008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.466149 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1811  TetR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 209 aa  51.6  0.000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0788  TetR family transcriptional regulator  21.03 
 
 		 221 aa  51.2  0.000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.796627 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1014  TetR family transcriptional regulator  28.1 
 
 		 212 aa  50.8  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2561  transcriptional regulator, TetR family  35.37 
 
 		 203 aa  51.2  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2537  TetR family transcriptional regulator  37.74 
 
 		 87 aa  50.4  0.00001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2704  TetR family transcriptional regulator  40.38 
 
 		 203 aa  50.8  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.187148 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4218  TetR family transcriptional regulator  30.91 
 
 		 202 aa  49.7  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.135159  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0824  TetR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 206 aa  50.1  0.00002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3099  TetR family transcriptional regulator  24.64 
 
 		 222 aa  50.1  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.296713  normal  0.219943 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0167  transcriptional regulator, TetR family  40.35 
 
 		 200 aa  49.7  0.00002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2304  transcriptional regulator, TetR family  22.53 
 
 		 201 aa  50.1  0.00002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2373  TetR family transcriptional regulator  23.44 
 
 		 205 aa  50.4  0.00002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2176  TetR family transcriptional regulator  25.75 
 
 		 209 aa  50.1  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000096918  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0111  transcriptional regulator, TetR family  21.13 
 
 		 207 aa  50.1  0.00002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.482364  normal  0.0755622 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8152  putative transcriptional regulator, TetR family  41.07 
 
 		 174 aa  50.1  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.687421 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3052  TetR family transcriptional regulator  42.59 
 
 		 183 aa  49.7  0.00002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.186092 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2423  transcriptional regulator, TetR family  25.75 
 
 		 207 aa  50.1  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3004  transcriptional regulator, TetR family  41.82 
 
 		 186 aa  50.1  0.00002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.519568  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1276  transcriptional regulator, TetR family  38.71 
 
 		 214 aa  50.1  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.933053  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3888  TetR family transcriptional regulator  23.03 
 
 		 193 aa  49.7  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0944552  normal  0.0941974 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1656  TetR family transcriptional regulator  27.11 
 
 		 196 aa  50.1  0.00002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0515046  normal  1 
 
 
-
 
NC_010578  Bind_3907  regulatory protein TetR  33.7 
 
 		 212 aa  50.1  0.00002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5720  TetR family transcriptional regulator  44.68 
 
 		 291 aa  49.7  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.649137  normal  0.760569 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18080  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 212 aa  50.1  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3341  TetR family transcriptional regulator  24.26 
 
 		 196 aa  50.1  0.00002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0170  TetR family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 192 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.652591  normal  0.659974 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1569  putative transcriptional regulator  40 
 
 		 212 aa  50.1  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5392  transcriptional regulator, TetR family protein  32.63 
 
 		 190 aa  50.1  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2219  TetR family transcriptional regulator  23.32 
 
 		 207 aa  49.3  0.00003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.23135  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3704  regulatory protein TetR  28.16 
 
 		 202 aa  49.7  0.00003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.974133 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1218  TetR family transcriptional regulator  23.66 
 
 		 206 aa  49.7  0.00003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2636  transcriptional regulator, TetR family  37.29 
 
 		 222 aa  49.7  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0687  TetR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 261 aa  49.7  0.00003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.794796  normal  0.223624 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0684  TetR family transcriptional regulator  28.07 
 
 		 213 aa  49.3  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.974708 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3113  TetR family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 214 aa  49.7  0.00003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.527228  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1149  transcriptional regulator, TetR family protein  39.62 
 
 		 226 aa  49.7  0.00003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2270  TetR family transcriptional regulator  39.34 
 
 		 189 aa  49.7  0.00003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0765  TetR family transcriptional regulator  28.89 
 
 		 228 aa  49.7  0.00003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0330  transcriptional regulator, TetR family  33.87 
 
 		 233 aa  49.3  0.00003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1987  TetR family transcriptional regulator  39.58 
 
 		 210 aa  49.7  0.00003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4122  TetR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 207 aa  49.3  0.00003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.389931  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3301  transcriptional regulator, TetR family  27.89 
 
 		 193 aa  48.9  0.00004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000664283 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0817  TetR family transcriptional regulator  36.51 
 
 		 332 aa  48.9  0.00004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11350  transcriptional regulator  40.35 
 
 		 220 aa  49.3  0.00004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2085  transcriptional regulator, TetR family  29.9 
 
 		 210 aa  48.9  0.00004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5293  TetR family transcriptional regulator  29.07 
 
 		 210 aa  49.3  0.00004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.199638  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00486  transcriptional regulator, TetR family protein  42.31 
 
 		 224 aa  48.9  0.00004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3466  TetR family transcriptional regulator  22.11 
 
 		 245 aa  49.3  0.00004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.130911  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1768  TetR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 211 aa  49.3  0.00004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.570427  normal  0.275415 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>