More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_2734 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_2734  putative transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 206 aa  412  1e-114  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.596696  normal  0.79417 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9078  putative transcriptional regulator, TetR family  45.81 
 
 		 211 aa  180  1e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2067  transcriptional regulator, TetR family  44.88 
 
 		 213 aa  167  1e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.855193  normal  0.580158 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2079  transcriptional regulator, TetR family  44.83 
 
 		 208 aa  162  3e-39  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.674297  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5570  transcriptional regulator, TetR family  43.68 
 
 		 198 aa  154  1e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3979  transcriptional regulator, TetR family  43.56 
 
 		 222 aa  150  8.999999999999999e-36  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.318215  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1950  TetR family transcriptional regulator  43.23 
 
 		 240 aa  147  1.0000000000000001e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.663338  normal  0.729107 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1914  transcriptional regulator, TetR family  36.27 
 
 		 205 aa  126  3e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1470  transcriptional regulator, TetR family  37.32 
 
 		 213 aa  110  1.0000000000000001e-23  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.772741  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2290  transcriptional regulator, TetR family  37.98 
 
 		 208 aa  110  2.0000000000000002e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0794358  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0039  transcriptional regulator, TetR family  35.6 
 
 		 201 aa  107  1e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22560  transcriptional regulator, tetR family  34.39 
 
 		 208 aa  104  8e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0880115  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4968  transcriptional regulator, TetR family domain protein  30.3 
 
 		 197 aa  95.5  5e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4996  transcriptional regulator  29.59 
 
 		 197 aa  94.7  8e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4596  regulatory protein TetR  28.35 
 
 		 196 aa  79.3  0.00000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3494  transcriptional regulator, TetR family  29.02 
 
 		 208 aa  66.2  0.0000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3308  transcriptional regulator BetI  36.26 
 
 		 196 aa  63.2  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1516  transcriptional regulator BetI  30.64 
 
 		 197 aa  63.9  0.000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.026336  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5060  transcriptional regulator BetI  36.26 
 
 		 195 aa  62.8  0.000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0255482 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0328  putative transcriptional regulator  29.12 
 
 		 222 aa  62.4  0.000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.536324  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0626  TetR family transcriptional regulator  24.7 
 
 		 199 aa  62.4  0.000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1044  TetR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 180 aa  61.2  0.000000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0206033 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0555  transcriptional regulator BetI  34.07 
 
 		 194 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3085  TetR family transcriptional regulator  29.88 
 
 		 215 aa  60.8  0.00000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3270  transcriptional regulator BetI  34.07 
 
 		 194 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5035  transcriptional regulator BetI  34.07 
 
 		 194 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.496722  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4510  transcriptional regulator BetI  34.07 
 
 		 194 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5098  transcriptional regulator BetI  34.07 
 
 		 194 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5184  transcriptional regulator BetI  34.07 
 
 		 194 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.14696  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8404  putative transcriptional regulator, TetR family  35.58 
 
 		 677 aa  60.5  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1074  transcriptional regulator BetI  34.07 
 
 		 195 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.0000226822  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03010  TetR family transcriptional regulator  28.4 
 
 		 222 aa  60.5  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000381229 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0181  transcriptional regulator BetI  35.16 
 
 		 195 aa  59.7  0.00000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0916  transcriptional regulator BetI  33.02 
 
 		 202 aa  59.7  0.00000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0327012  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0375  transcriptional regulator BetI  33.02 
 
 		 202 aa  59.7  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00292447  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1005  transcriptional regulator, TetR family  35.9 
 
 		 218 aa  59.7  0.00000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1537  TetR family transcriptional regulator  26.26 
 
 		 257 aa  59.7  0.00000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0466  transcriptional regulator BetI  33.02 
 
 		 202 aa  59.7  0.00000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1923  transcriptional regulator BetI  35.16 
 
 		 195 aa  59.7  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00275068  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3598  TetR family transcriptional regulator  26.14 
 
 		 227 aa  59.7  0.00000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.646734  normal  0.699465 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1835  transcriptional regulator BetI  35.16 
 
 		 195 aa  59.7  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1426  transcriptional regulator BetI  35.16 
 
 		 195 aa  59.7  0.00000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.80296  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0499  transcriptional regulator, TetR family  28.16 
 
 		 201 aa  59.7  0.00000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.38098  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0658  TetR family transcriptional regulator  26.96 
 
 		 195 aa  59.3  0.00000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.609022  normal  0.929409 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0891  TetR family transcriptional regulator  29.52 
 
 		 211 aa  58.9  0.00000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2589  transcriptional regulator BetI  31.18 
 
 		 196 aa  58.5  0.00000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1129  TetR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 231 aa  58.9  0.00000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1669  TetR family transcriptional regulator  27.33 
 
 		 235 aa  58.2  0.00000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17920  transcriptional regulator, tetR family  34.26 
 
 		 204 aa  58.2  0.0000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.330701  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2737  TetR family transcriptional regulator  28.4 
 
 		 220 aa  57.8  0.0000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2556  transcriptional regulator BetI  33.7 
 
 		 195 aa  57.4  0.0000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.160785  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1590  transcriptional regulator BetI  35.16 
 
 		 195 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2628  transcriptional regulator, TetR family  25.39 
 
 		 194 aa  56.6  0.0000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00732346  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6345  transcriptional regulator, TetR family  26.06 
 
 		 241 aa  56.6  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4456  regulatory protein TetR  29.38 
 
 		 202 aa  56.6  0.0000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0166479  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3149  TetR family transcriptional regulator  30.05 
 
 		 205 aa  57  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3888  TetR family transcriptional regulator  27.16 
 
 		 193 aa  57  0.0000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0944552  normal  0.0941974 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3538  transcriptional regulator BetI  32.97 
 
 		 194 aa  57  0.0000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4633  TetR family transcriptional regulator  26.99 
 
 		 224 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.458937  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2507  TetR family transcriptional regulator  29.27 
 
 		 211 aa  57.4  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00142913 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3842  transcriptional regulator BetI  31.25 
 
 		 197 aa  57  0.0000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1885  transcriptional regulator, TetR family  27.71 
 
 		 204 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.393011  normal  0.0927704 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0882  transcriptional regulator, TetR family  26.25 
 
 		 233 aa  56.2  0.0000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0886  TetR family transcriptional regulator  26.11 
 
 		 231 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4571  transcriptional regulator, TetR family  26.75 
 
 		 231 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5162  TetR family transcriptional regulator  26.99 
 
 		 224 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.122941 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1014  TetR family transcriptional regulator  27.32 
 
 		 212 aa  55.8  0.0000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1087  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 215 aa  55.8  0.0000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.9461  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05020  transcriptional regulator, TetR family  26.9 
 
 		 194 aa  55.8  0.0000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0805  TetR family transcriptional regulator  22.36 
 
 		 204 aa  55.5  0.0000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0424  transcriptional regulator, TetR family  28.64 
 
 		 201 aa  55.8  0.0000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.315635  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2993  TetR family transcriptional regulator  36.96 
 
 		 206 aa  55.1  0.0000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1062  TetR family transcriptional regulator  27.01 
 
 		 215 aa  55.1  0.0000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.453034  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05643  putative transcription regulator protein  35.14 
 
 		 233 aa  54.7  0.0000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1332  transcriptional regulator BetI  31.91 
 
 		 196 aa  55.1  0.0000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.945819  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1365  transcriptional regulator  29.27 
 
 		 211 aa  55.1  0.0000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.575727 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1397  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 224 aa  55.1  0.0000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.515474  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1415  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 224 aa  55.1  0.0000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4533  transcriptional regulator, TetR family  29.47 
 
 		 197 aa  54.7  0.0000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0585795  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1451  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 224 aa  54.7  0.0000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2970  putative transcriptional regulator  28.65 
 
 		 196 aa  54.7  0.0000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0889426  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1177  TetR family transcriptional regulator  18.9 
 
 		 190 aa  54.7  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4062  TetR family transcriptional regulator  27.98 
 
 		 218 aa  54.3  0.000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1513  transcriptional regulator BetI  30.43 
 
 		 198 aa  54.3  0.000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0564912  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6034  TetR family transcriptional regulator  34.26 
 
 		 223 aa  53.9  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1833  TetR family transcriptional regulator  25.16 
 
 		 206 aa  54.7  0.000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.226385 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3448  TetR family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 240 aa  54.7  0.000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1204  transcriptional regulator, TetR family  34.62 
 
 		 206 aa  54.3  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.260768  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1866  TetR family transcriptional regulator  28.28 
 
 		 212 aa  54.3  0.000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.26917  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0757  transcriptional regulator, TetR family  30.71 
 
 		 210 aa  54.3  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0106421  normal  0.698078 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3293  transcriptional regulator, TetR family  32.61 
 
 		 195 aa  53.9  0.000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3310  transcriptional regulator BetI  32.61 
 
 		 195 aa  53.9  0.000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6485  regulatory protein, TetR  30 
 
 		 278 aa  53.5  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.521213  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0344  transcriptional regulator BetI  32.61 
 
 		 195 aa  53.5  0.000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0375  transcriptional regulator BetI  32.61 
 
 		 195 aa  53.9  0.000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0868398 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4995  TetR family transcriptional regulator  25.66 
 
 		 224 aa  53.5  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.11542  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2599  TetR family transcriptional regulator  24.86 
 
 		 233 aa  53.5  0.000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.87329  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3094  TetR family transcriptional regulator  25.66 
 
 		 237 aa  53.5  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4672  TetR family transcriptional regulator  32.65 
 
 		 224 aa  53.5  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.959951  normal  0.170381 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1976  putative transcriptional regulator, TetR family  30.36 
 
 		 181 aa  53.5  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>